More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3813 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_3813  ferrous iron efflux protein F  100 
 
 		 298 aa  600  1.0000000000000001e-171  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.70191  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4020  ferrous iron efflux protein F  87.25 
 
 		 300 aa  508  1e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0139  ferrous iron efflux protein F  78.11 
 
 		 300 aa  474  1e-133  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.205512  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0137  ferrous iron efflux protein F  75.42 
 
 		 300 aa  449  1e-125  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4057  ferrous iron efflux protein F  72.85 
 
 		 300 aa  438  9.999999999999999e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.3408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4392  ferrous iron efflux protein F  73.56 
 
 		 300 aa  437  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4459  ferrous iron efflux protein F  73.56 
 
 		 300 aa  437  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.709567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4390  ferrous iron efflux protein F  73.56 
 
 		 300 aa  437  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.228028 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4278  ferrous iron efflux protein F  72.88 
 
 		 300 aa  435  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.546202  normal  0.887398 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4307  ferrous iron efflux protein F  73.56 
 
 		 300 aa  435  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03800  ferrous iron efflux protein F  72.2 
 
 		 300 aa  432  1e-120  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.769582  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4070  cation diffusion facilitator family transporter  72.2 
 
 		 300 aa  432  1e-120  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4355  ferrous iron efflux protein F  72.2 
 
 		 300 aa  432  1e-120  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.363052 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4145  ferrous iron efflux protein F  72.2 
 
 		 300 aa  432  1e-120  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03749  hypothetical protein  72.2 
 
 		 300 aa  432  1e-120  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.859371  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4103  ferrous iron efflux protein F  72.2 
 
 		 300 aa  432  1e-120  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4448  ferrous iron efflux protein F  72.2 
 
 		 300 aa  432  1e-120  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5369  ferrous iron efflux protein F  72.2 
 
 		 300 aa  432  1e-120  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4394  ferrous iron efflux protein F  72.2 
 
 		 300 aa  431  1e-119  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0088  ferrous iron efflux protein F  69.8 
 
 		 300 aa  417  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4808  ferrous iron efflux protein F  71.81 
 
 		 300 aa  419  1e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0087  ferrous iron efflux protein F  70.13 
 
 		 300 aa  419  1e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4127  ferrous iron efflux protein F  70.13 
 
 		 300 aa  419  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2262  ferrous iron efflux protein F  64.48 
 
 		 302 aa  382  1e-105  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000896639  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00146  ferrous iron efflux protein F  64.83 
 
 		 302 aa  380  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002221  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  63.79 
 
 		 302 aa  374  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000518265  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2795  ferrous iron efflux protein F  63.45 
 
 		 301 aa  368  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00102947  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0484  cation efflux protein  50.34 
 
 		 298 aa  302  5.000000000000001e-81  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3300  iron and zinc efflux system protein  47.93 
 
 		 318 aa  293  2e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.831799  normal  0.0946092 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0263  cation diffusion facilitator family transporter  48.57 
 
 		 296 aa  267  1e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000665998  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0256  cation diffusion facilitator family transporter  49.29 
 
 		 290 aa  267  2e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.015822  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0791  cation diffusion facilitator family transporter  45.73 
 
 		 312 aa  267  2e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0258  cation diffusion facilitator family transporter  48.57 
 
 		 296 aa  267  2e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0238617  decreased coverage  0.0000137847 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0263  cation diffusion facilitator family transporter  48.57 
 
 		 296 aa  267  2e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3430  cation efflux family protein  48.24 
 
 		 289 aa  267  2e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.038315  normal  0.371724 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0369  cation diffusion facilitator family transporter  48.4 
 
 		 293 aa  260  2e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000868845  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4937  cation efflux protein  47.55 
 
 		 298 aa  259  3e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3931  cation diffusion facilitator family transporter  48.75 
 
 		 289 aa  259  4e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146752  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0254  cation diffusion facilitator family transporter  48.76 
 
 		 297 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00100286  hitchhiker  0.000434478 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3741  cation diffusion facilitator family transporter  47.24 
 
 		 292 aa  258  9e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4385  cation efflux family protein  43.84 
 
 		 301 aa  256  3e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.592721  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4333  cation efflux protein  47.22 
 
 		 297 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3767  cation diffusion facilitator family transporter  48.06 
 
 		 297 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0281724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0281  cation diffusion facilitator family transporter  49.82 
 
 		 289 aa  253  3e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000230949  unclonable  0.000000000100578 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0314  cation diffusion facilitator family transporter  46.95 
 
 		 289 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000499164  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4790  cation efflux family protein  45.8 
 
 		 297 aa  252  5.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4475  cation efflux family protein  47.55 
 
 		 296 aa  252  6e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4774  cation diffusion facilitator family transporter  48.06 
 
 		 290 aa  251  9.000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00437993 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4650  cation diffusion facilitator family transporter  48.06 
 
 		 290 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.188299 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0255  cation diffusion facilitator family transporter  47.7 
 
