More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3406 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_3406  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 337 aa  666    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3245  cation efflux protein  77.35 
 
 		 309 aa  429  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0496  cation diffusion facilitator family transporter  62.78 
 
 		 318 aa  392  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.920568  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0577  cation diffusion facilitator family transporter  69.7 
 
 		 308 aa  385  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.215169 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2941  cation diffusion facilitator family transporter  68.24 
 
 		 307 aa  382  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1675  cation diffusion facilitator family transporter  68.24 
 
 		 307 aa  382  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.282896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1587  cation diffusion facilitator family transporter  68.28 
 
 		 307 aa  379  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.697729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5170  cation efflux protein  71.02 
 
 		 303 aa  377  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4982  cation diffusion facilitator family transporter  68.62 
 
 		 307 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0279964 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1531  cation diffusion facilitator family transporter  61.49 
 
 		 317 aa  374  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2526  cation diffusion facilitator family transporter  68.28 
 
 		 307 aa  373  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0324472 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6231  cation diffusion facilitator family transporter  68.21 
 
 		 299 aa  360  2e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0069  cation efflux family protein  67.02 
 
 		 318 aa  354  1e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3548  cation diffusion facilitator family transporter  65.09 
 
 		 320 aa  347  2e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.058207 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0570  cation diffusion facilitator family transporter  58.98 
 
 		 298 aa  345  6e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.712384  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2906  cation efflux family protein  54.83 
 
 		 396 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.313592  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3403  cation efflux family protein  54.83 
 
 		 396 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.843377  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0047  cation efflux family protein  54.83 
 
 		 396 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3907  cation efflux family protein  54.83 
 
 		 396 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2966  cation efflux family protein  54.83 
 
 		 396 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3825  cation efflux family protein  54.83 
 
 		 396 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1635  cation efflux family protein  54.83 
 
 		 396 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.504056  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3154  cation efflux family protein  55.24 
 
 		 418 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0191  cation diffusion facilitator family transporter  54.42 
 
 		 384 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.114126  hitchhiker  0.0000000345826 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3385  cation efflux protein  55.12 
 
 		 385 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0399  cation diffusion facilitator family transporter  54.77 
 
 		 418 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.329701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0282  cation diffusion facilitator family transporter  54.42 
 
 		 385 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.369403  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0264  cation diffusion facilitator family transporter  54.42 
 
 		 385 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.56079 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0210  cation diffusion facilitator family transporter  53.71 
 
 		 404 aa  300  3e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.904407 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0196  cation diffusion facilitator family transporter  53.71 
 
 		 404 aa  300  3e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.831911  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2824  cation diffusion facilitator family transporter  54.06 
 
 		 385 aa  299  4e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.74147  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0117  cation diffusion facilitator family transporter  53.96 
 
 		 400 aa  295  8e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4320  cation (Co++/Zn++/Cd++) efflux protein  54.42 
 
 		 414 aa  291  1e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3356  cation diffusion facilitator family transporter  55.63 
 
 		 382 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3009  cation diffusion facilitator family transporter  55.29 
 
 		 382 aa  281  8.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3764  cation efflux protein  46.48 
 
 		 389 aa  268  8e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0837533 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3647  cation diffusion facilitator family transporter  45.57 
 
 		 395 aa  262  4.999999999999999e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3077  hypothetical protein  55.02 
 
 		 392 aa  262  6.999999999999999e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.197933  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2017  hypothetical protein  37.32 
 
 		 380 aa  201  9.999999999999999e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2012  hypothetical protein  36.97 
 
 		 380 aa  201  9.999999999999999e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2576  cation diffusion facilitator family transporter  39.74 
 
 		 423 aa  196  5.000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00102277 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0938  cation diffusion facilitator family transporter  42.18 
 
 		 387 aa  193  3e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1668  cation diffusion facilitator family transporter  36.52 
 
 		 291 aa  192  7e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0340924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1036  cation diffusion facilitator family transporter  35.22 
 
 		 387 aa  192  8e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.246594  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3258  cation diffusion facilitator family transporter  42.36 
 
 		 390 aa  189  5.999999999999999e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0625  cation diffusion facilitator family transporter  42.45 
 
 		 391 aa  186  4e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0465  cation efflux family protein  42.45 
 
 		 391 aa  186  4e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.326406  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0960  cation diffusion facilitator family transporter  36.65 
 
 		 291 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2889  cation diffusion facilitator family transporter  37.72 
 
 		 388 aa  182  7e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000320508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3150  cation diffusion facilitator family transporter  37.88 
 
