More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0745 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0846  cation diffusion facilitator family transporter  73.36 
 
 		 459 aa  674    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0034385  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0745  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 460 aa  927    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0550  cation efflux protein  66.96 
 
 		 459 aa  587  1e-166  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.247369 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0198  cation diffusion facilitator family transporter  37.28 
 
 		 474 aa  331  2e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.859565 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2530  cation diffusion facilitator family transporter  39.43 
 
 		 460 aa  326  6e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2245  cation diffusion facilitator family transporter  39.35 
 
 		 483 aa  323  3e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1450  cation diffusion facilitator family transporter  36.81 
 
 		 460 aa  300  4e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.25137  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3435  cation diffusion facilitator family transporter  36.22 
 
 		 478 aa  296  5e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0253813 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2019  cation diffusion facilitator family transporter  36.59 
 
 		 459 aa  291  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.40781 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1848  cation diffusion facilitator family transporter  36.36 
 
 		 460 aa  288  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.762115 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1379  cation diffusion facilitator family transporter  34.74 
 
 		 481 aa  287  2.9999999999999996e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.892961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0853  cation diffusion facilitator family transporter  34.42 
 
 		 479 aa  282  8.000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2149  cation diffusion facilitator family transporter  35.99 
 
 		 460 aa  280  3e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3095  putative cation-efflux pump  34.72 
 
 		 462 aa  274  3e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1201  cation efflux protein  36.11 
 
 		 460 aa  273  7e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0710  cation diffusion facilitator family transporter  34.66 
 
 		 476 aa  266  8e-70  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0393  cation diffusion facilitator family transporter  36.82 
 
 		 483 aa  259  7e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.38697 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0974  cation diffusion facilitator family transporter  31.45 
 
 		 466 aa  247  3e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1202  cation diffusion facilitator family transporter  32.42 
 
 		 488 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0622136  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  38.95 
 
 		 311 aa  191  2e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  38.6 
 
 		 311 aa  185  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3895  cation diffusion facilitator family transporter  34.69 
 
 		 307 aa  171  3e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.640647  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0331  cation efflux family protein  37.59 
 
 		 311 aa  169  7e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2400  cation diffusion facilitator family transporter  35.15 
 
 		 307 aa  169  1e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1683  cation diffusion facilitator family transporter  34.98 
 
 		 308 aa  166  5.9999999999999996e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000676071  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1684  cation diffusion facilitator family transporter  26.53 
 
 		 450 aa  156  8e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.000631579  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0589  cation diffusion facilitator family transporter  33.81 
 
 		 285 aa  155  2e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000134664  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1509  putative transport system permease protein  33.8 
 
 		 314 aa  155  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073133  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2574  cation diffusion facilitator family transporter  34.92 
 
 		 310 aa  152  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1954  cation diffusion facilitator family transporter  32.88 
 
 		 328 aa  151  3e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0806665 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1521  cation diffusion facilitator family transporter  35.06 
 
 		 309 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0724  cation diffusion facilitator family transporter  33.22 
 
 		 315 aa  146  7.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152803  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3300  iron and zinc efflux system protein  30.2 
 
 		 318 aa  142  9.999999999999999e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.831799  normal  0.0946092 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0332  cation diffusion facilitator family transporter  25.22 
 
 		 450 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0526  cation diffusion facilitator family transporter  34.03 
 
 		 327 aa  141  3e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0791  cation diffusion facilitator family transporter  30.58 
 
 		 312 aa  140  6e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1127  cation diffusion facilitator family transporter  34.56 
 
 		 323 aa  139  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4333  cation efflux protein  28.94 
 
 		 297 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1177  cation diffusion facilitator family transporter  32.01 
 
 		 308 aa  130  4.0000000000000003e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2025  cation diffusion facilitator family transporter  30.88 
 
 		 313 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0165078  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1113  hypothetical protein  31.14 
 
 		 307 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.416676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2262  ferrous iron efflux protein F  29.39 
 
 		 302 aa  128  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000896639  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0446  cation diffusion facilitator family transporter  32.65 
 
 		 328 aa  128  2.0000000000000002e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.48861  normal  0.265047 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1171  cation efflux family protein  28.62 
 
 		 295 aa  128  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1026  cation efflux family protein  27.88 
 
 		 295 aa  127  5e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0972  cation efflux family protein  27.88 
 
 		 295 aa  127  5e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1360  cation diffusion facilitator family transporter  32.86 
 
 		 396 aa  125  1e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3813  ferrous iron efflux protein F  30.04 
 
 		 298 aa  125  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.70191  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4020  ferrous iron efflux protein F  29.41 
 
 		 300 aa  126  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0470  cation diffusion facilitator family transporter  31.27 
 
