40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_37230 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_37230  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 320 aa  622  1e-177  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4191  cation efflux protein  48.84 
 
 		 319 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2938  cation diffusion facilitator family transporter  49.01 
 
 		 308 aa  291  1e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.197596  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1227  cation efflux protein  47.85 
 
 		 319 aa  287  1e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.873181 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1256  cation efflux protein  47.85 
 
 		 319 aa  287  1e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.274158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3985  cation efflux protein  46.05 
 
 		 319 aa  280  2e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.561091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2718  cation efflux protein  45.57 
 
 		 317 aa  275  6e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2130  cation efflux protein  45.72 
 
 		 329 aa  275  8e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.052432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3086  cation diffusion facilitator family transporter  44.59 
 
 		 308 aa  264  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0625445  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5197  cation efflux protein  43.52 
 
 		 341 aa  259  6e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0750922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0225  cation diffusion facilitator family transporter  44.26 
 
 		 370 aa  251  1e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0856806  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2043  hypothetical protein  36.03 
 
 		 303 aa  211  1e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2041  hypothetical protein  35.69 
 
 		 303 aa  210  2e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1766  cation diffusion facilitator family transporter  38.31 
 
 		 312 aa  207  2e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000394316  hitchhiker  0.00956613 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1607  cation diffusion facilitator family transporter  38.31 
 
 		 312 aa  207  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0711616  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1502  cation diffusion facilitator family transporter  37.97 
 
 		 312 aa  204  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000419943  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0128  cation diffusion facilitator family transporter  35.93 
 
 		 303 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00780296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0350  cation diffusion facilitator family transporter  35.84 
 
 		 307 aa  188  1e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0122115 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2392  cation diffusion facilitator family transporter  32.78 
 
 		 300 aa  169  5e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.546441 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0558  cation efflux protein  30.51 
 
 		 301 aa  166  4e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000438262  normal  0.603969 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2127  cation diffusion facilitator family transporter  27.36 
 
 		 299 aa  142  6e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1226  cation diffusion facilitator family transporter  27.42 
 
 		 327 aa  130  4.0000000000000003e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2169  cation diffusion facilitator family transporter  27.42 
 
 		 305 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.986609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2193  cation diffusion facilitator family transporter  27.81 
 
 		 323 aa  124  2e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2240  cation diffusion facilitator family transporter  27.67 
 
 		 326 aa  123  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.178806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1874  cation efflux family protein  22.39 
 
 		 268 aa  101  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0135582  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0337  cation efflux protein  28.69 
 
 		 257 aa  92.4  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0401  hypothetical protein  28.89 
 
 		 317 aa  91.3  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.414063  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05417  hypothetical protein  25.9 
 
 		 297 aa  77  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001476  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  27.31 
 
 		 298 aa  75.5  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.320249  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1043  putative cation efflux pump  24.88 
 
 		 227 aa  72.4  0.000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0820  Co/Zn/Cd cation transporter  23.31 
 
 		 301 aa  58.2  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00173784  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2062  hypothetical protein  25.43 
 
 		 305 aa  56.2  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00314891 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1049  putative Co/Zn/Cd cation transporter  22.59 
 
 		 302 aa  51.6  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0896  cation efflux family protein  24.16 
 
 		 304 aa  46.6  0.0006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0221423  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1171  cation efflux family protein  22.43 
 
 		 295 aa  45.8  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0281  cation diffusion facilitator family transporter  21.81 
 
 		 304 aa  44.3  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0952355  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0532  ferrous-iron efflux pump FieF  23.7 
 
 		 291 aa  44.3  0.003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.800383  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1884  Co/Zn/Cd cation transporter  21.16 
 
 		 307 aa  43.1  0.006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4552  cation efflux protein  29.27 
 
 		 328 aa  43.1  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.471009  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>