More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1114 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1114  cation efflux protein  100 
 
 		 305 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1043  cation efflux protein  69.83 
 
 		 320 aa  437  1e-121  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1483  cation diffusion facilitator family transporter  60.4 
 
 		 308 aa  374  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2073  cation diffusion facilitator family transporter  60.54 
 
 		 308 aa  363  3e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.981542 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1731  cation diffusion facilitator family transporter  60.68 
 
 		 315 aa  362  5.0000000000000005e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.560975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1439  cation efflux protein  61.57 
 
 		 293 aa  351  8e-96  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0109958  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1770  cation diffusion facilitator family transporter  58.59 
 
 		 315 aa  336  2.9999999999999997e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1850  cation diffusion facilitator family transporter  58.45 
 
 		 315 aa  333  1e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2106  cation diffusion facilitator family transporter  59.26 
 
 		 315 aa  325  8.000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0225  cation diffusion facilitator family transporter  55 
 
 		 312 aa  318  1e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0597  cation diffusion facilitator family transporter  55.97 
 
 		 302 aa  314  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0980  cation diffusion facilitator family transporter  53.69 
 
 		 305 aa  312  5.999999999999999e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1801  cation efflux family protein  56.25 
 
 		 376 aa  311  1e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0942158  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5667  cation diffusion facilitator family transporter  55.44 
 
 		 328 aa  304  1.0000000000000001e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2873  cation diffusion facilitator family transporter  57.91 
 
 		 314 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07750  cation diffusion facilitator family transporter  51.03 
 
 		 330 aa  282  4.0000000000000003e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2025  cation diffusion facilitator family transporter  47.57 
 
 		 313 aa  276  3e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0165078  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5864  cation diffusion facilitator family transporter  50.35 
 
 		 300 aa  269  5e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.499716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3146  cation efflux family protein  50.53 
 
 		 296 aa  261  2e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440371  hitchhiker  0.000651912 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1206  cation diffusion facilitator family transporter  48.74 
 
 		 316 aa  257  2e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1928  cation diffusion facilitator family transporter  53.87 
 
 		 305 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.479128  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4244  cation diffusion facilitator family transporter  51.26 
 
 		 339 aa  249  3e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.337864 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4669  cation diffusion facilitator family transporter  48.57 
 
 		 332 aa  249  4e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1334  cation diffusion facilitator family transporter  47.3 
 
 		 312 aa  241  1e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.215207  hitchhiker  0.000886879 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3707  cation diffusion facilitator family transporter  47.29 
 
 		 319 aa  239  2.9999999999999997e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0354783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0487  cation diffusion facilitator family transporter  47.29 
 
 		 319 aa  239  5e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0729  cation diffusion facilitator family transporter  46.24 
 
 		 304 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2239  cation diffusion facilitator family transporter  45.39 
 
 		 302 aa  233  4.0000000000000004e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0407082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4099  cation diffusion facilitator family transporter  47.62 
 
 		 304 aa  231  8.000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.932753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0050  cation diffusion facilitator family transporter  43.26 
 
 		 317 aa  227  2e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.374526 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3476  putative cation efflux family protein, CzcD-like protein  42.96 
 
 		 296 aa  226  3e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606573  normal  0.771262 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1178  cation diffusion facilitator family transporter  45 
 
 		 300 aa  226  5.0000000000000005e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00185198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2468  cation diffusion facilitator family transporter  45.16 
 
 		 295 aa  226  5.0000000000000005e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.376521 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0023  cation diffusion facilitator family transporter  43.26 
 
 		 295 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.556428 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2198  cation diffusion facilitator family transporter  42.91 
 
 		 293 aa  221  9.999999999999999e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.776966  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0867  cation diffusion facilitator family transporter  46.33 
 
 		 295 aa  218  7e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.851238 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1021  cation diffusion facilitator family transporter  40.67 
 
 		 346 aa  217  2e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3075  cation diffusion facilitator family transporter  40.57 
 
 		 304 aa  216  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3261  cation efflux system protein  41.07 
 
 		 305 aa  215  7e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826048  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2294  cation diffusion facilitator family transporter  42.35 
 
 		 306 aa  214  9.999999999999999e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38282  normal  0.177312 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2658  cation diffusion facilitator family transporter  46.39 
 
 		 295 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3290  cation diffusion facilitator family transporter  42.65 
 
 		 295 aa  210  2e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3065  cation diffusion facilitator family transporter  42.65 
 
 		 295 aa  210  2e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.686004  normal  0.910257 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5513  cation diffusion facilitator family transporter  44.2 
 
 		 295 aa  209  5e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.281094  normal  0.363198 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  39.5 
 
 		 311 aa  205  6e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2809  cation diffusion facilitator family transporter  43.73 
 
 		 304 aa  205  7e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.252612  normal  0.010552 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2446  cation diffusion facilitator family transporter  42.86 
 
 		 304 aa  204  1e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.526861  normal  0.400869 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  38.05 
 
