More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1531 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_1531  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 
317 aa  633  1e-180  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0496  cation diffusion facilitator family transporter  85.48 
 
 
318 aa  532  1e-150  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.920568  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3548  cation diffusion facilitator family transporter  82.39 
 
 
320 aa  460  9.999999999999999e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.058207 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0069  cation efflux family protein  72.28 
 
 
318 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6231  cation diffusion facilitator family transporter  71.18 
 
 
299 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554838  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3406  cation diffusion facilitator family transporter  62.14 
 
 
337 aa  387  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0577  cation diffusion facilitator family transporter  66.89 
 
 
308 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.215169 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2941  cation diffusion facilitator family transporter  68.9 
 
 
307 aa  376  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1675  cation diffusion facilitator family transporter  68.9 
 
 
307 aa  376  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.282896  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2526  cation diffusion facilitator family transporter  68.18 
 
 
307 aa  373  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0324472 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1587  cation diffusion facilitator family transporter  68.2 
 
 
307 aa  373  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.697729  normal 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4982  cation diffusion facilitator family transporter  66.08 
 
 
307 aa  362  4e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0279964 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0570  cation diffusion facilitator family transporter  64.63 
 
 
298 aa  362  6e-99  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.712384  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3245  cation efflux protein  62 
 
 
309 aa  358  5e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5170  cation efflux protein  63.82 
 
 
303 aa  347  2e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3385  cation efflux protein  60.34 
 
 
385 aa  342  5e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0282  cation diffusion facilitator family transporter  60.34 
 
 
385 aa  341  8e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.369403  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0264  cation diffusion facilitator family transporter  60.34 
 
 
385 aa  340  1e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.56079 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0399  cation diffusion facilitator family transporter  60.35 
 
 
418 aa  339  4e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.329701  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0196  cation diffusion facilitator family transporter  59.66 
 
 
404 aa  338  5e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.831911  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2824  cation diffusion facilitator family transporter  60 
 
 
385 aa  338  5.9999999999999996e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.74147  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0210  cation diffusion facilitator family transporter  59.66 
 
 
404 aa  338  5.9999999999999996e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.904407 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0191  cation diffusion facilitator family transporter  58.01 
 
 
384 aa  338  8e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.114126  hitchhiker  0.0000000345826 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0117  cation diffusion facilitator family transporter  58.6 
 
 
400 aa  333  2e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2906  cation efflux family protein  61.05 
 
 
396 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.313592  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1635  cation efflux family protein  61.05 
 
 
396 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.504056  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3154  cation efflux family protein  61.05 
 
 
418 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3825  cation efflux family protein  61.05 
 
 
396 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3403  cation efflux family protein  61.05 
 
 
396 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.843377  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2966  cation efflux family protein  61.05 
 
 
396 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0047  cation efflux family protein  61.05 
 
 
396 aa  326  3e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3907  cation efflux family protein  61.05 
 
 
396 aa  326  3e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4320  cation (Co++/Zn++/Cd++) efflux protein  59.86 
 
 
414 aa  323  3e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3009  cation diffusion facilitator family transporter  57.19 
 
 
382 aa  310  2e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3356  cation diffusion facilitator family transporter  57.43 
 
 
382 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3764  cation efflux protein  49.5 
 
 
389 aa  295  7e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0837533 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3077  hypothetical protein  57.54 
 
 
392 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.197933  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3647  cation diffusion facilitator family transporter  46.13 
 
 
395 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2017  hypothetical protein  42.36 
 
 
380 aa  221  1.9999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2012  hypothetical protein  42.36 
 
 
380 aa  220  1.9999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2576  cation diffusion facilitator family transporter  43.45 
 
 
423 aa  211  1e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00102277 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0553  cation diffusion facilitator family transporter  40.6 
 
 
388 aa  194  1e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1774  cation diffusion facilitator family transporter  34.68 
 
 
293 aa  194  1e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000103729  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1668  cation diffusion facilitator family transporter  34.35 
 
 
291 aa  193  3e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0340924  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1036  cation diffusion facilitator family transporter  35.41 
 
 
387 aa  192  6e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.246594  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04060  cation diffusion facilitator family transporter  36.9 
 
 
292 aa  192  7e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0938  cation diffusion facilitator family transporter  41.79 
 
 
387 aa  192  7e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3258  cation diffusion facilitator family transporter  39.86 
 
