More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1410 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1410  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 333 aa  667    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2381  cation diffusion facilitator family transporter  61.49 
 
 		 388 aa  375  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000223883  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0586  cation efflux family protein  45.18 
 
 		 393 aa  293  4e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0440871  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0576  cation efflux family protein  43.77 
 
 		 393 aa  292  7e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3583  cation diffusion facilitator family transporter  43.28 
 
 		 392 aa  281  1e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000126728  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0754  cation diffusion facilitator family transporter  38.61 
 
 		 311 aa  218  1e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00172245  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0970  cation diffusion facilitator family transporter  37.64 
 
 		 390 aa  175  9e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000558459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1051  putative cation efflux system protein  33.67 
 
 		 319 aa  174  1.9999999999999998e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1712  cation diffusion facilitator family transporter  34.59 
 
 		 306 aa  168  1e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00125134  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0272  MMT1 protein  34.33 
 
 		 372 aa  162  7e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00381399  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20770  cation diffusion facilitator family transporter  33.94 
 
 		 380 aa  159  5e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.799337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04870  cation diffusion facilitator family transporter  35.87 
 
 		 374 aa  155  7e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08140  cation diffusion facilitator family transporter  31.34 
 
 		 369 aa  150  2e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.150714  normal  0.172071 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0339  cation diffusion facilitator family transporter  29.45 
 
 		 293 aa  150  4e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000143188  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0076  cation diffusion facilitator family transporter  36.27 
 
 		 315 aa  144  3e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.097535  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1513  cation diffusion facilitator family transporter  34.83 
 
 		 302 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.5227 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2491  cation diffusion facilitator family transporter  32.35 
 
 		 288 aa  129  9.000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2443  cation diffusion facilitator family transporter  32.35 
 
 		 288 aa  129  9.000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2155  cation efflux family protein  30.04 
 
 		 296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.112799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2093  cation efflux protein  30.04 
 
 		 296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0345856  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1700  cation diffusion facilitator family transporter  28.27 
 
 		 293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2310  cation efflux family protein  30.04 
 
 		 296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2334  cation efflux family protein  30.04 
 
 		 293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0074  cation diffusion facilitator family transporter  30.11 
 
 		 313 aa  127  3e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2343  cation efflux family protein  29.68 
 
 		 293 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.412902  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2089  cation efflux protein  29.68 
 
 		 296 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.328738  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2418  cation efflux family protein  29.68 
 
 		 293 aa  126  5e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3033  cation efflux family protein  29.68 
 
 		 293 aa  126  6e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2291  cation efflux family protein  29.68 
 
 		 293 aa  126  6e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2127  cation diffusion facilitator family transporter  29.33 
 
 		 293 aa  125  9e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.139968  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1366  cation diffusion facilitator family transporter  30.5 
 
 		 422 aa  124  3e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0900  cation diffusion facilitator family transporter  30.32 
 
 		 285 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000200254  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0491  cation diffusion facilitator family transporter  30.22 
 
 		 354 aa  122  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0566502 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2008  cation efflux family protein  32.32 
 
 		 293 aa  121  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.536733  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0051  cation diffusion facilitator family transporter  29.12 
 
 		 306 aa  119  7e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04060  cation diffusion facilitator family transporter  29.87 
 
 		 292 aa  119  9e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1127  cation diffusion facilitator family transporter  27.02 
 
 		 323 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0051  cation diffusion facilitator family transporter  28.77 
 
 		 306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0344  cation transporter  27.86 
 
 		 427 aa  115  1.0000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00235154  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0245  cation diffusion facilitator family transporter  30.04 
 
 		 291 aa  114  3e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1199  cation diffusion facilitator family transporter  31.88 
 
 		 315 aa  114  3e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000000135405  hitchhiker  0.00000509926 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2100  cation diffusion facilitator family transporter  29.25 
 
 		 310 aa  113  5e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.70845  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0496  cation diffusion facilitator family transporter  26.85 
 
 		 318 aa  113  5e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.920568  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0139  ferrous iron efflux protein F  26.06 
 
 		 300 aa  113  5e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.205512  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3300  iron and zinc efflux system protein  23.18 
 
 		 318 aa  113  6e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.831799  normal  0.0946092 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0634  cation efflux family protein  29.41 
 
 		 314 aa  112  7.000000000000001e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0858  cation efflux system protein  26.64 
 
 		 331 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3406  cation diffusion facilitator family transporter  25.84 
 
