More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1536 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1536  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 
295 aa  572  1.0000000000000001e-162  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.503443  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0050  cation diffusion facilitator family transporter  49.15 
 
 
317 aa  278  8e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.374526 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3476  putative cation efflux family protein, CzcD-like protein  48.28 
 
 
296 aa  275  7e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606573  normal  0.771262 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0023  cation diffusion facilitator family transporter  52.77 
 
 
295 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.556428 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2468  cation diffusion facilitator family transporter  49.32 
 
 
295 aa  268  5.9999999999999995e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.376521 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2658  cation diffusion facilitator family transporter  50.7 
 
 
295 aa  268  1e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5513  cation diffusion facilitator family transporter  50.35 
 
 
295 aa  261  8.999999999999999e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.281094  normal  0.363198 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3290  cation diffusion facilitator family transporter  47.75 
 
 
295 aa  256  2e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3065  cation diffusion facilitator family transporter  47.75 
 
 
295 aa  255  6e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.686004  normal  0.910257 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3075  cation diffusion facilitator family transporter  44.14 
 
 
304 aa  251  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553073  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3264  cation diffusion facilitator family transporter  48.1 
 
 
295 aa  244  9e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3261  cation efflux system protein  45.17 
 
 
305 aa  244  9.999999999999999e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826048  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0463  cation efflux transporter  48.3 
 
 
295 aa  242  6e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.632211  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2294  cation diffusion facilitator family transporter  45.02 
 
 
306 aa  239  2.9999999999999997e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38282  normal  0.177312 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0607  cation diffusion facilitator family transporter  47.55 
 
 
309 aa  239  4e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.212656  normal  0.0107339 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0867  cation diffusion facilitator family transporter  47.96 
 
 
295 aa  238  8e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.851238 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2239  cation diffusion facilitator family transporter  44.33 
 
 
302 aa  236  4e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0407082  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2384  cation diffusion facilitator family transporter  48.3 
 
 
295 aa  234  9e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.336168 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2198  cation diffusion facilitator family transporter  47.54 
 
 
293 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.776966  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2809  cation diffusion facilitator family transporter  45.85 
 
 
304 aa  232  4.0000000000000004e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.252612  normal  0.010552 
 
 
-
 
NC_004310  BR1568  cation efflux family protein  44.88 
 
 
302 aa  231  1e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1514  cation efflux family protein  44.88 
 
 
302 aa  231  1e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1598  cation diffusion facilitator family transporter  44.88 
 
 
302 aa  230  2e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2115  cation diffusion facilitator family transporter  48.3 
 
 
295 aa  229  3e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.922775  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2446  cation diffusion facilitator family transporter  45.3 
 
 
304 aa  228  1e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.526861  normal  0.400869 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1013  metal cation efflux protein CzrB  42.76 
 
 
302 aa  228  1e-58  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.323499  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1178  cation diffusion facilitator family transporter  43.58 
 
 
300 aa  217  1e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00185198  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2073  cation diffusion facilitator family transporter  39.01 
 
 
308 aa  178  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.981542 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1483  cation diffusion facilitator family transporter  37.77 
 
 
308 aa  176  5e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1850  cation diffusion facilitator family transporter  40.14 
 
 
315 aa  176  5e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1770  cation diffusion facilitator family transporter  40.14 
 
 
315 aa  175  9e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0980  cation diffusion facilitator family transporter  37.41 
 
 
305 aa  170  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1801  cation efflux family protein  37.72 
 
 
376 aa  168  1e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0942158  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1731  cation diffusion facilitator family transporter  37.77 
 
 
315 aa  168  1e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.560975  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0225  cation diffusion facilitator family transporter  37.37 
 
 
312 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2106  cation diffusion facilitator family transporter  39.78 
 
 
315 aa  166  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1439  cation efflux protein  34.28 
 
 
293 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0109958  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1043  cation efflux protein  35.25 
 
 
320 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  33.45 
 
 
311 aa  163  3e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1021  cation diffusion facilitator family transporter  37.86 
 
 
346 aa  161  9e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1114  cation efflux protein  34.89 
 
 
305 aa  161  1e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  33.09 
 
 
311 aa  161  1e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07750  cation diffusion facilitator family transporter  36.95 
 
 
330 aa  159  4e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0729  cation diffusion facilitator family transporter  34.49 
 
 
304 aa  155  6e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5864  cation diffusion facilitator family transporter  36.79 
 
 
300 aa  155  8e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.499716  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0597  cation diffusion facilitator family transporter  36.26 
 
 
302 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0331  cation efflux family protein  34.89 
 
 
311 aa  154  2e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5667  cation diffusion facilitator family transporter  35.69 
 
 
328 aa  153  2.9999999999999998e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1334  cation diffusion facilitator family transporter  34.97 
 
