125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0558 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0558  cation efflux protein  100 
 
 		 301 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000438262  normal  0.603969 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2043  hypothetical protein  38.64 
 
 		 303 aa  240  2e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2041  hypothetical protein  38.31 
 
 		 303 aa  239  4e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1766  cation diffusion facilitator family transporter  38.98 
 
 		 312 aa  232  6e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000394316  hitchhiker  0.00956613 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1607  cation diffusion facilitator family transporter  38.98 
 
 		 312 aa  232  6e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0711616  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1502  cation diffusion facilitator family transporter  38.64 
 
 		 312 aa  228  8e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000419943  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0128  cation diffusion facilitator family transporter  39.46 
 
 		 303 aa  228  1e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00780296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0350  cation diffusion facilitator family transporter  37.07 
 
 		 307 aa  223  3e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0122115 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2392  cation diffusion facilitator family transporter  37.46 
 
 		 300 aa  222  4.9999999999999996e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.546441 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2718  cation efflux protein  35.53 
 
 		 317 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1227  cation efflux protein  35.08 
 
 		 319 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.873181 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1256  cation efflux protein  35.08 
 
 		 319 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.274158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4191  cation efflux protein  34.75 
 
 		 319 aa  192  6e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3985  cation efflux protein  34.75 
 
 		 319 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.561091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5197  cation efflux protein  33.66 
 
 		 341 aa  191  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0750922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3086  cation diffusion facilitator family transporter  35.31 
 
 		 308 aa  188  8e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0625445  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2130  cation efflux protein  32.47 
 
 		 329 aa  183  3e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.052432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0225  cation diffusion facilitator family transporter  35.53 
 
 		 370 aa  181  2e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0856806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1226  cation diffusion facilitator family transporter  31.54 
 
 		 327 aa  177  1e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2938  cation diffusion facilitator family transporter  33.44 
 
 		 308 aa  177  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.197596  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2127  cation diffusion facilitator family transporter  29.63 
 
 		 299 aa  154  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1874  cation efflux family protein  28.3 
 
 		 268 aa  152  4e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0135582  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37230  cation diffusion facilitator family transporter  30.51 
 
 		 320 aa  145  6e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2169  cation diffusion facilitator family transporter  25.68 
 
 		 305 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.986609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2193  cation diffusion facilitator family transporter  28.22 
 
 		 323 aa  122  6e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2240  cation diffusion facilitator family transporter  27.15 
 
 		 326 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.178806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05417  hypothetical protein  29.66 
 
 		 297 aa  108  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001476  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  25.35 
 
 		 298 aa  105  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.320249  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0337  cation efflux protein  30.69 
 
 		 257 aa  104  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0401  hypothetical protein  28.74 
 
 		 317 aa  103  4e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.414063  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1043  putative cation efflux pump  27.81 
 
 		 227 aa  87.8  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1615  cation transporter, permease component  21.37 
 
 		 301 aa  70.9  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0151047  normal  0.0448748 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1049  putative Co/Zn/Cd cation transporter  24.32 
 
 		 302 aa  66.2  0.0000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1146  cation efflux family protein  27.85 
 
 		 411 aa  61.6  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00680044  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0532  ferrous-iron efflux pump FieF  24.34 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.800383  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1549  cation diffusion facilitator family transporter  27.23 
 
 		 290 aa  61.2  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1731  cation diffusion facilitator family transporter  24.21 
 
 		 315 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.560975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2062  hypothetical protein  28.25 
 
 		 305 aa  60.8  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00314891 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1752  cation diffusion facilitator family transporter  26.19 
 
 		 301 aa  60.1  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00011926  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2000  cation diffusion facilitator family transporter  27 
 
 		 285 aa  59.3  0.00000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.7679  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3626  cation diffusion facilitator family transporter  26.76 
 
 		 321 aa  58.9  0.00000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.89177 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3964  cation diffusion facilitator family transporter  26.76 
 
 		 321 aa  58.9  0.00000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0559635  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3895  cation diffusion facilitator family transporter  24.81 
 
 		 307 aa  58.5  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.640647  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3075  cation diffusion facilitator family transporter  24.31 
 
 		 304 aa  57.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00146  ferrous iron efflux protein F  26.27 
 
 		 302 aa  57.8  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0737  cation efflux system protein  23.44 
 
 		 317 aa  57.4  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.338743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5864  cation diffusion facilitator family transporter  20.91 
 
 		 300 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.499716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5513  cation diffusion facilitator family transporter  24.14 
 
 		 295 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.281094  normal  0.363198 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1668  cation diffusion facilitator family transporter  26.24 
 
 		 291 aa  55.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0340924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0245  cation diffusion facilitator family transporter  24.64 
 
 		 291 aa  55.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0896  cation efflux family protein  23.97 
 