 		 299 aa  251  1e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000211411  hitchhiker  0.0000000259918 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0241  cation diffusion facilitator family transporter  48.46 
 
 		 310 aa  250  2e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000961232  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2871  cation efflux protein  46.67 
 
 		 317 aa  250  3e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12610  putative transporter  47.4 
 
 		 298 aa  249  3e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.686969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3459  cation diffusion facilitator family transporter  45.45 
 
 		 295 aa  249  4e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000668227  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1146  putative transporter  46.71 
 
 		 298 aa  249  5e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0283  cation diffusion facilitator family transporter  49.1 
 
 		 289 aa  248  9e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000135254  hitchhiker  0.000000557586 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3568  cation diffusion facilitator family transporter  50.18 
 
 		 289 aa  246  4e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000153022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0646  cation diffusion facilitator family transporter  45.94 
 
 		 289 aa  241  9e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.186266  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09970  Cation efflux protein  48.04 
 
 		 293 aa  241  2e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.907578  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2628  cation efflux protein  43.86 
 
 		 325 aa  240  2e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.620911  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4828  cation diffusion facilitator family transporter  46.64 
 
 		 290 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1177  cation diffusion facilitator family transporter  41.96 
 
 		 308 aa  220  3e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4753  cation diffusion facilitator family transporter  41.67 
 
 		 296 aa  210  3e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.36054  decreased coverage  0.00983844 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0047  cation diffusion facilitator family transporter  40.77 
 
 		 325 aa  205  8e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.408108  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4947  cation diffusion facilitator family transporter  38.1 
 
 		 312 aa  190  2.9999999999999997e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.723787  normal  0.395043 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1582  cation diffusion facilitator family transporter  33.45 
 
 		 299 aa  172  6.999999999999999e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1509  putative transport system permease protein  36.01 
 
 		 314 aa  170  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073133  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1026  cation efflux family protein  31.65 
 
 		 295 aa  168  8e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0972  cation efflux family protein  31.65 
 
 		 295 aa  168  8e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0116  cation diffusion facilitator family transporter  38.06 
 
 		 323 aa  168  1e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.358203  normal  0.378394 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1171  cation efflux family protein  31.29 
 
 		 295 aa  166  4e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2574  cation diffusion facilitator family transporter  32.18 
 
 		 310 aa  162  7e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0847  cation efflux protein  32.37 
 
 		 297 aa  160  2e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3075  cation diffusion facilitator family transporter  34.44 
 
 		 304 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0084  pantothenate metabolism flavoprotein  33.09 
 
 		 311 aa  151  1e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00694286  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0896  cation efflux family protein  29.14 
 
 		 304 aa  151  1e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0221423  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3261  cation efflux system protein  32.16 
 
 		 305 aa  150  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826048  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2809  cation diffusion facilitator family transporter  34.07 
 
 		 304 aa  149  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.252612  normal  0.010552 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1123  ferrous-iron efflux pump FieF  30.55 
 
 		 289 aa  147  2.0000000000000003e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00791465  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2468  cation diffusion facilitator family transporter  32.38 
 
 		 295 aa  144  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.376521 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2000  cation diffusion facilitator family transporter  35.85 
 
 		 285 aa  142  6e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.7679  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  32.63 
 
 		 311 aa  142  7e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2239  cation diffusion facilitator family transporter  32.51 
 
 		 302 aa  141  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0407082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3290  cation diffusion facilitator family transporter  32.13 
 
 		 295 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3065  cation diffusion facilitator family transporter  31.77 
 
 		 295 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.686004  normal  0.910257 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  32.28 
 
 		 311 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2294  cation diffusion facilitator family transporter  31.16 
 
 		 306 aa  140  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38282  normal  0.177312 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3435  cation diffusion facilitator family transporter  34.39 
 
 		 478 aa  138  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0253813 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1954  cation diffusion facilitator family transporter  30.71 
 
 		 328 aa  137  2e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0806665 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0023  cation diffusion facilitator family transporter  32.37 
 
 		 295 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.556428 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2446  cation diffusion facilitator family transporter  31.54 
 
 		 304 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.526861  normal  0.400869 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2198  cation diffusion facilitator family transporter  33.46 
 
 		 293 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.776966  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0589  cation diffusion facilitator family transporter  29 
 
 		 285 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000134664  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2658  cation diffusion facilitator family transporter  32.16 
 
 		 295 aa  135  9e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1127  cation diffusion facilitator family transporter  30.22 
 
 		 323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1521  cation diffusion facilitator family transporter  27.9 
 
 		 309 aa  133  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1483  cation diffusion facilitator family transporter  29.33 
 
 		 308 aa  133  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1178  cation diffusion facilitator family transporter  32.5 
 
 		 300 aa  133  3.9999999999999996e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00185198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2073  cation diffusion facilitator family transporter  30.04 
 
 		 308 aa  132  9e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.981542 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1731  cation diffusion facilitator family transporter  30.1 
 
 		 315 aa  132  9e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.560975  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>