More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0125 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_0125  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 
317 aa  630  1e-180  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0195839  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1891  cation diffusion facilitator family transporter  75.39 
 
 
314 aa  464  9.999999999999999e-131  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0381749 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2239  cation diffusion facilitator family transporter  69.93 
 
 
305 aa  439  9.999999999999999e-123  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.482091  normal  0.467458 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1215  cation diffusion facilitator family transporter  69.67 
 
 
302 aa  399  9.999999999999999e-111  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.322219 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2574  cation diffusion facilitator family transporter  36.6 
 
 
310 aa  149  8e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0393  cation diffusion facilitator family transporter  36.14 
 
 
483 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.38697 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0710  cation diffusion facilitator family transporter  31.4 
 
 
476 aa  139  6e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0974  cation diffusion facilitator family transporter  32.66 
 
 
466 aa  139  6e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1379  cation diffusion facilitator family transporter  31.21 
 
 
481 aa  139  7e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.892961  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2245  cation diffusion facilitator family transporter  34.72 
 
 
483 aa  137  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1202  cation diffusion facilitator family transporter  35.71 
 
 
488 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0622136  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  30.84 
 
 
311 aa  134  3e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  30.57 
 
 
311 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0589  cation diffusion facilitator family transporter  29.01 
 
 
285 aa  127  3e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000134664  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1509  putative transport system permease protein  29.21 
 
 
314 aa  125  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073133  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0846  cation diffusion facilitator family transporter  30.96 
 
 
459 aa  125  1e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0034385  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0331  cation efflux family protein  30.5 
 
 
311 aa  124  2e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3476  putative cation efflux family protein, CzcD-like protein  29.49 
 
 
296 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606573  normal  0.771262 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2262  ferrous iron efflux protein F  29.18 
 
 
302 aa  124  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000896639  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1127  cation diffusion facilitator family transporter  31.76 
 
 
323 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1684  cation diffusion facilitator family transporter  33.69 
 
 
450 aa  123  3e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.000631579  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0332  cation diffusion facilitator family transporter  28.77 
 
 
450 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2400  cation diffusion facilitator family transporter  30.43 
 
 
307 aa  122  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0745  cation diffusion facilitator family transporter  30.22 
 
 
460 aa  121  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00146  ferrous iron efflux protein F  30.36 
 
 
302 aa  120  3.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3813  ferrous iron efflux protein F  31.54 
 
 
298 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.70191  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0050  cation diffusion facilitator family transporter  32.43 
 
 
317 aa  119  4.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.374526 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4020  ferrous iron efflux protein F  30.5 
 
 
300 aa  119  9e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0724  cation diffusion facilitator family transporter  30.28 
 
 
315 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152803  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3095  putative cation-efflux pump  33.2 
 
 
462 aa  117  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3290  cation diffusion facilitator family transporter  30.9 
 
 
295 aa  116  5e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4390  ferrous iron efflux protein F  31.65 
 
 
300 aa  116  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.228028 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4459  ferrous iron efflux protein F  31.65 
 
 
300 aa  116  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.709567  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4392  ferrous iron efflux protein F  31.65 
 
 
300 aa  116  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123338  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4307  ferrous iron efflux protein F  31.65 
 
 
300 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4355  ferrous iron efflux protein F  31.65 
 
 
300 aa  115  7.999999999999999e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.363052 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03800  ferrous iron efflux protein F  31.29 
 
 
300 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.769582  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4070  cation diffusion facilitator family transporter  31.29 
 
 
300 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03749  hypothetical protein  31.29 
 
 
300 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.859371  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3065  cation diffusion facilitator family transporter  30.56 
 
 
295 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.686004  normal  0.910257 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4145  ferrous iron efflux protein F  31.29 
 
 
300 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4448  ferrous iron efflux protein F  31.29 
 
 
300 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4103  ferrous iron efflux protein F  31.29 
 
 
300 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2530  cation diffusion facilitator family transporter  30.11 
 
 
460 aa  115  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4808  ferrous iron efflux protein F  31.29 
 
 
300 aa  114  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2468  cation diffusion facilitator family transporter  30.61 
 
 
295 aa  115  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.376521 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5369  ferrous iron efflux protein F  31.29 
 
 
300 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4057  ferrous iron efflux protein F  30.34 
 
 
300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.3408  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0484  cation efflux protein  30.38 
 
 
298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4278  ferrous iron efflux protein F  31.29 
 
 
300 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.546202  normal  0.887398 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4394  ferrous iron efflux protein F  30.94 
 