 		 304 aa  54.7  0.000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0221423  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3476  putative cation efflux family protein, CzcD-like protein  20.07 
 
 		 296 aa  54.7  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606573  normal  0.771262 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3931  cation diffusion facilitator family transporter  24.9 
 
 		 289 aa  54.3  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146752  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0166  Co/Zn/Cd efflux system component protein  26.05 
 
 		 312 aa  54.7  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.157738  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1770  cation diffusion facilitator family transporter  24.64 
 
 		 315 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3300  iron and zinc efflux system protein  21.84 
 
 		 318 aa  53.9  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.831799  normal  0.0946092 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1850  cation diffusion facilitator family transporter  22.71 
 
 		 315 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1483  cation diffusion facilitator family transporter  22.82 
 
 		 308 aa  53.5  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1521  cation diffusion facilitator family transporter  21.72 
 
 		 309 aa  52.8  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0960  cation diffusion facilitator family transporter  27.14 
 
 		 291 aa  52.4  0.000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1026  cation efflux family protein  26.34 
 
 		 295 aa  52  0.00001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0618  cation diffusion facilitator family transporter  26.94 
 
 		 411 aa  52  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000865863  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0972  cation efflux family protein  26.34 
 
 		 295 aa  52  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1171  cation efflux family protein  25.85 
 
 		 295 aa  52  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1013  metal cation efflux protein CzrB  21.51 
 
 		 302 aa  51.6  0.00002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.323499  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2262  ferrous iron efflux protein F  24.81 
 
 		 302 aa  51.2  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000896639  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1214  cation diffusion facilitator family transporter  27.74 
 
 		 406 aa  51.2  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0101557  hitchhiker  0.000000113777 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1496  cation diffusion facilitator family transporter  27.74 
 
 		 400 aa  50.8  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0023  cation diffusion facilitator family transporter  21.22 
 
 		 295 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.556428 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002221  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  23.92 
 
 		 302 aa  50.4  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000518265  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2863  zinc transporter ZitB  20.25 
 
 		 312 aa  50.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00819873  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  20.25 
 
 		 312 aa  50.1  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2951  zinc transporter ZitB  20.25 
 
 		 312 aa  50.4  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.278393  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  20.71 
 
 		 311 aa  50.1  0.00005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0314  cation diffusion facilitator family transporter  25 
 
 		 289 aa  50.1  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000499164  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2073  cation diffusion facilitator family transporter  21.62 
 
 		 308 aa  49.7  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.981542 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0970  cation diffusion facilitator family transporter  21.1 
 
 		 390 aa  49.7  0.00007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000558459  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1801  cation efflux family protein  24.61 
 
 		 376 aa  49.3  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0942158  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2198  cation diffusion facilitator family transporter  20.34 
 
 		 293 aa  48.5  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.776966  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0446  cation diffusion facilitator family transporter  24.15 
 
 		 328 aa  48.5  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.48861  normal  0.265047 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0050  cation diffusion facilitator family transporter  20.69 
 
 		 317 aa  48.9  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.374526 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0754  cation diffusion facilitator family transporter  20.39 
 
 		 311 aa  47.8  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00172245  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1113  hypothetical protein  22.68 
 
 		 307 aa  48.1  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.416676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2658  cation diffusion facilitator family transporter  20.16 
 
 		 295 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19310  cation diffusion facilitator family transporter  26.47 
 
 		 298 aa  48.1  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000504538 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1509  putative transport system permease protein  20.15 
 
 		 314 aa  47.4  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073133  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1042  Co/Zn/Cd cation transporter  24.83 
 
 		 398 aa  47.4  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0463512  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0281  cation diffusion facilitator family transporter  27.27 
 
 		 304 aa  47.4  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0952355  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0586  cation efflux family protein  22.43 
 
 		 393 aa  47  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0440871  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  22.01 
 
 		 311 aa  47  0.0004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2294  cation diffusion facilitator family transporter  23.08 
 
 		 306 aa  47  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38282  normal  0.177312 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  25.21 
 
 		 316 aa  47  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2809  cation diffusion facilitator family transporter  22.27 
 
 		 304 aa  47  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.252612  normal  0.010552 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1114  cation efflux protein  19.23 
 
 		 305 aa  46.6  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0576  cation efflux family protein  22.05 
 
 		 393 aa  46.6  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1536  cation diffusion facilitator family transporter  23.16 
 
 		 295 aa  46.6  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.503443  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1026  cation diffusion facilitator family transporter  20.56 
 
 		 323 aa  46.2  0.0006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2106  cation diffusion facilitator family transporter  22.83 
 
 		 315 aa  46.2  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0130  cation diffusion facilitator family transporter  22.61 
 
 		 292 aa  46.2  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.120546  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11850  cation diffusion facilitator family transporter  24.22 
 
 		 312 aa  46.2  0.0007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>