38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0225 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0225  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 370 aa  741    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0856806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3086  cation diffusion facilitator family transporter  54.28 
 
 		 308 aa  341  1e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0625445  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2938  cation diffusion facilitator family transporter  53.27 
 
 		 308 aa  340  2e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.197596  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2718  cation efflux protein  52.27 
 
 		 317 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3985  cation efflux protein  50.16 
 
 		 319 aa  335  9e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.561091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4191  cation efflux protein  48.73 
 
 		 319 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1227  cation efflux protein  48.4 
 
 		 319 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.873181 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1256  cation efflux protein  48.4 
 
 		 319 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.274158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2130  cation efflux protein  50.66 
 
 		 329 aa  323  2e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.052432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5197  cation efflux protein  49.84 
 
 		 341 aa  306  3e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0750922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37230  cation diffusion facilitator family transporter  44.67 
 
 		 320 aa  243  3e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2043  hypothetical protein  37.29 
 
 		 303 aa  230  2e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2041  hypothetical protein  36.96 
 
 		 303 aa  228  2e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0128  cation diffusion facilitator family transporter  37.83 
 
 		 303 aa  207  2e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00780296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0350  cation diffusion facilitator family transporter  36.81 
 
 		 307 aa  202  5e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0122115 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1766  cation diffusion facilitator family transporter  35.18 
 
 		 312 aa  192  6e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000394316  hitchhiker  0.00956613 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1607  cation diffusion facilitator family transporter  35.18 
 
 		 312 aa  192  6e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0711616  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1502  cation diffusion facilitator family transporter  34.85 
 
 		 312 aa  192  8e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000419943  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0558  cation efflux protein  35.53 
 
 		 301 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000438262  normal  0.603969 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2392  cation diffusion facilitator family transporter  35.39 
 
 		 300 aa  177  2e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.546441 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2127  cation diffusion facilitator family transporter  28.01 
 
 		 299 aa  155  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1226  cation diffusion facilitator family transporter  27.06 
 
 		 327 aa  130  3e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2169  cation diffusion facilitator family transporter  27.69 
 
 		 305 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.986609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1874  cation efflux family protein  23.38 
 
 		 268 aa  116  6.9999999999999995e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0135582  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2240  cation diffusion facilitator family transporter  25.66 
 
 		 326 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.178806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2193  cation diffusion facilitator family transporter  24.84 
 
 		 323 aa  98.2  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0401  hypothetical protein  32.47 
 
 		 317 aa  96.3  8e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.414063  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0337  cation efflux protein  31.14 
 
 		 257 aa  87.8  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001476  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  25.35 
 
 		 298 aa  84.3  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.320249  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05417  hypothetical protein  27.38 
 
 		 297 aa  83.2  0.000000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1043  putative cation efflux pump  27.54 
 
 		 227 aa  74.7  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  21.22 
 
 		 311 aa  50.4  0.00004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1049  putative Co/Zn/Cd cation transporter  27.5 
 
 		 302 aa  48.5  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08140  cation diffusion facilitator family transporter  22.07 
 
 		 369 aa  48.1  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.150714  normal  0.172071 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4236  cation efflux protein  28.82 
 
 		 296 aa  48.5  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.52921  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0470  cation diffusion facilitator family transporter  21.67 
 
 		 337 aa  44.7  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0457303  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0445  cation efflux protein  35.87 
 
 		 240 aa  44.3  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.575135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0400  cation diffusion facilitator family transporter  20.83 
 
 		 327 aa  42.7  0.01  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>