More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1202 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1202  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 488 aa  988    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0622136  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1379  cation diffusion facilitator family transporter  45.68 
 
 		 481 aa  361  2e-98  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.892961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0393  cation diffusion facilitator family transporter  47.15 
 
 		 483 aa  355  1e-96  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.38697 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0710  cation diffusion facilitator family transporter  38.84 
 
 		 476 aa  310  4e-83  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2245  cation diffusion facilitator family transporter  37.34 
 
 		 483 aa  279  1e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0745  cation diffusion facilitator family transporter  32.42 
 
 		 460 aa  259  8e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0974  cation diffusion facilitator family transporter  34.54 
 
 		 466 aa  243  5e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0846  cation diffusion facilitator family transporter  31.39 
 
 		 459 aa  238  1e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0034385  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0550  cation efflux protein  30.32 
 
 		 459 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.247369 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3435  cation diffusion facilitator family transporter  32.77 
 
 		 478 aa  212  1e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0253813 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2019  cation diffusion facilitator family transporter  33.05 
 
 		 459 aa  212  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.40781 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2530  cation diffusion facilitator family transporter  30.92 
 
 		 460 aa  211  2e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1848  cation diffusion facilitator family transporter  32.76 
 
 		 460 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.762115 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2149  cation diffusion facilitator family transporter  31.79 
 
 		 460 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1450  cation diffusion facilitator family transporter  32.14 
 
 		 460 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.25137  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3095  putative cation-efflux pump  33.04 
 
 		 462 aa  197  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1201  cation efflux protein  31.49 
 
 		 460 aa  196  6e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0198  cation diffusion facilitator family transporter  30.36 
 
 		 474 aa  196  7e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.859565 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0853  cation diffusion facilitator family transporter  30.67 
 
 		 479 aa  187  5e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2574  cation diffusion facilitator family transporter  38.67 
 
 		 310 aa  181  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  33.87 
 
 		 311 aa  176  6e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  33.88 
 
 		 311 aa  174  3.9999999999999995e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0125  cation diffusion facilitator family transporter  36.3 
 
 		 317 aa  172  2e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0195839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1684  cation diffusion facilitator family transporter  31.58 
 
 		 450 aa  167  5e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.000631579  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1683  cation diffusion facilitator family transporter  34.9 
 
 		 308 aa  165  2.0000000000000002e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000676071  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2400  cation diffusion facilitator family transporter  36.39 
 
 		 307 aa  163  6e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3895  cation diffusion facilitator family transporter  35.45 
 
 		 307 aa  162  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.640647  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0331  cation efflux family protein  33.89 
 
 		 311 aa  160  7e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1954  cation diffusion facilitator family transporter  32.09 
 
 		 328 aa  160  7e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0806665 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0589  cation diffusion facilitator family transporter  33.11 
 
 		 285 aa  159  8e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000134664  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2239  cation diffusion facilitator family transporter  34.93 
 
 		 305 aa  155  2e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.482091  normal  0.467458 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1215  cation diffusion facilitator family transporter  35.97 
 
 		 302 aa  152  1e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.322219 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1891  cation diffusion facilitator family transporter  34.19 
 
 		 314 aa  152  1e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0381749 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0332  cation diffusion facilitator family transporter  24.28 
 
 		 450 aa  147  5e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4808  ferrous iron efflux protein F  31.16 
 
 		 300 aa  146  6e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0167  cation diffusion facilitator family transporter  32.85 
 
 		 305 aa  144  3e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3813  ferrous iron efflux protein F  31.05 
 
 		 298 aa  144  4e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.70191  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4057  ferrous iron efflux protein F  31.29 
 
 		 300 aa  144  4e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.3408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0087  ferrous iron efflux protein F  33.33 
 
 		 300 aa  144  4e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4127  ferrous iron efflux protein F  33.33 
 
 		 300 aa  144  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1113  hypothetical protein  31.86 
 
 		 307 aa  143  7e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.416676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1509  putative transport system permease protein  32.55 
 
 		 314 aa  143  7e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073133  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4020  ferrous iron efflux protein F  30.71 
 
 		 300 aa  143  8e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4392  ferrous iron efflux protein F  30.11 
 
 		 300 aa  143  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4390  ferrous iron efflux protein F  30.11 
 
 		 300 aa  143  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.228028 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4278  ferrous iron efflux protein F  30.11 
 
 		 300 aa  143  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.546202  normal  0.887398 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4459  ferrous iron efflux protein F  30.11 
 
 		 300 aa  143  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.709567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4753  cation diffusion facilitator family transporter  32.33 
 
 		 296 aa  142  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.36054  decreased coverage  0.00983844 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4307  ferrous iron efflux protein F  30.11 
 
 		 300 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0526  cation diffusion facilitator family transporter  33.12 
 
