More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1582 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1582  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 299 aa  594  1e-169  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0847  cation efflux protein  53.61 
 
 		 297 aa  305  5.0000000000000004e-82  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1026  cation efflux family protein  48.8 
 
 		 295 aa  287  1e-76  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0972  cation efflux family protein  48.8 
 
 		 295 aa  287  1e-76  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1171  cation efflux family protein  48.45 
 
 		 295 aa  286  2e-76  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0896  cation efflux family protein  48.8 
 
 		 304 aa  264  1e-69  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0221423  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0084  pantothenate metabolism flavoprotein  45.23 
 
 		 311 aa  250  2e-65  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00694286  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1123  ferrous-iron efflux pump FieF  47.22 
 
 		 289 aa  243  3.9999999999999997e-63  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00791465  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0532  ferrous-iron efflux pump FieF  45.96 
 
 		 291 aa  234  1.0000000000000001e-60  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.800383  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00146  ferrous iron efflux protein F  36.24 
 
 		 302 aa  190  2e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002221  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  35.89 
 
 		 302 aa  183  3e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000518265  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2871  cation efflux protein  35.64 
 
 		 317 aa  182  6e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0484  cation efflux protein  39.39 
 
 		 298 aa  181  2e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4385  cation efflux family protein  34.88 
 
 		 301 aa  179  4.999999999999999e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.592721  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1509  putative transport system permease protein  34.52 
 
 		 314 aa  178  8e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073133  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2262  ferrous iron efflux protein F  36.64 
 
 		 302 aa  177  3e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000896639  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3300  iron and zinc efflux system protein  35.93 
 
 		 318 aa  176  3e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.831799  normal  0.0946092 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0088  ferrous iron efflux protein F  38.06 
 
 		 300 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0139  ferrous iron efflux protein F  35.61 
 
 		 300 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.205512  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0087  ferrous iron efflux protein F  37.69 
 
 		 300 aa  172  5e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4127  ferrous iron efflux protein F  37.69 
 
 		 300 aa  172  5e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03800  ferrous iron efflux protein F  34.94 
 
 		 300 aa  172  5.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.769582  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4070  cation diffusion facilitator family transporter  34.94 
 
 		 300 aa  172  5.999999999999999e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03749  hypothetical protein  34.94 
 
 		 300 aa  172  5.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.859371  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5369  ferrous iron efflux protein F  34.94 
 
 		 300 aa  172  5.999999999999999e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4103  ferrous iron efflux protein F  34.94 
 
 		 300 aa  172  5.999999999999999e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4145  ferrous iron efflux protein F  34.94 
 
 		 300 aa  172  5.999999999999999e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4448  ferrous iron efflux protein F  34.94 
 
 		 300 aa  172  5.999999999999999e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4355  ferrous iron efflux protein F  34.94 
 
 		 300 aa  172  6.999999999999999e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.363052 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4937  cation efflux protein  36.97 
 
 		 298 aa  171  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4020  ferrous iron efflux protein F  34.47 
 
 		 300 aa  171  1e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  31.38 
 
 		 311 aa  171  2e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4394  ferrous iron efflux protein F  34.94 
 
 		 300 aa  170  2e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3430  cation efflux family protein  37.14 
 
 		 289 aa  170  2e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.038315  normal  0.371724 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0791  cation diffusion facilitator family transporter  33.69 
 
 		 312 aa  170  3e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4459  ferrous iron efflux protein F  34.46 
 
 		 300 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.709567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4333  cation efflux protein  35.56 
 
 		 297 aa  168  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4390  ferrous iron efflux protein F  34.46 
 
 		 300 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.228028 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0137  ferrous iron efflux protein F  35.61 
 
 		 300 aa  168  1e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4392  ferrous iron efflux protein F  34.46 
 
 		 300 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  31.72 
 
 		 311 aa  167  2e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0589  cation diffusion facilitator family transporter  34.51 
 
 		 285 aa  167  2e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000134664  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4057  ferrous iron efflux protein F  34.04 
 
 		 300 aa  167  2e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.3408  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0331  cation efflux family protein  32.44 
 
 		 311 aa  166  4e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2795  ferrous iron efflux protein F  33.79 
 
 		 301 aa  166  5.9999999999999996e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00102947  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3813  ferrous iron efflux protein F  33.33 
 
 		 298 aa  165  6.9999999999999995e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.70191  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4307  ferrous iron efflux protein F  34.08 
 
 		 300 aa  165  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4774  cation diffusion facilitator family transporter  35.82 
 
 		 290 aa  165  9e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00437993 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4278  ferrous iron efflux protein F  34.08 
 
 		 300 aa  165  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.546202  normal  0.887398 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0314  cation diffusion facilitator family transporter  36.79 
 
 		 289 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000499164  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0263  cation diffusion facilitator family transporter  34.03 
 
 		 296 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0263  cation diffusion facilitator family transporter  34.03 
 
