More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0241 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0241  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 310 aa  615  1e-175  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000961232  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2262  ferrous iron efflux protein F  50.51 
 
 		 302 aa  270  2.9999999999999997e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000896639  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00146  ferrous iron efflux protein F  49.32 
 
 		 302 aa  268  7e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002221  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  49.66 
 
 		 302 aa  268  1e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000518265  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3813  ferrous iron efflux protein F  50 
 
 		 298 aa  265  1e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.70191  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0139  ferrous iron efflux protein F  48.76 
 
 		 300 aa  263  4e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.205512  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2871  cation efflux protein  48.79 
 
 		 317 aa  260  2e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4020  ferrous iron efflux protein F  50 
 
 		 300 aa  260  2e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4127  ferrous iron efflux protein F  52.16 
 
 		 300 aa  258  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0087  ferrous iron efflux protein F  52.16 
 
 		 300 aa  258  1e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0088  ferrous iron efflux protein F  51.8 
 
 		 300 aa  256  3e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3931  cation diffusion facilitator family transporter  49.28 
 
 		 289 aa  255  5e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146752  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4057  ferrous iron efflux protein F  47 
 
 		 300 aa  254  1.0000000000000001e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.3408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0791  cation diffusion facilitator family transporter  47.89 
 
 		 312 aa  254  1.0000000000000001e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2628  cation efflux protein  47.77 
 
 		 325 aa  253  3e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.620911  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0137  ferrous iron efflux protein F  48.41 
 
 		 300 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4278  ferrous iron efflux protein F  48.31 
 
 		 300 aa  251  7e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.546202  normal  0.887398 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2795  ferrous iron efflux protein F  44.97 
 
 		 301 aa  251  1e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00102947  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4392  ferrous iron efflux protein F  47.94 
 
 		 300 aa  249  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4390  ferrous iron efflux protein F  47.94 
 
 		 300 aa  249  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.228028 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4459  ferrous iron efflux protein F  47.94 
 
 		 300 aa  249  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.709567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4307  ferrous iron efflux protein F  47.94 
 
 		 300 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03800  ferrous iron efflux protein F  47.57 
 
 		 300 aa  247  2e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.769582  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4070  cation diffusion facilitator family transporter  47.57 
 
 		 300 aa  247  2e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5369  ferrous iron efflux protein F  47.57 
 
 		 300 aa  247  2e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4448  ferrous iron efflux protein F  47.57 
 
 		 300 aa  247  2e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4145  ferrous iron efflux protein F  47.57 
 
 		 300 aa  247  2e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4103  ferrous iron efflux protein F  47.57 
 
 		 300 aa  247  2e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03749  hypothetical protein  47.57 
 
 		 300 aa  247  2e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.859371  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4355  ferrous iron efflux protein F  47.57 
 
 		 300 aa  246  3e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.363052 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0369  cation diffusion facilitator family transporter  46.81 
 
 		 293 aa  246  3e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000868845  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4394  ferrous iron efflux protein F  47.57 
 
 		 300 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0256  cation diffusion facilitator family transporter  46.59 
 
 		 290 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.015822  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0258  cation diffusion facilitator family transporter  46.24 
 
 		 296 aa  245  6e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0238617  decreased coverage  0.0000137847 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0263  cation diffusion facilitator family transporter  46.24 
 
 		 296 aa  245  6.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0263  cation diffusion facilitator family transporter  46.4 
 
 		 296 aa  245  6.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000665998  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0254  cation diffusion facilitator family transporter  47.54 
 
 		 297 aa  245  6.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00100286  hitchhiker  0.000434478 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0484  cation efflux protein  45.71 
 
 		 298 aa  243  3e-63  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3430  cation efflux family protein  47.84 
 
 		 289 aa  243  3e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.038315  normal  0.371724 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0314  cation diffusion facilitator family transporter  46.76 
 
 		 289 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000499164  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4808  ferrous iron efflux protein F  47.64 
 
 		 300 aa  242  7e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3767  cation diffusion facilitator family transporter  46.98 
 
 		 297 aa  241  1e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0281724  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4385  cation efflux family protein  46.79 
 
 		 301 aa  240  2e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.592721  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0281  cation diffusion facilitator family transporter  47.48 
 
 		 289 aa  237  2e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000230949  unclonable  0.000000000100578 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0255  cation diffusion facilitator family transporter  46.26 
 
 		 299 aa  236  3e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000211411  hitchhiker  0.0000000259918 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4475  cation efflux family protein  45.91 
 
 		 296 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0283  cation diffusion facilitator family transporter  46.76 
 
 		 289 aa  233  3e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000135254  hitchhiker  0.000000557586 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3300  iron and zinc efflux system protein  41.81 
 
 		 318 aa  232  5e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.831799  normal  0.0946092 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4937  cation efflux protein  46.07 
 
