74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2127 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_2127  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 
299 aa  595  1e-169  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1874  cation efflux family protein  39.03 
 
 
268 aa  215  5.9999999999999996e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0135582  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2169  cation diffusion facilitator family transporter  34.56 
 
 
305 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.986609  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0128  cation diffusion facilitator family transporter  29.97 
 
 
303 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00780296  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1502  cation diffusion facilitator family transporter  30.54 
 
 
312 aa  177  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000419943  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1766  cation diffusion facilitator family transporter  30.2 
 
 
312 aa  176  4e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000394316  hitchhiker  0.00956613 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1607  cation diffusion facilitator family transporter  30.2 
 
 
312 aa  176  4e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0711616  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5197  cation efflux protein  30.29 
 
 
341 aa  171  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0750922  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2043  hypothetical protein  29.67 
 
 
303 aa  162  5.0000000000000005e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1227  cation efflux protein  29.84 
 
 
319 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.873181 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1256  cation efflux protein  29.84 
 
 
319 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.274158  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4191  cation efflux protein  29.84 
 
 
319 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2041  hypothetical protein  28.62 
 
 
303 aa  160  2e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2718  cation efflux protein  30.62 
 
 
317 aa  159  6e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3985  cation efflux protein  29.18 
 
 
319 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.561091  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0558  cation efflux protein  29.63 
 
 
301 aa  154  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000438262  normal  0.603969 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0350  cation diffusion facilitator family transporter  28.72 
 
 
307 aa  153  4e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0122115 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0401  hypothetical protein  32.53 
 
 
317 aa  150  2e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.414063  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0225  cation diffusion facilitator family transporter  27.69 
 
 
370 aa  150  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0856806  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001476  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  34.04 
 
 
298 aa  149  5e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.320249  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2392  cation diffusion facilitator family transporter  28.04 
 
 
300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.546441 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1226  cation diffusion facilitator family transporter  28.52 
 
 
327 aa  146  4.0000000000000006e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3086  cation diffusion facilitator family transporter  29.32 
 
 
308 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0625445  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2938  cation diffusion facilitator family transporter  28.01 
 
 
308 aa  139  7e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.197596  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2130  cation efflux protein  26.23 
 
 
329 aa  138  8.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.052432  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05417  hypothetical protein  33.33 
 
 
297 aa  135  6.0000000000000005e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0337  cation efflux protein  32.02 
 
 
257 aa  132  6.999999999999999e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37230  cation diffusion facilitator family transporter  27.36 
 
 
320 aa  123  5e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1043  putative cation efflux pump  32.26 
 
 
227 aa  121  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2240  cation diffusion facilitator family transporter  23.84 
 
 
326 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.178806  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2193  cation diffusion facilitator family transporter  20.74 
 
 
323 aa  84.7  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1549  cation diffusion facilitator family transporter  23.89 
 
 
290 aa  70.5  0.00000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1668  cation diffusion facilitator family transporter  23.45 
 
 
291 aa  57  0.0000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0340924  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0847  cation efflux protein  19.52 
 
 
297 aa  56.6  0.0000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0634  cation efflux family protein  22.66 
 
 
314 aa  55.5  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0245  cation diffusion facilitator family transporter  23.05 
 
 
291 aa  55.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0960  cation diffusion facilitator family transporter  21.38 
 
 
291 aa  53.5  0.000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0970  cation diffusion facilitator family transporter  21.55 
 
 
390 aa  53.1  0.000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000558459  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04060  cation diffusion facilitator family transporter  24.03 
 
 
292 aa  52  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0044  cation diffusion facilitator family transporter  21.99 
 
 
381 aa  51.2  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2356  cation diffusion facilitator family transporter  22.1 
 
 
409 aa  50.4  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.868825  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2613  cation efflux family protein  24.4 
 
 
296 aa  49.3  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2000  cation diffusion facilitator family transporter  25.84 
 
 
285 aa  49.3  0.00008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.7679  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1774  cation diffusion facilitator family transporter  21.79 
 
 
293 aa  48.9  0.00009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000103729  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0820  Co/Zn/Cd cation transporter  20.3 
 
 
301 aa  48.9  0.00009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00173784  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1178  cation efflux family protein  24.11 
 
 
316 aa  47.8  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.349373  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0491  cation diffusion facilitator family transporter  20.57 
 
 
354 aa  48.1  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0566502 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0663  cation diffusion facilitator family transporter  21.69 
 
 
312 aa  46.2  0.0007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0132428  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1884  Co/Zn/Cd cation transporter  21.89 
 
 
307 aa  46.2  0.0007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2100  cation diffusion facilitator family transporter  22.18 
 
 
310 aa  45.8  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.70845  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1511  cation diffusion facilitator family transporter  21.89 
 
 
314 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00242761  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1615  cation transporter, permease component  19.34 
 
 
301 aa  44.3  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0151047  normal  0.0448748 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1741  cation diffusion facilitator family transporter  23.77 
 
 
307 aa  44.7  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00244826  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1752  cation diffusion facilitator family transporter  22.96 
 
 
301 aa  44.7  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00011926  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4529  cation efflux family protein  25.81 
 
 
297 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0737  cation efflux system protein  24.2 
 
 
317 aa  44.7  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.338743  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2804  cation diffusion facilitator family transporter  16.91 
 
 
303 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3126  cation diffusion facilitator family transporter  25.27 
 
 
297 aa  44.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1521  cation diffusion facilitator family transporter  22.18 
 
 
309 aa  43.9  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1127  cation diffusion facilitator family transporter  22.03 
 
 
323 aa  44.3  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1297  cation efflux family protein  23.32 
 
 
316 aa  44.3  0.003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0051  cation diffusion facilitator family transporter  21.83 
 
 
306 aa  43.9  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1040  cation diffusion facilitator family transporter  22.39 
 
 
308 aa  43.5  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1509  putative transport system permease protein  17.42 
 
 
314 aa  43.5  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073133  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0074  cation diffusion facilitator family transporter  20.82 
 
 
313 aa  43.1  0.006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1700  cation diffusion facilitator family transporter  21.47 
 
 
293 aa  42.7  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2446  cation diffusion facilitator family transporter  19.32 
 
 
304 aa  42.7  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.526861  normal  0.400869 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2951  zinc transporter ZitB  21.69 
 
 
312 aa  42.4  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.278393  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0051  cation diffusion facilitator family transporter  21.83 
 
 
306 aa  42.7  0.008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0710  cation diffusion facilitator family transporter  21.65 
 
 
476 aa  42.4  0.009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2343  cation efflux family protein  23.23 
 
 
293 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.412902  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2089  cation efflux protein  23.23 
 
 
296 aa  42.4  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.328738  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0706  cation efflux family protein  25.27 
 
 
297 aa  42.4  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1531  cation diffusion facilitator family transporter  19.47 
 
 
317 aa  42.4  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>