More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1256 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_1256  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 
303 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.513971  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1021  cation diffusion facilitator family transporter  46.99 
 
 
346 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1114  cation efflux protein  42.6 
 
 
305 aa  215  5.9999999999999996e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2804  cation diffusion facilitator family transporter  43.82 
 
 
303 aa  212  7e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1483  cation diffusion facilitator family transporter  43.57 
 
 
308 aa  211  9e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1661  cation diffusion facilitator family transporter  38.21 
 
 
331 aa  210  2e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2073  cation diffusion facilitator family transporter  42.96 
 
 
308 aa  209  5e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.981542 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1439  cation efflux protein  40.14 
 
 
293 aa  206  4e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0109958  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1043  cation efflux protein  38.27 
 
 
320 aa  205  8e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2568  cation diffusion facilitator family transporter  32.78 
 
 
332 aa  205  8e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.364379 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1770  cation diffusion facilitator family transporter  42.39 
 
 
315 aa  202  5e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1850  cation diffusion facilitator family transporter  41.67 
 
 
315 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2239  cation diffusion facilitator family transporter  43.26 
 
 
302 aa  198  1.0000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0407082  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1731  cation diffusion facilitator family transporter  39.58 
 
 
315 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.560975  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2025  cation diffusion facilitator family transporter  37.05 
 
 
313 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0165078  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0980  cation diffusion facilitator family transporter  38.91 
 
 
305 aa  191  9e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0432  cation diffusion facilitator family transporter  37.31 
 
 
331 aa  191  2e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0225  cation diffusion facilitator family transporter  39.93 
 
 
312 aa  191  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1178  cation diffusion facilitator family transporter  39.58 
 
 
300 aa  189  2.9999999999999997e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00185198  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0597  cation diffusion facilitator family transporter  39.49 
 
 
302 aa  189  5e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1928  cation diffusion facilitator family transporter  44.74 
 
 
305 aa  189  5e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.479128  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3750  cation diffusion facilitator family transporter  37.81 
 
 
326 aa  189  5.999999999999999e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220836  hitchhiker  0.0009443 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0867  cation diffusion facilitator family transporter  42.55 
 
 
295 aa  188  1e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.851238 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2106  cation diffusion facilitator family transporter  42.03 
 
 
315 aa  186  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1801  cation efflux family protein  38.23 
 
 
376 aa  185  9e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0942158  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5667  cation diffusion facilitator family transporter  41.64 
 
 
328 aa  185  1.0000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2446  cation diffusion facilitator family transporter  40.98 
 
 
304 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.526861  normal  0.400869 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5864  cation diffusion facilitator family transporter  38.93 
 
 
300 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.499716  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0470  cation diffusion facilitator family transporter  34.15 
 
 
337 aa  181  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0457303  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0487  cation diffusion facilitator family transporter  40.21 
 
 
319 aa  180  2e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3707  cation diffusion facilitator family transporter  40.21 
 
 
319 aa  181  2e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0354783  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1013  metal cation efflux protein CzrB  35.31 
 
 
302 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.323499  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3476  putative cation efflux family protein, CzcD-like protein  37.05 
 
 
296 aa  178  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606573  normal  0.771262 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2873  cation diffusion facilitator family transporter  40.67 
 
 
314 aa  178  1e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1206  cation diffusion facilitator family transporter  38.15 
 
 
316 aa  176  6e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07750  cation diffusion facilitator family transporter  36.52 
 
 
330 aa  176  6e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3146  cation efflux family protein  38.89 
 
 
296 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440371  hitchhiker  0.000651912 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0400  cation diffusion facilitator family transporter  34.93 
 
 
327 aa  174  1.9999999999999998e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0589  cation diffusion facilitator family transporter  32.23 
 
 
285 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000134664  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4669  cation diffusion facilitator family transporter  38.89 
 
 
332 aa  172  5e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2468  cation diffusion facilitator family transporter  38.35 
 
 
295 aa  172  6.999999999999999e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.376521 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2658  cation diffusion facilitator family transporter  39.43 
 
 
295 aa  172  9e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1334  cation diffusion facilitator family transporter  38.91 
 
 
312 aa  171  1e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.215207  hitchhiker  0.000886879 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2198  cation diffusion facilitator family transporter  37.59 
 
 
293 aa  171  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.776966  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5513  cation diffusion facilitator family transporter  38.81 
 
 
295 aa  170  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.281094  normal  0.363198 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2294  cation diffusion facilitator family transporter  37.13 
 
 
306 aa  170  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38282  normal  0.177312 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4244  cation diffusion facilitator family transporter  39.39 
 
 
339 aa  170  3e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.337864 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3290  cation diffusion facilitator family transporter  39.35 
 
 
295 aa  169  4e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3065  cation diffusion facilitator family transporter  39.71 
 
