More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3300 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_3300  iron and zinc efflux system protein  100 
 
 		 318 aa  642    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.831799  normal  0.0946092 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002221  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  51 
 
 		 302 aa  310  2.9999999999999997e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000518265  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00146  ferrous iron efflux protein F  49.67 
 
 		 302 aa  307  2.0000000000000002e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4307  ferrous iron efflux protein F  49.66 
 
 		 300 aa  301  9e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4390  ferrous iron efflux protein F  49.66 
 
 		 300 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.228028 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4459  ferrous iron efflux protein F  49.66 
 
 		 300 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.709567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4392  ferrous iron efflux protein F  49.66 
 
 		 300 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4355  ferrous iron efflux protein F  49.66 
 
 		 300 aa  300  2e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.363052 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03800  ferrous iron efflux protein F  49.32 
 
 		 300 aa  300  3e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.769582  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4070  cation diffusion facilitator family transporter  49.32 
 
 		 300 aa  300  3e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4145  ferrous iron efflux protein F  49.32 
 
 		 300 aa  300  3e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03749  hypothetical protein  49.32 
 
 		 300 aa  300  3e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.859371  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5369  ferrous iron efflux protein F  49.32 
 
 		 300 aa  300  3e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4448  ferrous iron efflux protein F  49.32 
 
 		 300 aa  300  3e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4103  ferrous iron efflux protein F  49.32 
 
 		 300 aa  300  3e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4057  ferrous iron efflux protein F  48.97 
 
 		 300 aa  298  6e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.3408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4278  ferrous iron efflux protein F  49.32 
 
 		 300 aa  298  6e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.546202  normal  0.887398 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4394  ferrous iron efflux protein F  49.32 
 
 		 300 aa  298  1e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2262  ferrous iron efflux protein F  49.34 
 
 		 302 aa  297  2e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000896639  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2795  ferrous iron efflux protein F  50 
 
 		 301 aa  296  3e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00102947  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3813  ferrous iron efflux protein F  47.93 
 
 		 298 aa  285  5e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.70191  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4808  ferrous iron efflux protein F  48.81 
 
 		 300 aa  285  7e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4127  ferrous iron efflux protein F  47.77 
 
 		 300 aa  285  9e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0087  ferrous iron efflux protein F  47.77 
 
 		 300 aa  285  9e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4020  ferrous iron efflux protein F  48.28 
 
 		 300 aa  284  1.0000000000000001e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0139  ferrous iron efflux protein F  47.44 
 
 		 300 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.205512  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0088  ferrous iron efflux protein F  47.42 
 
 		 300 aa  283  4.0000000000000003e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0137  ferrous iron efflux protein F  47.78 
 
 		 300 aa  279  5e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4937  cation efflux protein  46.42 
 
 		 298 aa  276  3e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0256  cation diffusion facilitator family transporter  47.22 
 
 		 290 aa  275  5e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.015822  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0263  cation diffusion facilitator family transporter  47.04 
 
 		 296 aa  275  9e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0263  cation diffusion facilitator family transporter  47.04 
 
 		 296 aa  275  9e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000665998  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4333  cation efflux protein  45.67 
 
 		 297 aa  272  5.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0258  cation diffusion facilitator family transporter  46.69 
 
 		 296 aa  271  8.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0238617  decreased coverage  0.0000137847 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0369  cation diffusion facilitator family transporter  45.7 
 
 		 293 aa  271  1e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000868845  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4790  cation efflux family protein  44.98 
 
 		 297 aa  268  7e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0646  cation diffusion facilitator family transporter  48.94 
 
 		 289 aa  268  7e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.186266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3430  cation efflux family protein  48.25 
 
 		 289 aa  268  1e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.038315  normal  0.371724 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3931  cation diffusion facilitator family transporter  46.48 
 
 		 289 aa  267  2e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146752  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4650  cation diffusion facilitator family transporter  47.18 
 
 		 290 aa  267  2e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.188299 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12610  putative transporter  46.08 
 
 		 298 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.686969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0254  cation diffusion facilitator family transporter  46.71 
 
 		 297 aa  265  5.999999999999999e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00100286  hitchhiker  0.000434478 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4774  cation diffusion facilitator family transporter  46.48 
 
 		 290 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00437993 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0314  cation diffusion facilitator family transporter  47.74 
 
 		 289 aa  264  1e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000499164  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1146  putative transporter  45.39 
 
 		 298 aa  264  2e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0255  cation diffusion facilitator family transporter  46.37 
 
 		 299 aa  264  2e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000211411  hitchhiker  0.0000000259918 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3741  cation diffusion facilitator family transporter  47.22 
 
 		 292 aa  263  3e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3459  cation diffusion facilitator family transporter  45.89 
 
 		 295 aa  261  1e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000668227  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3767  cation diffusion facilitator family transporter  45.67 
 
 		 297 aa  261  1e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0281724  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4475  cation efflux family protein  45.33 
 
