More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2576 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_2576  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 423 aa  848    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00102277 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3258  cation diffusion facilitator family transporter  49.87 
 
 		 390 aa  322  8e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0938  cation diffusion facilitator family transporter  48.53 
 
 		 387 aa  280  3e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3647  cation diffusion facilitator family transporter  45.43 
 
 		 395 aa  280  5e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1517  cation diffusion facilitator family transporter  41.16 
 
 		 378 aa  269  5e-71  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1450  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  41.16 
 
 		 378 aa  269  5e-71  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.59644  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2017  hypothetical protein  43.7 
 
 		 380 aa  269  5.9999999999999995e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2012  hypothetical protein  43.4 
 
 		 380 aa  268  1e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1992  cation diffusion facilitator family transporter  42.5 
 
 		 389 aa  255  8e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3764  cation efflux protein  40.7 
 
 		 389 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0837533 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0553  cation diffusion facilitator family transporter  42.44 
 
 		 388 aa  245  9.999999999999999e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1036  cation diffusion facilitator family transporter  39.88 
 
 		 387 aa  241  2e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.246594  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0625  cation diffusion facilitator family transporter  41.02 
 
 		 391 aa  236  5.0000000000000005e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0465  cation efflux family protein  41.02 
 
 		 391 aa  236  5.0000000000000005e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.326406  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0117  cation diffusion facilitator family transporter  40.23 
 
 		 400 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0210  cation diffusion facilitator family transporter  41.41 
 
 		 404 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.904407 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0196  cation diffusion facilitator family transporter  41.41 
 
 		 404 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.831911  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3385  cation efflux protein  41.24 
 
 		 385 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2889  cation diffusion facilitator family transporter  37.57 
 
 		 388 aa  229  5e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000320508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0399  cation diffusion facilitator family transporter  39.11 
 
 		 418 aa  229  6e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.329701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3150  cation diffusion facilitator family transporter  36.39 
 
 		 401 aa  229  6e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0264  cation diffusion facilitator family transporter  41.69 
 
 		 385 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.56079 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0191  cation diffusion facilitator family transporter  41.09 
 
 		 384 aa  228  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.114126  hitchhiker  0.0000000345826 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0282  cation diffusion facilitator family transporter  41.69 
 
 		 385 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.369403  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2824  cation diffusion facilitator family transporter  41.41 
 
 		 385 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.74147  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3154  cation efflux family protein  43.49 
 
 		 418 aa  219  5e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3825  cation efflux family protein  42.37 
 
 		 396 aa  219  5e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2966  cation efflux family protein  42.37 
 
 		 396 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3907  cation efflux family protein  42.37 
 
 		 396 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2906  cation efflux family protein  42.37 
 
 		 396 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.313592  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3403  cation efflux family protein  42.37 
 
 		 396 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.843377  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0047  cation efflux family protein  42.37 
 
 		 396 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1635  cation efflux family protein  42.37 
 
 		 396 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.504056  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4320  cation (Co++/Zn++/Cd++) efflux protein  41.06 
 
 		 414 aa  216  7e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0496  cation diffusion facilitator family transporter  44.56 
 
 		 318 aa  213  7.999999999999999e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.920568  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1531  cation diffusion facilitator family transporter  43.77 
 
 		 317 aa  211  2e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3356  cation diffusion facilitator family transporter  40.11 
 
 		 382 aa  207  3e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3009  cation diffusion facilitator family transporter  39.09 
 
 		 382 aa  206  6e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3245  cation efflux protein  41.31 
 
 		 309 aa  203  5e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3406  cation diffusion facilitator family transporter  39.74 
 
 		 337 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1774  cation diffusion facilitator family transporter  35.19 
 
 		 293 aa  195  1e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000103729  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3548  cation diffusion facilitator family transporter  44.06 
 
 		 320 aa  192  7e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.058207 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3077  hypothetical protein  40.69 
 
 		 392 aa  192  1e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.197933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1144  cation efflux family protein  35.56 
 
 		 289 aa  191  2e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0182712  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6231  cation diffusion facilitator family transporter  42.32 
 
 		 299 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0069  cation efflux family protein  41.67 
 
 		 318 aa  189  5e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04060  cation diffusion facilitator family transporter  36.49 
 
 		 292 aa  189  1e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3126  cation diffusion facilitator family transporter  34.58 
 
 		 297 aa  188  2e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0983  cation efflux family protein  34.86 
 
 		 289 aa  188  2e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0179207  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4529  cation efflux family protein  35.47 
 
 		 297 aa  186  5e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0706  cation efflux family protein  35.47 
 
