More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0526 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0526  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 
327 aa  656    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1954  cation diffusion facilitator family transporter  57.53 
 
 
328 aa  343  2e-93  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0806665 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0446  cation diffusion facilitator family transporter  56.39 
 
 
328 aa  337  9.999999999999999e-92  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.48861  normal  0.265047 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1113  hypothetical protein  55.15 
 
 
307 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.416676  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3895  cation diffusion facilitator family transporter  47.25 
 
 
307 aa  297  2e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.640647  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1127  cation diffusion facilitator family transporter  46.44 
 
 
323 aa  285  5.999999999999999e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1521  cation diffusion facilitator family transporter  47.13 
 
 
309 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  47.6 
 
 
311 aa  279  4e-74  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  45.58 
 
 
311 aa  271  1e-71  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1683  cation diffusion facilitator family transporter  48.5 
 
 
308 aa  269  5e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000676071  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0724  cation diffusion facilitator family transporter  49.35 
 
 
315 aa  268  8.999999999999999e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152803  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0331  cation efflux family protein  46.94 
 
 
311 aa  259  5.0000000000000005e-68  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0589  cation diffusion facilitator family transporter  47.7 
 
 
285 aa  257  2e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000134664  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2400  cation diffusion facilitator family transporter  45.82 
 
 
307 aa  255  7e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2574  cation diffusion facilitator family transporter  46.74 
 
 
310 aa  224  2e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2000  cation diffusion facilitator family transporter  44.91 
 
 
285 aa  214  1.9999999999999998e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.7679  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2073  cation diffusion facilitator family transporter  40.28 
 
 
308 aa  202  8e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.981542 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1509  putative transport system permease protein  34.64 
 
 
314 aa  200  3e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073133  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1483  cation diffusion facilitator family transporter  40.43 
 
 
308 aa  200  3e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1731  cation diffusion facilitator family transporter  36.33 
 
 
315 aa  189  7e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.560975  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2025  cation diffusion facilitator family transporter  38.87 
 
 
313 aa  188  1e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0165078  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1114  cation efflux protein  36.15 
 
 
305 aa  183  3e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3261  cation efflux system protein  38.66 
 
 
305 aa  183  3e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826048  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0597  cation diffusion facilitator family transporter  36.69 
 
 
302 aa  179  7e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1021  cation diffusion facilitator family transporter  37.28 
 
 
346 aa  179  8e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1043  cation efflux protein  36.11 
 
 
320 aa  177  2e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1770  cation diffusion facilitator family transporter  36.55 
 
 
315 aa  176  4e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1850  cation diffusion facilitator family transporter  36.55 
 
 
315 aa  176  4e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2446  cation diffusion facilitator family transporter  36.19 
 
 
304 aa  176  5e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.526861  normal  0.400869 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0980  cation diffusion facilitator family transporter  33.68 
 
 
305 aa  176  6e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3476  putative cation efflux family protein, CzcD-like protein  36.11 
 
 
296 aa  172  6.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606573  normal  0.771262 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1439  cation efflux protein  35.02 
 
 
293 aa  171  2e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0109958  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2239  cation diffusion facilitator family transporter  38.11 
 
 
302 aa  171  2e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0407082  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0846  cation diffusion facilitator family transporter  36.94 
 
 
459 aa  170  2e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0034385  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5864  cation diffusion facilitator family transporter  35.4 
 
 
300 aa  170  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.499716  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2294  cation diffusion facilitator family transporter  38.13 
 
 
306 aa  170  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38282  normal  0.177312 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1801  cation efflux family protein  37.79 
 
 
376 aa  170  4e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0942158  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3075  cation diffusion facilitator family transporter  34.4 
 
 
304 aa  169  6e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553073  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0225  cation diffusion facilitator family transporter  36.75 
 
 
312 aa  168  1e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0023  cation diffusion facilitator family transporter  37.07 
 
 
295 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.556428 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2106  cation diffusion facilitator family transporter  37.59 
 
 
315 aa  166  5e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0050  cation diffusion facilitator family transporter  38.72 
 
 
317 aa  161  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.374526 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3290  cation diffusion facilitator family transporter  35.82 
 
 
295 aa  160  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2530  cation diffusion facilitator family transporter  35.76 
 
 
460 aa  161  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1178  cation diffusion facilitator family transporter  38.4 
 
 
300 aa  160  2e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00185198  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3065  cation diffusion facilitator family transporter  35.82 
 
 
295 aa  160  3e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.686004  normal  0.910257 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2871  cation efflux protein  33.77 
 
 
317 aa  159  5e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2873  cation diffusion facilitator family transporter  37.17 
 
 
314 aa  159  6e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1598  cation diffusion facilitator family transporter  41.25 
 
