More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_3767 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_3767  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 
297 aa  599  1e-170  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0281724  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0255  cation diffusion facilitator family transporter  97.98 
 
 
299 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000211411  hitchhiker  0.0000000259918 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0369  cation diffusion facilitator family transporter  95.55 
 
 
293 aa  563  1e-160  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000868845  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0254  cation diffusion facilitator family transporter  96.97 
 
 
297 aa  564  1e-160  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00100286  hitchhiker  0.000434478 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4475  cation efflux family protein  95.59 
 
 
296 aa  556  1e-157  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0256  cation diffusion facilitator family transporter  92.39 
 
 
290 aa  545  1e-154  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.015822  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0258  cation diffusion facilitator family transporter  90.41 
 
 
296 aa  543  1e-153  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0238617  decreased coverage  0.0000137847 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0263  cation diffusion facilitator family transporter  90.41 
 
 
296 aa  542  1e-153  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000665998  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0263  cation diffusion facilitator family transporter  90.41 
 
 
296 aa  542  1e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3931  cation diffusion facilitator family transporter  82.35 
 
 
289 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146752  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0283  cation diffusion facilitator family transporter  80.28 
 
 
289 aa  474  1e-132  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000135254  hitchhiker  0.000000557586 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0314  cation diffusion facilitator family transporter  76.47 
 
 
289 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000499164  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3430  cation efflux family protein  78.55 
 
 
289 aa  461  1e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.038315  normal  0.371724 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0281  cation diffusion facilitator family transporter  80.62 
 
 
289 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000230949  unclonable  0.000000000100578 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3568  cation diffusion facilitator family transporter  76.82 
 
 
289 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000153022  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3459  cation diffusion facilitator family transporter  73.68 
 
 
295 aa  437  1e-121  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000668227  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4385  cation efflux family protein  47.3 
 
 
301 aa  279  4e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.592721  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3300  iron and zinc efflux system protein  45.67 
 
 
318 aa  268  5.9999999999999995e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.831799  normal  0.0946092 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0791  cation diffusion facilitator family transporter  48.76 
 
 
312 aa  268  7e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2795  ferrous iron efflux protein F  48.61 
 
 
301 aa  264  1e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00102947  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03800  ferrous iron efflux protein F  49.07 
 
 
300 aa  264  2e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.769582  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4070  cation diffusion facilitator family transporter  49.07 
 
 
300 aa  264  2e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4937  cation efflux protein  48.8 
 
 
298 aa  263  2e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5369  ferrous iron efflux protein F  49.07 
 
 
300 aa  264  2e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4103  ferrous iron efflux protein F  49.07 
 
 
300 aa  264  2e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4145  ferrous iron efflux protein F  49.07 
 
 
300 aa  264  2e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4355  ferrous iron efflux protein F  49.07 
 
 
300 aa  263  2e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.363052 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4448  ferrous iron efflux protein F  49.07 
 
 
300 aa  264  2e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03749  hypothetical protein  49.07 
 
 
300 aa  264  2e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.859371  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4790  cation efflux family protein  46.39 
 
 
297 aa  263  3e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4057  ferrous iron efflux protein F  47.4 
 
 
300 aa  263  3e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.3408  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4394  ferrous iron efflux protein F  49.07 
 
 
300 aa  262  4e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4333  cation efflux protein  47.08 
 
 
297 aa  262  4.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4307  ferrous iron efflux protein F  48.33 
 
 
300 aa  259  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4392  ferrous iron efflux protein F  47.96 
 
 
300 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123338  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4459  ferrous iron efflux protein F  47.96 
 
 
300 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.709567  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4390  ferrous iron efflux protein F  47.96 
 
 
300 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.228028 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4278  ferrous iron efflux protein F  46.89 
 
 
300 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.546202  normal  0.887398 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4020  ferrous iron efflux protein F  48.52 
 
 
300 aa  256  2e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0088  ferrous iron efflux protein F  46.71 
 
 
300 aa  256  3e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3813  ferrous iron efflux protein F  48.5 
 
 
298 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.70191  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2871  cation efflux protein  49.82 
 
 
317 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0087  ferrous iron efflux protein F  46.37 
 
 
300 aa  254  1.0000000000000001e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4127  ferrous iron efflux protein F  46.37 
 
 
300 aa  254  1.0000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002221  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  47.2 
 
 
302 aa  254  2.0000000000000002e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000518265  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12610  putative transporter  46.39 
 
 
298 aa  253  3e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.686969  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00146  ferrous iron efflux protein F  46.85 
 
 
302 aa  253  4.0000000000000004e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2628  cation efflux protein  44.17 
 
