More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2025 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2025  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 313 aa  635    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0165078  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1483  cation diffusion facilitator family transporter  48.96 
 
 		 308 aa  286  4e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1731  cation diffusion facilitator family transporter  48.36 
 
 		 315 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.560975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2073  cation diffusion facilitator family transporter  48.61 
 
 		 308 aa  282  4.0000000000000003e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.981542 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1850  cation diffusion facilitator family transporter  48.61 
 
 		 315 aa  282  5.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1770  cation diffusion facilitator family transporter  48.26 
 
 		 315 aa  280  2e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0597  cation diffusion facilitator family transporter  50.17 
 
 		 302 aa  276  2e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1114  cation efflux protein  47.57 
 
 		 305 aa  276  3e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2106  cation diffusion facilitator family transporter  48.26 
 
 		 315 aa  272  6e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1043  cation efflux protein  46.18 
 
 		 320 aa  266  5e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0980  cation diffusion facilitator family transporter  45.33 
 
 		 305 aa  264  1e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1801  cation efflux family protein  47.39 
 
 		 376 aa  262  4e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0942158  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0225  cation diffusion facilitator family transporter  45.99 
 
 		 312 aa  262  6e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2873  cation diffusion facilitator family transporter  49.31 
 
 		 314 aa  257  2e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5667  cation diffusion facilitator family transporter  49.13 
 
 		 328 aa  256  4e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1439  cation efflux protein  44.37 
 
 		 293 aa  250  2e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0109958  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07750  cation diffusion facilitator family transporter  42.81 
 
 		 330 aa  245  9e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3146  cation efflux family protein  44.95 
 
 		 296 aa  236  4e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440371  hitchhiker  0.000651912 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5864  cation diffusion facilitator family transporter  43.42 
 
 		 300 aa  223  3e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.499716  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2239  cation diffusion facilitator family transporter  40.96 
 
 		 302 aa  221  9.999999999999999e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0407082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5513  cation diffusion facilitator family transporter  41.92 
 
 		 295 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.281094  normal  0.363198 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0729  cation diffusion facilitator family transporter  38.52 
 
 		 304 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1178  cation diffusion facilitator family transporter  39.52 
 
 		 300 aa  213  4.9999999999999996e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00185198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1021  cation diffusion facilitator family transporter  38.49 
 
 		 346 aa  212  9e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4669  cation diffusion facilitator family transporter  43.06 
 
 		 332 aa  209  3e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2658  cation diffusion facilitator family transporter  40.89 
 
 		 295 aa  209  6e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3707  cation diffusion facilitator family transporter  39.51 
 
 		 319 aa  206  3e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0354783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0023  cation diffusion facilitator family transporter  39.79 
 
 		 295 aa  206  3e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.556428 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4244  cation diffusion facilitator family transporter  41.9 
 
 		 339 aa  206  3e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.337864 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0487  cation diffusion facilitator family transporter  39.51 
 
 		 319 aa  206  5e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3476  putative cation efflux family protein, CzcD-like protein  39.52 
 
 		 296 aa  205  6e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606573  normal  0.771262 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1206  cation diffusion facilitator family transporter  41.73 
 
 		 316 aa  205  8e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1334  cation diffusion facilitator family transporter  39.59 
 
 		 312 aa  205  8e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.215207  hitchhiker  0.000886879 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2446  cation diffusion facilitator family transporter  42.75 
 
 		 304 aa  204  1e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.526861  normal  0.400869 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2468  cation diffusion facilitator family transporter  41.2 
 
 		 295 aa  204  2e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.376521 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1598  cation diffusion facilitator family transporter  39.58 
 
 		 302 aa  201  9e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2294  cation diffusion facilitator family transporter  40.35 
 
 		 306 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38282  normal  0.177312 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0867  cation diffusion facilitator family transporter  42.7 
 
 		 295 aa  200  1.9999999999999998e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.851238 
 
 
-
 
NC_004310  BR1568  cation efflux family protein  40.34 
 
 		 302 aa  200  3e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1514  cation efflux family protein  40.34 
 
 		 302 aa  200  3e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4099  cation diffusion facilitator family transporter  39.16 
 
 		 304 aa  199  3.9999999999999996e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.932753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  38.11 
 
 		 311 aa  198  9e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3075  cation diffusion facilitator family transporter  38.11 
 
 		 304 aa  198  9e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0050  cation diffusion facilitator family transporter  39.5 
 
 		 317 aa  198  1.0000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.374526 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2198  cation diffusion facilitator family transporter  39.86 
 
 		 293 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.776966  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2809  cation diffusion facilitator family transporter  39.18 
 
 		 304 aa  197  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.252612  normal  0.010552 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  37.76 
 
 		 311 aa  196  3e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3065  cation diffusion facilitator family transporter  40.88 
 
 		 295 aa  192  5e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.686004  normal  0.910257 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3290  cation diffusion facilitator family transporter  40.88 
 