 
302 aa  158  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1568  cation efflux family protein  41.63 
 
 
302 aa  157  2e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1514  cation efflux family protein  41.63 
 
 
302 aa  157  2e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5667  cation diffusion facilitator family transporter  35.84 
 
 
328 aa  157  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07750  cation diffusion facilitator family transporter  30.84 
 
 
330 aa  157  2e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2809  cation diffusion facilitator family transporter  37.6 
 
 
304 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.252612  normal  0.010552 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2468  cation diffusion facilitator family transporter  35.82 
 
 
295 aa  156  6e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.376521 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0867  cation diffusion facilitator family transporter  38.91 
 
 
295 aa  155  7e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.851238 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0710  cation diffusion facilitator family transporter  33 
 
 
476 aa  155  8e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0745  cation diffusion facilitator family transporter  34.03 
 
 
460 aa  155  9e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0974  cation diffusion facilitator family transporter  35.05 
 
 
466 aa  155  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2198  cation diffusion facilitator family transporter  36.21 
 
 
293 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.776966  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0432  cation diffusion facilitator family transporter  32.76 
 
 
331 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1334  cation diffusion facilitator family transporter  34.24 
 
 
312 aa  154  2.9999999999999998e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.215207  hitchhiker  0.000886879 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1379  cation diffusion facilitator family transporter  34.45 
 
 
481 aa  152  7e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.892961  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0084  pantothenate metabolism flavoprotein  31.41 
 
 
311 aa  151  1e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00694286  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0550  cation efflux protein  35.49 
 
 
459 aa  152  1e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.247369 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3300  iron and zinc efflux system protein  29.21 
 
 
318 aa  150  2e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.831799  normal  0.0946092 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1582  cation diffusion facilitator family transporter  31.62 
 
 
299 aa  149  5e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1171  cation efflux family protein  28.92 
 
 
295 aa  148  1.0000000000000001e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3435  cation diffusion facilitator family transporter  34.22 
 
 
478 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0253813 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2658  cation diffusion facilitator family transporter  33.11 
 
 
295 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4669  cation diffusion facilitator family transporter  34.84 
 
 
332 aa  147  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2245  cation diffusion facilitator family transporter  33.9 
 
 
483 aa  147  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1026  cation efflux family protein  28.92 
 
 
295 aa  146  6e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0972  cation efflux family protein  28.92 
 
 
295 aa  146  6e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3146  cation efflux family protein  36.71 
 
 
296 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440371  hitchhiker  0.000651912 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2804  cation diffusion facilitator family transporter  30.28 
 
 
303 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0087  ferrous iron efflux protein F  33.09 
 
 
300 aa  145  8.000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4127  ferrous iron efflux protein F  33.09 
 
 
300 aa  145  8.000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2795  ferrous iron efflux protein F  30.72 
 
 
301 aa  145  9e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00102947  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3264  cation diffusion facilitator family transporter  36.17 
 
 
295 aa  144  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0487  cation diffusion facilitator family transporter  36.88 
 
 
319 aa  145  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3707  cation diffusion facilitator family transporter  36.88 
 
 
319 aa  145  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0354783  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0393  cation diffusion facilitator family transporter  37.5 
 
 
483 aa  144  1e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.38697 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1206  cation diffusion facilitator family transporter  32.65 
 
 
316 aa  145  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0847  cation efflux protein  27.8 
 
 
297 aa  144  2e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2019  cation diffusion facilitator family transporter  34.81 
 
 
459 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.40781 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0088  ferrous iron efflux protein F  32.72 
 
 
300 aa  144  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0791  cation diffusion facilitator family transporter  32.3 
 
 
312 aa  143  3e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4808  ferrous iron efflux protein F  32.96 
 
 
300 aa  143  4e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1013  metal cation efflux protein CzrB  34.24 
 
 
302 aa  143  4e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.323499  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00146  ferrous iron efflux protein F  31.76 
 
 
302 aa  142  8e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4459  ferrous iron efflux protein F  32.47 
 
 
300 aa  142  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.709567  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4392  ferrous iron efflux protein F  32.47 
 
 
300 aa  142  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123338  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4390  ferrous iron efflux protein F  32.47 
 
 
300 aa  142  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.228028 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1256  cation diffusion facilitator family transporter  35.62 
 
 
303 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.513971  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1848  cation diffusion facilitator family transporter  33.79 
 
 
460 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.762115 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4278  ferrous iron efflux protein F  32.1 
 
 
300 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.546202  normal  0.887398 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4307  ferrous iron efflux protein F  32.1 
 
 
300 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2568  cation diffusion facilitator family transporter  28 
 
 
332 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.364379 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4937  cation efflux protein  34.52 
 
 
298 aa  139  7e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.451266 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>