 		 337 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4529  cation efflux family protein  31.06 
 
 		 297 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2184  cation diffusion facilitator family transporter  29.71 
 
 		 303 aa  111  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.478077  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0374  cation diffusion facilitator family transporter  29.86 
 
 		 303 aa  110  5e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0167  cation diffusion facilitator family transporter  27.72 
 
 		 305 aa  109  5e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3150  cation diffusion facilitator family transporter  25.17 
 
 		 401 aa  109  5e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2795  ferrous iron efflux protein F  26.74 
 
 		 301 aa  109  7.000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00102947  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1668  cation diffusion facilitator family transporter  29.35 
 
 		 291 aa  108  9.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0340924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0706  cation efflux family protein  29.07 
 
 		 297 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4257  cation diffusion facilitator family transporter  27.87 
 
 		 297 aa  108  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4808  ferrous iron efflux protein F  25.94 
 
 		 300 aa  108  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2250  cation diffusion facilitator family transporter  28.35 
 
 		 294 aa  108  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000133165  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0896  cation efflux family protein  27.72 
 
 		 304 aa  108  2e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0221423  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4305  cation efflux family protein  28.04 
 
 		 298 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.901101  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4143  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  28.04 
 
 		 297 aa  107  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4154  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  28.04 
 
 		 298 aa  107  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4640  cation efflux family protein  28.04 
 
 		 298 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4490  cation efflux family protein  28.04 
 
 		 297 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000013867 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0137  ferrous iron efflux protein F  24.91 
 
 		 300 aa  108  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4390  ferrous iron efflux protein F  26.39 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.228028 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4459  ferrous iron efflux protein F  26.39 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.709567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4392  ferrous iron efflux protein F  26.39 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2262  ferrous iron efflux protein F  24.29 
 
 		 302 aa  107  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000896639  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0858  cation efflux protein  26.67 
 
 		 299 aa  107  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4307  ferrous iron efflux protein F  26.39 
 
 		 300 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0702  Co/Zn/Cd cation transporter  29.32 
 
 		 291 aa  107  3e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03800  ferrous iron efflux protein F  24.81 
 
 		 300 aa  107  4e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.769582  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4070  cation diffusion facilitator family transporter  24.81 
 
 		 300 aa  107  4e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4494  cation efflux family protein  28.2 
 
 		 298 aa  107  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4448  ferrous iron efflux protein F  24.81 
 
 		 300 aa  107  4e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4103  ferrous iron efflux protein F  24.81 
 
 		 300 aa  107  4e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4145  ferrous iron efflux protein F  24.81 
 
 		 300 aa  107  4e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03749  hypothetical protein  24.81 
 
 		 300 aa  107  4e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.859371  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5369  ferrous iron efflux protein F  24.81 
 
 		 300 aa  107  4e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  26.76 
 
 		 311 aa  106  4e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4544  cation efflux family protein  28.04 
 
 		 297 aa  107  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4355  ferrous iron efflux protein F  24.44 
 
 		 300 aa  106  5e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.363052 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00146  ferrous iron efflux protein F  24.15 
 
 		 302 aa  106  5e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002221  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  24.75 
 
 		 302 aa  106  6e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000518265  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2256  cation diffusion facilitator family transporter  29.96 
 
 		 332 aa  106  6e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00134926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1794  cation diffusion facilitator family transporter  25.87 
 
 		 299 aa  106  6e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0663  cation diffusion facilitator family transporter  26.52 
 
 		 312 aa  106  7e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0132428  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1360  cation diffusion facilitator family transporter  26.33 
 
 		 396 aa  105  8e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3126  cation diffusion facilitator family transporter  28.74 
 
 		 297 aa  105  9e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3245  cation efflux protein  25.77 
 
 		 309 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  25.7 
 
 		 311 aa  105  1e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1774  cation diffusion facilitator family transporter  27.37 
 
 		 293 aa  105  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000103729  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4278  ferrous iron efflux protein F  26.02 
 
 		 300 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.546202  normal  0.887398 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1146  cation efflux family protein  25.17 
 
 		 411 aa  104  2e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00680044  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4057  ferrous iron efflux protein F  25.26 
 
 		 300 aa  104  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.3408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4394  ferrous iron efflux protein F  24.44 
 
 		 300 aa  104  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0331  cation efflux family protein  27.11 
 
 		 311 aa  104  3e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3813  ferrous iron efflux protein F  25.38 
 
 		 298 aa  104  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.70191  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>