 
295 aa  169  4e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.686004  normal  0.910257 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0023  cation diffusion facilitator family transporter  38.49 
 
 
295 aa  168  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.556428 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0729  cation diffusion facilitator family transporter  39.34 
 
 
304 aa  167  1e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3075  cation diffusion facilitator family transporter  37.59 
 
 
304 aa  168  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553073  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3261  cation efflux system protein  37.32 
 
 
305 aa  167  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826048  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2581  cation diffusion facilitator family transporter  42.13 
 
 
325 aa  165  8e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1521  cation diffusion facilitator family transporter  34.53 
 
 
309 aa  162  8.000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4099  cation diffusion facilitator family transporter  37.63 
 
 
304 aa  162  8.000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.932753  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  31.67 
 
 
311 aa  161  1e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0749  cation diffusion facilitator family transporter  35.36 
 
 
338 aa  161  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  31.08 
 
 
311 aa  160  2e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0526  cation diffusion facilitator family transporter  36.3 
 
 
327 aa  160  2e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1113  hypothetical protein  34.64 
 
 
307 aa  159  5e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.416676  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3264  cation diffusion facilitator family transporter  39.35 
 
 
295 aa  158  9e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3895  cation diffusion facilitator family transporter  33.95 
 
 
307 aa  157  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.640647  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0050  cation diffusion facilitator family transporter  35.13 
 
 
317 aa  157  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.374526 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1598  cation diffusion facilitator family transporter  36.62 
 
 
302 aa  156  4e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1568  cation efflux family protein  37.06 
 
 
302 aa  154  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1514  cation efflux family protein  37.06 
 
 
302 aa  154  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0463  cation efflux transporter  38.35 
 
 
295 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.632211  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0607  cation diffusion facilitator family transporter  36.33 
 
 
309 aa  152  7e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.212656  normal  0.0107339 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1143  cation efflux protein  33.33 
 
 
331 aa  151  1e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.344034  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2809  cation diffusion facilitator family transporter  35.56 
 
 
304 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.252612  normal  0.010552 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1954  cation diffusion facilitator family transporter  33.57 
 
 
328 aa  150  3e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0806665 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1509  putative transport system permease protein  32.43 
 
 
314 aa  149  4e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073133  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2000  cation diffusion facilitator family transporter  37.27 
 
 
285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.7679  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0331  cation efflux family protein  30.33 
 
 
311 aa  145  6e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2384  cation diffusion facilitator family transporter  37.63 
 
 
295 aa  145  6e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.336168 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0847  cation efflux protein  27.44 
 
 
297 aa  142  7e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1582  cation diffusion facilitator family transporter  29.71 
 
 
299 aa  142  9.999999999999999e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1127  cation diffusion facilitator family transporter  30.32 
 
 
323 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2400  cation diffusion facilitator family transporter  31.91 
 
 
307 aa  139  4.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2115  cation diffusion facilitator family transporter  38.71 
 
 
295 aa  138  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.922775  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1683  cation diffusion facilitator family transporter  31.51 
 
 
308 aa  137  3.0000000000000003e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000676071  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0446  cation diffusion facilitator family transporter  30.74 
 
 
328 aa  134  3e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.48861  normal  0.265047 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0724  cation diffusion facilitator family transporter  33.45 
 
 
315 aa  129  6e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152803  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1536  cation diffusion facilitator family transporter  35.11 
 
 
295 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.503443  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1752  cation diffusion facilitator family transporter  32.13 
 
 
301 aa  126  4.0000000000000003e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00011926  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0258  cation diffusion facilitator family transporter  29.72 
 
 
296 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0238617  decreased coverage  0.0000137847 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0263  cation diffusion facilitator family transporter  29.72 
 
 
296 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000665998  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0263  cation diffusion facilitator family transporter  29.72 
 
 
296 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3300  iron and zinc efflux system protein  27.6 
 
 
318 aa  119  6e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.831799  normal  0.0946092 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2871  cation efflux protein  31.43 
 
 
317 aa  119  7.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0167  cation diffusion facilitator family transporter  30.8 
 
 
305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11850  cation diffusion facilitator family transporter  31.27 
 
 
312 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2574  cation diffusion facilitator family transporter  32.12 
 
 
310 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0256  cation diffusion facilitator family transporter  29.24 
 
 
290 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.015822  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0791  cation diffusion facilitator family transporter  29.33 
 
 
312 aa  117  3e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1171  cation efflux family protein  26.79 
 
 
295 aa  117  3e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0972  cation efflux family protein  26.79 
 
 
295 aa  116  3.9999999999999997e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1026  cation efflux family protein  26.79 
 
 
295 aa  116  3.9999999999999997e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3931  cation diffusion facilitator family transporter  29.18 
 
 
289 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146752  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>