More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0399 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A4320  cation (Co++/Zn++/Cd++) efflux protein  86.84 
 
 		 414 aa  687    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0399  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 418 aa  828    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.329701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0117  cation diffusion facilitator family transporter  77.95 
 
 		 400 aa  617  1e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3385  cation efflux protein  73.56 
 
 		 385 aa  553  1e-156  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0196  cation diffusion facilitator family transporter  72.89 
 
 		 404 aa  550  1e-155  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.831911  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0210  cation diffusion facilitator family transporter  72.89 
 
 		 404 aa  550  1e-155  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.904407 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0282  cation diffusion facilitator family transporter  73.56 
 
 		 385 aa  541  1e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.369403  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0264  cation diffusion facilitator family transporter  73.3 
 
 		 385 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.56079 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0191  cation diffusion facilitator family transporter  72.37 
 
 		 384 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.114126  hitchhiker  0.0000000345826 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2824  cation diffusion facilitator family transporter  73.3 
 
 		 385 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.74147  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3825  cation efflux family protein  71.73 
 
 		 396 aa  531  1e-150  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2906  cation efflux family protein  71.2 
 
 		 396 aa  528  1e-149  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.313592  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0047  cation efflux family protein  71.47 
 
 		 396 aa  530  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3154  cation efflux family protein  71.73 
 
 		 418 aa  530  1e-149  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3403  cation efflux family protein  71.2 
 
 		 396 aa  528  1e-149  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.843377  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3907  cation efflux family protein  71.47 
 
 		 396 aa  530  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1635  cation efflux family protein  71.2 
 
 		 396 aa  528  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.504056  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2966  cation efflux family protein  71.2 
 
 		 396 aa  528  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0496  cation diffusion facilitator family transporter  58.63 
 
 		 318 aa  338  9e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.920568  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1531  cation diffusion facilitator family transporter  61.09 
 
 		 317 aa  333  3e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3764  cation efflux protein  50.3 
 
 		 389 aa  314  1.9999999999999998e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0837533 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3548  cation diffusion facilitator family transporter  62.55 
 
 		 320 aa  313  2.9999999999999996e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.058207 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3647  cation diffusion facilitator family transporter  47.41 
 
 		 395 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3406  cation diffusion facilitator family transporter  54.77 
 
 		 337 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1587  cation diffusion facilitator family transporter  58.72 
 
 		 307 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.697729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3356  cation diffusion facilitator family transporter  52.12 
 
 		 382 aa  302  6.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2526  cation diffusion facilitator family transporter  59.07 
 
 		 307 aa  302  7.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0324472 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1675  cation diffusion facilitator family transporter  58.72 
 
 		 307 aa  302  9e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.282896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2941  cation diffusion facilitator family transporter  58.72 
 
 		 307 aa  302  9e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3245  cation efflux protein  55.78 
 
 		 309 aa  301  1e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0069  cation efflux family protein  57.71 
 
 		 318 aa  300  3e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3009  cation diffusion facilitator family transporter  51.14 
 
 		 382 aa  297  2e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4982  cation diffusion facilitator family transporter  57.65 
 
 		 307 aa  296  4e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0279964 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0577  cation diffusion facilitator family transporter  56.85 
 
 		 308 aa  294  2e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.215169 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6231  cation diffusion facilitator family transporter  57.3 
 
 		 299 aa  294  2e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0570  cation diffusion facilitator family transporter  53.36 
 
 		 298 aa  293  4e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.712384  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3077  hypothetical protein  50.52 
 
 		 392 aa  292  7e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.197933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5170  cation efflux protein  54.08 
 
 		 303 aa  268  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2017  hypothetical protein  36.29 
 
 		 380 aa  246  4e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2012  hypothetical protein  36.02 
 
 		 380 aa  246  4e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1517  cation diffusion facilitator family transporter  38.73 
 
 		 378 aa  234  2.0000000000000002e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1450  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  38.73 
 
 		 378 aa  234  2.0000000000000002e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.59644  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3258  cation diffusion facilitator family transporter  41.69 
 
 		 390 aa  231  2e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2576  cation diffusion facilitator family transporter  38.9 
 
 		 423 aa  226  6e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00102277 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1036  cation diffusion facilitator family transporter  37.09 
 
 		 387 aa  223  4.9999999999999996e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.246594  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0465  cation efflux family protein  40.97 
 
 		 391 aa  220  3.9999999999999997e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.326406  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0625  cation diffusion facilitator family transporter  40.97 
 
 		 391 aa  220  3.9999999999999997e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0938  cation diffusion facilitator family transporter  38.16 
 
 		 387 aa  206  4e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3150  cation diffusion facilitator family transporter  34.69 
 
