More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0167 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0167  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 
305 aa  606  9.999999999999999e-173  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1752  cation diffusion facilitator family transporter  45.77 
 
 
301 aa  249  4e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00011926  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1011  cation diffusion facilitator family transporter  40.34 
 
 
289 aa  236  4e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1437  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  41.1 
 
 
303 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.929913 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11850  cation diffusion facilitator family transporter  41.11 
 
 
312 aa  227  2e-58  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3105  cation diffusion facilitator family transporter  38.54 
 
 
306 aa  170  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3015  cation diffusion facilitator family transporter  38.54 
 
 
306 aa  170  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.68136  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3764  cation efflux protein  35.4 
 
 
389 aa  168  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0837533 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1040  cation diffusion facilitator family transporter  36.62 
 
 
308 aa  166  4e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1002  cation efflux protein  39.5 
 
 
300 aa  165  9e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000361576 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3647  cation diffusion facilitator family transporter  33.11 
 
 
395 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3406  cation diffusion facilitator family transporter  34.63 
 
 
337 aa  162  6e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4538  cation diffusion facilitator family transporter  35.4 
 
 
307 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1554  cation diffusion facilitator family transporter  38.46 
 
 
301 aa  160  2e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.199907  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0191  cation diffusion facilitator family transporter  34.74 
 
 
384 aa  159  5e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.114126  hitchhiker  0.0000000345826 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3385  cation efflux protein  34.74 
 
 
385 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0264  cation diffusion facilitator family transporter  34.39 
 
 
385 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.56079 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0282  cation diffusion facilitator family transporter  34.39 
 
 
385 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.369403  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2824  cation diffusion facilitator family transporter  34.04 
 
 
385 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.74147  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2098  cation diffusion facilitator family transporter  32.16 
 
 
285 aa  152  5e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0491  cation diffusion facilitator family transporter  29.27 
 
 
354 aa  152  5.9999999999999996e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0566502 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0210  cation diffusion facilitator family transporter  33.57 
 
 
404 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.904407 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0196  cation diffusion facilitator family transporter  33.8 
 
 
404 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.831911  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0553  cation diffusion facilitator family transporter  33.33 
 
 
388 aa  150  2e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0399  cation diffusion facilitator family transporter  32.29 
 
 
418 aa  150  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.329701  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2576  cation diffusion facilitator family transporter  33.45 
 
 
423 aa  149  6e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00102277 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1450  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  32.73 
 
 
378 aa  147  1.0000000000000001e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.59644  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1517  cation diffusion facilitator family transporter  32.73 
 
 
378 aa  147  1.0000000000000001e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2889  cation diffusion facilitator family transporter  33.1 
 
 
388 aa  148  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000320508  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1989  cation diffusion facilitator family transporter  36.26 
 
 
303 aa  147  3e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.589418 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0117  cation diffusion facilitator family transporter  32.37 
 
 
400 aa  145  6e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  32.48 
 
 
311 aa  145  8.000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1036  cation diffusion facilitator family transporter  29.59 
 
 
387 aa  145  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.246594  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3150  cation diffusion facilitator family transporter  30.34 
 
 
401 aa  145  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2526  cation diffusion facilitator family transporter  34.25 
 
 
307 aa  143  4e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0324472 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0577  cation diffusion facilitator family transporter  35.09 
 
 
308 aa  142  5e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.215169 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0496  cation diffusion facilitator family transporter  30.59 
 
 
318 aa  142  6e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.920568  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3825  cation efflux family protein  33.21 
 
 
396 aa  142  7e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1549  cation diffusion facilitator family transporter  29.58 
 
 
290 aa  142  7e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0941  cation efflux protein  34.15 
 
 
308 aa  142  7e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.754529  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3403  cation efflux family protein  33.21 
 
 
396 aa  142  9e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.843377  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2906  cation efflux family protein  33.21 
 
 
396 aa  142  9e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.313592  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1635  cation efflux family protein  33.21 
 
 
396 aa  142  9e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.504056  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2966  cation efflux family protein  33.21 
 
 
396 aa  142  9e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3907  cation efflux family protein  33.21 
 
 
396 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0047  cation efflux family protein  33.21 
 
 
396 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1587  cation diffusion facilitator family transporter  34.01 
 
 
307 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.697729  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3154  cation efflux family protein  32.87 
 
 
418 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1992  cation diffusion facilitator family transporter  34.27 
 
 
389 aa  140  3e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4320  cation (Co++/Zn++/Cd++) efflux protein  32.17 
 