 		 298 aa  230  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3459  cation diffusion facilitator family transporter  44.6 
 
 		 295 aa  229  6e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000668227  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3568  cation diffusion facilitator family transporter  47.12 
 
 		 289 aa  225  9e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000153022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4333  cation efflux protein  44.64 
 
 		 297 aa  223  4e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4790  cation efflux family protein  44.64 
 
 		 297 aa  222  6e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12610  putative transporter  47.14 
 
 		 298 aa  222  7e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.686969  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4774  cation diffusion facilitator family transporter  46.26 
 
 		 290 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00437993 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1146  putative transporter  46.43 
 
 		 298 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4650  cation diffusion facilitator family transporter  46.26 
 
 		 290 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.188299 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0646  cation diffusion facilitator family transporter  46.98 
 
 		 289 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.186266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1177  cation diffusion facilitator family transporter  43.38 
 
 		 308 aa  219  6e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4753  cation diffusion facilitator family transporter  43.84 
 
 		 296 aa  216  4e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.36054  decreased coverage  0.00983844 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3741  cation diffusion facilitator family transporter  45.36 
 
 		 292 aa  211  1e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09970  Cation efflux protein  43.93 
 
 		 293 aa  208  7e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.907578  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4828  cation diffusion facilitator family transporter  46.62 
 
 		 290 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4947  cation diffusion facilitator family transporter  41.75 
 
 		 312 aa  200  3e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.723787  normal  0.395043 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0047  cation diffusion facilitator family transporter  39.51 
 
 		 325 aa  198  9e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.408108  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0116  cation diffusion facilitator family transporter  41.05 
 
 		 323 aa  195  7e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.358203  normal  0.378394 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1582  cation diffusion facilitator family transporter  34.83 
 
 		 299 aa  159  7e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1171  cation efflux family protein  30.17 
 
 		 295 aa  150  4e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1026  cation efflux family protein  29.83 
 
 		 295 aa  148  1.0000000000000001e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0972  cation efflux family protein  29.83 
 
 		 295 aa  148  1.0000000000000001e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1509  putative transport system permease protein  31.96 
 
 		 314 aa  147  3e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073133  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0847  cation efflux protein  31.65 
 
 		 297 aa  147  3e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0084  pantothenate metabolism flavoprotein  33.1 
 
 		 311 aa  145  8.000000000000001e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00694286  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1731  cation diffusion facilitator family transporter  31.45 
 
 		 315 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.560975  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0896  cation efflux family protein  28.43 
 
 		 304 aa  131  2.0000000000000002e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0221423  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1379  cation diffusion facilitator family transporter  31.19 
 
 		 481 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.892961  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3075  cation diffusion facilitator family transporter  30.88 
 
 		 304 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  30.38 
 
 		 311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0589  cation diffusion facilitator family transporter  27.94 
 
 		 285 aa  127  3e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000134664  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1954  cation diffusion facilitator family transporter  29.96 
 
 		 328 aa  127  3e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0806665 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0846  cation diffusion facilitator family transporter  27.52 
 
 		 459 aa  127  3e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0034385  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1043  cation efflux protein  28.83 
 
 		 320 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1483  cation diffusion facilitator family transporter  30.72 
 
 		 308 aa  125  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  28.62 
 
 		 311 aa  124  2e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1801  cation efflux family protein  32.09 
 
 		 376 aa  123  4e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0942158  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1521  cation diffusion facilitator family transporter  28.36 
 
 		 309 aa  123  4e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0745  cation diffusion facilitator family transporter  30.77 
 
 		 460 aa  123  5e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1114  cation efflux protein  29.66 
 
 		 305 aa  122  6e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0050  cation diffusion facilitator family transporter  29.41 
 
 		 317 aa  121  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.374526 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1123  ferrous-iron efflux pump FieF  31.78 
 
 		 289 aa  120  3e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00791465  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3476  putative cation efflux family protein, CzcD-like protein  30.69 
 
 		 296 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606573  normal  0.771262 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3261  cation efflux system protein  30.6 
 
 		 305 aa  119  4.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826048  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0710  cation diffusion facilitator family transporter  29.41 
 
 		 476 aa  119  7e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1439  cation efflux protein  29.35 
 
 		 293 aa  119  7.999999999999999e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0109958  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2574  cation diffusion facilitator family transporter  29.93 
 
 		 310 aa  119  9e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3537  cation diffusion facilitator family transporter  26.13 
 
 		 294 aa  118  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2400  cation diffusion facilitator family transporter  31.14 
 
 		 307 aa  118  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2198  cation diffusion facilitator family transporter  28.32 
 
 		 293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.776966  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0332  cation diffusion facilitator family transporter  29.41 
 
 		 450 aa  117  3e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0597  cation diffusion facilitator family transporter  29.89 
 
 		 302 aa  116  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>