More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0858 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0858  cation efflux system protein  100 
 
 
331 aa  677    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1741  cation diffusion facilitator family transporter  44.95 
 
 
307 aa  257  2e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00244826  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2090  cation efflux family protein  43.43 
 
 
302 aa  240  2.9999999999999997e-62  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0245  cation diffusion facilitator family transporter  41.55 
 
 
291 aa  229  5e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1549  cation diffusion facilitator family transporter  42.11 
 
 
290 aa  227  2e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3150  cation diffusion facilitator family transporter  41.33 
 
 
401 aa  227  2e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1774  cation diffusion facilitator family transporter  42.96 
 
 
293 aa  223  3e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000103729  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1668  cation diffusion facilitator family transporter  39.04 
 
 
291 aa  221  9e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0340924  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0960  cation diffusion facilitator family transporter  40.54 
 
 
291 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0983  cation efflux family protein  39.53 
 
 
289 aa  210  2e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0179207  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1144  cation efflux family protein  38.85 
 
 
289 aa  210  3e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0182712  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0974  cation diffusion facilitator family transporter  37.87 
 
 
320 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0210  cation diffusion facilitator family transporter  37.05 
 
 
404 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.904407 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0196  cation diffusion facilitator family transporter  37.05 
 
 
404 aa  189  8e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.831911  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0282  cation diffusion facilitator family transporter  36.18 
 
 
385 aa  189  8e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.369403  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3385  cation efflux protein  35.83 
 
 
385 aa  188  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0491  cation diffusion facilitator family transporter  35.23 
 
 
354 aa  188  1e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0566502 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0264  cation diffusion facilitator family transporter  36.18 
 
 
385 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.56079 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2824  cation diffusion facilitator family transporter  35.86 
 
 
385 aa  186  6e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.74147  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2005  cation diffusion facilitator family transporter  31.29 
 
 
299 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3245  cation efflux protein  36.98 
 
 
309 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0191  cation diffusion facilitator family transporter  34.85 
 
 
384 aa  182  6e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.114126  hitchhiker  0.0000000345826 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2576  cation diffusion facilitator family transporter  35.35 
 
 
423 aa  182  6e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00102277 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3406  cation diffusion facilitator family transporter  33.91 
 
 
337 aa  182  6e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0938  cation diffusion facilitator family transporter  38.54 
 
 
387 aa  182  6e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2017  hypothetical protein  37.71 
 
 
380 aa  181  1e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2012  hypothetical protein  37.37 
 
 
380 aa  182  1e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0553  cation diffusion facilitator family transporter  35.76 
 
 
388 aa  181  2e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0496  cation diffusion facilitator family transporter  34.15 
 
 
318 aa  179  7e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.920568  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1511  cation diffusion facilitator family transporter  38.16 
 
 
314 aa  178  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00242761  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3647  cation diffusion facilitator family transporter  33.8 
 
 
395 aa  177  2e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3764  cation efflux protein  33.22 
 
 
389 aa  176  5e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0837533 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0399  cation diffusion facilitator family transporter  36.25 
 
 
418 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.329701  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1722  cation diffusion facilitator family transporter  33.33 
 
 
299 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1531  cation diffusion facilitator family transporter  34.96 
 
 
317 aa  174  9.999999999999999e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0858  cation efflux protein  31.4 
 
 
299 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4257  cation diffusion facilitator family transporter  34.33 
 
 
297 aa  171  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0625  cation diffusion facilitator family transporter  36.24 
 
 
391 aa  170  3e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4529  cation efflux family protein  34.33 
 
 
297 aa  170  3e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0465  cation efflux family protein  36.24 
 
 
391 aa  170  3e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.326406  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3126  cation diffusion facilitator family transporter  34.67 
 
 
297 aa  169  4e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0570  cation diffusion facilitator family transporter  35.42 
 
 
298 aa  169  5e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.712384  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2428  cation diffusion facilitator family transporter  33.89 
 
 
299 aa  169  6e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000439977  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0577  cation diffusion facilitator family transporter  34.28 
 
 
308 aa  168  9e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.215169 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04060  cation diffusion facilitator family transporter  32.43 
 
 
292 aa  168  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4305  cation efflux family protein  34.55 
 
 
298 aa  168  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.901101  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4143  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  34.55 
 
 
297 aa  168  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4154  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  34.55 
 
 
298 aa  168  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0706  cation efflux family protein  34 
 
 
297 aa  168  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4640  cation efflux family protein  34.55 
 
