More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2530 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_2530  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 460 aa  923    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0198  cation diffusion facilitator family transporter  40.18 
 
 		 474 aa  350  3e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.859565 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1450  cation diffusion facilitator family transporter  40.75 
 
 		 460 aa  345  1e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.25137  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0745  cation diffusion facilitator family transporter  39.43 
 
 		 460 aa  333  6e-90  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3095  putative cation-efflux pump  40.6 
 
 		 462 aa  325  2e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3435  cation diffusion facilitator family transporter  39.02 
 
 		 478 aa  320  3e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0253813 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2019  cation diffusion facilitator family transporter  39.87 
 
 		 459 aa  319  5e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.40781 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1848  cation diffusion facilitator family transporter  39.25 
 
 		 460 aa  318  9e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.762115 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1201  cation efflux protein  39.95 
 
 		 460 aa  314  2.9999999999999996e-84  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2149  cation diffusion facilitator family transporter  40.14 
 
 		 460 aa  311  2e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0853  cation diffusion facilitator family transporter  34.59 
 
 		 479 aa  291  1e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0846  cation diffusion facilitator family transporter  35.57 
 
 		 459 aa  282  8.000000000000001e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0034385  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0550  cation efflux protein  37.31 
 
 		 459 aa  273  7e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.247369 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2245  cation diffusion facilitator family transporter  32.32 
 
 		 483 aa  268  2e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1379  cation diffusion facilitator family transporter  35.12 
 
 		 481 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.892961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0393  cation diffusion facilitator family transporter  34.36 
 
 		 483 aa  228  2e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.38697 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0974  cation diffusion facilitator family transporter  31.84 
 
 		 466 aa  206  8e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0710  cation diffusion facilitator family transporter  28.66 
 
 		 476 aa  186  7e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1202  cation diffusion facilitator family transporter  30.21 
 
 		 488 aa  181  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0622136  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3895  cation diffusion facilitator family transporter  37.37 
 
 		 307 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.640647  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  35.49 
 
 		 311 aa  164  4.0000000000000004e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  37.63 
 
 		 311 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2400  cation diffusion facilitator family transporter  34.36 
 
 		 307 aa  155  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0589  cation diffusion facilitator family transporter  35.92 
 
 		 285 aa  152  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000134664  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1954  cation diffusion facilitator family transporter  33.22 
 
 		 328 aa  147  3e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0806665 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0724  cation diffusion facilitator family transporter  34.59 
 
 		 315 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152803  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1521  cation diffusion facilitator family transporter  38.13 
 
 		 309 aa  146  7.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1683  cation diffusion facilitator family transporter  34.16 
 
 		 308 aa  145  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000676071  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0526  cation diffusion facilitator family transporter  35.76 
 
 		 327 aa  144  4e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1127  cation diffusion facilitator family transporter  34.36 
 
 		 323 aa  140  3e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0331  cation efflux family protein  34.02 
 
 		 311 aa  140  6e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1360  cation diffusion facilitator family transporter  30.42 
 
 		 396 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1113  hypothetical protein  33.11 
 
 		 307 aa  134  3e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.416676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2574  cation diffusion facilitator family transporter  32.99 
 
 		 310 aa  134  3e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4937  cation efflux protein  31.88 
 
 		 298 aa  134  5e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3300  iron and zinc efflux system protein  29.79 
 
 		 318 aa  133  6.999999999999999e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.831799  normal  0.0946092 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3931  cation diffusion facilitator family transporter  30.27 
 
 		 289 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146752  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4808  ferrous iron efflux protein F  30.15 
 
 		 300 aa  132  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1684  cation diffusion facilitator family transporter  26.56 
 
 		 450 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.000631579  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4475  cation efflux family protein  29.5 
 
 		 296 aa  131  3e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4394  ferrous iron efflux protein F  28.78 
 
 		 300 aa  130  6e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3767  cation diffusion facilitator family transporter  29.55 
 
 		 297 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0281724  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03800  ferrous iron efflux protein F  29.15 
 
 		 300 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.769582  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4070  cation diffusion facilitator family transporter  29.15 
 
 		 300 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4448  ferrous iron efflux protein F  29.15 
 
 		 300 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4459  ferrous iron efflux protein F  28.74 
 
 		 300 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.709567  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4790  cation efflux family protein  31.16 
 
 		 297 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4390  ferrous iron efflux protein F  28.74 
 
 		 300 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.228028 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4392  ferrous iron efflux protein F  28.74 
 
 		 300 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123338  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03749  hypothetical protein  29.15 
 
 		 300 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.859371  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5369  ferrous iron efflux protein F  29.15 
 
 		 300 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4145  ferrous iron efflux protein F  29.15 
 
