More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0710 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0710  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 
476 aa  970    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1379  cation diffusion facilitator family transporter  39.67 
 
 
481 aa  304  3.0000000000000004e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.892961  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0393  cation diffusion facilitator family transporter  40.13 
 
 
483 aa  276  6e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.38697 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0745  cation diffusion facilitator family transporter  34.66 
 
 
460 aa  266  8e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1202  cation diffusion facilitator family transporter  38.84 
 
 
488 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0622136  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0846  cation diffusion facilitator family transporter  35.68 
 
 
459 aa  257  3e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0034385  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2245  cation diffusion facilitator family transporter  34.22 
 
 
483 aa  246  4e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0550  cation efflux protein  34.62 
 
 
459 aa  228  2e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.247369 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0974  cation diffusion facilitator family transporter  37.86 
 
 
466 aa  213  5.999999999999999e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2530  cation diffusion facilitator family transporter  33.43 
 
 
460 aa  182  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0198  cation diffusion facilitator family transporter  28.33 
 
 
474 aa  182  1e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.859565 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1848  cation diffusion facilitator family transporter  29.34 
 
 
460 aa  176  7e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.762115 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3435  cation diffusion facilitator family transporter  30.17 
 
 
478 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0253813 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  36.24 
 
 
311 aa  174  3.9999999999999995e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2019  cation diffusion facilitator family transporter  30.27 
 
 
459 aa  173  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.40781 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1450  cation diffusion facilitator family transporter  29.13 
 
 
460 aa  168  2e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.25137  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  35.57 
 
 
311 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2149  cation diffusion facilitator family transporter  28.7 
 
 
460 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0589  cation diffusion facilitator family transporter  32.77 
 
 
285 aa  164  4.0000000000000004e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000134664  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0331  cation efflux family protein  36.58 
 
 
311 aa  163  8.000000000000001e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0853  cation diffusion facilitator family transporter  27.12 
 
 
479 aa  158  2e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1201  cation efflux protein  29.75 
 
 
460 aa  157  3e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3095  putative cation-efflux pump  30.27 
 
 
462 aa  157  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2574  cation diffusion facilitator family transporter  36.33 
 
 
310 aa  157  5.0000000000000005e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2400  cation diffusion facilitator family transporter  32.2 
 
 
307 aa  156  8e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1127  cation diffusion facilitator family transporter  34.38 
 
 
323 aa  155  1e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1683  cation diffusion facilitator family transporter  33.22 
 
 
308 aa  153  8e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000676071  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3895  cation diffusion facilitator family transporter  34.01 
 
 
307 aa  152  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.640647  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1954  cation diffusion facilitator family transporter  31.29 
 
 
328 aa  152  1e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0806665 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1113  hypothetical protein  33.33 
 
 
307 aa  150  6e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.416676  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0446  cation diffusion facilitator family transporter  32.35 
 
 
328 aa  150  7e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.48861  normal  0.265047 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1509  putative transport system permease protein  31.13 
 
 
314 aa  145  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073133  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1521  cation diffusion facilitator family transporter  31.91 
 
 
309 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1215  cation diffusion facilitator family transporter  34.33 
 
 
302 aa  144  3e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.322219 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0526  cation diffusion facilitator family transporter  33 
 
 
327 aa  143  6e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1684  cation diffusion facilitator family transporter  25.78 
 
 
450 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.000631579  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1483  cation diffusion facilitator family transporter  33.22 
 
 
308 aa  140  7e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5864  cation diffusion facilitator family transporter  32.25 
 
 
300 aa  139  7.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.499716  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0724  cation diffusion facilitator family transporter  32.89 
 
 
315 aa  139  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152803  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0125  cation diffusion facilitator family transporter  31.4 
 
 
317 aa  139  1e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0195839  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1731  cation diffusion facilitator family transporter  34.67 
 
 
315 aa  136  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.560975  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1439  cation efflux protein  33.33 
 
 
293 aa  136  8e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0109958  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2073  cation diffusion facilitator family transporter  33.33 
 
 
308 aa  136  8e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.981542 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1891  cation diffusion facilitator family transporter  32.48 
 
 
314 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0381749 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0051  cation diffusion facilitator family transporter  28.21 
 
 
306 aa  131  3e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0051  cation diffusion facilitator family transporter  28.21 
 
 
306 aa  130  6e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0332  cation diffusion facilitator family transporter  24.43 
 
 
450 aa  130  8.000000000000001e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2239  cation diffusion facilitator family transporter  32.08 
 
 
305 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.482091  normal  0.467458 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1770  cation diffusion facilitator family transporter  33 
 
 
315 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1114  cation efflux protein  30.43 
 
 
305 aa  128  3e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1850  cation diffusion facilitator family transporter  33 
 
