More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_3258 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_3258  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 
390 aa  778    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2576  cation diffusion facilitator family transporter  49.87 
 
 
423 aa  346  4e-94  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00102277 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1517  cation diffusion facilitator family transporter  41.91 
 
 
378 aa  305  9.000000000000001e-82  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1450  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  41.91 
 
 
378 aa  305  9.000000000000001e-82  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.59644  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3647  cation diffusion facilitator family transporter  45.79 
 
 
395 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3764  cation efflux protein  46.41 
 
 
389 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0837533 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0553  cation diffusion facilitator family transporter  46.7 
 
 
388 aa  282  9e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1992  cation diffusion facilitator family transporter  46.98 
 
 
389 aa  281  2e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0938  cation diffusion facilitator family transporter  44.54 
 
 
387 aa  279  5e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2017  hypothetical protein  40.43 
 
 
380 aa  278  1e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2012  hypothetical protein  40.16 
 
 
380 aa  276  5e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1036  cation diffusion facilitator family transporter  41.86 
 
 
387 aa  264  2e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.246594  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0399  cation diffusion facilitator family transporter  41.69 
 
 
418 aa  263  3e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.329701  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0465  cation efflux family protein  42.51 
 
 
391 aa  256  4e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.326406  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0625  cation diffusion facilitator family transporter  42.51 
 
 
391 aa  256  4e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3154  cation efflux family protein  42.78 
 
 
418 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0117  cation diffusion facilitator family transporter  40.59 
 
 
400 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3385  cation efflux protein  42.34 
 
 
385 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0196  cation diffusion facilitator family transporter  42.33 
 
 
404 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.831911  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0191  cation diffusion facilitator family transporter  40.92 
 
 
384 aa  251  2e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.114126  hitchhiker  0.0000000345826 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0210  cation diffusion facilitator family transporter  42.33 
 
 
404 aa  251  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.904407 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3825  cation efflux family protein  42.21 
 
 
396 aa  250  4e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0047  cation efflux family protein  42.21 
 
 
396 aa  249  7e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3907  cation efflux family protein  42.21 
 
 
396 aa  249  7e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1635  cation efflux family protein  42.21 
 
 
396 aa  249  8e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.504056  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2906  cation efflux family protein  42.21 
 
 
396 aa  249  8e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.313592  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3403  cation efflux family protein  42.21 
 
 
396 aa  249  8e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.843377  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2966  cation efflux family protein  42.21 
 
 
396 aa  249  8e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4320  cation (Co++/Zn++/Cd++) efflux protein  41.94 
 
 
414 aa  248  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0264  cation diffusion facilitator family transporter  44.04 
 
 
385 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.56079 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0282  cation diffusion facilitator family transporter  44.9 
 
 
385 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.369403  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2824  cation diffusion facilitator family transporter  44.56 
 
 
385 aa  242  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.74147  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3356  cation diffusion facilitator family transporter  42.5 
 
 
382 aa  239  8e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2889  cation diffusion facilitator family transporter  36.68 
 
 
388 aa  234  2.0000000000000002e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000320508  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3150  cation diffusion facilitator family transporter  37.99 
 
 
401 aa  234  2.0000000000000002e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3009  cation diffusion facilitator family transporter  42.22 
 
 
382 aa  232  9e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3077  hypothetical protein  42.54 
 
 
392 aa  231  1e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.197933  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3406  cation diffusion facilitator family transporter  42.36 
 
 
337 aa  224  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0496  cation diffusion facilitator family transporter  41.44 
 
 
318 aa  224  2e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.920568  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3245  cation efflux protein  44.8 
 
 
309 aa  223  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1531  cation diffusion facilitator family transporter  40.94 
 
 
317 aa  221  1.9999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3548  cation diffusion facilitator family transporter  43.55 
 
 
320 aa  211  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.058207 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0069  cation efflux family protein  40.88 
 
 
318 aa  210  4e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0570  cation diffusion facilitator family transporter  39.65 
 
 
298 aa  207  2e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.712384  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2526  cation diffusion facilitator family transporter  43.62 
 
 
307 aa  206  4e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0324472 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6231  cation diffusion facilitator family transporter  42.2 
 
 
299 aa  207  4e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554838  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2941  cation diffusion facilitator family transporter  44.21 
 
 
307 aa  203  5e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1675  cation diffusion facilitator family transporter  44.21 
 
 
307 aa  203  5e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.282896  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1587  cation diffusion facilitator family transporter  42.46 
 
