More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2250 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2250  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 294 aa  598  1e-170  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000133165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0491  cation diffusion facilitator family transporter  35.97 
 
 		 354 aa  196  5.000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0566502 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1668  cation diffusion facilitator family transporter  31.25 
 
 		 291 aa  180  2e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0340924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1774  cation diffusion facilitator family transporter  34.16 
 
 		 293 aa  179  4e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000103729  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04060  cation diffusion facilitator family transporter  36.55 
 
 		 292 aa  179  4e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2256  cation diffusion facilitator family transporter  30.8 
 
 		 332 aa  174  9.999999999999999e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00134926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0245  cation diffusion facilitator family transporter  31.6 
 
 		 291 aa  171  1e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0960  cation diffusion facilitator family transporter  31.94 
 
 		 291 aa  167  2e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2005  cation diffusion facilitator family transporter  30.88 
 
 		 299 aa  166  4e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0858  cation efflux protein  31.85 
 
 		 299 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2428  cation diffusion facilitator family transporter  36.19 
 
 		 299 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000439977  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1722  cation diffusion facilitator family transporter  33.33 
 
 		 299 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4257  cation diffusion facilitator family transporter  35.82 
 
 		 297 aa  162  6e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0706  cation efflux family protein  35.82 
 
 		 297 aa  162  7e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1549  cation diffusion facilitator family transporter  30.94 
 
 		 290 aa  162  8.000000000000001e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4544  cation efflux family protein  36.17 
 
 		 297 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4490  cation efflux family protein  35.82 
 
 		 297 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000013867 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4529  cation efflux family protein  35.46 
 
 		 297 aa  160  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4305  cation efflux family protein  35.82 
 
 		 298 aa  160  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.901101  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4143  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  35.82 
 
 		 297 aa  160  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4154  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  35.82 
 
 		 298 aa  160  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1788  cation diffusion facilitator family transporter  35.45 
 
 		 299 aa  160  3e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0431575 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4640  cation efflux family protein  35.82 
 
 		 298 aa  160  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4494  cation efflux family protein  36.56 
 
 		 298 aa  159  4e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2613  cation efflux family protein  30.22 
 
 		 296 aa  159  7e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0983  cation efflux family protein  32.4 
 
 		 289 aa  158  9e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0179207  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3126  cation diffusion facilitator family transporter  34.75 
 
 		 297 aa  158  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1144  cation efflux family protein  32.06 
 
 		 289 aa  157  2e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0182712  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1794  cation diffusion facilitator family transporter  29.11 
 
 		 299 aa  157  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0496  cation diffusion facilitator family transporter  32.86 
 
 		 318 aa  154  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.920568  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3150  cation diffusion facilitator family transporter  29.45 
 
 		 401 aa  152  8e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0936  cation diffusion facilitator family transporter  32.56 
 
 		 300 aa  149  7e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0858  cation efflux system protein  29.43 
 
 		 331 aa  148  9e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3647  cation diffusion facilitator family transporter  30.43 
 
 		 395 aa  147  3e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1531  cation diffusion facilitator family transporter  33.58 
 
 		 317 aa  145  6e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3406  cation diffusion facilitator family transporter  31.25 
 
 		 337 aa  145  9e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09106  cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcD  32.03 
 
 		 313 aa  144  2e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.341807  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3548  cation diffusion facilitator family transporter  32.7 
 
 		 320 aa  143  4e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.058207 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1026  cation diffusion facilitator family transporter  30.11 
 
 		 323 aa  141  9.999999999999999e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2090  cation efflux family protein  33.96 
 
 		 302 aa  140  3e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0051  cation diffusion facilitator family transporter  29.03 
 
 		 306 aa  140  3e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0577  cation diffusion facilitator family transporter  33.08 
 
 		 308 aa  140  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.215169 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2017  hypothetical protein  30.22 
 
 		 380 aa  139  6e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2100  cation diffusion facilitator family transporter  28.87 
 
 		 310 aa  139  6e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.70845  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2012  hypothetical protein  29.85 
 
 		 380 aa  139  7e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0191  cation diffusion facilitator family transporter  32.83 
 
 		 384 aa  138  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.114126  hitchhiker  0.0000000345826 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0938  cation diffusion facilitator family transporter  31.79 
 
 		 387 aa  137  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3245  cation efflux protein  33.98 
 
 		 309 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1450  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  30.69 
 
 		 378 aa  136  5e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.59644  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1517  cation diffusion facilitator family transporter  30.69 
 