 
315 aa  126  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2106  cation diffusion facilitator family transporter  33.67 
 
 
315 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1021  cation diffusion facilitator family transporter  30.87 
 
 
346 aa  125  2e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2025  cation diffusion facilitator family transporter  30.43 
 
 
313 aa  124  3e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0165078  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1013  metal cation efflux protein CzrB  31.38 
 
 
302 aa  124  3e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.323499  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0663  cation diffusion facilitator family transporter  24.27 
 
 
312 aa  124  4e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0132428  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0225  cation diffusion facilitator family transporter  30.32 
 
 
312 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1043  cation efflux protein  30.69 
 
 
320 aa  121  3e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0369  cation diffusion facilitator family transporter  28.97 
 
 
293 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000868845  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0470  cation diffusion facilitator family transporter  28.57 
 
 
337 aa  119  9e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0457303  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3290  cation diffusion facilitator family transporter  31.97 
 
 
295 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07750  cation diffusion facilitator family transporter  29.68 
 
 
330 aa  119  9.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3261  cation efflux system protein  31.45 
 
 
305 aa  119  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826048  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2239  cation diffusion facilitator family transporter  31.32 
 
 
302 aa  119  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0407082  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2446  cation diffusion facilitator family transporter  28.68 
 
 
304 aa  119  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.526861  normal  0.400869 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1582  cation diffusion facilitator family transporter  26.28 
 
 
299 aa  119  9.999999999999999e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3300  iron and zinc efflux system protein  28.67 
 
 
318 aa  118  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.831799  normal  0.0946092 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0597  cation diffusion facilitator family transporter  31.1 
 
 
302 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3065  cation diffusion facilitator family transporter  31.63 
 
 
295 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.686004  normal  0.910257 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1360  cation diffusion facilitator family transporter  29.32 
 
 
396 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0254  cation diffusion facilitator family transporter  29.31 
 
 
297 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00100286  hitchhiker  0.000434478 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3764  cation efflux protein  30.63 
 
 
389 aa  117  6e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0837533 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0314  cation diffusion facilitator family transporter  29.51 
 
 
289 aa  117  6e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000499164  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2568  cation diffusion facilitator family transporter  26.1 
 
 
332 aa  116  7.999999999999999e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.364379 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0980  cation diffusion facilitator family transporter  27.89 
 
 
305 aa  116  7.999999999999999e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0258  cation diffusion facilitator family transporter  28.23 
 
 
296 aa  116  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0238617  decreased coverage  0.0000137847 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1334  cation diffusion facilitator family transporter  31.74 
 
 
312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.215207  hitchhiker  0.000886879 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0263  cation diffusion facilitator family transporter  27.85 
 
 
296 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000665998  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4669  cation diffusion facilitator family transporter  32.53 
 
 
332 aa  115  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0263  cation diffusion facilitator family transporter  28.23 
 
 
296 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0074  cation diffusion facilitator family transporter  26.58 
 
 
313 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3931  cation diffusion facilitator family transporter  27.93 
 
 
289 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146752  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0256  cation diffusion facilitator family transporter  29.11 
 
 
290 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.015822  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3767  cation diffusion facilitator family transporter  29.31 
 
 
297 aa  114  3e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0281724  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3813  ferrous iron efflux protein F  28.06 
 
 
298 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.70191  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1178  cation diffusion facilitator family transporter  30.25 
 
 
300 aa  114  5e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00185198  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2795  ferrous iron efflux protein F  27.89 
 
 
301 aa  114  5e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00102947  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1188  cation diffusion facilitator family transporter  29.11 
 
 
322 aa  113  7.000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0609928  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3430  cation efflux family protein  29.35 
 
 
289 aa  113  8.000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.038315  normal  0.371724 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1206  cation diffusion facilitator family transporter  33.33 
 
 
316 aa  112  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1774  cation diffusion facilitator family transporter  27.08 
 
 
293 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000103729  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0167  cation diffusion facilitator family transporter  27.74 
 
 
305 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00146  ferrous iron efflux protein F  25.16 
 
 
302 aa  111  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0281  cation diffusion facilitator family transporter  28.97 
 
 
289 aa  111  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000230949  unclonable  0.000000000100578 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4475  cation efflux family protein  28.62 
 
 
296 aa  111  3e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5667  cation diffusion facilitator family transporter  32.27 
 
 
328 aa  111  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002221  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  25.74 
 
 
302 aa  110  4.0000000000000004e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000518265  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2100  cation diffusion facilitator family transporter  27.91 
 
 
310 aa  110  5e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.70845  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2871  cation efflux protein  28.91 
 
 
317 aa  110  6e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0983  cation efflux family protein  26.76 
 
 
289 aa  110  7.000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0179207  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>