 		 327 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0088  ferrous iron efflux protein F  32.99 
 
 		 300 aa  142  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4394  ferrous iron efflux protein F  30.11 
 
 		 300 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03800  ferrous iron efflux protein F  30.47 
 
 		 300 aa  141  3e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.769582  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4070  cation diffusion facilitator family transporter  30.47 
 
 		 300 aa  141  3e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5369  ferrous iron efflux protein F  30.47 
 
 		 300 aa  141  3e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2795  ferrous iron efflux protein F  30.35 
 
 		 301 aa  141  3e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00102947  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03749  hypothetical protein  30.47 
 
 		 300 aa  141  3e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.859371  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4448  ferrous iron efflux protein F  30.47 
 
 		 300 aa  141  3e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4103  ferrous iron efflux protein F  30.47 
 
 		 300 aa  141  3e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4145  ferrous iron efflux protein F  30.47 
 
 		 300 aa  141  3e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4355  ferrous iron efflux protein F  30.47 
 
 		 300 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.363052 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1127  cation diffusion facilitator family transporter  32.03 
 
 		 323 aa  140  6e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3300  iron and zinc efflux system protein  30.06 
 
 		 318 aa  140  7e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.831799  normal  0.0946092 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2262  ferrous iron efflux protein F  31.38 
 
 		 302 aa  138  2e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000896639  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0791  cation diffusion facilitator family transporter  33.45 
 
 		 312 aa  138  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1521  cation diffusion facilitator family transporter  30.51 
 
 		 309 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0936  cation diffusion facilitator family transporter  29.73 
 
 		 300 aa  136  8e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0139  ferrous iron efflux protein F  30.64 
 
 		 300 aa  136  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.205512  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2628  cation efflux protein  32.11 
 
 		 325 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.620911  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0137  ferrous iron efflux protein F  29.97 
 
 		 300 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0724  cation diffusion facilitator family transporter  32.78 
 
 		 315 aa  134  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152803  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002221  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  31.03 
 
 		 302 aa  134  5e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000518265  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0719  cation diffusion facilitator family transporter  32.5 
 
 		 278 aa  133  6e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.775503 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1360  cation diffusion facilitator family transporter  28.2 
 
 		 396 aa  133  6e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2446  cation diffusion facilitator family transporter  32.01 
 
 		 304 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.526861  normal  0.400869 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1144  cation efflux family protein  30.03 
 
 		 289 aa  131  3e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0182712  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00146  ferrous iron efflux protein F  29.31 
 
 		 302 aa  130  8.000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0983  cation efflux family protein  29.35 
 
 		 289 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0179207  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0491  cation diffusion facilitator family transporter  29.13 
 
 		 354 aa  128  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0566502 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1582  cation diffusion facilitator family transporter  26.6 
 
 		 299 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0023  cation diffusion facilitator family transporter  33.68 
 
 		 295 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.556428 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1752  cation diffusion facilitator family transporter  32.46 
 
 		 301 aa  127  3e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00011926  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2025  cation diffusion facilitator family transporter  31.74 
 
 		 313 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0165078  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1731  cation diffusion facilitator family transporter  34.83 
 
 		 315 aa  127  5e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.560975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0241  cation diffusion facilitator family transporter  31.86 
 
 		 310 aa  127  6e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000961232  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4947  cation diffusion facilitator family transporter  33.45 
 
 		 312 aa  126  7e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.723787  normal  0.395043 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0074  cation diffusion facilitator family transporter  27.76 
 
 		 313 aa  125  1e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3075  cation diffusion facilitator family transporter  30.03 
 
 		 304 aa  125  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0446  cation diffusion facilitator family transporter  30.52 
 
 		 328 aa  125  2e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.48861  normal  0.265047 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4257  cation diffusion facilitator family transporter  28.28 
 
 		 297 aa  125  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2428  cation diffusion facilitator family transporter  28.99 
 
 		 299 aa  124  5e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000439977  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4538  cation diffusion facilitator family transporter  29.64 
 
 		 307 aa  123  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0130  cation diffusion facilitator family transporter  27.67 
 
 		 292 aa  122  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.120546  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2000  cation diffusion facilitator family transporter  33.69 
 
 		 285 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.7679  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2098  cation diffusion facilitator family transporter  30.85 
 
 		 285 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3476  putative cation efflux family protein, CzcD-like protein  30.82 
 
 		 296 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606573  normal  0.771262 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2613  cation efflux family protein  29.59 
 
 		 296 aa  121  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4529  cation efflux family protein  28.18 
 
 		 297 aa  121  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5864  cation diffusion facilitator family transporter  35.25 
 
 		 300 aa  121  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.499716  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1788  cation diffusion facilitator family transporter  28.66 
 
 		 299 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0431575 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>