More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1123 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1123  ferrous-iron efflux pump FieF  100 
 
 
289 aa  571  1.0000000000000001e-162  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00791465  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0084  pantothenate metabolism flavoprotein  49.1 
 
 
311 aa  273  3e-72  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00694286  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1171  cation efflux family protein  48.1 
 
 
295 aa  253  2.0000000000000002e-66  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1582  cation diffusion facilitator family transporter  47.22 
 
 
299 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1026  cation efflux family protein  47.75 
 
 
295 aa  252  5.000000000000001e-66  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0972  cation efflux family protein  47.75 
 
 
295 aa  252  5.000000000000001e-66  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0532  ferrous-iron efflux pump FieF  46.83 
 
 
291 aa  243  3e-63  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.800383  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0896  cation efflux family protein  47.06 
 
 
304 aa  242  5e-63  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0221423  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0847  cation efflux protein  40.94 
 
 
297 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0484  cation efflux protein  35.13 
 
 
298 aa  154  1e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3813  ferrous iron efflux protein F  30.57 
 
 
298 aa  152  5e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.70191  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4020  ferrous iron efflux protein F  30.94 
 
 
300 aa  150  3e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1509  putative transport system permease protein  29.97 
 
 
314 aa  149  4e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073133  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2871  cation efflux protein  32.34 
 
 
317 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4385  cation efflux family protein  32.23 
 
 
301 aa  145  8.000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.592721  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00146  ferrous iron efflux protein F  32.7 
 
 
302 aa  145  8.000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2262  ferrous iron efflux protein F  33.58 
 
 
302 aa  144  2e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000896639  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4057  ferrous iron efflux protein F  30.66 
 
 
300 aa  143  3e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.3408  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0281  cation diffusion facilitator family transporter  33.33 
 
 
289 aa  143  4e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000230949  unclonable  0.000000000100578 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0589  cation diffusion facilitator family transporter  33.46 
 
 
285 aa  142  5e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000134664  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2795  ferrous iron efflux protein F  31.65 
 
 
301 aa  141  9.999999999999999e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00102947  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3931  cation diffusion facilitator family transporter  31.29 
 
 
289 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146752  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0139  ferrous iron efflux protein F  31.78 
 
 
300 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.205512  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002221  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  32.2 
 
 
302 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000518265  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0791  cation diffusion facilitator family transporter  32.13 
 
 
312 aa  140  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4394  ferrous iron efflux protein F  29.92 
 
 
300 aa  140  3e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4355  ferrous iron efflux protein F  29.55 
 
 
300 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.363052 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4307  ferrous iron efflux protein F  29.92 
 
 
300 aa  139  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4390  ferrous iron efflux protein F  29.92 
 
 
300 aa  139  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.228028 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4392  ferrous iron efflux protein F  29.92 
 
 
300 aa  139  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123338  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4459  ferrous iron efflux protein F  29.92 
 
 
300 aa  139  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.709567  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03800  ferrous iron efflux protein F  29.55 
 
 
300 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.769582  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4070  cation diffusion facilitator family transporter  29.55 
 
 
300 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5369  ferrous iron efflux protein F  29.55 
 
 
300 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4145  ferrous iron efflux protein F  29.55 
 
 
300 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4448  ferrous iron efflux protein F  29.55 
 
 
300 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03749  hypothetical protein  29.55 
 
 
300 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.859371  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4103  ferrous iron efflux protein F  29.55 
 
 
300 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0088  ferrous iron efflux protein F  31.34 
 
 
300 aa  138  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4808  ferrous iron efflux protein F  28.79 
 
 
300 aa  137  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4278  ferrous iron efflux protein F  29.55 
 
 
300 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.546202  normal  0.887398 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3895  cation diffusion facilitator family transporter  29.96 
 
 
307 aa  137  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.640647  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0087  ferrous iron efflux protein F  30.97 
 
 
300 aa  136  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0137  ferrous iron efflux protein F  31.78 
 
 
300 aa  136  4e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4127  ferrous iron efflux protein F  30.97 
 
 
300 aa  136  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0369  cation diffusion facilitator family transporter  31.79 
 
 
293 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000868845  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4650  cation diffusion facilitator family transporter  29.81 
 
 
290 aa  135  9e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.188299 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4774  cation diffusion facilitator family transporter  29.6 
 
 
290 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00437993 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2628  cation efflux protein  30.37 
 
 
325 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.620911  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3459  cation diffusion facilitator family transporter  31.67 
 
 
295 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000668227  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3430  cation efflux family protein  30.6 
 