 		 311 aa  203  2e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3895  cation diffusion facilitator family transporter  38.08 
 
 		 307 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.640647  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1521  cation diffusion facilitator family transporter  35.13 
 
 		 309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3264  cation diffusion facilitator family transporter  42.65 
 
 		 295 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1598  cation diffusion facilitator family transporter  39.3 
 
 		 302 aa  195  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1568  cation efflux family protein  40 
 
 		 302 aa  192  8e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1514  cation efflux family protein  40 
 
 		 302 aa  192  8e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0589  cation diffusion facilitator family transporter  37.63 
 
 		 285 aa  190  2e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000134664  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0331  cation efflux family protein  37.37 
 
 		 311 aa  187  1e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1954  cation diffusion facilitator family transporter  36.99 
 
 		 328 aa  188  1e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0806665 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2804  cation diffusion facilitator family transporter  38.57 
 
 		 303 aa  186  3e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1013  metal cation efflux protein CzrB  38.1 
 
 		 302 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.323499  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0463  cation efflux transporter  42.86 
 
 		 295 aa  183  3e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.632211  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2568  cation diffusion facilitator family transporter  34.04 
 
 		 332 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.364379 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0607  cation diffusion facilitator family transporter  39.58 
 
 		 309 aa  182  5.0000000000000004e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.212656  normal  0.0107339 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0470  cation diffusion facilitator family transporter  34.64 
 
 		 337 aa  181  9.000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0457303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1256  cation diffusion facilitator family transporter  42.6 
 
 		 303 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.513971  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1127  cation diffusion facilitator family transporter  33.69 
 
 		 323 aa  179  4e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1661  cation diffusion facilitator family transporter  36.59 
 
 		 331 aa  179  7e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2384  cation diffusion facilitator family transporter  42.21 
 
 		 295 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.336168 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2000  cation diffusion facilitator family transporter  37.92 
 
 		 285 aa  175  8e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.7679  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0432  cation diffusion facilitator family transporter  36.82 
 
 		 331 aa  174  9.999999999999999e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1683  cation diffusion facilitator family transporter  36.3 
 
 		 308 aa  171  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000676071  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2115  cation diffusion facilitator family transporter  43.22 
 
 		 295 aa  170  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.922775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2400  cation diffusion facilitator family transporter  35.71 
 
 		 307 aa  169  4e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0526  cation diffusion facilitator family transporter  36.15 
 
 		 327 aa  169  5e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2581  cation diffusion facilitator family transporter  40.07 
 
 		 325 aa  165  6.9999999999999995e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0446  cation diffusion facilitator family transporter  36.71 
 
 		 328 aa  162  8.000000000000001e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.48861  normal  0.265047 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3750  cation diffusion facilitator family transporter  33.83 
 
 		 326 aa  162  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220836  hitchhiker  0.0009443 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1113  hypothetical protein  35.56 
 
 		 307 aa  161  1e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.416676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2871  cation efflux protein  33.57 
 
 		 317 aa  158  8e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0724  cation diffusion facilitator family transporter  34.48 
 
 		 315 aa  155  8e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152803  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0400  cation diffusion facilitator family transporter  29.97 
 
 		 327 aa  155  1e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4333  cation efflux protein  34.27 
 
 		 297 aa  151  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1536  cation diffusion facilitator family transporter  34.89 
 
 		 295 aa  150  2e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.503443  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1509  putative transport system permease protein  30.14 
 
 		 314 aa  149  7e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073133  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4790  cation efflux family protein  34.62 
 
 		 297 aa  148  9e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1143  cation efflux protein  35.32 
 
 		 331 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.344034  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2574  cation diffusion facilitator family transporter  33.45 
 
 		 310 aa  146  4.0000000000000006e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3741  cation diffusion facilitator family transporter  32.53 
 
 		 292 aa  145  6e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0791  cation diffusion facilitator family transporter  31.07 
 
 		 312 aa  144  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0484  cation efflux protein  31.58 
 
 		 298 aa  144  1e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0749  cation diffusion facilitator family transporter  36.3 
 
 		 338 aa  145  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4385  cation efflux family protein  29.55 
 
 		 301 aa  142  9e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.592721  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0847  cation efflux protein  27.46 
 
 		 297 aa  141  9.999999999999999e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1582  cation diffusion facilitator family transporter  27.11 
 
 		 299 aa  138  1e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4278  ferrous iron efflux protein F  30.45 
 
 		 300 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.546202  normal  0.887398 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4307  ferrous iron efflux protein F  29.72 
 
 		 300 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2795  ferrous iron efflux protein F  30.27 
 
 		 301 aa  137  3.0000000000000003e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00102947  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1752  cation diffusion facilitator family transporter  30.99 
 
 		 301 aa  136  4e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00011926  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1146  putative transporter  31.49 
 
 		 298 aa  136  4e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4774  cation diffusion facilitator family transporter  32.13 
 
 		 290 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00437993 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4459  ferrous iron efflux protein F  29.37 
 
 		 300 aa  135  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.709567  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>