 		 401 aa  201  1.9999999999999998e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1992  cation diffusion facilitator family transporter  40.11 
 
 		 389 aa  195  1e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0553  cation diffusion facilitator family transporter  38.44 
 
 		 388 aa  195  2e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2889  cation diffusion facilitator family transporter  32.28 
 
 		 388 aa  193  6e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000320508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0974  cation diffusion facilitator family transporter  36.84 
 
 		 320 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1144  cation efflux family protein  35 
 
 		 289 aa  171  2e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0182712  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0983  cation efflux family protein  35.36 
 
 		 289 aa  170  4e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0179207  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0936  cation diffusion facilitator family transporter  32.42 
 
 		 300 aa  169  9e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1774  cation diffusion facilitator family transporter  31.71 
 
 		 293 aa  168  1e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000103729  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04060  cation diffusion facilitator family transporter  34.27 
 
 		 292 aa  166  5.9999999999999996e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4257  cation diffusion facilitator family transporter  31.85 
 
 		 297 aa  164  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4494  cation efflux family protein  32.53 
 
 		 298 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4490  cation efflux family protein  32.19 
 
 		 297 aa  163  6e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000013867 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4143  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  32.19 
 
 		 297 aa  163  6e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4529  cation efflux family protein  32.19 
 
 		 297 aa  162  7e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4305  cation efflux family protein  32.19 
 
 		 298 aa  163  7e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.901101  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4154  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  32.19 
 
 		 298 aa  163  7e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4640  cation efflux family protein  32.19 
 
 		 298 aa  163  7e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0858  cation efflux system protein  35.6 
 
 		 331 aa  162  8.000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4544  cation efflux family protein  32.19 
 
 		 297 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1668  cation diffusion facilitator family transporter  32.88 
 
 		 291 aa  162  2e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0340924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0706  cation efflux family protein  32.53 
 
 		 297 aa  161  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0245  cation diffusion facilitator family transporter  32.87 
 
 		 291 aa  160  5e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3126  cation diffusion facilitator family transporter  31.29 
 
 		 297 aa  159  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0960  cation diffusion facilitator family transporter  32.99 
 
 		 291 aa  157  3e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1511  cation diffusion facilitator family transporter  37.01 
 
 		 314 aa  156  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00242761  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2100  cation diffusion facilitator family transporter  35.4 
 
 		 310 aa  155  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.70845  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5408  cation efflux protein  45.77 
 
 		 222 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0362512  normal  0.663662 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0491  cation diffusion facilitator family transporter  30.85 
 
 		 354 aa  154  2.9999999999999998e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0566502 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1200  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  45.5 
 
 		 262 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.010126  normal  0.466724 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1549  cation diffusion facilitator family transporter  29.01 
 
 		 290 aa  146  6e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2090  cation efflux family protein  33 
 
 		 302 aa  146  8.000000000000001e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0167  cation diffusion facilitator family transporter  32.29 
 
 		 305 aa  144  4e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2005  cation diffusion facilitator family transporter  28.28 
 
 		 299 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1788  cation diffusion facilitator family transporter  30 
 
 		 299 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0431575 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2613  cation efflux family protein  32.3 
 
 		 296 aa  133  6.999999999999999e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2428  cation diffusion facilitator family transporter  30 
 
 		 299 aa  132  9e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000439977  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1722  cation diffusion facilitator family transporter  29.66 
 
 		 299 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0051  cation diffusion facilitator family transporter  30.56 
 
 		 306 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1051  putative cation efflux system protein  31.4 
 
 		 319 aa  130  4.0000000000000003e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19310  cation diffusion facilitator family transporter  37.45 
 
 		 298 aa  130  5.0000000000000004e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000504538 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09106  cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcD  30.45 
 
 		 313 aa  130  5.0000000000000004e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.341807  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45119  predicted protein  30.21 
 
 		 591 aa  130  6e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.170034  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1437  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  30.88 
 
 		 303 aa  129  7.000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.929913 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0051  cation diffusion facilitator family transporter  30.21 
 
 		 306 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0858  cation efflux protein  27.68 
 
 		 299 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0130  cation diffusion facilitator family transporter  29.97 
 
 		 292 aa  125  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.120546  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1794  cation diffusion facilitator family transporter  27.7 
 
 		 299 aa  124  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3537  cation diffusion facilitator family transporter  32.18 
 
 		 294 aa  124  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0074  cation diffusion facilitator family transporter  24.91 
 
 		 313 aa  123  7e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1741  cation diffusion facilitator family transporter  33.56 
 
 		 307 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00244826  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1366  cation diffusion facilitator family transporter  26.42 
 
 		 422 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>