 		 378 aa  136  5e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0051  cation diffusion facilitator family transporter  28.32 
 
 		 306 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1741  cation diffusion facilitator family transporter  29.37 
 
 		 307 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00244826  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0130  cation diffusion facilitator family transporter  31.03 
 
 		 292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.120546  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3537  cation diffusion facilitator family transporter  30.31 
 
 		 294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2526  cation diffusion facilitator family transporter  31.73 
 
 		 307 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0324472 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0465  cation efflux family protein  27.74 
 
 		 391 aa  132  5e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.326406  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0570  cation diffusion facilitator family transporter  35.42 
 
 		 298 aa  132  5e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.712384  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0625  cation diffusion facilitator family transporter  27.74 
 
 		 391 aa  132  5e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  28.57 
 
 		 311 aa  132  7.999999999999999e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45119  predicted protein  32.99 
 
 		 591 aa  131  1.0000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.170034  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1051  putative cation efflux system protein  28.08 
 
 		 319 aa  130  2.0000000000000002e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  27.86 
 
 		 311 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5170  cation efflux protein  32.7 
 
 		 303 aa  129  6e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0663  cation diffusion facilitator family transporter  29.35 
 
 		 312 aa  129  7.000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0132428  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3764  cation efflux protein  28.11 
 
 		 389 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0837533 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3385  cation efflux protein  31.7 
 
 		 385 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2530  cation diffusion facilitator family transporter  28.77 
 
 		 460 aa  128  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0974  cation diffusion facilitator family transporter  28.42 
 
 		 320 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4982  cation diffusion facilitator family transporter  31.48 
 
 		 307 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0279964 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0074  cation diffusion facilitator family transporter  28.01 
 
 		 313 aa  127  3e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2127  cation diffusion facilitator family transporter  31.64 
 
 		 293 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.139968  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2574  cation diffusion facilitator family transporter  29.69 
 
 		 310 aa  126  4.0000000000000003e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2941  cation diffusion facilitator family transporter  32.7 
 
 		 307 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1675  cation diffusion facilitator family transporter  32.7 
 
 		 307 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.282896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1511  cation diffusion facilitator family transporter  28.27 
 
 		 314 aa  125  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00242761  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2824  cation diffusion facilitator family transporter  31.32 
 
 		 385 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.74147  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0702  Co/Zn/Cd cation transporter  26.8 
 
 		 291 aa  125  1e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0282  cation diffusion facilitator family transporter  31.32 
 
 		 385 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.369403  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0264  cation diffusion facilitator family transporter  31.32 
 
 		 385 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.56079 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1587  cation diffusion facilitator family transporter  31.56 
 
 		 307 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.697729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1683  cation diffusion facilitator family transporter  34.44 
 
 		 308 aa  124  3e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000676071  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0210  cation diffusion facilitator family transporter  30.94 
 
 		 404 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.904407 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0196  cation diffusion facilitator family transporter  30.94 
 
 		 404 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.831911  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6231  cation diffusion facilitator family transporter  29.89 
 
 		 299 aa  123  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2576  cation diffusion facilitator family transporter  28.91 
 
 		 423 aa  123  4e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00102277 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2089  cation efflux protein  29.86 
 
 		 296 aa  122  5e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.328738  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0069  cation efflux family protein  30.4 
 
 		 318 aa  123  5e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2291  cation efflux family protein  29.5 
 
 		 293 aa  122  5e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3033  cation efflux family protein  29.5 
 
 		 293 aa  122  5e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2343  cation efflux family protein  29.86 
 
 		 293 aa  122  6e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.412902  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2418  cation efflux family protein  29.86 
 
 		 293 aa  122  6e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2155  cation efflux family protein  29.5 
 
 		 296 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.112799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2093  cation efflux protein  29.5 
 
 		 296 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0345856  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0117  cation diffusion facilitator family transporter  30.29 
 
 		 400 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0846  cation diffusion facilitator family transporter  31.09 
 
 		 459 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0034385  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1127  cation diffusion facilitator family transporter  27.01 
 
 		 323 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1752  cation diffusion facilitator family transporter  28.97 
 
 		 301 aa  121  9.999999999999999e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00011926  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2310  cation efflux family protein  29.5 
 
 		 296 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2334  cation efflux family protein  29.5 
 
 		 293 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3895  cation diffusion facilitator family transporter  32.03 
 
 		 307 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.640647  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>