 
289 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.038315  normal  0.371724 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  29.1 
 
 
311 aa  134  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3300  iron and zinc efflux system protein  32.83 
 
 
318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.831799  normal  0.0946092 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1127  cation diffusion facilitator family transporter  28.82 
 
 
323 aa  133  3e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0314  cation diffusion facilitator family transporter  31.29 
 
 
289 aa  132  5e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000499164  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3767  cation diffusion facilitator family transporter  31.67 
 
 
297 aa  132  6e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0281724  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  28.84 
 
 
311 aa  132  7.999999999999999e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0283  cation diffusion facilitator family transporter  32.38 
 
 
289 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000135254  hitchhiker  0.000000557586 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4475  cation efflux family protein  31.65 
 
 
296 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1954  cation diffusion facilitator family transporter  29.26 
 
 
328 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0806665 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4937  cation efflux protein  28.3 
 
 
298 aa  130  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1146  putative transporter  29.96 
 
 
298 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0254  cation diffusion facilitator family transporter  31.18 
 
 
297 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00100286  hitchhiker  0.000434478 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2400  cation diffusion facilitator family transporter  28.03 
 
 
307 aa  129  5.0000000000000004e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12610  putative transporter  29.48 
 
 
298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.686969  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0256  cation diffusion facilitator family transporter  29.86 
 
 
290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.015822  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4333  cation efflux protein  29.39 
 
 
297 aa  126  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0263  cation diffusion facilitator family transporter  30.22 
 
 
296 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1521  cation diffusion facilitator family transporter  29.47 
 
 
309 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0263  cation diffusion facilitator family transporter  30.22 
 
 
296 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000665998  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3741  cation diffusion facilitator family transporter  30.71 
 
 
292 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1113  hypothetical protein  30.56 
 
 
307 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.416676  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0255  cation diffusion facilitator family transporter  30.96 
 
 
299 aa  126  5e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000211411  hitchhiker  0.0000000259918 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4790  cation efflux family protein  28.96 
 
 
297 aa  125  9e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0258  cation diffusion facilitator family transporter  30.22 
 
 
296 aa  125  9e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0238617  decreased coverage  0.0000137847 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4828  cation diffusion facilitator family transporter  29.43 
 
 
290 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09970  Cation efflux protein  29.71 
 
 
293 aa  121  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.907578  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0331  cation efflux family protein  29.21 
 
 
311 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0241  cation diffusion facilitator family transporter  31.78 
 
 
310 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000961232  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2000  cation diffusion facilitator family transporter  30.15 
 
 
285 aa  120  3e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.7679  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3568  cation diffusion facilitator family transporter  33.06 
 
 
289 aa  119  6e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000153022  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0646  cation diffusion facilitator family transporter  27.92 
 
 
289 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.186266  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0724  cation diffusion facilitator family transporter  30.58 
 
 
315 aa  118  9e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152803  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3075  cation diffusion facilitator family transporter  27.04 
 
 
304 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553073  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0526  cation diffusion facilitator family transporter  26.22 
 
 
327 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1741  cation diffusion facilitator family transporter  22.11 
 
 
307 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00244826  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07750  cation diffusion facilitator family transporter  23.99 
 
 
330 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1177  cation diffusion facilitator family transporter  28.99 
 
 
308 aa  109  6e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4753  cation diffusion facilitator family transporter  25.93 
 
 
296 aa  108  8.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.36054  decreased coverage  0.00983844 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0225  cation diffusion facilitator family transporter  23.9 
 
 
312 aa  108  9.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1021  cation diffusion facilitator family transporter  25.43 
 
 
346 aa  107  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0446  cation diffusion facilitator family transporter  28.99 
 
 
328 aa  108  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.48861  normal  0.265047 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2574  cation diffusion facilitator family transporter  26.87 
 
 
310 aa  107  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2073  cation diffusion facilitator family transporter  23.4 
 
 
308 aa  107  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.981542 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2025  cation diffusion facilitator family transporter  25.74 
 
 
313 aa  107  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0165078  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1770  cation diffusion facilitator family transporter  22.14 
 
 
315 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1850  cation diffusion facilitator family transporter  23.16 
 
 
315 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0047  cation diffusion facilitator family transporter  26.33 
 
 
325 aa  106  4e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.408108  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1360  cation diffusion facilitator family transporter  31.64 
 
 
396 aa  105  6e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2239  cation diffusion facilitator family transporter  24.04 
 
 
302 aa  105  8e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0407082  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>