More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0332 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0332  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 
450 aa  897    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0974  cation diffusion facilitator family transporter  28.35 
 
 
466 aa  188  1e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0846  cation diffusion facilitator family transporter  26.2 
 
 
459 aa  159  1e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0034385  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2245  cation diffusion facilitator family transporter  24.14 
 
 
483 aa  156  6e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3095  putative cation-efflux pump  26.83 
 
 
462 aa  155  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1379  cation diffusion facilitator family transporter  25.06 
 
 
481 aa  152  8.999999999999999e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.892961  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0745  cation diffusion facilitator family transporter  25.22 
 
 
460 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1684  cation diffusion facilitator family transporter  26.28 
 
 
450 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.000631579  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3435  cation diffusion facilitator family transporter  27.09 
 
 
478 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0253813 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0393  cation diffusion facilitator family transporter  25.65 
 
 
483 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.38697 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0198  cation diffusion facilitator family transporter  25.97 
 
 
474 aa  137  5e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.859565 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2019  cation diffusion facilitator family transporter  26.87 
 
 
459 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.40781 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0710  cation diffusion facilitator family transporter  24.56 
 
 
476 aa  134  3e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0853  cation diffusion facilitator family transporter  26.13 
 
 
479 aa  133  7.999999999999999e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1848  cation diffusion facilitator family transporter  26.21 
 
 
460 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.762115 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0167  cation diffusion facilitator family transporter  32.96 
 
 
305 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0550  cation efflux protein  26.64 
 
 
459 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.247369 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2530  cation diffusion facilitator family transporter  26.1 
 
 
460 aa  127  5e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2149  cation diffusion facilitator family transporter  27 
 
 
460 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2239  cation diffusion facilitator family transporter  28.62 
 
 
305 aa  124  3e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.482091  normal  0.467458 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1450  cation diffusion facilitator family transporter  25.44 
 
 
460 aa  124  3e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.25137  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0125  cation diffusion facilitator family transporter  28.77 
 
 
317 aa  121  3e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0195839  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1202  cation diffusion facilitator family transporter  24.16 
 
 
488 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0622136  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0484  cation efflux protein  31.18 
 
 
298 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0719  cation diffusion facilitator family transporter  28.95 
 
 
278 aa  115  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.775503 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0589  cation diffusion facilitator family transporter  30.6 
 
 
285 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000134664  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1891  cation diffusion facilitator family transporter  26.87 
 
 
314 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0381749 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2795  ferrous iron efflux protein F  28.73 
 
 
301 aa  114  4.0000000000000004e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00102947  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  25.91 
 
 
311 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1201  cation efflux protein  26.26 
 
 
460 aa  114  5e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1509  putative transport system permease protein  29.07 
 
 
314 aa  113  6e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073133  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09106  cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcD  28.41 
 
 
313 aa  112  2.0000000000000002e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.341807  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1215  cation diffusion facilitator family transporter  29.53 
 
 
302 aa  110  5e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.322219 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  25.25 
 
 
311 aa  109  1e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2073  cation diffusion facilitator family transporter  27.04 
 
 
308 aa  109  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.981542 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0241  cation diffusion facilitator family transporter  29.41 
 
 
310 aa  108  2e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000961232  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1483  cation diffusion facilitator family transporter  27.57 
 
 
308 aa  108  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2262  ferrous iron efflux protein F  29.15 
 
 
302 aa  107  4e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000896639  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4057  ferrous iron efflux protein F  28.79 
 
 
300 aa  107  5e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.3408  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1954  cation diffusion facilitator family transporter  28.08 
 
 
328 aa  107  5e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0806665 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0491  cation diffusion facilitator family transporter  26.62 
 
 
354 aa  107  5e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0566502 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4278  ferrous iron efflux protein F  28.52 
 
 
300 aa  107  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.546202  normal  0.887398 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0791  cation diffusion facilitator family transporter  28.96 
 
 
312 aa  106  6e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4307  ferrous iron efflux protein F  28.46 
 
 
300 aa  107  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4459  ferrous iron efflux protein F  28.46 
 
 
300 aa  106  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.709567  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4392  ferrous iron efflux protein F  28.46 
 
 
300 aa  106  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123338  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4390  ferrous iron efflux protein F  28.46 
 
 
300 aa  106  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.228028 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4394  ferrous iron efflux protein F  28.16 
 
 
300 aa  105  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1712  cation diffusion facilitator family transporter  27.5 
 
 
306 aa  104  3e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00125134  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002221  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  27.41 
 
 
302 aa  104  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000518265  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03800  ferrous iron efflux protein F  27.8 
 
