More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0074 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0074  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 
313 aa  627  1e-179  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0663  cation diffusion facilitator family transporter  60.26 
 
 
312 aa  380  1e-104  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0132428  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0051  cation diffusion facilitator family transporter  45.51 
 
 
306 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0051  cation diffusion facilitator family transporter  45.18 
 
 
306 aa  271  1e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1026  cation diffusion facilitator family transporter  40.07 
 
 
323 aa  215  7e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04060  cation diffusion facilitator family transporter  34.15 
 
 
292 aa  178  1e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0634  cation efflux family protein  33.22 
 
 
314 aa  169  8e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0936  cation diffusion facilitator family transporter  31.37 
 
 
300 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3126  cation diffusion facilitator family transporter  31.58 
 
 
297 aa  162  9e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2613  cation efflux family protein  32.16 
 
 
296 aa  161  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4544  cation efflux family protein  32.63 
 
 
297 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4305  cation efflux family protein  32.28 
 
 
298 aa  157  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.901101  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4143  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  32.28 
 
 
297 aa  157  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4154  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  32.28 
 
 
298 aa  157  3e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4640  cation efflux family protein  32.28 
 
 
298 aa  157  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4490  cation efflux family protein  32.28 
 
 
297 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000013867 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4494  cation efflux family protein  31.93 
 
 
298 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4257  cation diffusion facilitator family transporter  31.58 
 
 
297 aa  155  6e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4529  cation efflux family protein  31.58 
 
 
297 aa  155  6e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0706  cation efflux family protein  31.58 
 
 
297 aa  155  9e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0491  cation diffusion facilitator family transporter  31.83 
 
 
354 aa  150  3e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0566502 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1794  cation diffusion facilitator family transporter  31.62 
 
 
299 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3537  cation diffusion facilitator family transporter  30.03 
 
 
294 aa  146  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0702  Co/Zn/Cd cation transporter  32.23 
 
 
291 aa  145  6e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0858  cation efflux protein  30.77 
 
 
299 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2428  cation diffusion facilitator family transporter  31.32 
 
 
299 aa  144  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000439977  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2005  cation diffusion facilitator family transporter  28.98 
 
 
299 aa  144  3e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3150  cation diffusion facilitator family transporter  27.1 
 
 
401 aa  143  4e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2017  hypothetical protein  29.07 
 
 
380 aa  143  5e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2012  hypothetical protein  29.07 
 
 
380 aa  142  7e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2008  cation efflux family protein  30.18 
 
 
293 aa  141  9.999999999999999e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.536733  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1788  cation diffusion facilitator family transporter  30.25 
 
 
299 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0431575 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2491  cation diffusion facilitator family transporter  30.77 
 
 
288 aa  141  9.999999999999999e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2443  cation diffusion facilitator family transporter  30.77 
 
 
288 aa  141  9.999999999999999e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2343  cation efflux family protein  31.72 
 
 
293 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.412902  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2089  cation efflux protein  31.72 
 
 
296 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.328738  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1774  cation diffusion facilitator family transporter  31.36 
 
 
293 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000103729  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2418  cation efflux family protein  31.72 
 
 
293 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1861  cation diffusion facilitator family transporter  31.52 
 
 
292 aa  140  3e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.350904  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2291  cation efflux family protein  31.38 
 
 
293 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3033  cation efflux family protein  31.38 
 
 
293 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2155  cation efflux family protein  31.38 
 
 
296 aa  139  6e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.112799  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2334  cation efflux family protein  31.38 
 
 
293 aa  139  6e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2310  cation efflux family protein  31.38 
 
 
296 aa  139  6e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1954  cation diffusion facilitator family transporter  29.29 
 
 
328 aa  139  6e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0806665 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2093  cation efflux protein  31.38 
 
 
296 aa  139  7e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0345856  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  31.49 
 
 
311 aa  139  7e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0900  cation diffusion facilitator family transporter  29.82 
 
 
285 aa  138  1e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000200254  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2356  cation diffusion facilitator family transporter  33.09 
 
 
409 aa  138  1e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.868825  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1036  cation diffusion facilitator family transporter  28.77 
 
 
387 aa  137  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.246594  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1722  cation diffusion facilitator family transporter  29.04 
 
 
299 aa  137  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2090  cation efflux family protein  29.83 
 