 		 296 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000665998  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4650  cation diffusion facilitator family transporter  35.82 
 
 		 290 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.188299 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0256  cation diffusion facilitator family transporter  34.64 
 
 		 290 aa  162  6e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.015822  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4790  cation efflux family protein  35.21 
 
 		 297 aa  161  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0369  cation diffusion facilitator family transporter  35.71 
 
 		 293 aa  161  1e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000868845  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0258  cation diffusion facilitator family transporter  33.68 
 
 		 296 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0238617  decreased coverage  0.0000137847 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0254  cation diffusion facilitator family transporter  36.07 
 
 		 297 aa  159  8e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00100286  hitchhiker  0.000434478 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1113  hypothetical protein  36.03 
 
 		 307 aa  158  1e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.416676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12610  putative transporter  36.08 
 
 		 298 aa  158  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.686969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4808  ferrous iron efflux protein F  34.09 
 
 		 300 aa  158  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0646  cation diffusion facilitator family transporter  35.46 
 
 		 289 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.186266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3767  cation diffusion facilitator family transporter  36.07 
 
 		 297 aa  157  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0281724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0255  cation diffusion facilitator family transporter  35.71 
 
 		 299 aa  157  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000211411  hitchhiker  0.0000000259918 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3741  cation diffusion facilitator family transporter  36.27 
 
 		 292 aa  157  3e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3895  cation diffusion facilitator family transporter  33.1 
 
 		 307 aa  156  4e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.640647  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1146  putative transporter  35.4 
 
 		 298 aa  156  4e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1683  cation diffusion facilitator family transporter  34.4 
 
 		 308 aa  155  5.0000000000000005e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000676071  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2000  cation diffusion facilitator family transporter  34.52 
 
 		 285 aa  153  4e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.7679  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1521  cation diffusion facilitator family transporter  34.04 
 
 		 309 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3459  cation diffusion facilitator family transporter  36.7 
 
 		 295 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000668227  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1954  cation diffusion facilitator family transporter  30.2 
 
 		 328 aa  150  3e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0806665 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4475  cation efflux family protein  35.36 
 
 		 296 aa  149  5e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0241  cation diffusion facilitator family transporter  34.83 
 
 		 310 aa  149  5e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000961232  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2400  cation diffusion facilitator family transporter  31.03 
 
 		 307 aa  149  5e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1127  cation diffusion facilitator family transporter  31.45 
 
 		 323 aa  149  6e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0281  cation diffusion facilitator family transporter  35.71 
 
 		 289 aa  149  6e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000230949  unclonable  0.000000000100578 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4753  cation diffusion facilitator family transporter  30.56 
 
 		 296 aa  148  9e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.36054  decreased coverage  0.00983844 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3931  cation diffusion facilitator family transporter  33.93 
 
 		 289 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146752  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09970  Cation efflux protein  33.67 
 
 		 293 aa  147  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.907578  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0283  cation diffusion facilitator family transporter  36.43 
 
 		 289 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000135254  hitchhiker  0.000000557586 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4947  cation diffusion facilitator family transporter  30.99 
 
 		 312 aa  147  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.723787  normal  0.395043 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4828  cation diffusion facilitator family transporter  34.75 
 
 		 290 aa  145  9e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3568  cation diffusion facilitator family transporter  37.14 
 
 		 289 aa  145  9e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000153022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1177  cation diffusion facilitator family transporter  30.24 
 
 		 308 aa  141  9.999999999999999e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2628  cation efflux protein  31.56 
 
 		 325 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.620911  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0047  cation diffusion facilitator family transporter  29.43 
 
 		 325 aa  140  3e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.408108  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2025  cation diffusion facilitator family transporter  29.07 
 
 		 313 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0165078  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3065  cation diffusion facilitator family transporter  30.24 
 
 		 295 aa  138  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.686004  normal  0.910257 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1114  cation efflux protein  27.11 
 
 		 305 aa  138  1e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3290  cation diffusion facilitator family transporter  29.9 
 
 		 295 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0446  cation diffusion facilitator family transporter  30.03 
 
 		 328 aa  136  4e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.48861  normal  0.265047 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0526  cation diffusion facilitator family transporter  31.62 
 
 		 327 aa  136  5e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1379  cation diffusion facilitator family transporter  27.88 
 
 		 481 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.892961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0597  cation diffusion facilitator family transporter  27.72 
 
 		 302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3075  cation diffusion facilitator family transporter  29.08 
 
 		 304 aa  134  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0225  cation diffusion facilitator family transporter  27.5 
 
 		 312 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1256  cation diffusion facilitator family transporter  29.96 
 
 		 303 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.513971  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0023  cation diffusion facilitator family transporter  25.85 
 
 		 295 aa  129  6e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.556428 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1021  cation diffusion facilitator family transporter  27.17 
 
 		 346 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>