123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0401 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0401  hypothetical protein  100 
 
 		 317 aa  641    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.414063  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001476  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  57.38 
 
 		 298 aa  329  5.0000000000000004e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.320249  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05417  hypothetical protein  58.59 
 
 		 297 aa  316  3e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0337  cation efflux protein  44.98 
 
 		 257 aa  186  5e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2127  cation diffusion facilitator family transporter  32.53 
 
 		 299 aa  162  6e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1874  cation efflux family protein  31.68 
 
 		 268 aa  158  1e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0135582  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1043  putative cation efflux pump  41.75 
 
 		 227 aa  158  1e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2169  cation diffusion facilitator family transporter  29.83 
 
 		 305 aa  142  5e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.986609  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2043  hypothetical protein  25.59 
 
 		 303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2041  hypothetical protein  24.66 
 
 		 303 aa  130  3e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1226  cation diffusion facilitator family transporter  27.74 
 
 		 327 aa  124  2e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2392  cation diffusion facilitator family transporter  33.07 
 
 		 300 aa  120  3.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.546441 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1766  cation diffusion facilitator family transporter  28.18 
 
 		 312 aa  116  5e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000394316  hitchhiker  0.00956613 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1607  cation diffusion facilitator family transporter  28.18 
 
 		 312 aa  116  5e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0711616  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0558  cation efflux protein  28.74 
 
 		 301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000438262  normal  0.603969 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5197  cation efflux protein  28.76 
 
 		 341 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0750922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1502  cation diffusion facilitator family transporter  27.84 
 
 		 312 aa  113  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000419943  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4191  cation efflux protein  31.27 
 
 		 319 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3985  cation efflux protein  30.14 
 
 		 319 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.561091  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1227  cation efflux protein  30.42 
 
 		 319 aa  109  5e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.873181 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1256  cation efflux protein  30.42 
 
 		 319 aa  109  5e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.274158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0225  cation diffusion facilitator family transporter  32.47 
 
 		 370 aa  110  5e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0856806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0128  cation diffusion facilitator family transporter  28.33 
 
 		 303 aa  108  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00780296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3086  cation diffusion facilitator family transporter  31.46 
 
 		 308 aa  106  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0625445  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0350  cation diffusion facilitator family transporter  26.87 
 
 		 307 aa  105  8e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0122115 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2193  cation diffusion facilitator family transporter  28.42 
 
 		 323 aa  103  3e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2938  cation diffusion facilitator family transporter  28.46 
 
 		 308 aa  104  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.197596  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2130  cation efflux protein  28.95 
 
 		 329 aa  103  5e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.052432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2718  cation efflux protein  28.8 
 
 		 317 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2240  cation diffusion facilitator family transporter  27.95 
 
 		 326 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.178806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37230  cation diffusion facilitator family transporter  28.3 
 
 		 320 aa  88.2  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1615  cation transporter, permease component  20.65 
 
 		 301 aa  75.5  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0151047  normal  0.0448748 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1509  putative transport system permease protein  23.92 
 
 		 314 aa  62.8  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073133  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1549  cation diffusion facilitator family transporter  22.66 
 
 		 290 aa  62  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1026  cation diffusion facilitator family transporter  22.88 
 
 		 323 aa  60.8  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2256  cation diffusion facilitator family transporter  23.26 
 
 		 332 aa  60.1  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00134926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2446  cation diffusion facilitator family transporter  26.01 
 
 		 304 aa  56.2  0.0000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.526861  normal  0.400869 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0710  cation diffusion facilitator family transporter  20 
 
 		 476 aa  55.8  0.0000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0245  cation diffusion facilitator family transporter  21.4 
 
 		 291 aa  55.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2613  cation efflux family protein  25.31 
 
 		 296 aa  54.7  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0589  cation diffusion facilitator family transporter  23.4 
 
 		 285 aa  54.7  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000134664  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0974  cation diffusion facilitator family transporter  24.31 
 
 		 466 aa  54.7  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  20.93 
 
 		 311 aa  54.7  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  21.32 
 
 		 311 aa  55.1  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3895  cation diffusion facilitator family transporter  24.79 
 
 		 307 aa  53.1  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.640647  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3126  cation diffusion facilitator family transporter  25.09 
 
 		 297 aa  53.1  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0858  cation efflux protein  22.63 
 
 		 299 aa  52.8  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2245  cation diffusion facilitator family transporter  22.69 
 
 		 483 aa  51.2  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1752  cation diffusion facilitator family transporter  27.01 
 
 		 301 aa  51.6  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00011926  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2530  cation diffusion facilitator family transporter  21.92 
 
