More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0867 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0867  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 295 aa  576  1.0000000000000001e-163  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.851238 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3476  putative cation efflux family protein, CzcD-like protein  61.09 
 
 		 296 aa  361  7.0000000000000005e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606573  normal  0.771262 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2468  cation diffusion facilitator family transporter  61.69 
 
 		 295 aa  342  2.9999999999999997e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.376521 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0050  cation diffusion facilitator family transporter  59.73 
 
 		 317 aa  342  5.999999999999999e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.374526 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1178  cation diffusion facilitator family transporter  62.81 
 
 		 300 aa  340  2e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00185198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3065  cation diffusion facilitator family transporter  61.36 
 
 		 295 aa  333  2e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.686004  normal  0.910257 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2658  cation diffusion facilitator family transporter  61.02 
 
 		 295 aa  332  4e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3290  cation diffusion facilitator family transporter  60.68 
 
 		 295 aa  331  9e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5513  cation diffusion facilitator family transporter  62.03 
 
 		 295 aa  330  2e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.281094  normal  0.363198 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0023  cation diffusion facilitator family transporter  58.64 
 
 		 295 aa  324  9e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.556428 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3075  cation diffusion facilitator family transporter  57.4 
 
 		 304 aa  323  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3264  cation diffusion facilitator family transporter  61.36 
 
 		 295 aa  322  4e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1598  cation diffusion facilitator family transporter  60.14 
 
 		 302 aa  322  6e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1568  cation efflux family protein  58.39 
 
 		 302 aa  317  2e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1514  cation efflux family protein  58.39 
 
 		 302 aa  317  2e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2239  cation diffusion facilitator family transporter  57.24 
 
 		 302 aa  315  4e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0407082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2198  cation diffusion facilitator family transporter  58.42 
 
 		 293 aa  308  5e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.776966  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2384  cation diffusion facilitator family transporter  59.66 
 
 		 295 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.336168 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3261  cation efflux system protein  57.35 
 
 		 305 aa  303  2.0000000000000002e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826048  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2809  cation diffusion facilitator family transporter  57.4 
 
 		 304 aa  300  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.252612  normal  0.010552 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0463  cation efflux transporter  57.63 
 
 		 295 aa  293  2e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.632211  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1013  metal cation efflux protein CzrB  48.25 
 
 		 302 aa  285  7e-76  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.323499  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0607  cation diffusion facilitator family transporter  56.25 
 
 		 309 aa  284  2.0000000000000002e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.212656  normal  0.0107339 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2294  cation diffusion facilitator family transporter  56.68 
 
 		 306 aa  278  7e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38282  normal  0.177312 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2115  cation diffusion facilitator family transporter  58.64 
 
 		 295 aa  276  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.922775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2446  cation diffusion facilitator family transporter  51.39 
 
 		 304 aa  265  7e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.526861  normal  0.400869 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1536  cation diffusion facilitator family transporter  47.96 
 
 		 295 aa  250  2e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.503443  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1439  cation efflux protein  44.2 
 
 		 293 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0109958  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1043  cation efflux protein  46.15 
 
 		 320 aa  232  6e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1114  cation efflux protein  45.42 
 
 		 305 aa  232  7.000000000000001e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1483  cation diffusion facilitator family transporter  44.95 
 
 		 308 aa  231  1e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0980  cation diffusion facilitator family transporter  43.77 
 
 		 305 aa  228  9e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2073  cation diffusion facilitator family transporter  45.94 
 
 		 308 aa  228  1e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.981542 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0597  cation diffusion facilitator family transporter  46.74 
 
 		 302 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1731  cation diffusion facilitator family transporter  46.74 
 
 		 315 aa  222  4e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.560975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1770  cation diffusion facilitator family transporter  47.12 
 
 		 315 aa  222  4.9999999999999996e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1021  cation diffusion facilitator family transporter  44.72 
 
 		 346 aa  219  6e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1850  cation diffusion facilitator family transporter  46.4 
 
 		 315 aa  217  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2025  cation diffusion facilitator family transporter  42.11 
 
 		 313 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0165078  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0225  cation diffusion facilitator family transporter  43.97 
 
 		 312 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1801  cation efflux family protein  43.25 
 
 		 376 aa  211  7.999999999999999e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0942158  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2106  cation diffusion facilitator family transporter  47.12 
 
 		 315 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1334  cation diffusion facilitator family transporter  45.52 
 
 		 312 aa  207  1e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.215207  hitchhiker  0.000886879 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0729  cation diffusion facilitator family transporter  42.35 
 
 		 304 aa  205  6e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5864  cation diffusion facilitator family transporter  43.8 
 
 		 300 aa  202  4e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.499716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  39.65 
 
 		 311 aa  201  9.999999999999999e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1206  cation diffusion facilitator family transporter  45.45 
 
 		 316 aa  200  3e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2873  cation diffusion facilitator family transporter  45.52 
 
 		 314 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1928  cation diffusion facilitator family transporter  46.62 
 