 		 295 aa  192  5e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3261  cation efflux system protein  37.76 
 
 		 305 aa  191  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826048  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1928  cation diffusion facilitator family transporter  42.75 
 
 		 305 aa  190  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.479128  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1521  cation diffusion facilitator family transporter  37.14 
 
 		 309 aa  188  1e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0331  cation efflux family protein  36.36 
 
 		 311 aa  187  2e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3264  cation diffusion facilitator family transporter  39.5 
 
 		 295 aa  187  3e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1013  metal cation efflux protein CzrB  38.3 
 
 		 302 aa  186  6e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.323499  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1683  cation diffusion facilitator family transporter  40.21 
 
 		 308 aa  184  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000676071  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0607  cation diffusion facilitator family transporter  36.91 
 
 		 309 aa  182  4.0000000000000006e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.212656  normal  0.0107339 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0589  cation diffusion facilitator family transporter  36.65 
 
 		 285 aa  182  6e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000134664  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3895  cation diffusion facilitator family transporter  36.17 
 
 		 307 aa  175  7e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.640647  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0526  cation diffusion facilitator family transporter  38.87 
 
 		 327 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1661  cation diffusion facilitator family transporter  35.89 
 
 		 331 aa  172  5.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1256  cation diffusion facilitator family transporter  37.05 
 
 		 303 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.513971  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0432  cation diffusion facilitator family transporter  37.21 
 
 		 331 aa  171  1e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2574  cation diffusion facilitator family transporter  37.41 
 
 		 310 aa  171  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1127  cation diffusion facilitator family transporter  34.86 
 
 		 323 aa  168  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2804  cation diffusion facilitator family transporter  32.13 
 
 		 303 aa  166  5e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2384  cation diffusion facilitator family transporter  37.8 
 
 		 295 aa  165  9e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.336168 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0446  cation diffusion facilitator family transporter  36.63 
 
 		 328 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.48861  normal  0.265047 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0724  cation diffusion facilitator family transporter  36.81 
 
 		 315 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152803  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2568  cation diffusion facilitator family transporter  32.86 
 
 		 332 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.364379 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3750  cation diffusion facilitator family transporter  32.62 
 
 		 326 aa  159  5e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220836  hitchhiker  0.0009443 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0470  cation diffusion facilitator family transporter  34.64 
 
 		 337 aa  159  8e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0457303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0463  cation efflux transporter  39.18 
 
 		 295 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.632211  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1509  putative transport system permease protein  31.07 
 
 		 314 aa  155  7e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073133  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1113  hypothetical protein  30.82 
 
 		 307 aa  154  2e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.416676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1954  cation diffusion facilitator family transporter  34.15 
 
 		 328 aa  154  2e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0806665 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0749  cation diffusion facilitator family transporter  34.3 
 
 		 338 aa  154  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2400  cation diffusion facilitator family transporter  34.16 
 
 		 307 aa  152  5.9999999999999996e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2000  cation diffusion facilitator family transporter  38.01 
 
 		 285 aa  152  8.999999999999999e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.7679  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4790  cation efflux family protein  31.94 
 
 		 297 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2115  cation diffusion facilitator family transporter  39.18 
 
 		 295 aa  150  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.922775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3741  cation diffusion facilitator family transporter  33.68 
 
 		 292 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4333  cation efflux protein  31.56 
 
 		 297 aa  144  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1379  cation diffusion facilitator family transporter  34.25 
 
 		 481 aa  142  6e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.892961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1536  cation diffusion facilitator family transporter  32.99 
 
 		 295 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.503443  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1582  cation diffusion facilitator family transporter  29.07 
 
 		 299 aa  139  8.999999999999999e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2795  ferrous iron efflux protein F  28.06 
 
 		 301 aa  138  1e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00102947  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0646  cation diffusion facilitator family transporter  31.99 
 
 		 289 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.186266  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4774  cation diffusion facilitator family transporter  31.42 
 
 		 290 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00437993 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0847  cation efflux protein  27.27 
 
 		 297 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2581  cation diffusion facilitator family transporter  35.41 
 
 		 325 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4650  cation diffusion facilitator family transporter  31.25 
 
 		 290 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.188299 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0400  cation diffusion facilitator family transporter  31.33 
 
 		 327 aa  133  3e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4828  cation diffusion facilitator family transporter  31.62 
 
 		 290 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2262  ferrous iron efflux protein F  28.47 
 
 		 302 aa  131  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000896639  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0791  cation diffusion facilitator family transporter  27.11 
 
 		 312 aa  130  4.0000000000000003e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3931  cation diffusion facilitator family transporter  27.64 
 
 		 289 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146752  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2871  cation efflux protein  28.92 
 
 		 317 aa  129  6e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0745  cation diffusion facilitator family transporter  30.88 
 
 		 460 aa  129  9.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4808  ferrous iron efflux protein F  29.81 
 
 		 300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>