More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2574 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2574  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 310 aa  615  1e-175  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3895  cation diffusion facilitator family transporter  49.67 
 
 		 307 aa  261  1e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.640647  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  48.62 
 
 		 311 aa  255  7e-67  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2400  cation diffusion facilitator family transporter  48.67 
 
 		 307 aa  255  8e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1954  cation diffusion facilitator family transporter  48.53 
 
 		 328 aa  253  3e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0806665 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  47.93 
 
 		 311 aa  253  4.0000000000000004e-66  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0589  cation diffusion facilitator family transporter  46.88 
 
 		 285 aa  248  8e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000134664  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1683  cation diffusion facilitator family transporter  46.89 
 
 		 308 aa  243  1.9999999999999999e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000676071  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0526  cation diffusion facilitator family transporter  47.42 
 
 		 327 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0331  cation efflux family protein  46.21 
 
 		 311 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1521  cation diffusion facilitator family transporter  44.33 
 
 		 309 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0446  cation diffusion facilitator family transporter  46.62 
 
 		 328 aa  227  2e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.48861  normal  0.265047 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0724  cation diffusion facilitator family transporter  46.8 
 
 		 315 aa  226  3e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152803  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1127  cation diffusion facilitator family transporter  43.3 
 
 		 323 aa  224  2e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1113  hypothetical protein  43.71 
 
 		 307 aa  217  2e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.416676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2000  cation diffusion facilitator family transporter  45.77 
 
 		 285 aa  208  8e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.7679  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1509  putative transport system permease protein  37.07 
 
 		 314 aa  198  9e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073133  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2025  cation diffusion facilitator family transporter  37.76 
 
 		 313 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0165078  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0710  cation diffusion facilitator family transporter  36.67 
 
 		 476 aa  182  8.000000000000001e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3261  cation efflux system protein  37.59 
 
 		 305 aa  173  3.9999999999999995e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826048  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3075  cation diffusion facilitator family transporter  36.05 
 
 		 304 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553073  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3813  ferrous iron efflux protein F  34.07 
 
 		 298 aa  170  2e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.70191  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0745  cation diffusion facilitator family transporter  35.25 
 
 		 460 aa  171  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1731  cation diffusion facilitator family transporter  34.72 
 
 		 315 aa  169  6e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.560975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1202  cation diffusion facilitator family transporter  38.54 
 
 		 488 aa  168  9e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0622136  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1379  cation diffusion facilitator family transporter  37.42 
 
 		 481 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.892961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1850  cation diffusion facilitator family transporter  35.89 
 
 		 315 aa  166  5e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1770  cation diffusion facilitator family transporter  35.89 
 
 		 315 aa  166  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0125  cation diffusion facilitator family transporter  36.6 
 
 		 317 aa  165  8e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0195839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1483  cation diffusion facilitator family transporter  33.92 
 
 		 308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1114  cation efflux protein  34.14 
 
 		 305 aa  163  3e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1021  cation diffusion facilitator family transporter  34.12 
 
 		 346 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0393  cation diffusion facilitator family transporter  40.53 
 
 		 483 aa  162  7e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.38697 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2073  cation diffusion facilitator family transporter  33.57 
 
 		 308 aa  162  8.000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.981542 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1439  cation efflux protein  33.33 
 
 		 293 aa  161  1e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0109958  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0867  cation diffusion facilitator family transporter  36.1 
 
 		 295 aa  161  1e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.851238 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2239  cation diffusion facilitator family transporter  36.52 
 
 		 302 aa  160  3e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0407082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2245  cation diffusion facilitator family transporter  36.23 
 
 		 483 aa  159  4e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0980  cation diffusion facilitator family transporter  33.12 
 
 		 305 aa  157  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2809  cation diffusion facilitator family transporter  36.88 
 
 		 304 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.252612  normal  0.010552 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1043  cation efflux protein  33.33 
 
 		 320 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3476  putative cation efflux family protein, CzcD-like protein  34.83 
 
 		 296 aa  155  8e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606573  normal  0.771262 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1178  cation diffusion facilitator family transporter  34.71 
 
 		 300 aa  155  9e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00185198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0023  cation diffusion facilitator family transporter  35.07 
 
 		 295 aa  155  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.556428 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5864  cation diffusion facilitator family transporter  34.55 
 
 		 300 aa  154  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.499716  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1568  cation efflux family protein  37.93 
 
 		 302 aa  154  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2658  cation diffusion facilitator family transporter  35.67 
 
 		 295 aa  154  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0974  cation diffusion facilitator family transporter  33.78 
 
 		 466 aa  154  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1514  cation efflux family protein  37.93 
 
 		 302 aa  154  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1598  cation diffusion facilitator family transporter  37.93 
 
 		 302 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3065  cation diffusion facilitator family transporter  36.14 
 
