More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0116 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0116  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 
323 aa  641    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.358203  normal  0.378394 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4947  cation diffusion facilitator family transporter  51.32 
 
 
312 aa  294  1e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.723787  normal  0.395043 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2628  cation efflux protein  45.83 
 
 
325 aa  247  2e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.620911  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0791  cation diffusion facilitator family transporter  44.33 
 
 
312 aa  227  2e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2871  cation efflux protein  43.75 
 
 
317 aa  224  2e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4333  cation efflux protein  43.11 
 
 
297 aa  216  4e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3931  cation diffusion facilitator family transporter  41.67 
 
 
289 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146752  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4790  cation efflux family protein  41.94 
 
 
297 aa  211  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00146  ferrous iron efflux protein F  40.73 
 
 
302 aa  211  2e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4753  cation diffusion facilitator family transporter  42.05 
 
 
296 aa  211  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.36054  decreased coverage  0.00983844 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09970  Cation efflux protein  42.86 
 
 
293 aa  209  4e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.907578  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2262  ferrous iron efflux protein F  41.54 
 
 
302 aa  209  5e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000896639  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0241  cation diffusion facilitator family transporter  42.55 
 
 
310 aa  206  3e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000961232  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0256  cation diffusion facilitator family transporter  41.67 
 
 
290 aa  206  4e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.015822  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002221  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  40 
 
 
302 aa  206  5e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000518265  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0258  cation diffusion facilitator family transporter  40.94 
 
 
296 aa  205  7e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0238617  decreased coverage  0.0000137847 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0369  cation diffusion facilitator family transporter  40.21 
 
 
293 aa  204  1e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000868845  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0263  cation diffusion facilitator family transporter  40.94 
 
 
296 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0263  cation diffusion facilitator family transporter  40.94 
 
 
296 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000665998  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3741  cation diffusion facilitator family transporter  42.75 
 
 
292 aa  202  8e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4937  cation efflux protein  41.7 
 
 
298 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3300  iron and zinc efflux system protein  39.15 
 
 
318 aa  201  9.999999999999999e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.831799  normal  0.0946092 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4057  ferrous iron efflux protein F  39.1 
 
 
300 aa  200  3e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.3408  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2795  ferrous iron efflux protein F  40.43 
 
 
301 aa  199  7.999999999999999e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00102947  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3459  cation diffusion facilitator family transporter  40.94 
 
 
295 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000668227  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4774  cation diffusion facilitator family transporter  43.46 
 
 
290 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00437993 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4475  cation efflux family protein  40.78 
 
 
296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0047  cation diffusion facilitator family transporter  38.65 
 
 
325 aa  197  2.0000000000000003e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.408108  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3767  cation diffusion facilitator family transporter  40.78 
 
 
297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0281724  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3430  cation efflux family protein  40.58 
 
 
289 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.038315  normal  0.371724 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4650  cation diffusion facilitator family transporter  43.46 
 
 
290 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.188299 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4278  ferrous iron efflux protein F  38.43 
 
 
300 aa  196  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.546202  normal  0.887398 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4390  ferrous iron efflux protein F  38.43 
 
 
300 aa  195  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.228028 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4459  ferrous iron efflux protein F  38.43 
 
 
300 aa  195  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.709567  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4392  ferrous iron efflux protein F  38.43 
 
 
300 aa  195  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123338  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0254  cation diffusion facilitator family transporter  40.78 
 
 
297 aa  194  1e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00100286  hitchhiker  0.000434478 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4307  ferrous iron efflux protein F  38.43 
 
 
300 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4020  ferrous iron efflux protein F  40.53 
 
 
300 aa  193  3e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4828  cation diffusion facilitator family transporter  42.75 
 
 
290 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12610  putative transporter  41.94 
 
 
298 aa  192  5e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.686969  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1146  putative transporter  41.22 
 
 
298 aa  192  6e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0255  cation diffusion facilitator family transporter  40.43 
 
 
299 aa  192  6e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000211411  hitchhiker  0.0000000259918 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0283  cation diffusion facilitator family transporter  39.49 
 
 
289 aa  192  7e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000135254  hitchhiker  0.000000557586 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0281  cation diffusion facilitator family transporter  39.86 
 
 
289 aa  192  8e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000230949  unclonable  0.000000000100578 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0646  cation diffusion facilitator family transporter  43.46 
 
 
289 aa  192  8e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.186266  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0484  cation efflux protein  36.71 
 
 
298 aa  192  8e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03800  ferrous iron efflux protein F  38.35 
 
 
300 aa  191  1e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.769582  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4070  cation diffusion facilitator family transporter  38.35 
 
 
300 aa  191  1e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03749  hypothetical protein  38.35 
 
 
300 aa  191  1e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.859371  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4103  ferrous iron efflux protein F  38.35 
 
