106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2392 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2392  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 300 aa  592  1e-168  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.546441 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0350  cation diffusion facilitator family transporter  45.97 
 
 		 307 aa  268  5.9999999999999995e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0122115 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2043  hypothetical protein  39.66 
 
 		 303 aa  246  4e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2041  hypothetical protein  38.98 
 
 		 303 aa  240  2e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0128  cation diffusion facilitator family transporter  42.37 
 
 		 303 aa  232  5e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00780296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0558  cation efflux protein  37.46 
 
 		 301 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000438262  normal  0.603969 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3985  cation efflux protein  39.94 
 
 		 319 aa  218  7e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.561091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1766  cation diffusion facilitator family transporter  38.33 
 
 		 312 aa  217  2e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000394316  hitchhiker  0.00956613 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1607  cation diffusion facilitator family transporter  38.33 
 
 		 312 aa  217  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0711616  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1502  cation diffusion facilitator family transporter  38.33 
 
 		 312 aa  215  9e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000419943  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2718  cation efflux protein  37.66 
 
 		 317 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1227  cation efflux protein  37.99 
 
 		 319 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.873181 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1256  cation efflux protein  37.99 
 
 		 319 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.274158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4191  cation efflux protein  37.99 
 
 		 319 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2938  cation diffusion facilitator family transporter  38.28 
 
 		 308 aa  206  4e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.197596  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5197  cation efflux protein  36.81 
 
 		 341 aa  202  6e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0750922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2130  cation efflux protein  37.29 
 
 		 329 aa  202  6e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.052432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3086  cation diffusion facilitator family transporter  36.63 
 
 		 308 aa  200  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0625445  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1226  cation diffusion facilitator family transporter  31.31 
 
 		 327 aa  181  2e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0225  cation diffusion facilitator family transporter  35.28 
 
 		 370 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0856806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37230  cation diffusion facilitator family transporter  32.78 
 
 		 320 aa  152  5.9999999999999996e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2127  cation diffusion facilitator family transporter  28.04 
 
 		 299 aa  147  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2169  cation diffusion facilitator family transporter  29.63 
 
 		 305 aa  132  5e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.986609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2193  cation diffusion facilitator family transporter  25.93 
 
 		 323 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1874  cation efflux family protein  25.56 
 
 		 268 aa  126  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0135582  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2240  cation diffusion facilitator family transporter  27.09 
 
 		 326 aa  113  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.178806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0401  hypothetical protein  33.07 
 
 		 317 aa  103  4e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.414063  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0337  cation efflux protein  33.95 
 
 		 257 aa  90.9  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05417  hypothetical protein  31.05 
 
 		 297 aa  87.8  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001476  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  32.26 
 
 		 298 aa  85.5  9e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.320249  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1043  putative cation efflux pump  25.47 
 
 		 227 aa  77.4  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1741  cation diffusion facilitator family transporter  26.17 
 
 		 307 aa  63.5  0.000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00244826  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1615  cation transporter, permease component  21.36 
 
 		 301 aa  61.2  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0151047  normal  0.0448748 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11850  cation diffusion facilitator family transporter  24.06 
 
 		 312 aa  60.8  0.00000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1752  cation diffusion facilitator family transporter  25.93 
 
 		 301 aa  60.1  0.00000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00011926  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0166  Co/Zn/Cd efflux system component protein  28.38 
 
 		 312 aa  55.8  0.0000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.157738  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1954  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 293 aa  53.9  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000254131  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2198  cation diffusion facilitator family transporter  30 
 
 		 307 aa  53.9  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2609  cation diffusion facilitator family transporter  25.09 
 
 		 352 aa  53.5  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.716643  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1036  cation diffusion facilitator family transporter  23.55 
 
 		 387 aa  53.5  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.246594  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1983  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  31.1 
 
 		 300 aa  53.1  0.000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.644974  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1912  cation diffusion facilitator family transporter  31.1 
 
 		 300 aa  53.1  0.000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114222  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0026  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  25.91 
 
 		 301 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000390702 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0040  cation diffusion facilitator family transporter  25.91 
 
 		 301 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142458 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0040  cation diffusion facilitator family transporter  25.91 
 
 		 301 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0043  cation diffusion facilitator family transporter  25.91 
 
 		 301 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04060  cation diffusion facilitator family transporter  24.09 
 
 		 292 aa  52  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1554  cation diffusion facilitator family transporter  24.64 
 
 		 301 aa  51.6  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.199907  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0693  cation diffusion facilitator family transporter  26.7 
 
 		 312 aa  50.4  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3642  cation diffusion facilitator family transporter  27.6 
 
 		 299 aa  50.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5042  normal  0.259615 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3652  cation diffusion facilitator family transporter  26.75 
 
 		 384 aa  49.7  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3476  putative cation efflux family protein, CzcD-like protein  23.38 
 
