More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5170 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5170  cation efflux protein  100 
 
 		 303 aa  599  1e-170  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0577  cation diffusion facilitator family transporter  78.72 
 
 		 308 aa  444  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.215169 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1587  cation diffusion facilitator family transporter  73.09 
 
 		 307 aa  421  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.697729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1675  cation diffusion facilitator family transporter  74.09 
 
 		 307 aa  422  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.282896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2941  cation diffusion facilitator family transporter  74.09 
 
 		 307 aa  422  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2526  cation diffusion facilitator family transporter  73 
 
 		 307 aa  414  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0324472 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4982  cation diffusion facilitator family transporter  73.33 
 
 		 307 aa  415  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0279964 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3406  cation diffusion facilitator family transporter  68.21 
 
 		 337 aa  401  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0496  cation diffusion facilitator family transporter  67.35 
 
 		 318 aa  389  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.920568  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3245  cation efflux protein  67.57 
 
 		 309 aa  377  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1531  cation diffusion facilitator family transporter  65.45 
 
 		 317 aa  365  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6231  cation diffusion facilitator family transporter  67.62 
 
 		 299 aa  350  2e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0570  cation diffusion facilitator family transporter  61.46 
 
 		 298 aa  349  3e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.712384  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0069  cation efflux family protein  64.85 
 
 		 318 aa  342  4e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3548  cation diffusion facilitator family transporter  66.91 
 
 		 320 aa  341  7e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.058207 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0191  cation diffusion facilitator family transporter  55.83 
 
 		 384 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.114126  hitchhiker  0.0000000345826 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0264  cation diffusion facilitator family transporter  56.18 
 
 		 385 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.56079 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0282  cation diffusion facilitator family transporter  56.18 
 
 		 385 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.369403  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3385  cation efflux protein  55.48 
 
 		 385 aa  295  6e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2824  cation diffusion facilitator family transporter  55.83 
 
 		 385 aa  295  8e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.74147  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0210  cation diffusion facilitator family transporter  55.91 
 
 		 404 aa  293  2e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.904407 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0196  cation diffusion facilitator family transporter  55.91 
 
 		 404 aa  293  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.831911  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0399  cation diffusion facilitator family transporter  54.08 
 
 		 418 aa  293  3e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.329701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0117  cation diffusion facilitator family transporter  56.03 
 
 		 400 aa  293  4e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3825  cation efflux family protein  56.18 
 
 		 396 aa  290  2e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2966  cation efflux family protein  56.18 
 
 		 396 aa  289  3e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2906  cation efflux family protein  56.18 
 
 		 396 aa  289  3e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.313592  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1635  cation efflux family protein  56.18 
 
 		 396 aa  289  3e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.504056  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3154  cation efflux family protein  56.18 
 
 		 418 aa  289  3e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3403  cation efflux family protein  56.18 
 
 		 396 aa  289  3e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.843377  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3907  cation efflux family protein  56.18 
 
 		 396 aa  289  4e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0047  cation efflux family protein  56.18 
 
 		 396 aa  289  4e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4320  cation (Co++/Zn++/Cd++) efflux protein  54.93 
 
 		 414 aa  286  4e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3356  cation diffusion facilitator family transporter  51.84 
 
 		 382 aa  266  2e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3009  cation diffusion facilitator family transporter  51.84 
 
 		 382 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3764  cation efflux protein  45.74 
 
 		 389 aa  252  6e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0837533 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3077  hypothetical protein  51.86 
 
 		 392 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.197933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3647  cation diffusion facilitator family transporter  43.18 
 
 		 395 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2017  hypothetical protein  37.94 
 
 		 380 aa  192  5e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2012  hypothetical protein  37.94 
 
 		 380 aa  192  7e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2889  cation diffusion facilitator family transporter  37.59 
 
 		 388 aa  188  1e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000320508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3150  cation diffusion facilitator family transporter  37.07 
 
 		 401 aa  183  3e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2576  cation diffusion facilitator family transporter  39.15 
 
 		 423 aa  181  2e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00102277 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1036  cation diffusion facilitator family transporter  34.75 
 
 		 387 aa  179  4e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.246594  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0491  cation diffusion facilitator family transporter  32.29 
 
 		 354 aa  179  5.999999999999999e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0566502 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1668  cation diffusion facilitator family transporter  34.41 
 
 		 291 aa  178  1e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0340924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1450  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  34.93 
 
 		 378 aa  174  1.9999999999999998e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.59644  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1549  cation diffusion facilitator family transporter  34.05 
 
 		 290 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1517  cation diffusion facilitator family transporter  34.93 
 
 		 378 aa  174  1.9999999999999998e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0553  cation diffusion facilitator family transporter  38.54 
 
