More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B4307 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011149  SeAg_B4307  ferrous iron efflux protein F  100 
 
 
300 aa  610  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4390  ferrous iron efflux protein F  99.33 
 
 
300 aa  606  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.228028 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4392  ferrous iron efflux protein F  99.33 
 
 
300 aa  606  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123338  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4459  ferrous iron efflux protein F  99.33 
 
 
300 aa  606  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.709567  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4278  ferrous iron efflux protein F  98.33 
 
 
300 aa  601  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.546202  normal  0.887398 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03800  ferrous iron efflux protein F  92.57 
 
 
300 aa  547  1e-155  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.769582  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4070  cation diffusion facilitator family transporter  92.57 
 
 
300 aa  547  1e-155  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4103  ferrous iron efflux protein F  92.57 
 
 
300 aa  547  1e-155  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5369  ferrous iron efflux protein F  92.57 
 
 
300 aa  547  1e-155  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4448  ferrous iron efflux protein F  92.57 
 
 
300 aa  547  1e-155  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4145  ferrous iron efflux protein F  92.57 
 
 
300 aa  547  1e-155  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03749  hypothetical protein  92.57 
 
 
300 aa  547  1e-155  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.859371  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4057  ferrous iron efflux protein F  91.41 
 
 
300 aa  546  1e-154  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.3408  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4394  ferrous iron efflux protein F  92.57 
 
 
300 aa  546  1e-154  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4355  ferrous iron efflux protein F  92.23 
 
 
300 aa  547  1e-154  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.363052 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4808  ferrous iron efflux protein F  81.08 
 
 
300 aa  471  1e-132  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0087  ferrous iron efflux protein F  79.52 
 
 
300 aa  471  1e-132  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4127  ferrous iron efflux protein F  79.52 
 
 
300 aa  471  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0088  ferrous iron efflux protein F  79.18 
 
 
300 aa  469  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4020  ferrous iron efflux protein F  74.24 
 
 
300 aa  442  1e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0139  ferrous iron efflux protein F  71.19 
 
 
300 aa  439  9.999999999999999e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.205512  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3813  ferrous iron efflux protein F  73.56 
 
 
298 aa  433  1e-120  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.70191  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0137  ferrous iron efflux protein F  69.15 
 
 
300 aa  412  1e-114  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2795  ferrous iron efflux protein F  60 
 
 
301 aa  365  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00102947  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00146  ferrous iron efflux protein F  59.73 
 
 
302 aa  365  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002221  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  58.39 
 
 
302 aa  364  1e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000518265  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2262  ferrous iron efflux protein F  60.34 
 
 
302 aa  363  2e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000896639  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3300  iron and zinc efflux system protein  49.66 
 
 
318 aa  309  2.9999999999999997e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.831799  normal  0.0946092 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0484  cation efflux protein  46.42 
 
 
298 aa  281  7.000000000000001e-75  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1146  putative transporter  48.29 
 
 
298 aa  271  8.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0263  cation diffusion facilitator family transporter  48.62 
 
 
296 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0263  cation diffusion facilitator family transporter  48.62 
 
 
296 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000665998  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4333  cation efflux protein  45.83 
 
 
297 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0258  cation diffusion facilitator family transporter  48.62 
 
 
296 aa  269  5e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0238617  decreased coverage  0.0000137847 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0256  cation diffusion facilitator family transporter  48.28 
 
 
290 aa  268  5.9999999999999995e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.015822  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12610  putative transporter  47.95 
 
 
298 aa  268  8e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.686969  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4937  cation efflux protein  47.55 
 
 
298 aa  268  1e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4790  cation efflux family protein  46.15 
 
 
297 aa  266  2e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0791  cation diffusion facilitator family transporter  47.37 
 
 
312 aa  266  2.9999999999999995e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0646  cation diffusion facilitator family transporter  48.76 
 
 
289 aa  264  1e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.186266  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3741  cation diffusion facilitator family transporter  48.28 
 
 
292 aa  263  2e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3931  cation diffusion facilitator family transporter  48.1 
 
 
289 aa  263  2e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146752  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4774  cation diffusion facilitator family transporter  47.7 
 
 
290 aa  263  3e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00437993 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0369  cation diffusion facilitator family transporter  47.42 
 
 
293 aa  263  3e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000868845  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4650  cation diffusion facilitator family transporter  48.06 
 
 
290 aa  263  3e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.188299 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3430  cation efflux family protein  47.2 
 
 
289 aa  261  8.999999999999999e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.038315  normal  0.371724 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2871  cation efflux protein  46.88 
 
 
317 aa  259  5.0000000000000005e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0314  cation diffusion facilitator family transporter  46.98 
 
 
289 aa  258  9e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000499164  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0283  cation diffusion facilitator family transporter  49.13 
 
 
289 aa  256  4e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000135254  hitchhiker  0.000000557586 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0254  cation diffusion facilitator family transporter  47.44 
 