 
390 aa  191  9e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0465  cation efflux family protein  39.86 
 
 
391 aa  191  1e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.326406  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0625  cation diffusion facilitator family transporter  39.86 
 
 
391 aa  191  1e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0245  cation diffusion facilitator family transporter  34.69 
 
 
291 aa  191  1e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2889  cation diffusion facilitator family transporter  39.93 
 
 
388 aa  189  5.999999999999999e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000320508  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3150  cation diffusion facilitator family transporter  37.33 
 
 
401 aa  188  1e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1450  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  38.38 
 
 
378 aa  187  2e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.59644  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1517  cation diffusion facilitator family transporter  38.38 
 
 
378 aa  187  2e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0960  cation diffusion facilitator family transporter  33.33 
 
 
291 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1549  cation diffusion facilitator family transporter  33.45 
 
 
290 aa  182  6e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1992  cation diffusion facilitator family transporter  40.99 
 
 
389 aa  182  8.000000000000001e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3126  cation diffusion facilitator family transporter  32.09 
 
 
297 aa  176  7e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4529  cation efflux family protein  31.16 
 
 
297 aa  175  9e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1144  cation efflux family protein  35.86 
 
 
289 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0182712  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0706  cation efflux family protein  31.51 
 
 
297 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4305  cation efflux family protein  31.16 
 
 
298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.901101  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4143  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  31.16 
 
 
297 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4154  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  31.16 
 
 
298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4490  cation efflux family protein  31.16 
 
 
297 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000013867 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4640  cation efflux family protein  31.16 
 
 
298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0974  cation diffusion facilitator family transporter  36.31 
 
 
320 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1511  cation diffusion facilitator family transporter  37.58 
 
 
314 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00242761  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4544  cation efflux family protein  31.16 
 
 
297 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0936  cation diffusion facilitator family transporter  31.54 
 
 
300 aa  172  5e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4257  cation diffusion facilitator family transporter  30.82 
 
 
297 aa  172  5e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4494  cation efflux family protein  31.16 
 
 
298 aa  172  9e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0983  cation efflux family protein  35.92 
 
 
289 aa  172  9e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0179207  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0491  cation diffusion facilitator family transporter  32.52 
 
 
354 aa  171  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0566502 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0858  cation efflux system protein  32.98 
 
 
331 aa  169  4e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2100  cation diffusion facilitator family transporter  34.74 
 
 
310 aa  165  9e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.70845  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2005  cation diffusion facilitator family transporter  32.07 
 
 
299 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0051  cation diffusion facilitator family transporter  32.29 
 
 
306 aa  155  7e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09106  cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcD  32.29 
 
 
313 aa  155  8e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.341807  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0051  cation diffusion facilitator family transporter  31.6 
 
 
306 aa  152  5e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2090  cation efflux family protein  33.11 
 
 
302 aa  150  2e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19310  cation diffusion facilitator family transporter  35.36 
 
 
298 aa  148  1.0000000000000001e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000504538 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3033  cation efflux family protein  33.92 
 
 
293 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2291  cation efflux family protein  33.92 
 
 
293 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2089  cation efflux protein  33.92 
 
 
296 aa  145  6e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.328738  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1051  putative cation efflux system protein  32.2 
 
 
319 aa  145  6e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2250  cation diffusion facilitator family transporter  33.58 
 
 
294 aa  145  7.0000000000000006e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000133165  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2343  cation efflux family protein  33.57 
 
 
293 aa  145  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.412902  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0130  cation diffusion facilitator family transporter  33.45 
 
 
292 aa  145  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.120546  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2334  cation efflux family protein  33.57 
 
 
293 aa  144  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2418  cation efflux family protein  33.57 
 
 
293 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2155  cation efflux family protein  33.57 
 
 
296 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.112799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2093  cation efflux protein  33.57 
 
 
296 aa  144  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0345856  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2127  cation diffusion facilitator family transporter  33.22 
 
 
293 aa  144  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.139968  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1700  cation diffusion facilitator family transporter  33.57 
 
 
293 aa  144  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2310  cation efflux family protein  33.57 
 
 
296 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2428  cation diffusion facilitator family transporter  29.79 
 
 
299 aa  144  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000439977  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1712  cation diffusion facilitator family transporter  31.8 
 
 
306 aa  144  2e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00125134  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0858  cation efflux protein  28.62 
 
 
299 aa  142  5e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>