 		 295 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.686004  normal  0.910257 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4020  ferrous iron efflux protein F  32.48 
 
 		 300 aa  153  4e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3290  cation diffusion facilitator family transporter  36.14 
 
 		 295 aa  152  5e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2446  cation diffusion facilitator family transporter  34.98 
 
 		 304 aa  152  5e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.526861  normal  0.400869 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2239  cation diffusion facilitator family transporter  34.3 
 
 		 305 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.482091  normal  0.467458 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0936  cation diffusion facilitator family transporter  32.43 
 
 		 300 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4392  ferrous iron efflux protein F  31.54 
 
 		 300 aa  152  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4390  ferrous iron efflux protein F  31.54 
 
 		 300 aa  152  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.228028 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4459  ferrous iron efflux protein F  31.54 
 
 		 300 aa  152  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.709567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2106  cation diffusion facilitator family transporter  34.84 
 
 		 315 aa  152  8e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1215  cation diffusion facilitator family transporter  36.03 
 
 		 302 aa  152  8.999999999999999e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.322219 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4307  ferrous iron efflux protein F  31.54 
 
 		 300 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5513  cation diffusion facilitator family transporter  35 
 
 		 295 aa  150  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.281094  normal  0.363198 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2530  cation diffusion facilitator family transporter  32.99 
 
 		 460 aa  150  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4057  ferrous iron efflux protein F  30.51 
 
 		 300 aa  150  3e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.3408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4278  ferrous iron efflux protein F  31.21 
 
 		 300 aa  149  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.546202  normal  0.887398 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0225  cation diffusion facilitator family transporter  31.82 
 
 		 312 aa  149  6e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1928  cation diffusion facilitator family transporter  35.87 
 
 		 305 aa  149  8e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.479128  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2090  cation efflux family protein  32.56 
 
 		 302 aa  148  1.0000000000000001e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4669  cation diffusion facilitator family transporter  36.01 
 
 		 332 aa  147  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0597  cation diffusion facilitator family transporter  34.69 
 
 		 302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1334  cation diffusion facilitator family transporter  34.06 
 
 		 312 aa  147  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.215207  hitchhiker  0.000886879 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4355  ferrous iron efflux protein F  31.42 
 
 		 300 aa  146  5e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.363052 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03800  ferrous iron efflux protein F  31.42 
 
 		 300 aa  145  6e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.769582  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4070  cation diffusion facilitator family transporter  31.42 
 
 		 300 aa  145  6e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4103  ferrous iron efflux protein F  31.42 
 
 		 300 aa  145  6e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4448  ferrous iron efflux protein F  31.42 
 
 		 300 aa  145  6e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03749  hypothetical protein  31.42 
 
 		 300 aa  145  6e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.859371  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0791  cation diffusion facilitator family transporter  31.49 
 
 		 312 aa  145  6e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5369  ferrous iron efflux protein F  31.42 
 
 		 300 aa  145  6e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4145  ferrous iron efflux protein F  31.42 
 
 		 300 aa  145  6e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4394  ferrous iron efflux protein F  31.42 
 
 		 300 aa  144  1e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00146  ferrous iron efflux protein F  30.17 
 
 		 302 aa  144  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0074  cation diffusion facilitator family transporter  29.3 
 
 		 313 aa  144  2e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0050  cation diffusion facilitator family transporter  34.92 
 
 		 317 aa  144  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.374526 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0846  cation diffusion facilitator family transporter  31.65 
 
 		 459 aa  144  2e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0034385  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2294  cation diffusion facilitator family transporter  34.51 
 
 		 306 aa  143  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38282  normal  0.177312 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3435  cation diffusion facilitator family transporter  38.08 
 
 		 478 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0253813 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2468  cation diffusion facilitator family transporter  32.75 
 
 		 295 aa  143  3e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.376521 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1801  cation efflux family protein  33.92 
 
 		 376 aa  143  4e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0942158  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2198  cation diffusion facilitator family transporter  35.79 
 
 		 293 aa  143  4e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.776966  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002221  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  29.83 
 
 		 302 aa  142  7e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000518265  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1891  cation diffusion facilitator family transporter  34.46 
 
 		 314 aa  142  7e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0381749 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0550  cation efflux protein  34.36 
 
 		 459 aa  142  9.999999999999999e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.247369 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3300  iron and zinc efflux system protein  28.87 
 
 		 318 aa  141  9.999999999999999e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.831799  normal  0.0946092 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4127  ferrous iron efflux protein F  30.8 
 
 		 300 aa  140  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2871  cation efflux protein  31.62 
 
 		 317 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0087  ferrous iron efflux protein F  30.8 
 
 		 300 aa  140  1.9999999999999998e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5667  cation diffusion facilitator family transporter  35.79 
 
 		 328 aa  140  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3264  cation diffusion facilitator family transporter  34.56 
 
 		 295 aa  140  3e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>