 
298 aa  168  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0069  cation efflux family protein  34.69 
 
 
318 aa  168  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4544  cation efflux family protein  34.55 
 
 
297 aa  168  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1788  cation diffusion facilitator family transporter  33.89 
 
 
299 aa  168  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0431575 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4490  cation efflux family protein  34.55 
 
 
297 aa  168  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000013867 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1794  cation diffusion facilitator family transporter  30.95 
 
 
299 aa  168  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1450  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  33.89 
 
 
378 aa  167  2e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.59644  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1517  cation diffusion facilitator family transporter  33.89 
 
 
378 aa  167  2e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1587  cation diffusion facilitator family transporter  33.79 
 
 
307 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.697729  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2613  cation efflux family protein  32.76 
 
 
296 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4320  cation (Co++/Zn++/Cd++) efflux protein  38.59 
 
 
414 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4494  cation efflux family protein  34.22 
 
 
298 aa  166  4e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2906  cation efflux family protein  34.53 
 
 
396 aa  166  4e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.313592  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19310  cation diffusion facilitator family transporter  34.3 
 
 
298 aa  166  4e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000504538 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0047  cation efflux family protein  34.53 
 
 
396 aa  166  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3403  cation efflux family protein  34.53 
 
 
396 aa  166  4e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.843377  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3907  cation efflux family protein  34.53 
 
 
396 aa  166  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2966  cation efflux family protein  34.53 
 
 
396 aa  166  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1635  cation efflux family protein  34.53 
 
 
396 aa  166  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.504056  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6231  cation diffusion facilitator family transporter  36.09 
 
 
299 aa  166  5e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554838  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2941  cation diffusion facilitator family transporter  35.09 
 
 
307 aa  166  5e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1675  cation diffusion facilitator family transporter  35.09 
 
 
307 aa  166  5e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.282896  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3825  cation efflux family protein  34.53 
 
 
396 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0117  cation diffusion facilitator family transporter  34.22 
 
 
400 aa  165  9e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3548  cation diffusion facilitator family transporter  35.45 
 
 
320 aa  165  9e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.058207 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2526  cation diffusion facilitator family transporter  33.45 
 
 
307 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0324472 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1992  cation diffusion facilitator family transporter  36.88 
 
 
389 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3154  cation efflux family protein  35.86 
 
 
418 aa  164  3e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4982  cation diffusion facilitator family transporter  33.45 
 
 
307 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0279964 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1066  hypothetical protein  33.12 
 
 
339 aa  162  7e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0936  cation diffusion facilitator family transporter  33.81 
 
 
300 aa  162  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3258  cation diffusion facilitator family transporter  34.92 
 
 
390 aa  159  7e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1036  cation diffusion facilitator family transporter  30.13 
 
 
387 aa  159  7e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.246594  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2100  cation diffusion facilitator family transporter  31.02 
 
 
310 aa  156  5.0000000000000005e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.70845  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2889  cation diffusion facilitator family transporter  32.99 
 
 
388 aa  155  6e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000320508  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3009  cation diffusion facilitator family transporter  33.95 
 
 
382 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2250  cation diffusion facilitator family transporter  29.77 
 
 
294 aa  155  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000133165  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3356  cation diffusion facilitator family transporter  34.07 
 
 
382 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1026  cation diffusion facilitator family transporter  30.87 
 
 
323 aa  152  8e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1712  cation diffusion facilitator family transporter  32.14 
 
 
306 aa  152  1e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00125134  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5170  cation efflux protein  34.92 
 
 
303 aa  150  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1188  cation diffusion facilitator family transporter  31.31 
 
 
322 aa  146  6e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0609928  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1700  cation diffusion facilitator family transporter  33.93 
 
 
293 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3537  cation diffusion facilitator family transporter  29.97 
 
 
294 aa  145  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1521  cation diffusion facilitator family transporter  29.21 
 
 
309 aa  145  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2127  cation diffusion facilitator family transporter  33.57 
 
 
293 aa  145  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.139968  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0130  cation diffusion facilitator family transporter  29.35 
 
 
292 aa  144  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.120546  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0737  cation efflux system protein  29.62 
 
 
317 aa  144  2e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.338743  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0167  cation diffusion facilitator family transporter  33.45 
 
 
305 aa  143  3e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2334  cation efflux family protein  33.93 
 
 
293 aa  143  4e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3033  cation efflux family protein  33.57 
 
 
293 aa  143  5e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>