More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0196 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_0191  cation diffusion facilitator family transporter  90.1 
 
 
384 aa  673    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.114126  hitchhiker  0.0000000345826 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3385  cation efflux protein  92.71 
 
 
385 aa  699    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0264  cation diffusion facilitator family transporter  92.97 
 
 
385 aa  679    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.56079 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2824  cation diffusion facilitator family transporter  92.97 
 
 
385 aa  679    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.74147  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0210  cation diffusion facilitator family transporter  99.75 
 
 
404 aa  793    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.904407 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0196  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 
404 aa  795    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.831911  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0282  cation diffusion facilitator family transporter  93.23 
 
 
385 aa  682    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.369403  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3154  cation efflux family protein  77.33 
 
 
418 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3825  cation efflux family protein  78.04 
 
 
396 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2906  cation efflux family protein  77.52 
 
 
396 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.313592  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2966  cation efflux family protein  77.52 
 
 
396 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3403  cation efflux family protein  77.52 
 
 
396 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.843377  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0047  cation efflux family protein  77.78 
 
 
396 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3907  cation efflux family protein  77.78 
 
 
396 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1635  cation efflux family protein  77.52 
 
 
396 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.504056  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0399  cation diffusion facilitator family transporter  72.89 
 
 
418 aa  550  1e-155  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.329701  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0117  cation diffusion facilitator family transporter  72.46 
 
 
400 aa  547  1e-154  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4320  cation (Co++/Zn++/Cd++) efflux protein  72.34 
 
 
414 aa  526  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0496  cation diffusion facilitator family transporter  60 
 
 
318 aa  341  1e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.920568  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1531  cation diffusion facilitator family transporter  60.7 
 
 
317 aa  334  2e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3764  cation efflux protein  48.8 
 
 
389 aa  318  1e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0837533 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3548  cation diffusion facilitator family transporter  63.16 
 
 
320 aa  317  2e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.058207 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0570  cation diffusion facilitator family transporter  55.71 
 
 
298 aa  309  5e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.712384  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1587  cation diffusion facilitator family transporter  55.91 
 
 
307 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.697729  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2526  cation diffusion facilitator family transporter  55.7 
 
 
307 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0324472 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1675  cation diffusion facilitator family transporter  56.62 
 
 
307 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.282896  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2941  cation diffusion facilitator family transporter  56.62 
 
 
307 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0069  cation efflux family protein  59.5 
 
 
318 aa  300  2e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3406  cation diffusion facilitator family transporter  53.71 
 
 
337 aa  300  4e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4982  cation diffusion facilitator family transporter  54.43 
 
 
307 aa  299  5e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0279964 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6231  cation diffusion facilitator family transporter  58.72 
 
 
299 aa  297  2e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554838  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3245  cation efflux protein  56.25 
 
 
309 aa  295  1e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0577  cation diffusion facilitator family transporter  58.39 
 
 
308 aa  294  2e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.215169 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3356  cation diffusion facilitator family transporter  50.13 
 
 
382 aa  293  5e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3009  cation diffusion facilitator family transporter  50.14 
 
 
382 aa  290  4e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3647  cation diffusion facilitator family transporter  45.78 
 
 
395 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3077  hypothetical protein  49.49 
 
 
392 aa  280  2e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.197933  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5170  cation efflux protein  55.91 
 
 
303 aa  268  8.999999999999999e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2012  hypothetical protein  39.45 
 
 
380 aa  261  2e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2017  hypothetical protein  39.18 
 
 
380 aa  259  7e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1517  cation diffusion facilitator family transporter  39.13 
 
 
378 aa  234  2.0000000000000002e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1450  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  39.13 
 
 
378 aa  234  2.0000000000000002e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.59644  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2576  cation diffusion facilitator family transporter  41.41 
 
 
423 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00102277 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0625  cation diffusion facilitator family transporter  44.04 
 
 
391 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0465  cation efflux family protein  44.04 
 
 
391 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.326406  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3258  cation diffusion facilitator family transporter  42.33 
 
 
390 aa  218  1e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1036  cation diffusion facilitator family transporter  37.03 
 
 
387 aa  217  2e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.246594  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0553  cation diffusion facilitator family transporter  42.26 
 
 
388 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0938  cation diffusion facilitator family transporter  41.06 
 
 
387 aa  207  4e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1992  cation diffusion facilitator family transporter  42.18 
 
