More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2256 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2256  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 
332 aa  667    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00134926  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2250  cation diffusion facilitator family transporter  30.8 
 
 
294 aa  174  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000133165  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1722  cation diffusion facilitator family transporter  29.55 
 
 
299 aa  155  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1794  cation diffusion facilitator family transporter  29.9 
 
 
299 aa  153  4e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2428  cation diffusion facilitator family transporter  33.7 
 
 
299 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000439977  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0245  cation diffusion facilitator family transporter  28.21 
 
 
291 aa  147  3e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0858  cation efflux protein  30.58 
 
 
299 aa  147  3e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2613  cation efflux family protein  29.9 
 
 
296 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1788  cation diffusion facilitator family transporter  32.34 
 
 
299 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0431575 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0491  cation diffusion facilitator family transporter  30.23 
 
 
354 aa  145  1e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0566502 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2005  cation diffusion facilitator family transporter  28.43 
 
 
299 aa  145  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1668  cation diffusion facilitator family transporter  28.57 
 
 
291 aa  143  3e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0340924  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0960  cation diffusion facilitator family transporter  29.64 
 
 
291 aa  143  5e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1549  cation diffusion facilitator family transporter  29.5 
 
 
290 aa  140  3e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2012  hypothetical protein  30.98 
 
 
380 aa  135  9e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2127  cation diffusion facilitator family transporter  29.8 
 
 
293 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.139968  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1741  cation diffusion facilitator family transporter  33.33 
 
 
307 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00244826  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0974  cation diffusion facilitator family transporter  28.87 
 
 
320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04060  cation diffusion facilitator family transporter  29.78 
 
 
292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2017  hypothetical protein  30.64 
 
 
380 aa  134  3e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2291  cation efflux family protein  30.31 
 
 
293 aa  133  5e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3033  cation efflux family protein  30.31 
 
 
293 aa  133  5e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2089  cation efflux protein  30.31 
 
 
296 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.328738  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0983  cation efflux family protein  29.74 
 
 
289 aa  132  6.999999999999999e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0179207  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2418  cation efflux family protein  30.31 
 
 
293 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1774  cation diffusion facilitator family transporter  28.41 
 
 
293 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000103729  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2343  cation efflux family protein  29.92 
 
 
293 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.412902  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2155  cation efflux family protein  29.92 
 
 
296 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.112799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2093  cation efflux protein  29.92 
 
 
296 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0345856  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2310  cation efflux family protein  29.92 
 
 
296 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2334  cation efflux family protein  29.92 
 
 
293 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1144  cation efflux family protein  29.74 
 
 
289 aa  130  3e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0182712  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1026  cation diffusion facilitator family transporter  29.14 
 
 
323 aa  127  3e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0051  cation diffusion facilitator family transporter  29.57 
 
 
306 aa  124  2e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2100  cation diffusion facilitator family transporter  29.54 
 
 
310 aa  124  3e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.70845  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0938  cation diffusion facilitator family transporter  31.34 
 
 
387 aa  124  3e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1450  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  28.46 
 
 
378 aa  123  4e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.59644  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0858  cation efflux system protein  31.43 
 
 
331 aa  123  4e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1517  cation diffusion facilitator family transporter  28.46 
 
 
378 aa  123  4e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1036  cation diffusion facilitator family transporter  30.51 
 
 
387 aa  121  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.246594  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2491  cation diffusion facilitator family transporter  32.7 
 
 
288 aa  121  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2443  cation diffusion facilitator family transporter  32.7 
 
 
288 aa  121  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1700  cation diffusion facilitator family transporter  27.84 
 
 
293 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0553  cation diffusion facilitator family transporter  30.86 
 
 
388 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3150  cation diffusion facilitator family transporter  25.95 
 
 
401 aa  119  7e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0051  cation diffusion facilitator family transporter  29.24 
 
 
306 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6231  cation diffusion facilitator family transporter  32.02 
 
 
299 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554838  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3647  cation diffusion facilitator family transporter  27.63 
 
 
395 aa  117  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3258  cation diffusion facilitator family transporter  30.6 
 
 
390 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0465  cation efflux family protein  29.89 
 
 
391 aa  112  7.000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.326406  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0625  cation diffusion facilitator family transporter  29.89 
 
 
391 aa  112  7.000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0496  cation diffusion facilitator family transporter  29.8 
 