 
297 aa  256  4e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00100286  hitchhiker  0.000434478 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3767  cation diffusion facilitator family transporter  47.44 
 
 
297 aa  254  9e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0281724  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0281  cation diffusion facilitator family transporter  48.79 
 
 
289 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000230949  unclonable  0.000000000100578 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0255  cation diffusion facilitator family transporter  47.78 
 
 
299 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000211411  hitchhiker  0.0000000259918 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4475  cation efflux family protein  47.44 
 
 
296 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3459  cation diffusion facilitator family transporter  46.62 
 
 
295 aa  249  4e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000668227  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3568  cation diffusion facilitator family transporter  49.47 
 
 
289 aa  247  2e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000153022  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4385  cation efflux family protein  42.47 
 
 
301 aa  246  3e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.592721  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09970  Cation efflux protein  48.94 
 
 
293 aa  246  3e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.907578  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4828  cation diffusion facilitator family transporter  47.35 
 
 
290 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2628  cation efflux protein  41.75 
 
 
325 aa  236  2e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.620911  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0241  cation diffusion facilitator family transporter  46.64 
 
 
310 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000961232  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1177  cation diffusion facilitator family transporter  41.79 
 
 
308 aa  216  2.9999999999999998e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4753  cation diffusion facilitator family transporter  40.07 
 
 
296 aa  203  3e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.36054  decreased coverage  0.00983844 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0047  cation diffusion facilitator family transporter  37.5 
 
 
325 aa  197  1.0000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.408108  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4947  cation diffusion facilitator family transporter  36.49 
 
 
312 aa  197  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.723787  normal  0.395043 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0116  cation diffusion facilitator family transporter  37.54 
 
 
323 aa  183  4.0000000000000006e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.358203  normal  0.378394 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1026  cation efflux family protein  31.85 
 
 
295 aa  177  1e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0972  cation efflux family protein  31.85 
 
 
295 aa  177  1e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1171  cation efflux family protein  31.51 
 
 
295 aa  175  8e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1582  cation diffusion facilitator family transporter  34.04 
 
 
299 aa  172  3.9999999999999995e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0847  cation efflux protein  34.77 
 
 
297 aa  171  2e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1509  putative transport system permease protein  33.1 
 
 
314 aa  159  4e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073133  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0084  pantothenate metabolism flavoprotein  34.52 
 
 
311 aa  157  2e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00694286  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0896  cation efflux family protein  31.31 
 
 
304 aa  150  2e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0221423  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2000  cation diffusion facilitator family transporter  35.96 
 
 
285 aa  149  5e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.7679  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1731  cation diffusion facilitator family transporter  31.5 
 
 
315 aa  149  7e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.560975  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0532  ferrous-iron efflux pump FieF  36.12 
 
 
291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.800383  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3261  cation efflux system protein  31.12 
 
 
305 aa  144  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826048  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3075  cation diffusion facilitator family transporter  30.34 
 
 
304 aa  144  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553073  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2198  cation diffusion facilitator family transporter  31.97 
 
 
293 aa  142  5e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.776966  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2574  cation diffusion facilitator family transporter  31.54 
 
 
310 aa  142  8e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2294  cation diffusion facilitator family transporter  30.2 
 
 
306 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38282  normal  0.177312 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0589  cation diffusion facilitator family transporter  29.35 
 
 
285 aa  140  3e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000134664  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1114  cation efflux protein  29.9 
 
 
305 aa  140  3e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2239  cation diffusion facilitator family transporter  31.23 
 
 
302 aa  138  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0407082  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3476  putative cation efflux family protein, CzcD-like protein  30.77 
 
 
296 aa  137  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606573  normal  0.771262 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1483  cation diffusion facilitator family transporter  28.99 
 
 
308 aa  137  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1521  cation diffusion facilitator family transporter  28.9 
 
 
309 aa  135  9e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0050  cation diffusion facilitator family transporter  31.72 
 
 
317 aa  134  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.374526 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2809  cation diffusion facilitator family transporter  31.5 
 
 
304 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.252612  normal  0.010552 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3065  cation diffusion facilitator family transporter  29.14 
 
 
295 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.686004  normal  0.910257 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2468  cation diffusion facilitator family transporter  31.48 
 
 
295 aa  135  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.376521 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2073  cation diffusion facilitator family transporter  28.99 
 
 
308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.981542 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  28.83 
 
 
311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2446  cation diffusion facilitator family transporter  28.46 
 
 
304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.526861  normal  0.400869 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3290  cation diffusion facilitator family transporter  28.78 
 
 
295 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1178  cation diffusion facilitator family transporter  32.04 
 
 
300 aa  133  3e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00185198  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1043  cation efflux protein  30.1 
 
 
320 aa  132  6.999999999999999e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1598  cation diffusion facilitator family transporter  30 
 
 
302 aa  132  6.999999999999999e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1123  ferrous-iron efflux pump FieF  29.17 
 
 
289 aa  131  1.0000000000000001e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00791465  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>