 
302 aa  136  4e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3895  cation diffusion facilitator family transporter  32.75 
 
 
307 aa  135  8e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.640647  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2127  cation diffusion facilitator family transporter  31.62 
 
 
293 aa  135  9e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.139968  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1700  cation diffusion facilitator family transporter  30.28 
 
 
293 aa  135  9e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2100  cation diffusion facilitator family transporter  27.42 
 
 
310 aa  135  9.999999999999999e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.70845  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1144  cation efflux family protein  32.51 
 
 
289 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0182712  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0983  cation efflux family protein  32.86 
 
 
289 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0179207  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3385  cation efflux protein  26.8 
 
 
385 aa  133  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2423  cation diffusion facilitator family transporter  30.63 
 
 
291 aa  133  5e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2576  cation diffusion facilitator family transporter  26.55 
 
 
423 aa  132  6e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00102277 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0264  cation diffusion facilitator family transporter  26.8 
 
 
385 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.56079 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0282  cation diffusion facilitator family transporter  26.8 
 
 
385 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.369403  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09106  cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcD  31.83 
 
 
313 aa  130  2.0000000000000002e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.341807  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3548  cation diffusion facilitator family transporter  25.87 
 
 
320 aa  130  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.058207 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0210  cation diffusion facilitator family transporter  26.55 
 
 
404 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.904407 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0196  cation diffusion facilitator family transporter  26.55 
 
 
404 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.831911  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2400  cation diffusion facilitator family transporter  29.69 
 
 
307 aa  130  3e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1531  cation diffusion facilitator family transporter  26.64 
 
 
317 aa  130  4.0000000000000003e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1450  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  27.86 
 
 
378 aa  129  6e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.59644  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1517  cation diffusion facilitator family transporter  27.86 
 
 
378 aa  129  6e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0344  cation transporter  29.87 
 
 
427 aa  129  6e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00235154  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2574  cation diffusion facilitator family transporter  29.3 
 
 
310 aa  129  6e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3647  cation diffusion facilitator family transporter  23.29 
 
 
395 aa  129  7.000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0974  cation diffusion facilitator family transporter  27.68 
 
 
320 aa  129  9.000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0577  cation diffusion facilitator family transporter  26.04 
 
 
308 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.215169 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  29.12 
 
 
311 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1521  cation diffusion facilitator family transporter  31.45 
 
 
309 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2824  cation diffusion facilitator family transporter  26.46 
 
 
385 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.74147  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3764  cation efflux protein  24.41 
 
 
389 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0837533 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1127  cation diffusion facilitator family transporter  30.8 
 
 
323 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1587  cation diffusion facilitator family transporter  27.15 
 
 
307 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.697729  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1410  cation diffusion facilitator family transporter  30.11 
 
 
333 aa  127  3e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0496  cation diffusion facilitator family transporter  24.91 
 
 
318 aa  127  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.920568  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3825  cation efflux family protein  26.57 
 
 
396 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2250  cation diffusion facilitator family transporter  28.01 
 
 
294 aa  127  3e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000133165  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2966  cation efflux family protein  26.12 
 
 
396 aa  126  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2906  cation efflux family protein  26.12 
 
 
396 aa  126  5e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.313592  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1635  cation efflux family protein  26.12 
 
 
396 aa  126  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.504056  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3403  cation efflux family protein  26.12 
 
 
396 aa  126  5e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.843377  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0047  cation efflux family protein  26.12 
 
 
396 aa  126  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3154  cation efflux family protein  26.57 
 
 
418 aa  126  6e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0737  cation efflux system protein  29.67 
 
 
317 aa  126  6e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.338743  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3907  cation efflux family protein  26.12 
 
 
396 aa  126  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0130  cation diffusion facilitator family transporter  31.23 
 
 
292 aa  125  9e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.120546  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0465  cation efflux family protein  25.78 
 
 
391 aa  125  9e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.326406  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0625  cation diffusion facilitator family transporter  25.78 
 
 
391 aa  125  9e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0331  cation efflux family protein  28.72 
 
 
311 aa  125  1e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0191  cation diffusion facilitator family transporter  26.55 
 
 
384 aa  125  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.114126  hitchhiker  0.0000000345826 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0698  cation diffusion facilitator family transporter  30.71 
 
 
406 aa  125  1e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>