More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1206 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1206  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 316 aa  627  1e-179  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0487  cation diffusion facilitator family transporter  67.58 
 
 		 319 aa  394  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3707  cation diffusion facilitator family transporter  67.58 
 
 		 319 aa  394  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0354783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4244  cation diffusion facilitator family transporter  67.8 
 
 		 339 aa  379  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.337864 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1334  cation diffusion facilitator family transporter  64.34 
 
 		 312 aa  365  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.215207  hitchhiker  0.000886879 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4669  cation diffusion facilitator family transporter  63.92 
 
 		 332 aa  360  2e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4099  cation diffusion facilitator family transporter  63.73 
 
 		 304 aa  353  2e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.932753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0729  cation diffusion facilitator family transporter  62.46 
 
 		 304 aa  345  6e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3146  cation efflux family protein  61.75 
 
 		 296 aa  331  1e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440371  hitchhiker  0.000651912 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1731  cation diffusion facilitator family transporter  51.41 
 
 		 315 aa  266  4e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.560975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1114  cation efflux protein  48.74 
 
 		 305 aa  257  2e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1483  cation diffusion facilitator family transporter  46.57 
 
 		 308 aa  248  1e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1043  cation efflux protein  45.3 
 
 		 320 aa  244  9.999999999999999e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0597  cation diffusion facilitator family transporter  48.38 
 
 		 302 aa  242  6e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2073  cation diffusion facilitator family transporter  46.93 
 
 		 308 aa  241  1e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.981542 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1770  cation diffusion facilitator family transporter  46.13 
 
 		 315 aa  240  2e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1850  cation diffusion facilitator family transporter  46.47 
 
 		 315 aa  238  1e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1439  cation efflux protein  46.01 
 
 		 293 aa  236  4e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0109958  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1801  cation efflux family protein  43.04 
 
 		 376 aa  228  8e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0942158  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2106  cation diffusion facilitator family transporter  48.69 
 
 		 315 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0980  cation diffusion facilitator family transporter  44.77 
 
 		 305 aa  226  3e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07750  cation diffusion facilitator family transporter  43.14 
 
 		 330 aa  225  7e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1928  cation diffusion facilitator family transporter  51.76 
 
 		 305 aa  219  7e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.479128  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0225  cation diffusion facilitator family transporter  43.05 
 
 		 312 aa  217  2.9999999999999998e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2239  cation diffusion facilitator family transporter  46.18 
 
 		 302 aa  211  2e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0407082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5667  cation diffusion facilitator family transporter  45.9 
 
 		 328 aa  209  7e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2025  cation diffusion facilitator family transporter  41.73 
 
 		 313 aa  205  8e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0165078  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5864  cation diffusion facilitator family transporter  41.99 
 
 		 300 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.499716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2873  cation diffusion facilitator family transporter  45.9 
 
 		 314 aa  198  9e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3075  cation diffusion facilitator family transporter  42.7 
 
 		 304 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2198  cation diffusion facilitator family transporter  42.75 
 
 		 293 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.776966  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1178  cation diffusion facilitator family transporter  42.01 
 
 		 300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00185198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2468  cation diffusion facilitator family transporter  44.36 
 
 		 295 aa  194  1e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.376521 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1021  cation diffusion facilitator family transporter  42.42 
 
 		 346 aa  194  2e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3261  cation efflux system protein  41.51 
 
 		 305 aa  191  1e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826048  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2804  cation diffusion facilitator family transporter  40.23 
 
 		 303 aa  187  2e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2294  cation diffusion facilitator family transporter  42.01 
 
 		 306 aa  187  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38282  normal  0.177312 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2809  cation diffusion facilitator family transporter  42.38 
 
 		 304 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.252612  normal  0.010552 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3476  putative cation efflux family protein, CzcD-like protein  41.54 
 
 		 296 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606573  normal  0.771262 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0867  cation diffusion facilitator family transporter  42.8 
 
 		 295 aa  184  2.0000000000000003e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.851238 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3290  cation diffusion facilitator family transporter  43.71 
 
 		 295 aa  180  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0023  cation diffusion facilitator family transporter  40.44 
 
 		 295 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.556428 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3065  cation diffusion facilitator family transporter  43.71 
 
 		 295 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.686004  normal  0.910257 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1013  metal cation efflux protein CzrB  39.85 
 
 		 302 aa  179  4.999999999999999e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.323499  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2446  cation diffusion facilitator family transporter  40.61 
 
 		 304 aa  178  1e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.526861  normal  0.400869 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2658  cation diffusion facilitator family transporter  40.58 
 
 		 295 aa  177  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0050  cation diffusion facilitator family transporter  39.35 
 
 		 317 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.374526 
 
 
-
 
NC_004310  BR1568  cation efflux family protein  42.8 
 
 		 302 aa  171  2e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1514  cation efflux family protein  42.8 
 
 		 302 aa  171  2e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5513  cation diffusion facilitator family transporter  40.43 
 