 		 297 aa  186  7e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0491  cation diffusion facilitator family transporter  34.71 
 
 		 354 aa  185  2.0000000000000003e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0566502 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0936  cation diffusion facilitator family transporter  37.21 
 
 		 300 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4257  cation diffusion facilitator family transporter  35.14 
 
 		 297 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4490  cation efflux family protein  34.8 
 
 		 297 aa  182  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000013867 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4143  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  34.8 
 
 		 297 aa  182  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4305  cation efflux family protein  34.8 
 
 		 298 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.901101  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4154  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  34.8 
 
 		 298 aa  181  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4640  cation efflux family protein  34.8 
 
 		 298 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2526  cation diffusion facilitator family transporter  39.66 
 
 		 307 aa  181  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0324472 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4494  cation efflux family protein  34.46 
 
 		 298 aa  180  4e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4544  cation efflux family protein  34.12 
 
 		 297 aa  180  4e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0858  cation efflux system protein  34.92 
 
 		 331 aa  179  5.999999999999999e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0974  cation diffusion facilitator family transporter  38.59 
 
 		 320 aa  179  8e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1675  cation diffusion facilitator family transporter  40 
 
 		 307 aa  178  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.282896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0570  cation diffusion facilitator family transporter  39.45 
 
 		 298 aa  177  2e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.712384  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2941  cation diffusion facilitator family transporter  40 
 
 		 307 aa  178  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1511  cation diffusion facilitator family transporter  42.71 
 
 		 314 aa  177  4e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00242761  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4982  cation diffusion facilitator family transporter  39.32 
 
 		 307 aa  176  5e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0279964 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1549  cation diffusion facilitator family transporter  31.72 
 
 		 290 aa  176  6e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0245  cation diffusion facilitator family transporter  33.68 
 
 		 291 aa  176  7e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1587  cation diffusion facilitator family transporter  38.31 
 
 		 307 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.697729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0577  cation diffusion facilitator family transporter  39.73 
 
 		 308 aa  172  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.215169 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1668  cation diffusion facilitator family transporter  32.99 
 
 		 291 aa  168  2e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0340924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5170  cation efflux protein  39.15 
 
 		 303 aa  166  6.9999999999999995e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1752  cation diffusion facilitator family transporter  34.77 
 
 		 301 aa  162  1e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00011926  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1051  putative cation efflux system protein  34.64 
 
 		 319 aa  162  1e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3537  cation diffusion facilitator family transporter  35.02 
 
 		 294 aa  161  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0960  cation diffusion facilitator family transporter  32.99 
 
 		 291 aa  161  3e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2100  cation diffusion facilitator family transporter  35.54 
 
 		 310 aa  160  5e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.70845  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19310  cation diffusion facilitator family transporter  33.9 
 
 		 298 aa  159  6e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000504538 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1188  cation diffusion facilitator family transporter  34.14 
 
 		 322 aa  155  1e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0609928  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0167  cation diffusion facilitator family transporter  33.92 
 
 		 305 aa  147  3e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0858  cation efflux protein  31.62 
 
 		 299 aa  145  9e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2090  cation efflux family protein  33.67 
 
 		 302 aa  145  1e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45119  predicted protein  32.76 
 
 		 591 aa  145  1e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.170034  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1788  cation diffusion facilitator family transporter  32.77 
 
 		 299 aa  145  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0431575 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2428  cation diffusion facilitator family transporter  33.22 
 
 		 299 aa  145  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000439977  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2005  cation diffusion facilitator family transporter  30.14 
 
 		 299 aa  145  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1722  cation diffusion facilitator family transporter  30.58 
 
 		 299 aa  143  5e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1741  cation diffusion facilitator family transporter  36.21 
 
 		 307 aa  142  9e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00244826  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0130  cation diffusion facilitator family transporter  30.53 
 
 		 292 aa  140  4.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.120546  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0737  cation efflux system protein  33.1 
 
 		 317 aa  139  7.999999999999999e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.338743  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2613  cation efflux family protein  31.38 
 
 		 296 aa  138  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1026  cation diffusion facilitator family transporter  26.67 
 
 		 323 aa  138  2e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09106  cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcD  32.52 
 
 		 313 aa  138  2e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.341807  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0074  cation diffusion facilitator family transporter  26.55 
 
 		 313 aa  138  2e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11850  cation diffusion facilitator family transporter  30.07 
 
 		 312 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1794  cation diffusion facilitator family transporter  28.91 
 
 		 299 aa  133  5e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0900  cation diffusion facilitator family transporter  27.46 
 
 		 285 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000200254  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>