More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0553 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_0553  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 388 aa  766    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1992  cation diffusion facilitator family transporter  62.9 
 
 		 389 aa  415  9.999999999999999e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0938  cation diffusion facilitator family transporter  54.45 
 
 		 387 aa  337  1.9999999999999998e-91  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3258  cation diffusion facilitator family transporter  44.21 
 
 		 390 aa  278  1e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2012  hypothetical protein  44.61 
 
 		 380 aa  275  9e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2017  hypothetical protein  44.31 
 
 		 380 aa  275  1.0000000000000001e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2576  cation diffusion facilitator family transporter  40.78 
 
 		 423 aa  256  4e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00102277 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1450  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  38.35 
 
 		 378 aa  246  6.999999999999999e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.59644  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1517  cation diffusion facilitator family transporter  38.35 
 
 		 378 aa  246  6.999999999999999e-64  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1036  cation diffusion facilitator family transporter  41.84 
 
 		 387 aa  245  8e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.246594  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3647  cation diffusion facilitator family transporter  40.53 
 
 		 395 aa  244  9.999999999999999e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3764  cation efflux protein  42.56 
 
 		 389 aa  238  9e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0837533 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3385  cation efflux protein  41.76 
 
 		 385 aa  238  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0264  cation diffusion facilitator family transporter  41.55 
 
 		 385 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.56079 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0191  cation diffusion facilitator family transporter  40.64 
 
 		 384 aa  237  3e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.114126  hitchhiker  0.0000000345826 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0282  cation diffusion facilitator family transporter  41.94 
 
 		 385 aa  236  6e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.369403  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2889  cation diffusion facilitator family transporter  36.62 
 
 		 388 aa  233  4.0000000000000004e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000320508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0196  cation diffusion facilitator family transporter  42.26 
 
 		 404 aa  233  5e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.831911  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2824  cation diffusion facilitator family transporter  41.64 
 
 		 385 aa  233  6e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.74147  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0210  cation diffusion facilitator family transporter  42.26 
 
 		 404 aa  233  6e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.904407 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3825  cation efflux family protein  40.44 
 
 		 396 aa  223  4e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3403  cation efflux family protein  40.71 
 
 		 396 aa  222  7e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.843377  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2906  cation efflux family protein  40.71 
 
 		 396 aa  222  7e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.313592  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0047  cation efflux family protein  40.71 
 
 		 396 aa  222  7e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3154  cation efflux family protein  41.47 
 
 		 418 aa  222  7e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3907  cation efflux family protein  40.71 
 
 		 396 aa  222  7e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2966  cation efflux family protein  40.71 
 
 		 396 aa  222  7e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1635  cation efflux family protein  40.71 
 
 		 396 aa  222  7e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.504056  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3150  cation diffusion facilitator family transporter  42.35 
 
 		 401 aa  218  1e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3356  cation diffusion facilitator family transporter  40 
 
 		 382 aa  218  2e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0117  cation diffusion facilitator family transporter  39.71 
 
 		 400 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0399  cation diffusion facilitator family transporter  38.44 
 
 		 418 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.329701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0496  cation diffusion facilitator family transporter  41.38 
 
 		 318 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.920568  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3009  cation diffusion facilitator family transporter  39.06 
 
 		 382 aa  213  5.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3077  hypothetical protein  41.23 
 
 		 392 aa  209  5e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.197933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0465  cation efflux family protein  39.51 
 
 		 391 aa  209  1e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.326406  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0625  cation diffusion facilitator family transporter  39.51 
 
 		 391 aa  209  1e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0570  cation diffusion facilitator family transporter  43.01 
 
 		 298 aa  207  2e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.712384  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1531  cation diffusion facilitator family transporter  41.48 
 
 		 317 aa  206  5e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4320  cation (Co++/Zn++/Cd++) efflux protein  38.73 
 
 		 414 aa  206  6e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3548  cation diffusion facilitator family transporter  42.05 
 
 		 320 aa  202  9.999999999999999e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.058207 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6231  cation diffusion facilitator family transporter  41.47 
 
 		 299 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0069  cation efflux family protein  40.71 
 
 		 318 aa  195  9e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0491  cation diffusion facilitator family transporter  35.23 
 
 		 354 aa  195  1e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0566502 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3406  cation diffusion facilitator family transporter  42.16 
 
 		 337 aa  193  5e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1774  cation diffusion facilitator family transporter  34.17 
 
 		 293 aa  189  5e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000103729  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0577  cation diffusion facilitator family transporter  42.81 
 
 		 308 aa  189  5.999999999999999e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.215169 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0858  cation efflux system protein  35.76 
 