 		 401 aa  182  8.000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0245  cation diffusion facilitator family transporter  34.64 
 
 		 291 aa  181  1e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1549  cation diffusion facilitator family transporter  33.45 
 
 		 290 aa  181  2e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1450  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  35.02 
 
 		 378 aa  179  4e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.59644  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1517  cation diffusion facilitator family transporter  35.02 
 
 		 378 aa  179  4e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0553  cation diffusion facilitator family transporter  42.16 
 
 		 388 aa  177  2e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1774  cation diffusion facilitator family transporter  31.25 
 
 		 293 aa  176  4e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000103729  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04060  cation diffusion facilitator family transporter  34.86 
 
 		 292 aa  175  8e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1144  cation efflux family protein  32.4 
 
 		 289 aa  173  3.9999999999999995e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0182712  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0491  cation diffusion facilitator family transporter  32.74 
 
 		 354 aa  170  3e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0566502 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4529  cation efflux family protein  32.07 
 
 		 297 aa  169  4e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4305  cation efflux family protein  31.72 
 
 		 298 aa  169  6e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.901101  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4143  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  31.72 
 
 		 297 aa  169  6e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4154  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  31.72 
 
 		 298 aa  169  6e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0858  cation efflux system protein  33.45 
 
 		 331 aa  169  6e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4640  cation efflux family protein  31.72 
 
 		 298 aa  169  6e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4490  cation efflux family protein  31.72 
 
 		 297 aa  169  6e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000013867 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4257  cation diffusion facilitator family transporter  31.38 
 
 		 297 aa  169  7e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1992  cation diffusion facilitator family transporter  40.89 
 
 		 389 aa  169  7e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0974  cation diffusion facilitator family transporter  34.21 
 
 		 320 aa  169  8e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0983  cation efflux family protein  31.71 
 
 		 289 aa  169  8e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0179207  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4494  cation efflux family protein  31.38 
 
 		 298 aa  168  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3126  cation diffusion facilitator family transporter  31.38 
 
 		 297 aa  167  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4544  cation efflux family protein  31.03 
 
 		 297 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0706  cation efflux family protein  31.38 
 
 		 297 aa  166  4e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2100  cation diffusion facilitator family transporter  35.79 
 
 		 310 aa  157  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.70845  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1511  cation diffusion facilitator family transporter  38.08 
 
 		 314 aa  157  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00242761  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0936  cation diffusion facilitator family transporter  31.72 
 
 		 300 aa  155  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0167  cation diffusion facilitator family transporter  34.63 
 
 		 305 aa  153  4e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1712  cation diffusion facilitator family transporter  31.25 
 
 		 306 aa  150  2e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00125134  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19310  cation diffusion facilitator family transporter  35.03 
 
 		 298 aa  149  6e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000504538 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1437  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  30.9 
 
 		 303 aa  146  5e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.929913 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1188  cation diffusion facilitator family transporter  32.69 
 
 		 322 aa  146  6e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0609928  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1741  cation diffusion facilitator family transporter  35.14 
 
 		 307 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00244826  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0737  cation efflux system protein  29.68 
 
 		 317 aa  145  1e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.338743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2250  cation diffusion facilitator family transporter  31.25 
 
 		 294 aa  145  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000133165  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2090  cation efflux family protein  30.56 
 
 		 302 aa  144  2e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0130  cation diffusion facilitator family transporter  30.5 
 
 		 292 aa  143  4e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.120546  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09106  cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcD  29.18 
 
 		 313 aa  142  9.999999999999999e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.341807  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1051  putative cation efflux system protein  31.95 
 
 		 319 aa  141  1.9999999999999998e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1366  cation diffusion facilitator family transporter  28.47 
 
 		 422 aa  140  3e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3537  cation diffusion facilitator family transporter  30.53 
 
 		 294 aa  139  7.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1722  cation diffusion facilitator family transporter  29.86 
 
 		 299 aa  139  8.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0858  cation efflux protein  30.58 
 
 		 299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1752  cation diffusion facilitator family transporter  32.38 
 
 		 301 aa  133  3.9999999999999996e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00011926  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45119  predicted protein  31.74 
 
 		 591 aa  132  6e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.170034  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2428  cation diffusion facilitator family transporter  28.78 
 
 		 299 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000439977  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2343  cation efflux family protein  29.93 
 
 		 293 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.412902  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2418  cation efflux family protein  29.93 
 
 		 293 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1788  cation diffusion facilitator family transporter  29.14 
 
 		 299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0431575 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2310  cation efflux family protein  30.11 
 
 		 296 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>