 
300 aa  113  5e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3300  iron and zinc efflux system protein  26.88 
 
 
318 aa  113  5e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.831799  normal  0.0946092 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0737  cation efflux system protein  30.03 
 
 
317 aa  112  6e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.338743  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2100  cation diffusion facilitator family transporter  30.77 
 
 
310 aa  112  7.000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.70845  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002221  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  28.48 
 
 
302 aa  112  8.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000518265  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0087  ferrous iron efflux protein F  32.37 
 
 
300 aa  112  9e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4127  ferrous iron efflux protein F  32.37 
 
 
300 aa  112  9e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0258  cation diffusion facilitator family transporter  29.86 
 
 
296 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0238617  decreased coverage  0.0000137847 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3895  cation diffusion facilitator family transporter  29 
 
 
307 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.640647  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1774  cation diffusion facilitator family transporter  29.45 
 
 
293 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000103729  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1450  cation diffusion facilitator family transporter  30.6 
 
 
460 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.25137  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0088  ferrous iron efflux protein F  32.01 
 
 
300 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0263  cation diffusion facilitator family transporter  29.86 
 
 
296 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0130  cation diffusion facilitator family transporter  30.1 
 
 
292 aa  110  3e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.120546  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2795  ferrous iron efflux protein F  30.82 
 
 
301 aa  110  5e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00102947  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0139  ferrous iron efflux protein F  29.21 
 
 
300 aa  109  6e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.205512  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0369  cation diffusion facilitator family transporter  28.18 
 
 
293 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000868845  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3264  cation diffusion facilitator family transporter  30.21 
 
 
295 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0256  cation diffusion facilitator family transporter  29.45 
 
 
290 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.015822  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4790  cation efflux family protein  27.97 
 
 
297 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0263  cation diffusion facilitator family transporter  29.6 
 
 
296 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000665998  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2198  cation diffusion facilitator family transporter  29.55 
 
 
293 aa  108  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.776966  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1794  cation diffusion facilitator family transporter  29.15 
 
 
299 aa  108  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0137  ferrous iron efflux protein F  28.87 
 
 
300 aa  108  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1788  cation diffusion facilitator family transporter  30.85 
 
 
299 aa  107  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0431575 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5667  cation diffusion facilitator family transporter  32.43 
 
 
328 aa  106  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0791  cation diffusion facilitator family transporter  28.52 
 
 
312 aa  107  4e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2025  cation diffusion facilitator family transporter  29.55 
 
 
313 aa  106  4e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0165078  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4333  cation efflux protein  28.73 
 
 
297 aa  106  5e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4774  cation diffusion facilitator family transporter  30.21 
 
 
290 aa  106  6e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00437993 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2428  cation diffusion facilitator family transporter  30.14 
 
 
299 aa  106  6e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000439977  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3075  cation diffusion facilitator family transporter  28.97 
 
 
304 aa  105  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553073  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0051  cation diffusion facilitator family transporter  27.4 
 
 
306 aa  105  1e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2239  cation diffusion facilitator family transporter  29.33 
 
 
302 aa  105  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0407082  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1536  cation diffusion facilitator family transporter  30 
 
 
295 aa  104  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.503443  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0463  cation efflux transporter  29.73 
 
 
295 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.632211  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3435  cation diffusion facilitator family transporter  29.75 
 
 
478 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0253813 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2149  cation diffusion facilitator family transporter  31.35 
 
 
460 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1146  putative transporter  29.35 
 
 
298 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2019  cation diffusion facilitator family transporter  29.45 
 
 
459 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.40781 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0023  cation diffusion facilitator family transporter  31.33 
 
 
295 aa  103  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.556428 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0281  cation diffusion facilitator family transporter  27.94 
 
 
289 aa  103  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000230949  unclonable  0.000000000100578 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0051  cation diffusion facilitator family transporter  27.4 
 
 
306 aa  103  3e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3931  cation diffusion facilitator family transporter  26.55 
 
 
289 aa  103  4e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146752  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0646  cation diffusion facilitator family transporter  28.41 
 
 
289 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.186266  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1731  cation diffusion facilitator family transporter  27.88 
 
 
315 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.560975  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04060  cation diffusion facilitator family transporter  29.35 
 
 
292 aa  103  4e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0634  cation efflux family protein  26.8 
 
 
314 aa  103  5e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2628  cation efflux protein  25.74 
 
 
325 aa  103  5e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.620911  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12610  putative transporter  29.35 
 
 
298 aa  102  6e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.686969  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>