 
307 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.697729  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1144  cation efflux family protein  35.31 
 
 
289 aa  200  3e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0182712  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0983  cation efflux family protein  34.62 
 
 
289 aa  198  1.0000000000000001e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0179207  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1774  cation diffusion facilitator family transporter  34.51 
 
 
293 aa  196  8.000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000103729  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0577  cation diffusion facilitator family transporter  42.16 
 
 
308 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.215169 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4982  cation diffusion facilitator family transporter  42.2 
 
 
307 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0279964 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0974  cation diffusion facilitator family transporter  36.48 
 
 
320 aa  192  8e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1511  cation diffusion facilitator family transporter  40.96 
 
 
314 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00242761  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0245  cation diffusion facilitator family transporter  37.14 
 
 
291 aa  188  1e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0491  cation diffusion facilitator family transporter  32.3 
 
 
354 aa  185  1.0000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0566502 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1549  cation diffusion facilitator family transporter  33.69 
 
 
290 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5170  cation efflux protein  39.18 
 
 
303 aa  183  6e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04060  cation diffusion facilitator family transporter  34.62 
 
 
292 aa  179  5.999999999999999e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1668  cation diffusion facilitator family transporter  35.36 
 
 
291 aa  178  2e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0340924  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0858  cation efflux system protein  34.92 
 
 
331 aa  176  7e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0936  cation diffusion facilitator family transporter  34.33 
 
 
300 aa  173  5e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0960  cation diffusion facilitator family transporter  36.07 
 
 
291 aa  172  1e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2100  cation diffusion facilitator family transporter  34.13 
 
 
310 aa  168  2e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.70845  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4494  cation efflux family protein  33.81 
 
 
298 aa  166  9e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3126  cation diffusion facilitator family transporter  34.29 
 
 
297 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4305  cation efflux family protein  33.33 
 
 
298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.901101  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4490  cation efflux family protein  33.33 
 
 
297 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000013867 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4143  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  33.33 
 
 
297 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4154  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  33.33 
 
 
298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4640  cation efflux family protein  33.33 
 
 
298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4257  cation diffusion facilitator family transporter  33.7 
 
 
297 aa  164  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1051  putative cation efflux system protein  32.19 
 
 
319 aa  163  4.0000000000000004e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4544  cation efflux family protein  32.61 
 
 
297 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4529  cation efflux family protein  32.97 
 
 
297 aa  162  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0706  cation efflux family protein  32.97 
 
 
297 aa  161  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45119  predicted protein  33.96 
 
 
591 aa  159  1e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.170034  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2005  cation diffusion facilitator family transporter  29.45 
 
 
299 aa  158  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0858  cation efflux protein  31.53 
 
 
299 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1741  cation diffusion facilitator family transporter  35.54 
 
 
307 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00244826  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3537  cation diffusion facilitator family transporter  32.27 
 
 
294 aa  153  4e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19310  cation diffusion facilitator family transporter  30.24 
 
 
298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000504538 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1794  cation diffusion facilitator family transporter  30 
 
 
299 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1752  cation diffusion facilitator family transporter  32.19 
 
 
301 aa  146  8.000000000000001e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00011926  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0167  cation diffusion facilitator family transporter  34.27 
 
 
305 aa  145  9e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1437  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  30.42 
 
 
303 aa  145  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.929913 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2613  cation efflux family protein  30.14 
 
 
296 aa  145  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0074  cation diffusion facilitator family transporter  27.18 
 
 
313 aa  144  3e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1712  cation diffusion facilitator family transporter  34.07 
 
 
306 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00125134  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1722  cation diffusion facilitator family transporter  29.31 
 
 
299 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1188  cation diffusion facilitator family transporter  30.07 
 
 
322 aa  139  7e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0609928  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09106  cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcD  29.02 
 
 
313 aa  139  7.999999999999999e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.341807  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0737  cation efflux system protein  28.05 
 
 
317 aa  139  8.999999999999999e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.338743  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0634  cation efflux family protein  31.76 
 
 
314 aa  139  1e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2090  cation efflux family protein  29.21 
 
 
302 aa  137  3.0000000000000003e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0663  cation diffusion facilitator family transporter  23.93 
 
 
312 aa  137  4e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0132428  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11850  cation diffusion facilitator family transporter  29.68 
 
 
312 aa  137  5e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2256  cation diffusion facilitator family transporter  30.66 
 
 
332 aa  136  5e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00134926  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>