 
325 aa  251  1e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.620911  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1146  putative transporter  45.36 
 
 
298 aa  249  5e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2262  ferrous iron efflux protein F  45.42 
 
 
302 aa  248  1e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000896639  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0484  cation efflux protein  44.52 
 
 
298 aa  248  1e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0139  ferrous iron efflux protein F  44.86 
 
 
300 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.205512  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4808  ferrous iron efflux protein F  46.53 
 
 
300 aa  243  3.9999999999999997e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3741  cation diffusion facilitator family transporter  46.26 
 
 
292 aa  241  1e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09970  Cation efflux protein  47.52 
 
 
293 aa  240  2e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.907578  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0137  ferrous iron efflux protein F  44.52 
 
 
300 aa  235  6e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4774  cation diffusion facilitator family transporter  44.64 
 
 
290 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00437993 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0646  cation diffusion facilitator family transporter  44.64 
 
 
289 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.186266  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4650  cation diffusion facilitator family transporter  44.64 
 
 
290 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.188299 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0241  cation diffusion facilitator family transporter  46.98 
 
 
310 aa  228  1e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000961232  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4828  cation diffusion facilitator family transporter  44.64 
 
 
290 aa  211  9e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0047  cation diffusion facilitator family transporter  40.48 
 
 
325 aa  206  4e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.408108  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1177  cation diffusion facilitator family transporter  39.34 
 
 
308 aa  201  8e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4753  cation diffusion facilitator family transporter  39.86 
 
 
296 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.36054  decreased coverage  0.00983844 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4947  cation diffusion facilitator family transporter  41.01 
 
 
312 aa  191  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.723787  normal  0.395043 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0116  cation diffusion facilitator family transporter  40.07 
 
 
323 aa  189  5e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.358203  normal  0.378394 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1582  cation diffusion facilitator family transporter  36.07 
 
 
299 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1509  putative transport system permease protein  36.33 
 
 
314 aa  160  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073133  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0847  cation efflux protein  33.57 
 
 
297 aa  159  5e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3075  cation diffusion facilitator family transporter  31.8 
 
 
304 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553073  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1483  cation diffusion facilitator family transporter  32.62 
 
 
308 aa  144  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1731  cation diffusion facilitator family transporter  32.14 
 
 
315 aa  142  7e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.560975  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2073  cation diffusion facilitator family transporter  32.13 
 
 
308 aa  141  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.981542 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  30.96 
 
 
311 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0084  pantothenate metabolism flavoprotein  30 
 
 
311 aa  137  3.0000000000000003e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00694286  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  31.32 
 
 
311 aa  136  4e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3261  cation efflux system protein  31.82 
 
 
305 aa  136  4e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826048  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1171  cation efflux family protein  27.86 
 
 
295 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1026  cation efflux family protein  28.21 
 
 
295 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0972  cation efflux family protein  28.21 
 
 
295 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0896  cation efflux family protein  32.86 
 
 
304 aa  133  3e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0221423  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2530  cation diffusion facilitator family transporter  30.27 
 
 
460 aa  134  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0867  cation diffusion facilitator family transporter  34.2 
 
 
295 aa  133  3e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.851238 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0245  cation diffusion facilitator family transporter  26.18 
 
 
291 aa  134  3e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1770  cation diffusion facilitator family transporter  32.73 
 
 
315 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1114  cation efflux protein  30.43 
 
 
305 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0225  cation diffusion facilitator family transporter  32.23 
 
 
312 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2809  cation diffusion facilitator family transporter  31.45 
 
 
304 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.252612  normal  0.010552 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0980  cation diffusion facilitator family transporter  30.8 
 
 
305 aa  130  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1850  cation diffusion facilitator family transporter  32.37 
 
 
315 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1334  cation diffusion facilitator family transporter  30.5 
 
 
312 aa  129  5.0000000000000004e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.215207  hitchhiker  0.000886879 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1043  cation efflux protein  28.87 
 
 
320 aa  129  6e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2446  cation diffusion facilitator family transporter  30.12 
 
 
304 aa  129  6e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.526861  normal  0.400869 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2658  cation diffusion facilitator family transporter  32.25 
 
 
295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1113  hypothetical protein  30.21 
 
 
307 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.416676  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2106  cation diffusion facilitator family transporter  33.81 
 
 
315 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1123  ferrous-iron efflux pump FieF  32.03 
 
 
289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00791465  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2198  cation diffusion facilitator family transporter  28.97 
 
 
293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.776966  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0167  cation diffusion facilitator family transporter  31.8 
 
 
305 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0532  ferrous-iron efflux pump FieF  33.46 
 
 
291 aa  125  7e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.800383  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>