39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4191 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4191  cation efflux protein  100 
 
 		 319 aa  644    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1227  cation efflux protein  95.92 
 
 		 319 aa  623  1e-177  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.873181 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1256  cation efflux protein  95.92 
 
 		 319 aa  623  1e-177  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.274158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3985  cation efflux protein  87.15 
 
 		 319 aa  570  1e-161  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.561091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2718  cation efflux protein  68.91 
 
 		 317 aa  447  1e-125  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2938  cation diffusion facilitator family transporter  64.82 
 
 		 308 aa  421  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.197596  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2130  cation efflux protein  61.04 
 
 		 329 aa  408  1e-113  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.052432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3086  cation diffusion facilitator family transporter  60.71 
 
 		 308 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0625445  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5197  cation efflux protein  54.05 
 
 		 341 aa  360  2e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0750922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0225  cation diffusion facilitator family transporter  48.73 
 
 		 370 aa  320  1.9999999999999998e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0856806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37230  cation diffusion facilitator family transporter  48.84 
 
 		 320 aa  265  7e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2043  hypothetical protein  39.93 
 
 		 303 aa  251  2e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0350  cation diffusion facilitator family transporter  41.88 
 
 		 307 aa  248  1e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0122115 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2041  hypothetical protein  38.94 
 
 		 303 aa  244  9.999999999999999e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1607  cation diffusion facilitator family transporter  38.44 
 
 		 312 aa  237  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0711616  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1766  cation diffusion facilitator family transporter  38.44 
 
 		 312 aa  237  2e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000394316  hitchhiker  0.00956613 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1502  cation diffusion facilitator family transporter  38.44 
 
 		 312 aa  234  1.0000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000419943  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2392  cation diffusion facilitator family transporter  37.99 
 
 		 300 aa  211  1e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.546441 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0128  cation diffusion facilitator family transporter  37.17 
 
 		 303 aa  202  4e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00780296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0558  cation efflux protein  34.75 
 
 		 301 aa  192  7e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000438262  normal  0.603969 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2127  cation diffusion facilitator family transporter  29.84 
 
 		 299 aa  161  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1226  cation diffusion facilitator family transporter  29.28 
 
 		 327 aa  154  2e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2169  cation diffusion facilitator family transporter  26.97 
 
 		 305 aa  144  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.986609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2240  cation diffusion facilitator family transporter  27.78 
 
 		 326 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.178806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1874  cation efflux family protein  23.64 
 
 		 268 aa  125  9e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0135582  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0401  hypothetical protein  31.15 
 
 		 317 aa  100  5e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.414063  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2193  cation diffusion facilitator family transporter  24.44 
 
 		 323 aa  98.6  1e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0337  cation efflux protein  27.76 
 
 		 257 aa  97.4  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1043  putative cation efflux pump  30.81 
 
 		 227 aa  86.7  5e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001476  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  29.55 
 
 		 298 aa  84.7  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.320249  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05417  hypothetical protein  29.09 
 
 		 297 aa  82.4  0.000000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1049  putative Co/Zn/Cd cation transporter  25.47 
 
 		 302 aa  48.5  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0154  cation diffusion facilitator family transporter  22.86 
 
 		 319 aa  46.6  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.618945  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0159  cation diffusion facilitator family transporter  22.86 
 
 		 319 aa  46.6  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0896  cation efflux family protein  27.05 
 
 		 304 aa  46.2  0.0008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0221423  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2062  hypothetical protein  24.25 
 
 		 305 aa  45.4  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00314891 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  24.44 
 
 		 316 aa  44.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25900  cation diffusion facilitator family transporter  25.43 
 
 		 304 aa  43.5  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0532  ferrous-iron efflux pump FieF  22.54 
 
 		 291 aa  42.4  0.01  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.800383  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>