 
300 aa  103  5e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.769582  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4070  cation diffusion facilitator family transporter  27.8 
 
 
300 aa  103  5e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4103  ferrous iron efflux protein F  27.8 
 
 
300 aa  103  5e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4145  ferrous iron efflux protein F  27.8 
 
 
300 aa  103  5e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4448  ferrous iron efflux protein F  27.8 
 
 
300 aa  103  5e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4355  ferrous iron efflux protein F  27.8 
 
 
300 aa  103  5e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.363052 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03749  hypothetical protein  27.8 
 
 
300 aa  103  5e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.859371  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5369  ferrous iron efflux protein F  27.8 
 
 
300 aa  103  5e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0087  ferrous iron efflux protein F  28.29 
 
 
300 aa  103  7e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4127  ferrous iron efflux protein F  28.29 
 
 
300 aa  103  7e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0088  ferrous iron efflux protein F  28.29 
 
 
300 aa  103  8e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0331  cation efflux family protein  25.58 
 
 
311 aa  102  1e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2147  cation efflux system protein  28.57 
 
 
380 aa  102  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.809019  normal  0.389636 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1731  cation diffusion facilitator family transporter  25.08 
 
 
315 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.560975  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0245  cation diffusion facilitator family transporter  27.24 
 
 
291 aa  102  2e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2468  cation diffusion facilitator family transporter  27.13 
 
 
295 aa  102  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.376521 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2400  cation diffusion facilitator family transporter  26.06 
 
 
307 aa  101  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2574  cation diffusion facilitator family transporter  25.93 
 
 
310 aa  100  4e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00146  ferrous iron efflux protein F  27.04 
 
 
302 aa  100  5e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4538  cation diffusion facilitator family transporter  30.88 
 
 
307 aa  100  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3649  cation efflux system protein  27.43 
 
 
384 aa  100  7e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.29953 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4937  cation efflux protein  27.07 
 
 
298 aa  99.8  9e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1752  cation diffusion facilitator family transporter  28.62 
 
 
301 aa  99.8  9e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00011926  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5864  cation diffusion facilitator family transporter  27.53 
 
 
300 aa  99  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.499716  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0858  cation efflux system protein  27.94 
 
 
331 aa  99.4  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0225  cation diffusion facilitator family transporter  28.85 
 
 
312 aa  98.2  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0570  cation diffusion facilitator family transporter  29.32 
 
 
298 aa  98.6  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.712384  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1531  cation diffusion facilitator family transporter  26.77 
 
 
317 aa  98.2  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3813  ferrous iron efflux protein F  26.69 
 
 
298 aa  99  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.70191  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1487  cation diffusion facilitator family transporter  31.1 
 
 
340 aa  99  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4333  cation efflux protein  26.14 
 
 
297 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1489  cation diffusion facilitator family transporter  31.1 
 
 
314 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4808  ferrous iron efflux protein F  27.13 
 
 
300 aa  98.6  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3647  cation diffusion facilitator family transporter  26.97 
 
 
395 aa  99  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3895  cation diffusion facilitator family transporter  25.93 
 
 
307 aa  98.2  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.640647  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1511  cation diffusion facilitator family transporter  31.1 
 
 
340 aa  99  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2889  cation diffusion facilitator family transporter  26.74 
 
 
388 aa  97.8  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000320508  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3537  cation diffusion facilitator family transporter  26.94 
 
 
294 aa  97.8  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12610  putative transporter  26.26 
 
 
298 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.686969  normal 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4982  cation diffusion facilitator family transporter  27.27 
 
 
307 aa  97.8  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0279964 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3430  cation efflux family protein  26.79 
 
 
289 aa  98.2  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.038315  normal  0.371724 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3741  cation diffusion facilitator family transporter  26.91 
 
 
292 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4020  ferrous iron efflux protein F  27.24 
 
 
300 aa  97.8  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4790  cation efflux family protein  25.09 
 
 
297 aa  97.4  5e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1683  cation diffusion facilitator family transporter  26.41 
 
 
308 aa  97.4  5e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000676071  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1675  cation diffusion facilitator family transporter  26.52 
 
 
307 aa  97.1  6e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.282896  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2941  cation diffusion facilitator family transporter  26.52 
 
 
307 aa  97.1  6e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0369  cation diffusion facilitator family transporter  24.71 
 
 
293 aa  96.7  7e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000868845  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3406  cation diffusion facilitator family transporter  25.19 
 
 
337 aa  96.7  7e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0577  cation diffusion facilitator family transporter  26.01 
 
 
308 aa  96.3  9e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.215169 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>