 		 296 aa  256  5e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4385  cation efflux family protein  43.48 
 
 		 301 aa  254  1.0000000000000001e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.592721  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0791  cation diffusion facilitator family transporter  45.08 
 
 		 312 aa  253  3e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0484  cation efflux protein  44.64 
 
 		 298 aa  253  4.0000000000000004e-66  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0281  cation diffusion facilitator family transporter  45.99 
 
 		 289 aa  251  2e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000230949  unclonable  0.000000000100578 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2628  cation efflux protein  44.18 
 
 		 325 aa  250  3e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.620911  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0283  cation diffusion facilitator family transporter  45.99 
 
 		 289 aa  248  1e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000135254  hitchhiker  0.000000557586 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4828  cation diffusion facilitator family transporter  46.83 
 
 		 290 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3568  cation diffusion facilitator family transporter  45.26 
 
 		 289 aa  242  6e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000153022  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09970  Cation efflux protein  45.61 
 
 		 293 aa  241  1e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.907578  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2871  cation efflux protein  42.95 
 
 		 317 aa  239  5.999999999999999e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1177  cation diffusion facilitator family transporter  41.18 
 
 		 308 aa  214  9.999999999999999e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0241  cation diffusion facilitator family transporter  41.81 
 
 		 310 aa  209  3e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000961232  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0047  cation diffusion facilitator family transporter  35.05 
 
 		 325 aa  206  5e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.408108  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4753  cation diffusion facilitator family transporter  36.96 
 
 		 296 aa  194  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.36054  decreased coverage  0.00983844 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4947  cation diffusion facilitator family transporter  36.13 
 
 		 312 aa  181  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.723787  normal  0.395043 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1026  cation efflux family protein  35.66 
 
 		 295 aa  180  2.9999999999999997e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0972  cation efflux family protein  35.66 
 
 		 295 aa  180  2.9999999999999997e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1171  cation efflux family protein  35.66 
 
 		 295 aa  180  2.9999999999999997e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0116  cation diffusion facilitator family transporter  36.88 
 
 		 323 aa  179  8e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.358203  normal  0.378394 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1582  cation diffusion facilitator family transporter  35.93 
 
 		 299 aa  176  3e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1509  putative transport system permease protein  35.48 
 
 		 314 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073133  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0896  cation efflux family protein  33.67 
 
 		 304 aa  166  4e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0221423  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0589  cation diffusion facilitator family transporter  32.14 
 
 		 285 aa  160  3e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000134664  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0847  cation efflux protein  32.74 
 
 		 297 aa  159  4e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0084  pantothenate metabolism flavoprotein  34.01 
 
 		 311 aa  157  3e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00694286  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  31.31 
 
 		 311 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3895  cation diffusion facilitator family transporter  30.34 
 
 		 307 aa  152  8e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.640647  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  31.79 
 
 		 311 aa  151  1e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2000  cation diffusion facilitator family transporter  33.22 
 
 		 285 aa  149  7e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.7679  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1954  cation diffusion facilitator family transporter  31.41 
 
 		 328 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0806665 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0446  cation diffusion facilitator family transporter  31.01 
 
 		 328 aa  144  2e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.48861  normal  0.265047 
 
 
-
 
NC_002936  DET0331  cation efflux family protein  31.31 
 
 		 311 aa  142  7e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0745  cation diffusion facilitator family transporter  30.2 
 
 		 460 aa  142  8e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1113  hypothetical protein  31.65 
 
 		 307 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.416676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0526  cation diffusion facilitator family transporter  29.21 
 
 		 327 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1683  cation diffusion facilitator family transporter  31.07 
 
 		 308 aa  139  4.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000676071  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3075  cation diffusion facilitator family transporter  31.32 
 
 		 304 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0846  cation diffusion facilitator family transporter  27.88 
 
 		 459 aa  136  4e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0034385  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2446  cation diffusion facilitator family transporter  28.47 
 
 		 304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.526861  normal  0.400869 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2400  cation diffusion facilitator family transporter  28.86 
 
 		 307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2530  cation diffusion facilitator family transporter  29.79 
 
 		 460 aa  134  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1521  cation diffusion facilitator family transporter  29.5 
 
 		 309 aa  133  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1483  cation diffusion facilitator family transporter  28 
 
 		 308 aa  131  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2198  cation diffusion facilitator family transporter  27.57 
 
 		 293 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.776966  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2574  cation diffusion facilitator family transporter  28.87 
 
 		 310 aa  130  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1127  cation diffusion facilitator family transporter  29.76 
 
 		 323 aa  130  3e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3261  cation efflux system protein  30.34 
 
 		 305 aa  130  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826048  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1439  cation efflux protein  28.83 
 
 		 293 aa  129  6e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0109958  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1114  cation efflux protein  28.36 
 
 		 305 aa  129  8.000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1043  cation efflux protein  28.07 
 
 		 320 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>