 		 295 aa  169  5e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.281094  normal  0.363198 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1598  cation diffusion facilitator family transporter  40.73 
 
 		 302 aa  169  5e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3264  cation diffusion facilitator family transporter  42.18 
 
 		 295 aa  168  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1661  cation diffusion facilitator family transporter  31.85 
 
 		 331 aa  166  5.9999999999999996e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0463  cation efflux transporter  39.64 
 
 		 295 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.632211  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  34.92 
 
 		 311 aa  161  1e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2581  cation diffusion facilitator family transporter  37.3 
 
 		 325 aa  161  1e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  33.56 
 
 		 311 aa  159  7e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0470  cation diffusion facilitator family transporter  32.7 
 
 		 337 aa  157  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0457303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2384  cation diffusion facilitator family transporter  40.36 
 
 		 295 aa  155  6e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.336168 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0432  cation diffusion facilitator family transporter  34.88 
 
 		 331 aa  152  7e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2115  cation diffusion facilitator family transporter  40 
 
 		 295 aa  151  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.922775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2568  cation diffusion facilitator family transporter  31.27 
 
 		 332 aa  149  4e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.364379 
 
 
-
 
NC_002936  DET0331  cation efflux family protein  35.59 
 
 		 311 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1256  cation diffusion facilitator family transporter  37.11 
 
 		 303 aa  145  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.513971  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0589  cation diffusion facilitator family transporter  30.71 
 
 		 285 aa  144  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000134664  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0400  cation diffusion facilitator family transporter  30.5 
 
 		 327 aa  144  2e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3750  cation diffusion facilitator family transporter  34.98 
 
 		 326 aa  143  5e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220836  hitchhiker  0.0009443 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1521  cation diffusion facilitator family transporter  30.66 
 
 		 309 aa  142  9e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3895  cation diffusion facilitator family transporter  35.61 
 
 		 307 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.640647  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1113  hypothetical protein  32.52 
 
 		 307 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.416676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1143  cation efflux protein  33.98 
 
 		 331 aa  132  6e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.344034  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0607  cation diffusion facilitator family transporter  36.63 
 
 		 309 aa  131  1.0000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.212656  normal  0.0107339 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0749  cation diffusion facilitator family transporter  35.08 
 
 		 338 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0791  cation diffusion facilitator family transporter  30.11 
 
 		 312 aa  130  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0526  cation diffusion facilitator family transporter  32.65 
 
 		 327 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1127  cation diffusion facilitator family transporter  32.21 
 
 		 323 aa  130  3e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1954  cation diffusion facilitator family transporter  31.9 
 
 		 328 aa  129  8.000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0806665 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0446  cation diffusion facilitator family transporter  31.85 
 
 		 328 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.48861  normal  0.265047 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2871  cation efflux protein  30.94 
 
 		 317 aa  126  5e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1683  cation diffusion facilitator family transporter  34.2 
 
 		 308 aa  125  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000676071  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1536  cation diffusion facilitator family transporter  34.98 
 
 		 295 aa  124  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.503443  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4020  ferrous iron efflux protein F  29.12 
 
 		 300 aa  122  8e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2000  cation diffusion facilitator family transporter  32.99 
 
 		 285 aa  121  9.999999999999999e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.7679  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0369  cation diffusion facilitator family transporter  31.08 
 
 		 293 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000868845  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2400  cation diffusion facilitator family transporter  31.03 
 
 		 307 aa  120  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3568  cation diffusion facilitator family transporter  31.15 
 
 		 289 aa  120  3e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000153022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3741  cation diffusion facilitator family transporter  34.81 
 
 		 292 aa  119  7e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3767  cation diffusion facilitator family transporter  31.47 
 
 		 297 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0281724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0281  cation diffusion facilitator family transporter  31.32 
 
 		 289 aa  117  3e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000230949  unclonable  0.000000000100578 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4385  cation efflux family protein  27.31 
 
 		 301 aa  117  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.592721  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4459  ferrous iron efflux protein F  27 
 
 		 300 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.709567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4392  ferrous iron efflux protein F  27 
 
 		 300 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4390  ferrous iron efflux protein F  27 
 
 		 300 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.228028 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4475  cation efflux family protein  31.47 
 
 		 296 aa  116  5e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0255  cation diffusion facilitator family transporter  31.08 
 
 		 299 aa  116  5e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000211411  hitchhiker  0.0000000259918 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4307  ferrous iron efflux protein F  27 
 
 		 300 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0254  cation diffusion facilitator family transporter  30.68 
 
 		 297 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00100286  hitchhiker  0.000434478 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3931  cation diffusion facilitator family transporter  28.41 
 
 		 289 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146752  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3459  cation diffusion facilitator family transporter  30.68 
 
 		 295 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000668227  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4278  ferrous iron efflux protein F  26.62 
 
 		 300 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.546202  normal  0.887398 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>