122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_2193 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_2193  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 323 aa  650    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2240  cation diffusion facilitator family transporter  32.67 
 
 		 326 aa  152  7e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.178806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2392  cation diffusion facilitator family transporter  25.93 
 
 		 300 aa  127  3e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.546441 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0350  cation diffusion facilitator family transporter  27.48 
 
 		 307 aa  123  5e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0122115 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0128  cation diffusion facilitator family transporter  24.83 
 
 		 303 aa  122  6e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00780296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0558  cation efflux protein  28.22 
 
 		 301 aa  122  7e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000438262  normal  0.603969 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1766  cation diffusion facilitator family transporter  23.96 
 
 		 312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000394316  hitchhiker  0.00956613 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1607  cation diffusion facilitator family transporter  23.96 
 
 		 312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0711616  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1502  cation diffusion facilitator family transporter  24.05 
 
 		 312 aa  111  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000419943  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2043  hypothetical protein  21.59 
 
 		 303 aa  107  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1226  cation diffusion facilitator family transporter  25.24 
 
 		 327 aa  107  3e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2938  cation diffusion facilitator family transporter  25.41 
 
 		 308 aa  106  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.197596  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2041  hypothetical protein  22.8 
 
 		 303 aa  105  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3985  cation efflux protein  25.89 
 
 		 319 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.561091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2718  cation efflux protein  24.04 
 
 		 317 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37230  cation diffusion facilitator family transporter  27.81 
 
 		 320 aa  101  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1227  cation efflux protein  24.27 
 
 		 319 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.873181 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1256  cation efflux protein  24.27 
 
 		 319 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.274158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4191  cation efflux protein  24.44 
 
 		 319 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1874  cation efflux family protein  26.57 
 
 		 268 aa  95.1  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0135582  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2130  cation efflux protein  21.9 
 
 		 329 aa  95.5  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.052432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0401  hypothetical protein  28.42 
 
 		 317 aa  92  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.414063  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2169  cation diffusion facilitator family transporter  21.78 
 
 		 305 aa  92  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.986609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0225  cation diffusion facilitator family transporter  24.84 
 
 		 370 aa  90.5  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0856806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0281  cation diffusion facilitator family transporter  26.47 
 
 		 304 aa  89  9e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0952355  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3086  cation diffusion facilitator family transporter  21.36 
 
 		 308 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0625445  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001476  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  26.82 
 
 		 298 aa  85.5  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.320249  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2127  cation diffusion facilitator family transporter  20.74 
 
 		 299 aa  84.7  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05417  hypothetical protein  31.35 
 
 		 297 aa  84  0.000000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0337  cation efflux protein  25.99 
 
 		 257 aa  82  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5197  cation efflux protein  21.7 
 
 		 341 aa  82.4  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0750922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2062  hypothetical protein  28.57 
 
 		 305 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00314891 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1043  putative cation efflux pump  22.43 
 
 		 227 aa  77  0.0000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1615  cation transporter, permease component  23.86 
 
 		 301 aa  73.9  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0151047  normal  0.0448748 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0820  Co/Zn/Cd cation transporter  24.12 
 
 		 301 aa  70.5  0.00000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00173784  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1850  cation diffusion facilitator family transporter  23.83 
 
 		 315 aa  64.3  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1439  cation efflux protein  21.69 
 
 		 293 aa  63.2  0.000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0109958  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1549  cation diffusion facilitator family transporter  20.77 
 
 		 290 aa  63.2  0.000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1770  cation diffusion facilitator family transporter  23.4 
 
 		 315 aa  63.2  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1752  cation diffusion facilitator family transporter  22.82 
 
 		 301 aa  61.6  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00011926  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1668  cation diffusion facilitator family transporter  20 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0340924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1049  putative Co/Zn/Cd cation transporter  20.54 
 
 		 302 aa  58.9  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1884  Co/Zn/Cd cation transporter  20.35 
 
 		 307 aa  57.4  0.0000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2025  cation diffusion facilitator family transporter  20.39 
 
 		 313 aa  57.4  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0165078  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0589  cation diffusion facilitator family transporter  21.12 
 
 		 285 aa  56.6  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000134664  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2100  cation diffusion facilitator family transporter  23.08 
 
 		 310 aa  56.2  0.0000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.70845  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2356  cation diffusion facilitator family transporter  25.25 
 
 		 409 aa  54.7  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.868825  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1450  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  23.83 
 
 		 378 aa  55.1  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.59644  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0245  cation diffusion facilitator family transporter  20 
 
 		 291 aa  55.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1517  cation diffusion facilitator family transporter  23.83 
 