 		 300 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4103  ferrous iron efflux protein F  29.15 
 
 		 300 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0087  ferrous iron efflux protein F  29.12 
 
 		 300 aa  128  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1509  putative transport system permease protein  29.86 
 
 		 314 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073133  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4355  ferrous iron efflux protein F  28.78 
 
 		 300 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.363052 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4127  ferrous iron efflux protein F  29.12 
 
 		 300 aa  128  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4278  ferrous iron efflux protein F  28.35 
 
 		 300 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.546202  normal  0.887398 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0281  cation diffusion facilitator family transporter  31.44 
 
 		 289 aa  127  3e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000230949  unclonable  0.000000000100578 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4333  cation efflux protein  30.43 
 
 		 297 aa  128  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4307  ferrous iron efflux protein F  28.35 
 
 		 300 aa  128  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2250  cation diffusion facilitator family transporter  28.77 
 
 		 294 aa  127  3e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000133165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4057  ferrous iron efflux protein F  29.04 
 
 		 300 aa  128  3e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.3408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0314  cation diffusion facilitator family transporter  31.18 
 
 		 289 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000499164  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0332  cation diffusion facilitator family transporter  24.33 
 
 		 450 aa  127  5e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4774  cation diffusion facilitator family transporter  30.66 
 
 		 290 aa  127  6e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00437993 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0139  ferrous iron efflux protein F  30.04 
 
 		 300 aa  127  6e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.205512  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0088  ferrous iron efflux protein F  28.74 
 
 		 300 aa  126  7e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3261  cation efflux system protein  32.98 
 
 		 305 aa  125  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826048  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0137  ferrous iron efflux protein F  30.77 
 
 		 300 aa  125  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4020  ferrous iron efflux protein F  31.35 
 
 		 300 aa  124  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0369  cation diffusion facilitator family transporter  29.01 
 
 		 293 aa  125  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000868845  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0255  cation diffusion facilitator family transporter  28.79 
 
 		 299 aa  125  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000211411  hitchhiker  0.0000000259918 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4650  cation diffusion facilitator family transporter  30.29 
 
 		 290 aa  124  4e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.188299 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0254  cation diffusion facilitator family transporter  29.7 
 
 		 297 aa  124  4e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00100286  hitchhiker  0.000434478 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3568  cation diffusion facilitator family transporter  30.68 
 
 		 289 aa  123  7e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000153022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1177  cation diffusion facilitator family transporter  30.99 
 
 		 308 aa  122  9.999999999999999e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1146  putative transporter  31.2 
 
 		 298 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0283  cation diffusion facilitator family transporter  32.18 
 
 		 289 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000135254  hitchhiker  0.000000557586 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3813  ferrous iron efflux protein F  27.59 
 
 		 298 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.70191  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0256  cation diffusion facilitator family transporter  28.73 
 
 		 290 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.015822  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12610  putative transporter  31.2 
 
 		 298 aa  120  6e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.686969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3430  cation efflux family protein  31 
 
 		 289 aa  120  6e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.038315  normal  0.371724 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0258  cation diffusion facilitator family transporter  28 
 
 		 296 aa  119  9e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0238617  decreased coverage  0.0000137847 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0263  cation diffusion facilitator family transporter  28 
 
 		 296 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000665998  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1026  cation efflux family protein  29.07 
 
 		 295 aa  119  9.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0972  cation efflux family protein  29.07 
 
 		 295 aa  119  9.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0263  cation diffusion facilitator family transporter  28 
 
 		 296 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2262  ferrous iron efflux protein F  28.52 
 
 		 302 aa  118  3e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000896639  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0791  cation diffusion facilitator family transporter  30.34 
 
 		 312 aa  117  3.9999999999999997e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1171  cation efflux family protein  28.29 
 
 		 295 aa  116  6.9999999999999995e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0245  cation diffusion facilitator family transporter  25.18 
 
 		 291 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1026  cation diffusion facilitator family transporter  28.68 
 
 		 323 aa  116  7.999999999999999e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1668  cation diffusion facilitator family transporter  26.24 
 
 		 291 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0340924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0125  cation diffusion facilitator family transporter  30.11 
 
 		 317 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0195839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1144  cation efflux family protein  32.02 
 
 		 289 aa  114  5e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0182712  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0983  cation efflux family protein  32.41 
 
 		 289 aa  114  5e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0179207  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0084  pantothenate metabolism flavoprotein  31.36 
 
 		 311 aa  114  5e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00694286  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1549  cation diffusion facilitator family transporter  27.21 
 
 		 290 aa  114  5e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0446  cation diffusion facilitator family transporter  31.96 
 
 		 328 aa  113  8.000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.48861  normal  0.265047 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>