 
318 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.920568  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3406  cation diffusion facilitator family transporter  30.24 
 
 
337 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0702  Co/Zn/Cd cation transporter  27.49 
 
 
291 aa  112  1.0000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2008  cation efflux family protein  29.12 
 
 
293 aa  111  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.536733  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3245  cation efflux protein  31.13 
 
 
309 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0069  cation efflux family protein  30.43 
 
 
318 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1992  cation diffusion facilitator family transporter  31.31 
 
 
389 aa  110  3e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3548  cation diffusion facilitator family transporter  32.08 
 
 
320 aa  110  3e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.058207 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3764  cation efflux protein  28.21 
 
 
389 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0837533 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1531  cation diffusion facilitator family transporter  28.35 
 
 
317 aa  110  4.0000000000000004e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0663  cation diffusion facilitator family transporter  29.21 
 
 
312 aa  110  5e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0132428  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0570  cation diffusion facilitator family transporter  28.24 
 
 
298 aa  109  6e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.712384  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1051  putative cation efflux system protein  29.23 
 
 
319 aa  109  8.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0167  cation diffusion facilitator family transporter  29.43 
 
 
305 aa  107  2e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3300  iron and zinc efflux system protein  27.24 
 
 
318 aa  108  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.831799  normal  0.0946092 
 
 
-
 
NC_002950  PG2090  cation efflux family protein  30.92 
 
 
302 aa  107  3e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4494  cation efflux family protein  27.86 
 
 
298 aa  106  6e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1410  cation diffusion facilitator family transporter  29.96 
 
 
333 aa  106  6e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2576  cation diffusion facilitator family transporter  28.81 
 
 
423 aa  106  6e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00102277 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4257  cation diffusion facilitator family transporter  27.97 
 
 
297 aa  105  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0577  cation diffusion facilitator family transporter  31.5 
 
 
308 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.215169 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1861  cation diffusion facilitator family transporter  27.68 
 
 
292 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.350904  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0618  cation diffusion facilitator family transporter  29.27 
 
 
411 aa  105  1e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000865863  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0737  cation efflux system protein  26.3 
 
 
317 aa  105  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.338743  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0745  cation diffusion facilitator family transporter  25.72 
 
 
460 aa  105  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4529  cation efflux family protein  27.86 
 
 
297 aa  104  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0706  cation efflux family protein  26.82 
 
 
297 aa  104  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1752  cation diffusion facilitator family transporter  27.78 
 
 
301 aa  104  3e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00011926  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4544  cation efflux family protein  27.48 
 
 
297 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0117  cation diffusion facilitator family transporter  27.65 
 
 
400 aa  103  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4305  cation efflux family protein  27.48 
 
 
298 aa  103  5e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.901101  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4143  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  27.48 
 
 
297 aa  103  5e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4154  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  27.48 
 
 
298 aa  103  5e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4490  cation efflux family protein  27.48 
 
 
297 aa  103  5e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000013867 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4640  cation efflux family protein  27.48 
 
 
298 aa  103  5e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0900  cation diffusion facilitator family transporter  25.87 
 
 
285 aa  103  5e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000200254  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0719  cation diffusion facilitator family transporter  28.1 
 
 
278 aa  102  8e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.775503 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  28.24 
 
 
311 aa  102  8e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0936  cation diffusion facilitator family transporter  29.86 
 
 
300 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09106  cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcD  25.91 
 
 
313 aa  102  1e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.341807  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0130  cation diffusion facilitator family transporter  27.68 
 
 
292 aa  102  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.120546  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3537  cation diffusion facilitator family transporter  29.15 
 
 
294 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1511  cation diffusion facilitator family transporter  25.5 
 
 
314 aa  101  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00242761  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0044  cation diffusion facilitator family transporter  28.68 
 
 
381 aa  100  3e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0344  cation transporter  27.27 
 
 
427 aa  100  3e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00235154  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1366  cation diffusion facilitator family transporter  29.77 
 
 
422 aa  100  4e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11850  cation diffusion facilitator family transporter  28.36 
 
 
312 aa  100  4e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0198  cation diffusion facilitator family transporter  27.9 
 
 
474 aa  100  5e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.859565 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0791  cation diffusion facilitator family transporter  26.94 
 
 
312 aa  99.8  5e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.536733 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>