 		 331 aa  188  1e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1511  cation diffusion facilitator family transporter  41.48 
 
 		 314 aa  186  8e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00242761  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3245  cation efflux protein  38.82 
 
 		 309 aa  182  8.000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1549  cation diffusion facilitator family transporter  32.97 
 
 		 290 aa  181  2e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2526  cation diffusion facilitator family transporter  40.07 
 
 		 307 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0324472 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0974  cation diffusion facilitator family transporter  39.45 
 
 		 320 aa  178  1e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5170  cation efflux protein  38.54 
 
 		 303 aa  178  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1144  cation efflux family protein  35.84 
 
 		 289 aa  177  2e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0182712  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04060  cation diffusion facilitator family transporter  35.54 
 
 		 292 aa  175  9.999999999999999e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0983  cation efflux family protein  35.13 
 
 		 289 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0179207  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1675  cation diffusion facilitator family transporter  38.98 
 
 		 307 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.282896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1587  cation diffusion facilitator family transporter  37.97 
 
 		 307 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.697729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2941  cation diffusion facilitator family transporter  38.98 
 
 		 307 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4982  cation diffusion facilitator family transporter  39.04 
 
 		 307 aa  171  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0279964 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1668  cation diffusion facilitator family transporter  31.76 
 
 		 291 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0340924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0245  cation diffusion facilitator family transporter  32.09 
 
 		 291 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2090  cation efflux family protein  35.44 
 
 		 302 aa  161  2e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1188  cation diffusion facilitator family transporter  33.45 
 
 		 322 aa  157  3e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0609928  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0960  cation diffusion facilitator family transporter  32.09 
 
 		 291 aa  156  7e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0167  cation diffusion facilitator family transporter  33.33 
 
 		 305 aa  155  2e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45119  predicted protein  32.55 
 
 		 591 aa  152  1e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.170034  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2100  cation diffusion facilitator family transporter  31.56 
 
 		 310 aa  147  3e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.70845  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4257  cation diffusion facilitator family transporter  32.87 
 
 		 297 aa  147  5e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1794  cation diffusion facilitator family transporter  29.35 
 
 		 299 aa  146  6e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4494  cation efflux family protein  32.87 
 
 		 298 aa  145  9e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4529  cation efflux family protein  33.22 
 
 		 297 aa  145  9e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4305  cation efflux family protein  32.87 
 
 		 298 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.901101  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4143  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  32.87 
 
 		 297 aa  145  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4154  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  32.87 
 
 		 298 aa  145  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4490  cation efflux family protein  32.87 
 
 		 297 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000013867 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4640  cation efflux family protein  32.87 
 
 		 298 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2005  cation diffusion facilitator family transporter  29.63 
 
 		 299 aa  145  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4544  cation efflux family protein  32.52 
 
 		 297 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0936  cation diffusion facilitator family transporter  32.41 
 
 		 300 aa  145  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3126  cation diffusion facilitator family transporter  32.52 
 
 		 297 aa  143  6e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1741  cation diffusion facilitator family transporter  35.66 
 
 		 307 aa  143  6e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00244826  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0706  cation efflux family protein  33.22 
 
 		 297 aa  143  7e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0858  cation efflux protein  29.69 
 
 		 299 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09106  cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcD  31.01 
 
 		 313 aa  135  8e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.341807  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2613  cation efflux family protein  31.74 
 
 		 296 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2256  cation diffusion facilitator family transporter  31 
 
 		 332 aa  135  9.999999999999999e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00134926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1722  cation diffusion facilitator family transporter  28.33 
 
 		 299 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3537  cation diffusion facilitator family transporter  30.66 
 
 		 294 aa  131  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2098  cation diffusion facilitator family transporter  30.11 
 
 		 285 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1788  cation diffusion facilitator family transporter  29.19 
 
 		 299 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0431575 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0663  cation diffusion facilitator family transporter  26.15 
 
 		 312 aa  129  1.0000000000000001e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0132428  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2428  cation diffusion facilitator family transporter  28.52 
 
 		 299 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000439977  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0130  cation diffusion facilitator family transporter  31.01 
 
 		 292 aa  128  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.120546  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1026  cation diffusion facilitator family transporter  28.87 
 
 		 323 aa  127  3e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0074  cation diffusion facilitator family transporter  27.37 
 
 		 313 aa  127  3e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1051  putative cation efflux system protein  31.66 
 
 		 319 aa  127  4.0000000000000003e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0339  cation diffusion facilitator family transporter  28.52 
 
 		 293 aa  125  1e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000143188  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19310  cation diffusion facilitator family transporter  31.07 
 
 		 298 aa  125  2e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000504538 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>