 		 296 aa  49.3  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606573  normal  0.771262 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1685  CDF family cation efflux system protein  38.03 
 
 		 83 aa  49.3  0.00008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.890428  normal  0.971407 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0896  cation efflux family protein  20.78 
 
 		 304 aa  48.9  0.0001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0221423  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1245  cation diffusion facilitator family transporter  22.37 
 
 		 294 aa  47.8  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1549  cation diffusion facilitator family transporter  19.33 
 
 		 290 aa  48.1  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2863  zinc transporter ZitB  25.47 
 
 		 312 aa  48.1  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00819873  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  25.47 
 
 		 312 aa  48.1  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2951  zinc transporter ZitB  25.18 
 
 		 312 aa  47.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.278393  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03787  Co/Zn/Cd efflux system component  24.91 
 
 		 320 aa  47.8  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00228734  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2025  cation diffusion facilitator family transporter  26.07 
 
 		 313 aa  48.1  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0165078  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1002  cation efflux protein  22.43 
 
 		 300 aa  47.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000361576 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0978  cation diffusion facilitator family transporter  25.86 
 
 		 317 aa  47.4  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0892489  normal  0.0362171 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1123  ferrous-iron efflux pump FieF  18.52 
 
 		 289 aa  47.4  0.0003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00791465  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0084  pantothenate metabolism flavoprotein  20.87 
 
 		 311 aa  47.4  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00694286  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2062  hypothetical protein  22.17 
 
 		 305 aa  47.4  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00314891 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2000  cation diffusion facilitator family transporter  27.17 
 
 		 285 aa  47  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.7679  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0468  cation efflux protein  26.21 
 
 		 302 aa  47  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2256  cation diffusion facilitator family transporter  22.33 
 
 		 332 aa  46.6  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00134926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0050  cation diffusion facilitator family transporter  23.08 
 
 		 317 aa  46.6  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.374526 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02030  Co/Zn/Cd efflux system component  26.21 
 
 		 271 aa  46.6  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.434455  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2250  cation diffusion facilitator family transporter  25.64 
 
 		 294 aa  46.2  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000133165  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3813  ferrous iron efflux protein F  23.73 
 
 		 298 aa  45.8  0.0008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.70191  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0154  cation diffusion facilitator family transporter  28.41 
 
 		 319 aa  45.8  0.0009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.618945  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0159  cation diffusion facilitator family transporter  28.41 
 
 		 319 aa  45.8  0.0009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2131  cation diffusion facilitator family transporter  25 
 
 		 305 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.127518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0867  cation diffusion facilitator family transporter  27.27 
 
 		 295 aa  45.4  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.851238 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1715  cation transport protein  24.44 
 
 		 305 aa  45.4  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0389  cation diffusion facilitator family transporter  27.36 
 
 		 308 aa  45.8  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2286  cation diffusion facilitator family transporter  25 
 
 		 305 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76035  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0712  cation diffusion facilitator family transporter  31.87 
 
 		 301 aa  45.4  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1408  CzcD family heavy metal efflux protein  25.82 
 
 		 321 aa  45.1  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.475704 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0196  cation diffusion facilitator family transporter  25.47 
 
 		 404 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.831911  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2468  cation diffusion facilitator family transporter  26.22 
 
 		 295 aa  44.3  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.376521 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0210  cation diffusion facilitator family transporter  25.47 
 
 		 404 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.904407 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1531  cation diffusion facilitator family transporter  22.49 
 
 		 317 aa  44.3  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0553  cation diffusion facilitator family transporter  22.47 
 
 		 388 aa  44.3  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2017  hypothetical protein  20.22 
 
 		 380 aa  43.5  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2012  hypothetical protein  20.6 
 
 		 380 aa  43.5  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1582  cation diffusion facilitator family transporter  22.18 
 
 		 299 aa  43.5  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4276  cation efflux protein  29.02 
 
 		 325 aa  43.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4118  cation diffusion facilitator family transporter  29.02 
 
 		 325 aa  43.5  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0719  cation diffusion facilitator family transporter  23.44 
 
 		 278 aa  43.1  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.775503 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1074  cation diffusion facilitator family transporter  26.54 
 
 		 305 aa  43.1  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1136  cation diffusion facilitator family transporter  23.61 
 
 		 342 aa  43.1  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3105  cation diffusion facilitator family transporter  25.81 
 
 		 306 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3015  cation diffusion facilitator family transporter  25.81 
 
 		 306 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.68136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3385  cation efflux protein  25.56 
 
 		 385 aa  42.7  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2027  cation diffusion facilitator family transporter  23.98 
 
 		 294 aa  42.7  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3496  cation diffusion facilitator family transporter  30.72 
 
 		 300 aa  42.7  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.844675 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>