 
389 aa  206  5e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3150  cation diffusion facilitator family transporter  34.99 
 
 
401 aa  206  5e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2889  cation diffusion facilitator family transporter  33.43 
 
 
388 aa  188  2e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000320508  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1144  cation efflux family protein  35.21 
 
 
289 aa  181  2e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0182712  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0974  cation diffusion facilitator family transporter  37.85 
 
 
320 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0983  cation efflux family protein  35.56 
 
 
289 aa  180  2.9999999999999997e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0179207  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0858  cation efflux system protein  35.08 
 
 
331 aa  177  4e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0491  cation diffusion facilitator family transporter  33.78 
 
 
354 aa  176  6e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0566502 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1774  cation diffusion facilitator family transporter  33.1 
 
 
293 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000103729  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1511  cation diffusion facilitator family transporter  38.08 
 
 
314 aa  171  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00242761  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0936  cation diffusion facilitator family transporter  34.38 
 
 
300 aa  170  5e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0960  cation diffusion facilitator family transporter  33.68 
 
 
291 aa  167  2e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04060  cation diffusion facilitator family transporter  34.62 
 
 
292 aa  167  4e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1668  cation diffusion facilitator family transporter  32.29 
 
 
291 aa  166  5e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0340924  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0245  cation diffusion facilitator family transporter  32.76 
 
 
291 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4143  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  31.29 
 
 
297 aa  162  9e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4490  cation efflux family protein  31.29 
 
 
297 aa  162  9e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000013867 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4305  cation efflux family protein  31.29 
 
 
298 aa  162  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.901101  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4154  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  31.29 
 
 
298 aa  162  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4640  cation efflux family protein  31.29 
 
 
298 aa  162  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4544  cation efflux family protein  30.95 
 
 
297 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4257  cation diffusion facilitator family transporter  31.19 
 
 
297 aa  162  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4529  cation efflux family protein  30.95 
 
 
297 aa  161  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4494  cation efflux family protein  31.29 
 
 
298 aa  161  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0706  cation efflux family protein  30.95 
 
 
297 aa  159  8e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2100  cation diffusion facilitator family transporter  37.54 
 
 
310 aa  158  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.70845  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3126  cation diffusion facilitator family transporter  30.27 
 
 
297 aa  155  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5408  cation efflux protein  44.78 
 
 
222 aa  152  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0362512  normal  0.663662 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1549  cation diffusion facilitator family transporter  31.82 
 
 
290 aa  150  5e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1200  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  44.97 
 
 
262 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.010126  normal  0.466724 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0167  cation diffusion facilitator family transporter  34.21 
 
 
305 aa  145  1e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2090  cation efflux family protein  33.67 
 
 
302 aa  142  9.999999999999999e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0051  cation diffusion facilitator family transporter  31.19 
 
 
306 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0051  cation diffusion facilitator family transporter  31.19 
 
 
306 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19310  cation diffusion facilitator family transporter  35.19 
 
 
298 aa  140  6e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000504538 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45119  predicted protein  31.15 
 
 
591 aa  139  6e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.170034  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1437  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  30.6 
 
 
303 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.929913 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1051  putative cation efflux system protein  32.19 
 
 
319 aa  135  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2005  cation diffusion facilitator family transporter  28.18 
 
 
299 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2613  cation efflux family protein  31.1 
 
 
296 aa  133  5e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0858  cation efflux protein  28.31 
 
 
299 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1741  cation diffusion facilitator family transporter  34.95 
 
 
307 aa  130  3e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00244826  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1788  cation diffusion facilitator family transporter  30.45 
 
 
299 aa  130  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0431575 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0074  cation diffusion facilitator family transporter  26.55 
 
 
313 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1752  cation diffusion facilitator family transporter  31.67 
 
 
301 aa  130  5.0000000000000004e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00011926  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0130  cation diffusion facilitator family transporter  29.47 
 
 
292 aa  128  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.120546  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2343  cation efflux family protein  32.62 
 
 
293 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.412902  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2418  cation efflux family protein  32.62 
 
 
293 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2428  cation diffusion facilitator family transporter  30.1 
 
 
299 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000439977  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1040  cation diffusion facilitator family transporter  31.51 
 
 
308 aa  128  2.0000000000000002e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1794  cation diffusion facilitator family transporter  27.44 
 
 
299 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>