 		 305 aa  194  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.479128  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  38.95 
 
 		 311 aa  194  1e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07750  cation diffusion facilitator family transporter  40.64 
 
 		 330 aa  195  1e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4669  cation diffusion facilitator family transporter  44.96 
 
 		 332 aa  193  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2804  cation diffusion facilitator family transporter  40.14 
 
 		 303 aa  192  5e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3146  cation efflux family protein  40.48 
 
 		 296 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440371  hitchhiker  0.000651912 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4099  cation diffusion facilitator family transporter  41.94 
 
 		 304 aa  189  7e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.932753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3707  cation diffusion facilitator family transporter  40.57 
 
 		 319 aa  188  9e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0354783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0487  cation diffusion facilitator family transporter  40.57 
 
 		 319 aa  188  1e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1127  cation diffusion facilitator family transporter  36.58 
 
 		 323 aa  187  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4244  cation diffusion facilitator family transporter  42.91 
 
 		 339 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.337864 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5667  cation diffusion facilitator family transporter  42.49 
 
 		 328 aa  183  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1661  cation diffusion facilitator family transporter  35.84 
 
 		 331 aa  183  3e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0331  cation efflux family protein  40.35 
 
 		 311 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0470  cation diffusion facilitator family transporter  36.5 
 
 		 337 aa  180  2e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0457303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2568  cation diffusion facilitator family transporter  33.45 
 
 		 332 aa  180  2e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.364379 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0589  cation diffusion facilitator family transporter  33.57 
 
 		 285 aa  172  6.999999999999999e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000134664  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0432  cation diffusion facilitator family transporter  36.03 
 
 		 331 aa  171  1e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1256  cation diffusion facilitator family transporter  41.96 
 
 		 303 aa  170  3e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.513971  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4333  cation efflux protein  36.56 
 
 		 297 aa  169  5e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1683  cation diffusion facilitator family transporter  40.31 
 
 		 308 aa  168  1e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000676071  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1954  cation diffusion facilitator family transporter  35.46 
 
 		 328 aa  166  5e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0806665 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2000  cation diffusion facilitator family transporter  42.11 
 
 		 285 aa  166  5e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.7679  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1521  cation diffusion facilitator family transporter  34.12 
 
 		 309 aa  165  9e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4790  cation efflux family protein  35.48 
 
 		 297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2871  cation efflux protein  37.32 
 
 		 317 aa  163  4.0000000000000004e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0791  cation diffusion facilitator family transporter  34.98 
 
 		 312 aa  162  6e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2574  cation diffusion facilitator family transporter  36.15 
 
 		 310 aa  162  6e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2581  cation diffusion facilitator family transporter  42.63 
 
 		 325 aa  162  7e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3895  cation diffusion facilitator family transporter  35.84 
 
 		 307 aa  160  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.640647  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0446  cation diffusion facilitator family transporter  35.82 
 
 		 328 aa  158  8e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.48861  normal  0.265047 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3750  cation diffusion facilitator family transporter  32.75 
 
 		 326 aa  157  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220836  hitchhiker  0.0009443 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0724  cation diffusion facilitator family transporter  35.31 
 
 		 315 aa  157  3e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152803  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1113  hypothetical protein  34.28 
 
 		 307 aa  155  8e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.416676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1509  putative transport system permease protein  32.62 
 
 		 314 aa  154  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073133  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12610  putative transporter  38.43 
 
 		 298 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.686969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3741  cation diffusion facilitator family transporter  34.77 
 
 		 292 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1146  putative transporter  37.01 
 
 		 298 aa  149  6e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0526  cation diffusion facilitator family transporter  37.68 
 
 		 327 aa  148  9e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0749  cation diffusion facilitator family transporter  34.83 
 
 		 338 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0047  cation diffusion facilitator family transporter  33.57 
 
 		 325 aa  144  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.408108  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2628  cation efflux protein  32.41 
 
 		 325 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.620911  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4937  cation efflux protein  35.25 
 
 		 298 aa  140  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0400  cation diffusion facilitator family transporter  29.55 
 
 		 327 aa  139  3.9999999999999997e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0369  cation diffusion facilitator family transporter  32.6 
 
 		 293 aa  139  6e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000868845  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0646  cation diffusion facilitator family transporter  35.16 
 
 		 289 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.186266  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4475  cation efflux family protein  33.7 
 
 		 296 aa  138  8.999999999999999e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4650  cation diffusion facilitator family transporter  34.43 
 
 		 290 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.188299 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4774  cation diffusion facilitator family transporter  34.07 
 
 		 290 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00437993 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3300  iron and zinc efflux system protein  28.21 
 
 		 318 aa  137  2e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.831799  normal  0.0946092 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0254  cation diffusion facilitator family transporter  33.45 
 
 		 297 aa  137  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00100286  hitchhiker  0.000434478 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11850  cation diffusion facilitator family transporter  30.4 
 
 		 312 aa  137  2e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>