12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1884 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_1884  Co/Zn/Cd cation transporter  100 
 
 		 307 aa  617  1e-176  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0820  Co/Zn/Cd cation transporter  47.51 
 
 		 301 aa  287  1e-76  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00173784  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1049  putative Co/Zn/Cd cation transporter  34.33 
 
 		 302 aa  218  7.999999999999999e-56  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2062  hypothetical protein  28.23 
 
 		 305 aa  144  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00314891 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0281  cation diffusion facilitator family transporter  28.62 
 
 		 304 aa  125  9e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0952355  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2946  cation efflux protein  22.4 
 
 		 327 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457445 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2193  cation diffusion facilitator family transporter  20.35 
 
 		 323 aa  69.7  0.00000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0558  cation efflux protein  21.58 
 
 		 301 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000438262  normal  0.603969 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2169  cation diffusion facilitator family transporter  23.22 
 
 		 305 aa  46.6  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.986609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2127  cation diffusion facilitator family transporter  21.63 
 
 		 299 aa  46.6  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4191  cation efflux protein  27.15 
 
 		 319 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0401  hypothetical protein  22.91 
 
 		 317 aa  42.4  0.009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.414063  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>