 
300 aa  191  1e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4145  ferrous iron efflux protein F  38.35 
 
 
300 aa  191  1e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5369  ferrous iron efflux protein F  38.35 
 
 
300 aa  191  1e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0314  cation diffusion facilitator family transporter  40.58 
 
 
289 aa  191  1e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000499164  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4448  ferrous iron efflux protein F  38.35 
 
 
300 aa  191  1e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4355  ferrous iron efflux protein F  37.99 
 
 
300 aa  191  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.363052 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4394  ferrous iron efflux protein F  38.35 
 
 
300 aa  191  2e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4808  ferrous iron efflux protein F  40.59 
 
 
300 aa  190  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0139  ferrous iron efflux protein F  40.94 
 
 
300 aa  189  5e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.205512  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4385  cation efflux family protein  40.36 
 
 
301 aa  189  5.999999999999999e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.592721  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1177  cation diffusion facilitator family transporter  39.08 
 
 
308 aa  189  5.999999999999999e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3813  ferrous iron efflux protein F  39.46 
 
 
298 aa  185  8e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.70191  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4127  ferrous iron efflux protein F  39.03 
 
 
300 aa  184  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0087  ferrous iron efflux protein F  39.03 
 
 
300 aa  184  2.0000000000000003e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0088  ferrous iron efflux protein F  38.66 
 
 
300 aa  182  6e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0137  ferrous iron efflux protein F  39.86 
 
 
300 aa  178  1e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3568  cation diffusion facilitator family transporter  38.04 
 
 
289 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000153022  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1171  cation efflux family protein  30.58 
 
 
295 aa  157  2e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1026  cation efflux family protein  30.58 
 
 
295 aa  155  7e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0972  cation efflux family protein  30.58 
 
 
295 aa  155  7e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1509  putative transport system permease protein  33.21 
 
 
314 aa  150  3e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073133  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0847  cation efflux protein  27.68 
 
 
297 aa  146  5e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2468  cation diffusion facilitator family transporter  33.9 
 
 
295 aa  139  4.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.376521 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1954  cation diffusion facilitator family transporter  30.57 
 
 
328 aa  135  9e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0806665 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0846  cation diffusion facilitator family transporter  30.19 
 
 
459 aa  134  3e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0034385  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1379  cation diffusion facilitator family transporter  31.51 
 
 
481 aa  133  3e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.892961  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3476  putative cation efflux family protein, CzcD-like protein  30.61 
 
 
296 aa  132  7.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606573  normal  0.771262 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0550  cation efflux protein  33.58 
 
 
459 aa  132  7.999999999999999e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.247369 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0589  cation diffusion facilitator family transporter  29.81 
 
 
285 aa  132  7.999999999999999e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000134664  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  29.79 
 
 
311 aa  132  9e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1731  cation diffusion facilitator family transporter  32.84 
 
 
315 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.560975  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  29.79 
 
 
311 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1521  cation diffusion facilitator family transporter  29.01 
 
 
309 aa  130  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0331  cation efflux family protein  30.85 
 
 
311 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2294  cation diffusion facilitator family transporter  31.58 
 
 
306 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38282  normal  0.177312 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1113  hypothetical protein  31 
 
 
307 aa  127  3e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.416676  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0050  cation diffusion facilitator family transporter  31.53 
 
 
317 aa  126  5e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.374526 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07750  cation diffusion facilitator family transporter  29.78 
 
 
330 aa  126  5e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2239  cation diffusion facilitator family transporter  28.08 
 
 
302 aa  125  9e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0407082  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3895  cation diffusion facilitator family transporter  29.75 
 
 
307 aa  125  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.640647  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2198  cation diffusion facilitator family transporter  28.37 
 
 
293 aa  125  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.776966  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2400  cation diffusion facilitator family transporter  29.18 
 
 
307 aa  125  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1483  cation diffusion facilitator family transporter  29.67 
 
 
308 aa  124  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3075  cation diffusion facilitator family transporter  31.73 
 
 
304 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553073  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0745  cation diffusion facilitator family transporter  27.56 
 
 
460 aa  123  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0867  cation diffusion facilitator family transporter  30.83 
 
 
295 aa  123  4e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.851238 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3261  cation efflux system protein  30.08 
 
 
305 aa  123  4e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826048  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3290  cation diffusion facilitator family transporter  28.87 
 
 
295 aa  123  5e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1582  cation diffusion facilitator family transporter  28.17 
 
 
299 aa  122  6e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5513  cation diffusion facilitator family transporter  29.41 
 
 
295 aa  122  6e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.281094  normal  0.363198 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3065  cation diffusion facilitator family transporter  28.87 
 
 
295 aa  122  6e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.686004  normal  0.910257 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>