More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2613 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2613  cation efflux family protein  100 
 
 		 296 aa  601  1.0000000000000001e-171  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0858  cation efflux protein  72.24 
 
 		 299 aa  455  1e-127  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1722  cation diffusion facilitator family transporter  69.57 
 
 		 299 aa  432  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2005  cation diffusion facilitator family transporter  68.56 
 
 		 299 aa  427  1e-119  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1794  cation diffusion facilitator family transporter  66.89 
 
 		 299 aa  417  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2428  cation diffusion facilitator family transporter  65.22 
 
 		 299 aa  390  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000439977  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1788  cation diffusion facilitator family transporter  64.21 
 
 		 299 aa  386  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0431575 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1549  cation diffusion facilitator family transporter  34.15 
 
 		 290 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0245  cation diffusion facilitator family transporter  32.87 
 
 		 291 aa  189  5e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04060  cation diffusion facilitator family transporter  35.05 
 
 		 292 aa  186  3e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3126  cation diffusion facilitator family transporter  33.78 
 
 		 297 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1668  cation diffusion facilitator family transporter  32.98 
 
 		 291 aa  179  7e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0340924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4529  cation efflux family protein  32.66 
 
 		 297 aa  177  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4257  cation diffusion facilitator family transporter  33 
 
 		 297 aa  177  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4544  cation efflux family protein  32.66 
 
 		 297 aa  176  3e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4305  cation efflux family protein  32.66 
 
 		 298 aa  176  5e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.901101  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4143  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  32.66 
 
 		 297 aa  176  5e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4154  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  32.66 
 
 		 298 aa  176  5e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4640  cation efflux family protein  32.66 
 
 		 298 aa  176  5e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4490  cation efflux family protein  32.66 
 
 		 297 aa  176  5e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000013867 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0706  cation efflux family protein  31.99 
 
 		 297 aa  175  7e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4494  cation efflux family protein  32.32 
 
 		 298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0960  cation diffusion facilitator family transporter  32.98 
 
 		 291 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0491  cation diffusion facilitator family transporter  34.39 
 
 		 354 aa  172  3.9999999999999995e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0566502 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3537  cation diffusion facilitator family transporter  37.11 
 
 		 294 aa  172  6.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2100  cation diffusion facilitator family transporter  37.15 
 
 		 310 aa  170  2e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.70845  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0936  cation diffusion facilitator family transporter  32.89 
 
 		 300 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3150  cation diffusion facilitator family transporter  31 
 
 		 401 aa  166  5.9999999999999996e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1144  cation efflux family protein  31.82 
 
 		 289 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0182712  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1774  cation diffusion facilitator family transporter  32.04 
 
 		 293 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000103729  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0983  cation efflux family protein  32.17 
 
 		 289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0179207  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2127  cation diffusion facilitator family transporter  32.71 
 
 		 293 aa  163  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.139968  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0974  cation diffusion facilitator family transporter  31.63 
 
 		 320 aa  162  9e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0074  cation diffusion facilitator family transporter  32.16 
 
 		 313 aa  161  1e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0858  cation efflux system protein  32.42 
 
 		 331 aa  160  3e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2250  cation diffusion facilitator family transporter  30.22 
 
 		 294 aa  159  7e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000133165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1700  cation diffusion facilitator family transporter  31.23 
 
 		 293 aa  158  8e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1026  cation diffusion facilitator family transporter  31.27 
 
 		 323 aa  157  1e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1741  cation diffusion facilitator family transporter  35.17 
 
 		 307 aa  157  2e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00244826  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2017  hypothetical protein  29.79 
 
 		 380 aa  156  3e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2012  hypothetical protein  29.79 
 
 		 380 aa  156  3e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1861  cation diffusion facilitator family transporter  31.77 
 
 		 292 aa  157  3e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.350904  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2089  cation efflux protein  31.97 
 
 		 296 aa  156  4e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.328738  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2343  cation efflux family protein  31.97 
 
 		 293 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.412902  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2418  cation efflux family protein  31.97 
 
 		 293 aa  155  6e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0702  Co/Zn/Cd cation transporter  29.86 
 
 		 291 aa  155  6e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2334  cation efflux family protein  31.6 
 
 		 293 aa  155  8e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2155  cation efflux family protein  31.6 
 
 		 296 aa  155  9e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.112799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2093  cation efflux protein  31.6 
 
 		 296 aa  155  9e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0345856  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2310  cation efflux family protein  31.6 
 
 		 296 aa  155  9e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0051  cation diffusion facilitator family transporter  31.25 
 