 
414 aa  140  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1712  cation diffusion facilitator family transporter  32.46 
 
 
306 aa  139  4.999999999999999e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00125134  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0589  cation diffusion facilitator family transporter  31.73 
 
 
285 aa  139  4.999999999999999e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000134664  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3245  cation efflux protein  33.1 
 
 
309 aa  139  6e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1668  cation diffusion facilitator family transporter  28.72 
 
 
291 aa  139  6e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0340924  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0069  cation efflux family protein  33.79 
 
 
318 aa  139  6e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1531  cation diffusion facilitator family transporter  29 
 
 
317 aa  139  6e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  32.12 
 
 
311 aa  139  7e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0938  cation diffusion facilitator family transporter  31.56 
 
 
387 aa  138  1e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0791  cation diffusion facilitator family transporter  30.56 
 
 
312 aa  137  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0570  cation diffusion facilitator family transporter  30.47 
 
 
298 aa  137  2e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.712384  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1675  cation diffusion facilitator family transporter  34.01 
 
 
307 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.282896  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2941  cation diffusion facilitator family transporter  34.01 
 
 
307 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0245  cation diffusion facilitator family transporter  28.01 
 
 
291 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0858  cation efflux system protein  32.29 
 
 
331 aa  136  4e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6231  cation diffusion facilitator family transporter  34.29 
 
 
299 aa  136  5e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554838  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0331  cation efflux family protein  32.85 
 
 
311 aa  135  8e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5170  cation efflux protein  33.8 
 
 
303 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2356  cation diffusion facilitator family transporter  30.94 
 
 
409 aa  133  3e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.868825  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0258  cation diffusion facilitator family transporter  32.1 
 
 
296 aa  133  3e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0238617  decreased coverage  0.0000137847 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0263  cation diffusion facilitator family transporter  32.1 
 
 
296 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000665998  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1509  putative transport system permease protein  31.29 
 
 
314 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073133  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0263  cation diffusion facilitator family transporter  32.1 
 
 
296 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0256  cation diffusion facilitator family transporter  32.47 
 
 
290 aa  132  5e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.015822  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04060  cation diffusion facilitator family transporter  27.82 
 
 
292 aa  132  6e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2100  cation diffusion facilitator family transporter  32.27 
 
 
310 aa  132  6e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.70845  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0332  cation diffusion facilitator family transporter  33.09 
 
 
450 aa  132  7.999999999999999e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12062  hypothetical protein  34.15 
 
 
332 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4982  cation diffusion facilitator family transporter  32.88 
 
 
307 aa  132  7.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0279964 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2017  hypothetical protein  28.37 
 
 
380 aa  131  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2012  hypothetical protein  28.01 
 
 
380 aa  131  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0974  cation diffusion facilitator family transporter  32.31 
 
 
466 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0960  cation diffusion facilitator family transporter  28.37 
 
 
291 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2239  cation diffusion facilitator family transporter  31.72 
 
 
302 aa  131  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0407082  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1731  cation diffusion facilitator family transporter  33.7 
 
 
315 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.560975  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1489  cation diffusion facilitator family transporter  37.1 
 
 
314 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1487  cation diffusion facilitator family transporter  37.1 
 
 
340 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1511  cation diffusion facilitator family transporter  37.1 
 
 
340 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0974  cation diffusion facilitator family transporter  30.39 
 
 
320 aa  128  9.000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0465  cation efflux family protein  31.08 
 
 
391 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.326406  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0625  cation diffusion facilitator family transporter  31.08 
 
 
391 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1127  cation diffusion facilitator family transporter  29.58 
 
 
323 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3895  cation diffusion facilitator family transporter  32.36 
 
 
307 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.640647  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3258  cation diffusion facilitator family transporter  34.27 
 
 
390 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0281  cation diffusion facilitator family transporter  32.62 
 
 
289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000230949  unclonable  0.000000000100578 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3430  cation efflux family protein  31.34 
 
 
289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.038315  normal  0.371724 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1202  cation diffusion facilitator family transporter  31.63 
 
 
488 aa  127  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0622136  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2446  cation diffusion facilitator family transporter  29.73 
 
 
304 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.526861  normal  0.400869 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4808  ferrous iron efflux protein F  32.7 
 
 
300 aa  126  5e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2294  cation diffusion facilitator family transporter  29.41 
 
 
306 aa  126  5e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38282  normal  0.177312 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1848  cation diffusion facilitator family transporter  33.09 
 
 
460 aa  126  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.762115 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>