 		 388 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0938  cation diffusion facilitator family transporter  40.36 
 
 		 387 aa  174  1.9999999999999998e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1774  cation diffusion facilitator family transporter  30.53 
 
 		 293 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000103729  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0245  cation diffusion facilitator family transporter  34.05 
 
 		 291 aa  169  4e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0960  cation diffusion facilitator family transporter  33.94 
 
 		 291 aa  169  5e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3258  cation diffusion facilitator family transporter  39.18 
 
 		 390 aa  168  1e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0625  cation diffusion facilitator family transporter  40.07 
 
 		 391 aa  167  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0465  cation efflux family protein  40.07 
 
 		 391 aa  167  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.326406  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0974  cation diffusion facilitator family transporter  35.09 
 
 		 320 aa  166  4e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1144  cation efflux family protein  32.29 
 
 		 289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0182712  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04060  cation diffusion facilitator family transporter  32.97 
 
 		 292 aa  162  5.0000000000000005e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0983  cation efflux family protein  31.94 
 
 		 289 aa  161  1e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0179207  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4529  cation efflux family protein  29.37 
 
 		 297 aa  157  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0858  cation efflux system protein  33.9 
 
 		 331 aa  156  3e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4257  cation diffusion facilitator family transporter  27.97 
 
 		 297 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0706  cation efflux family protein  29.02 
 
 		 297 aa  155  6e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4143  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  28.67 
 
 		 297 aa  155  7e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4490  cation efflux family protein  28.67 
 
 		 297 aa  155  7e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000013867 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4305  cation efflux family protein  28.67 
 
 		 298 aa  155  8e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.901101  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4154  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  28.67 
 
 		 298 aa  155  8e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4640  cation efflux family protein  28.67 
 
 		 298 aa  155  8e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1992  cation diffusion facilitator family transporter  39.15 
 
 		 389 aa  155  9e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4494  cation efflux family protein  28.67 
 
 		 298 aa  154  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4544  cation efflux family protein  28.32 
 
 		 297 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3126  cation diffusion facilitator family transporter  27.62 
 
 		 297 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0936  cation diffusion facilitator family transporter  29.86 
 
 		 300 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2005  cation diffusion facilitator family transporter  31.12 
 
 		 299 aa  153  4e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1712  cation diffusion facilitator family transporter  32.75 
 
 		 306 aa  143  4e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00125134  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2250  cation diffusion facilitator family transporter  32.7 
 
 		 294 aa  143  4e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000133165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0130  cation diffusion facilitator family transporter  32.08 
 
 		 292 aa  142  5e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.120546  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2090  cation efflux family protein  31.36 
 
 		 302 aa  141  9.999999999999999e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0167  cation diffusion facilitator family transporter  33.8 
 
 		 305 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1741  cation diffusion facilitator family transporter  34.88 
 
 		 307 aa  140  3e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00244826  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2100  cation diffusion facilitator family transporter  33.22 
 
 		 310 aa  139  4.999999999999999e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.70845  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0858  cation efflux protein  29.68 
 
 		 299 aa  139  6e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1511  cation diffusion facilitator family transporter  35.62 
 
 		 314 aa  139  6e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00242761  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3537  cation diffusion facilitator family transporter  30.61 
 
 		 294 aa  138  8.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09106  cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcD  29.97 
 
 		 313 aa  138  1e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.341807  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2613  cation efflux family protein  32.23 
 
 		 296 aa  136  4e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1437  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  31.73 
 
 		 303 aa  136  5e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.929913 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1366  cation diffusion facilitator family transporter  25.98 
 
 		 422 aa  133  3e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0051  cation diffusion facilitator family transporter  27.21 
 
 		 306 aa  132  5e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07060  iron ion homeostasis-related protein, putative  29.38 
 
 		 501 aa  132  6.999999999999999e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1752  cation diffusion facilitator family transporter  32.98 
 
 		 301 aa  132  7.999999999999999e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00011926  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1722  cation diffusion facilitator family transporter  28.37 
 
 		 299 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0051  cation diffusion facilitator family transporter  26.86 
 
 		 306 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0663  cation diffusion facilitator family transporter  26.48 
 
 		 312 aa  129  4.0000000000000003e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0132428  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1794  cation diffusion facilitator family transporter  28.27 
 
 		 299 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0737  cation efflux system protein  30.27 
 
 		 317 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.338743  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08791  CDF iron transporter (Eurofung)  31.65 
 
 		 490 aa  127  2.0000000000000002e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.221743  normal  0.15756 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19310  cation diffusion facilitator family transporter  32.26 
 
 		 298 aa  125  9e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000504538 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>