 		 337 aa  124  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0457303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2446  cation diffusion facilitator family transporter  29.84 
 
 		 304 aa  124  3e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.526861  normal  0.400869 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3741  cation diffusion facilitator family transporter  28.52 
 
 		 292 aa  124  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4774  cation diffusion facilitator family transporter  29.39 
 
 		 290 aa  124  4e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00437993 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2239  cation diffusion facilitator family transporter  30.24 
 
 		 305 aa  123  6e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.482091  normal  0.467458 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1439  cation efflux protein  28.26 
 
 		 293 aa  123  6e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0109958  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00146  ferrous iron efflux protein F  26.55 
 
 		 302 aa  123  6e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4650  cation diffusion facilitator family transporter  29.39 
 
 		 290 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.188299 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4790  cation efflux family protein  25.87 
 
 		 297 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1582  cation diffusion facilitator family transporter  28.73 
 
 		 299 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0369  cation diffusion facilitator family transporter  27.54 
 
 		 293 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000868845  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0125  cation diffusion facilitator family transporter  30.22 
 
 		 317 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0195839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4394  ferrous iron efflux protein F  28.57 
 
 		 300 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0137  ferrous iron efflux protein F  28.52 
 
 		 300 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4355  ferrous iron efflux protein F  28.57 
 
 		 300 aa  120  7e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.363052 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2250  cation diffusion facilitator family transporter  32.81 
 
 		 294 aa  119  9e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000133165  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03800  ferrous iron efflux protein F  28.21 
 
 		 300 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.769582  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4070  cation diffusion facilitator family transporter  28.21 
 
 		 300 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5369  ferrous iron efflux protein F  28.21 
 
 		 300 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03749  hypothetical protein  28.21 
 
 		 300 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.859371  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4448  ferrous iron efflux protein F  28.21 
 
 		 300 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0618  cation diffusion facilitator family transporter  25.87 
 
 		 411 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000865863  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4753  cation diffusion facilitator family transporter  29.14 
 
 		 296 aa  119  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.36054  decreased coverage  0.00983844 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4103  ferrous iron efflux protein F  28.21 
 
 		 300 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4145  ferrous iron efflux protein F  28.21 
 
 		 300 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4947  cation diffusion facilitator family transporter  28.67 
 
 		 312 aa  118  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.723787  normal  0.395043 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002221  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  26.55 
 
 		 302 aa  119  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000518265  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4475  cation efflux family protein  28.07 
 
 		 296 aa  117  3e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4307  ferrous iron efflux protein F  27.84 
 
 		 300 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1146  putative transporter  27.01 
 
 		 298 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1215  cation diffusion facilitator family transporter  30.07 
 
 		 302 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.322219 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3931  cation diffusion facilitator family transporter  26.64 
 
 		 289 aa  117  5e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146752  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0167  cation diffusion facilitator family transporter  28.89 
 
 		 305 aa  117  5e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0646  cation diffusion facilitator family transporter  27.7 
 
 		 289 aa  117  5e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.186266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0314  cation diffusion facilitator family transporter  27.01 
 
 		 289 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000499164  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0139  ferrous iron efflux protein F  27.4 
 
 		 300 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.205512  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4392  ferrous iron efflux protein F  27.84 
 
 		 300 aa  116  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4459  ferrous iron efflux protein F  27.84 
 
 		 300 aa  116  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.709567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4278  ferrous iron efflux protein F  27.84 
 
 		 300 aa  116  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.546202  normal  0.887398 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4390  ferrous iron efflux protein F  27.84 
 
 		 300 aa  116  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.228028 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12610  putative transporter  27.01 
 
 		 298 aa  116  8.999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.686969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0241  cation diffusion facilitator family transporter  30.77 
 
 		 310 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000961232  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0044  cation diffusion facilitator family transporter  27.38 
 
 		 381 aa  115  1.0000000000000001e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0084  pantothenate metabolism flavoprotein  26.91 
 
 		 311 aa  115  2.0000000000000002e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00694286  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3261  cation efflux system protein  28.85 
 
 		 305 aa  115  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826048  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3075  cation diffusion facilitator family transporter  28.21 
 
 		 304 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0087  ferrous iron efflux protein F  28.41 
 
 		 300 aa  114  3e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4127  ferrous iron efflux protein F  28.41 
 
 		 300 aa  114  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1891  cation diffusion facilitator family transporter  27.46 
 
 		 314 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0381749 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0254  cation diffusion facilitator family transporter  27.74 
 
 		 297 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00100286  hitchhiker  0.000434478 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2000  cation diffusion facilitator family transporter  33.6 
 
 		 285 aa  114  5e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.7679  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>