 		 460 aa  51.6  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1668  cation diffusion facilitator family transporter  22.34 
 
 		 291 aa  50.4  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0340924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2062  hypothetical protein  22.12 
 
 		 305 aa  50.8  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00314891 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1049  putative Co/Zn/Cd cation transporter  21.25 
 
 		 302 aa  51.2  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4305  cation efflux family protein  25 
 
 		 298 aa  50.1  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.901101  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4154  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  25 
 
 		 298 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4640  cation efflux family protein  25 
 
 		 298 aa  50.1  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4529  cation efflux family protein  25 
 
 		 297 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4143  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  25 
 
 		 297 aa  50.1  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4490  cation efflux family protein  25 
 
 		 297 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000013867 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0663  cation diffusion facilitator family transporter  22.98 
 
 		 312 aa  50.1  0.00005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0132428  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0339  cation diffusion facilitator family transporter  22.32 
 
 		 293 aa  49.7  0.00006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000143188  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3075  cation diffusion facilitator family transporter  20 
 
 		 304 aa  49.3  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1992  cation diffusion facilitator family transporter  29.73 
 
 		 389 aa  49.3  0.00009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0167  cation diffusion facilitator family transporter  27.15 
 
 		 305 aa  49.3  0.00009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1801  cation efflux family protein  23.08 
 
 		 376 aa  48.9  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0942158  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1450  cation diffusion facilitator family transporter  23.39 
 
 		 460 aa  48.9  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.25137  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0706  cation efflux family protein  24.62 
 
 		 297 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5864  cation diffusion facilitator family transporter  24.91 
 
 		 300 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.499716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1202  cation diffusion facilitator family transporter  28.19 
 
 		 488 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0622136  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2239  cation diffusion facilitator family transporter  23.02 
 
 		 305 aa  48.5  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.482091  normal  0.467458 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1123  ferrous-iron efflux pump FieF  20.41 
 
 		 289 aa  48.9  0.0001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00791465  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04060  cation diffusion facilitator family transporter  22 
 
 		 292 aa  48.9  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1954  cation diffusion facilitator family transporter  21.23 
 
 		 328 aa  48.5  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0806665 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2946  cation efflux protein  22.71 
 
 		 327 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457445 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0074  cation diffusion facilitator family transporter  23.86 
 
 		 313 aa  47.8  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4544  cation efflux family protein  24.24 
 
 		 297 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2356  cation diffusion facilitator family transporter  20 
 
 		 409 aa  47.8  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.868825  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1722  cation diffusion facilitator family transporter  23.91 
 
 		 299 aa  47.8  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2239  cation diffusion facilitator family transporter  23.99 
 
 		 302 aa  47  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0407082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1774  cation diffusion facilitator family transporter  23.73 
 
 		 293 aa  47  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000103729  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1582  cation diffusion facilitator family transporter  20.48 
 
 		 299 aa  46.6  0.0005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0332  cation diffusion facilitator family transporter  30 
 
 		 450 aa  47  0.0005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4257  cation diffusion facilitator family transporter  25.48 
 
 		 297 aa  47  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3435  cation diffusion facilitator family transporter  24.12 
 
 		 478 aa  46.2  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0253813 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2250  cation diffusion facilitator family transporter  19.07 
 
 		 294 aa  46.6  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000133165  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4494  cation efflux family protein  24.24 
 
 		 298 aa  46.2  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0858  cation efflux system protein  22.64 
 
 		 331 aa  46.2  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0960  cation diffusion facilitator family transporter  21.28 
 
 		 291 aa  46.2  0.0007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3261  cation efflux system protein  22 
 
 		 305 aa  46.2  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826048  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0198  cation diffusion facilitator family transporter  22.16 
 
 		 474 aa  45.8  0.0009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.859565 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2889  cation diffusion facilitator family transporter  21.88 
 
 		 388 aa  45.4  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000320508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  25.78 
 
 		 299 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3626  cation diffusion facilitator family transporter  20.83 
 
 		 321 aa  45.4  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.89177 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3964  cation diffusion facilitator family transporter  20.83 
 
 		 321 aa  45.4  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0559635  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0634  cation efflux family protein  25 
 
 		 314 aa  44.7  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1256  cation diffusion facilitator family transporter  22.83 
 
 		 303 aa  44.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.513971  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1683  cation diffusion facilitator family transporter  21.03 
 
 		 308 aa  44.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000676071  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0496  cation diffusion facilitator family transporter  23.05 
 
 		 318 aa  45.1  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.920568  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0745  cation diffusion facilitator family transporter  22.61 
 
 		 460 aa  45.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0491  cation diffusion facilitator family transporter  21.86 
 
 		 354 aa  44.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0566502 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>