 		 378 aa  55.1  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2239  cation diffusion facilitator family transporter  23.92 
 
 		 302 aa  54.3  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0407082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4529  cation efflux family protein  25 
 
 		 297 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2106  cation diffusion facilitator family transporter  22.94 
 
 		 315 aa  53.5  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0960  cation diffusion facilitator family transporter  19.92 
 
 		 291 aa  53.1  0.000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0400  cation diffusion facilitator family transporter  29.08 
 
 		 327 aa  53.1  0.000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3649  cation efflux system protein  23.63 
 
 		 384 aa  52.8  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.29953 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4257  cation diffusion facilitator family transporter  26.29 
 
 		 297 aa  52.8  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0706  cation efflux family protein  25 
 
 		 297 aa  52.8  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4494  cation efflux family protein  25.77 
 
 		 298 aa  52  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2946  cation efflux protein  21.79 
 
 		 327 aa  52  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457445 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4544  cation efflux family protein  25 
 
 		 297 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4305  cation efflux family protein  24.64 
 
 		 298 aa  51.2  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.901101  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4143  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  24.64 
 
 		 297 aa  51.6  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4154  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  24.64 
 
 		 298 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4640  cation efflux family protein  24.64 
 
 		 298 aa  51.2  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3126  cation diffusion facilitator family transporter  23.78 
 
 		 297 aa  51.6  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0432  cation diffusion facilitator family transporter  22.99 
 
 		 331 aa  51.6  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4490  cation efflux family protein  24.64 
 
 		 297 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000013867 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1026  cation diffusion facilitator family transporter  21.53 
 
 		 323 aa  50.8  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1114  cation efflux protein  21.79 
 
 		 305 aa  50.1  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  22.64 
 
 		 311 aa  49.7  0.00006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2147  cation efflux system protein  23.41 
 
 		 380 aa  49.7  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.809019  normal  0.389636 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2073  cation diffusion facilitator family transporter  26.67 
 
 		 308 aa  49.3  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.981542 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3071  cation efflux protein  33.64 
 
 		 334 aa  48.9  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3406  cation diffusion facilitator family transporter  21.26 
 
 		 337 aa  48.9  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2245  cation diffusion facilitator family transporter  20.88 
 
 		 483 aa  48.5  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1036  cation diffusion facilitator family transporter  30.77 
 
 		 387 aa  48.9  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.246594  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3261  cation efflux system protein  28.12 
 
 		 305 aa  48.9  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826048  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2109  cation diffusion facilitator family transporter  19.59 
 
 		 311 aa  49.3  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.762889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1220  cation efflux family protein  25.69 
 
 		 376 aa  48.1  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0974  cation diffusion facilitator family transporter  20.28 
 
 		 466 aa  48.1  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0496  cation diffusion facilitator family transporter  20.86 
 
 		 318 aa  48.1  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.920568  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4244  cation diffusion facilitator family transporter  24.39 
 
 		 339 aa  48.1  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.337864 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1531  cation diffusion facilitator family transporter  22.13 
 
 		 317 aa  48.5  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0130  cation diffusion facilitator family transporter  21.81 
 
 		 292 aa  48.5  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.120546  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  22.19 
 
 		 311 aa  48.5  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3476  putative cation efflux family protein, CzcD-like protein  19.93 
 
 		 296 aa  48.1  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606573  normal  0.771262 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1143  cation efflux protein  30.77 
 
 		 331 aa  47  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.344034  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1334  cation diffusion facilitator family transporter  19.38 
 
 		 312 aa  47.4  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.215207  hitchhiker  0.000886879 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2889  cation diffusion facilitator family transporter  30.21 
 
 		 388 aa  47  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000320508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0846  cation diffusion facilitator family transporter  25.2 
 
 		 459 aa  47  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0034385  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2576  cation diffusion facilitator family transporter  22.78 
 
 		 423 aa  46.6  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00102277 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1178  cation efflux family protein  24.88 
 
 		 316 aa  47  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.349373  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0487  cation efflux family protein  37.68 
 
 		 331 aa  46.6  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1683  cation diffusion facilitator family transporter  21.89 
 
 		 308 aa  46.6  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000676071  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0749  cation diffusion facilitator family transporter  28.12 
 
 		 338 aa  46.6  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0567  cation efflux family protein  27.64 
 
 		 316 aa  46.6  0.0006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.609101  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1297  cation efflux family protein  27.64 
 
 		 316 aa  46.2  0.0007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1483  cation diffusion facilitator family transporter  25.83 
 
 		 308 aa  46.2  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0331  cation efflux family protein  20.86 
 
 		 311 aa  46.2  0.0009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>