 		 306 aa  154  1e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2291  cation efflux family protein  31.6 
 
 		 293 aa  154  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3033  cation efflux family protein  31.6 
 
 		 293 aa  154  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0663  cation diffusion facilitator family transporter  29.89 
 
 		 312 aa  153  4e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0132428  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3647  cation diffusion facilitator family transporter  32.6 
 
 		 395 aa  153  4e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1511  cation diffusion facilitator family transporter  33.45 
 
 		 314 aa  151  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00242761  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0900  cation diffusion facilitator family transporter  33.45 
 
 		 285 aa  151  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000200254  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0051  cation diffusion facilitator family transporter  30.56 
 
 		 306 aa  147  3e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2256  cation diffusion facilitator family transporter  29.9 
 
 		 332 aa  146  3e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00134926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0496  cation diffusion facilitator family transporter  31.58 
 
 		 318 aa  146  5e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.920568  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3548  cation diffusion facilitator family transporter  33.7 
 
 		 320 aa  144  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.058207 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09106  cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcD  29.76 
 
 		 313 aa  144  2e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.341807  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0737  cation efflux system protein  31.25 
 
 		 317 aa  144  2e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.338743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0069  cation efflux family protein  34.75 
 
 		 318 aa  142  9e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3764  cation efflux protein  30.9 
 
 		 389 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0837533 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  31.18 
 
 		 311 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1531  cation diffusion facilitator family transporter  31.27 
 
 		 317 aa  140  3e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0625  cation diffusion facilitator family transporter  30.8 
 
 		 391 aa  138  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1146  cation efflux family protein  29.32 
 
 		 411 aa  138  1e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00680044  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0465  cation efflux family protein  30.8 
 
 		 391 aa  138  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.326406  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6231  cation diffusion facilitator family transporter  34.4 
 
 		 299 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2889  cation diffusion facilitator family transporter  31.03 
 
 		 388 aa  136  3.0000000000000003e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000320508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0344  cation transporter  29.41 
 
 		 427 aa  137  3.0000000000000003e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00235154  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3009  cation diffusion facilitator family transporter  32.67 
 
 		 382 aa  136  4e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1513  cation diffusion facilitator family transporter  34.5 
 
 		 302 aa  134  9.999999999999999e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.5227 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3356  cation diffusion facilitator family transporter  32.78 
 
 		 382 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0130  cation diffusion facilitator family transporter  30.94 
 
 		 292 aa  134  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.120546  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1752  cation diffusion facilitator family transporter  30.48 
 
 		 301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00011926  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  30.82 
 
 		 311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0938  cation diffusion facilitator family transporter  32.64 
 
 		 387 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1042  Co/Zn/Cd cation transporter  30.36 
 
 		 398 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0463512  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2090  cation efflux family protein  31.53 
 
 		 302 aa  133  3e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0210  cation diffusion facilitator family transporter  31.1 
 
 		 404 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.904407 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1127  cation diffusion facilitator family transporter  30.34 
 
 		 323 aa  133  3e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0196  cation diffusion facilitator family transporter  31.1 
 
 		 404 aa  133  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.831911  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1036  cation diffusion facilitator family transporter  30.63 
 
 		 387 aa  133  3e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.246594  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2008  cation efflux family protein  25.6 
 
 		 293 aa  133  3.9999999999999996e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.536733  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0399  cation diffusion facilitator family transporter  32.3 
 
 		 418 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.329701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0044  cation diffusion facilitator family transporter  26.74 
 
 		 381 aa  132  5e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0577  cation diffusion facilitator family transporter  32.35 
 
 		 308 aa  132  7.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.215169 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0264  cation diffusion facilitator family transporter  30.39 
 
 		 385 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.56079 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0282  cation diffusion facilitator family transporter  30.39 
 
 		 385 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.369403  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2576  cation diffusion facilitator family transporter  31.38 
 
 		 423 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00102277 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2423  cation diffusion facilitator family transporter  32.18 
 
 		 291 aa  130  3e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0117  cation diffusion facilitator family transporter  31.02 
 
 		 400 aa  130  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3385  cation efflux protein  30.04 
 
 		 385 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3895  cation diffusion facilitator family transporter  32.84 
 
 		 307 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.640647  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0191  cation diffusion facilitator family transporter  30.39 
 
 		 384 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.114126  hitchhiker  0.0000000345826 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1450  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  27.47 
 
 		 378 aa  129  7.000000000000001e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.59644  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1517  cation diffusion facilitator family transporter  27.47 
 
 		 378 aa  129  7.000000000000001e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>