 
312 aa  152  8e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.215207  hitchhiker  0.000886879 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2873  cation diffusion facilitator family transporter  38.66 
 
 
314 aa  150  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3707  cation diffusion facilitator family transporter  34.26 
 
 
319 aa  150  3e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0354783  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1127  cation diffusion facilitator family transporter  32.48 
 
 
323 aa  150  3e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0487  cation diffusion facilitator family transporter  34.26 
 
 
319 aa  149  5e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2025  cation diffusion facilitator family transporter  32.99 
 
 
313 aa  147  3e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0165078  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1521  cation diffusion facilitator family transporter  31.5 
 
 
309 aa  146  5e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4669  cation diffusion facilitator family transporter  37.41 
 
 
332 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3146  cation efflux family protein  35.13 
 
 
296 aa  144  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440371  hitchhiker  0.000651912 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4244  cation diffusion facilitator family transporter  35.64 
 
 
339 aa  144  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.337864 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4099  cation diffusion facilitator family transporter  32.4 
 
 
304 aa  138  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.932753  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0432  cation diffusion facilitator family transporter  32.6 
 
 
331 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2262  ferrous iron efflux protein F  33.33 
 
 
302 aa  136  3.0000000000000003e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000896639  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2804  cation diffusion facilitator family transporter  34.74 
 
 
303 aa  136  4e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2628  cation efflux protein  32.75 
 
 
325 aa  136  5e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.620911  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1206  cation diffusion facilitator family transporter  34.98 
 
 
316 aa  136  5e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2871  cation efflux protein  30.03 
 
 
317 aa  135  8e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1661  cation diffusion facilitator family transporter  28.57 
 
 
331 aa  135  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1928  cation diffusion facilitator family transporter  36.94 
 
 
305 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.479128  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0526  cation diffusion facilitator family transporter  35.27 
 
 
327 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4385  cation efflux family protein  27.59 
 
 
301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.592721  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1683  cation diffusion facilitator family transporter  32.82 
 
 
308 aa  126  4.0000000000000003e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000676071  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0400  cation diffusion facilitator family transporter  29.23 
 
 
327 aa  126  4.0000000000000003e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3750  cation diffusion facilitator family transporter  29.47 
 
 
326 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220836  hitchhiker  0.0009443 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1954  cation diffusion facilitator family transporter  32.81 
 
 
328 aa  125  6e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0806665 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0446  cation diffusion facilitator family transporter  33.21 
 
 
328 aa  125  1e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.48861  normal  0.265047 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0589  cation diffusion facilitator family transporter  28.95 
 
 
285 aa  123  4e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000134664  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2000  cation diffusion facilitator family transporter  35.52 
 
 
285 aa  122  6e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.7679  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4020  ferrous iron efflux protein F  30.26 
 
 
300 aa  122  8e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3813  ferrous iron efflux protein F  29.63 
 
 
298 aa  120  3e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.70191  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3895  cation diffusion facilitator family transporter  32.17 
 
 
307 aa  120  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.640647  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0724  cation diffusion facilitator family transporter  33.8 
 
 
315 aa  120  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152803  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2568  cation diffusion facilitator family transporter  27.67 
 
 
332 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.364379 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2574  cation diffusion facilitator family transporter  32.69 
 
 
310 aa  118  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0484  cation efflux protein  27.86 
 
 
298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0749  cation diffusion facilitator family transporter  32.72 
 
 
338 aa  116  5e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00146  ferrous iron efflux protein F  28.78 
 
 
302 aa  115  7.999999999999999e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0470  cation diffusion facilitator family transporter  28.82 
 
 
337 aa  115  8.999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0457303  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0791  cation diffusion facilitator family transporter  28.52 
 
 
312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2795  ferrous iron efflux protein F  28 
 
 
301 aa  113  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00102947  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002221  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  28.06 
 
 
302 aa  113  5e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000518265  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1113  hypothetical protein  27.73 
 
 
307 aa  112  6e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.416676  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1509  putative transport system permease protein  28.14 
 
 
314 aa  112  8.000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073133  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4333  cation efflux protein  30.11 
 
 
297 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0125  cation diffusion facilitator family transporter  31.46 
 
 
317 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0195839  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1256  cation diffusion facilitator family transporter  34.29 
 
 
303 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.513971  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12610  putative transporter  29.45 
 
 
298 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.686969  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3741  cation diffusion facilitator family transporter  32.48 
 
 
292 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0139  ferrous iron efflux protein F  28.37 
 
 
300 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.205512  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4307  ferrous iron efflux protein F  26.33 
 
 
300 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0137  ferrous iron efflux protein F  27.66 
 
 
300 aa  109  6e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1146  putative transporter  28.73 
 
 
298 aa  109  6e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>