More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_2239 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_2239  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 305 aa  604  9.999999999999999e-173  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.482091  normal  0.467458 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0125  cation diffusion facilitator family transporter  69.93 
 
 		 317 aa  439  9.999999999999999e-123  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0195839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1891  cation diffusion facilitator family transporter  75.34 
 
 		 314 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0381749 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1215  cation diffusion facilitator family transporter  70.81 
 
 		 302 aa  399  9.999999999999999e-111  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.322219 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0974  cation diffusion facilitator family transporter  33.56 
 
 		 466 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2574  cation diffusion facilitator family transporter  34.3 
 
 		 310 aa  138  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1379  cation diffusion facilitator family transporter  33.33 
 
 		 481 aa  138  1e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.892961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0393  cation diffusion facilitator family transporter  35.31 
 
 		 483 aa  130  3e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.38697 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0710  cation diffusion facilitator family transporter  32.08 
 
 		 476 aa  129  6e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0589  cation diffusion facilitator family transporter  29.55 
 
 		 285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000134664  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2245  cation diffusion facilitator family transporter  30.94 
 
 		 483 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1509  putative transport system permease protein  30.38 
 
 		 314 aa  125  8.000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073133  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0332  cation diffusion facilitator family transporter  28.62 
 
 		 450 aa  124  1e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2262  ferrous iron efflux protein F  30.66 
 
 		 302 aa  123  3e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000896639  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1684  cation diffusion facilitator family transporter  34.34 
 
 		 450 aa  123  3e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.000631579  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0745  cation diffusion facilitator family transporter  30.24 
 
 		 460 aa  123  4e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3095  putative cation-efflux pump  34.36 
 
 		 462 aa  122  7e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2400  cation diffusion facilitator family transporter  31.54 
 
 		 307 aa  121  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0846  cation diffusion facilitator family transporter  29.93 
 
 		 459 aa  120  3e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0034385  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1450  cation diffusion facilitator family transporter  32.16 
 
 		 460 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.25137  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0050  cation diffusion facilitator family transporter  33.11 
 
 		 317 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.374526 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1202  cation diffusion facilitator family transporter  33.78 
 
 		 488 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0622136  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3813  ferrous iron efflux protein F  31.29 
 
 		 298 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.70191  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  29.05 
 
 		 311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1127  cation diffusion facilitator family transporter  29.97 
 
 		 323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1954  cation diffusion facilitator family transporter  27.01 
 
 		 328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0806665 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3476  putative cation efflux family protein, CzcD-like protein  29.53 
 
 		 296 aa  113  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606573  normal  0.771262 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0139  ferrous iron efflux protein F  32.25 
 
 		 300 aa  114  3e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.205512  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2530  cation diffusion facilitator family transporter  31.13 
 
 		 460 aa  112  5e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1774  cation diffusion facilitator family transporter  28.62 
 
 		 293 aa  113  5e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000103729  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3075  cation diffusion facilitator family transporter  29.29 
 
 		 304 aa  112  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4459  ferrous iron efflux protein F  30 
 
 		 300 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.709567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4392  ferrous iron efflux protein F  30 
 
 		 300 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4390  ferrous iron efflux protein F  30 
 
 		 300 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.228028 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4307  ferrous iron efflux protein F  30 
 
 		 300 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3931  cation diffusion facilitator family transporter  30.4 
 
 		 289 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146752  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  28.47 
 
 		 311 aa  109  6e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00146  ferrous iron efflux protein F  28.37 
 
 		 302 aa  109  6e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002221  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  28.03 
 
 		 302 aa  109  7.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000518265  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2239  cation diffusion facilitator family transporter  29.37 
 
 		 302 aa  108  8.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0407082  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4020  ferrous iron efflux protein F  30 
 
 		 300 aa  108  8.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1119  cation diffusion facilitator family transporter  32.53 
 
 		 275 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.194456  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4808  ferrous iron efflux protein F  30.91 
 
 		 300 aa  108  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4394  ferrous iron efflux protein F  30.07 
 
 		 300 aa  108  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3895  cation diffusion facilitator family transporter  30.69 
 
 		 307 aa  108  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.640647  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03800  ferrous iron efflux protein F  30.31 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.769582  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4070  cation diffusion facilitator family transporter  30.31 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0331  cation efflux family protein  29.69 
 
 		 311 aa  108  2e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4145  ferrous iron efflux protein F  30.31 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03749  hypothetical protein  30.31 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.859371  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2795  ferrous iron efflux protein F  27.34 
 
 		 301 aa  107  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00102947  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4448  ferrous iron efflux protein F  30.31 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4057  ferrous iron efflux protein F  29.35 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.3408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2019  cation diffusion facilitator family transporter  33.21 
 
 		 459 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.40781 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2198  cation diffusion facilitator family transporter  30.85 
 
 		 293 aa  107  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.776966  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5369  ferrous iron efflux protein F  30.31 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4103  ferrous iron efflux protein F  30.31 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4355  ferrous iron efflux protein F  30.31 
 
 		 300 aa  107  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.363052 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2468  cation diffusion facilitator family transporter  29.87 
 
 		 295 aa  107  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.376521 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0074  cation diffusion facilitator family transporter  25.5 
 
 		 313 aa  106  4e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1848  cation diffusion facilitator family transporter  30.97 
 
 		 460 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.762115 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1722  cation diffusion facilitator family transporter  29.21 
 
 		 299 aa  106  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0137  ferrous iron efflux protein F  30.43 
 
 		 300 aa  106  5e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3435  cation diffusion facilitator family transporter  32.16 
 
 		 478 aa  106  5e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0253813 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2025  cation diffusion facilitator family transporter  28.39 
 
 		 313 aa  105  7e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0165078  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4278  ferrous iron efflux protein F  30 
 
 		 300 aa  105  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.546202  normal  0.887398 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2294  cation diffusion facilitator family transporter  30.82 
 
 		 306 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38282  normal  0.177312 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0550  cation efflux protein  28.72 
 
 		 459 aa  105  1e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.247369 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12610  putative transporter  32.09 
 
 		 298 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.686969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04060  cation diffusion facilitator family transporter  30.51 
 
 		 292 aa  104  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2428  cation diffusion facilitator family transporter  30.8 
 
 		 299 aa  103  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000439977  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3065  cation diffusion facilitator family transporter  31.1 
 
 		 295 aa  103  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.686004  normal  0.910257 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1788  cation diffusion facilitator family transporter  32.52 
 
 		 299 aa  103  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0431575 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0465  cation efflux family protein  31.1 
 
 		 391 aa  103  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.326406  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1144  cation efflux family protein  28.37 
 
 		 289 aa  103  4e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0182712  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0625  cation diffusion facilitator family transporter  31.1 
 
 		 391 aa  103  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4333  cation efflux protein  30.31 
 
 		 297 aa  102  6e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4790  cation efflux family protein  30.61 
 
 		 297 aa  102  7e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2100  cation diffusion facilitator family transporter  26.97 
 
 		 310 aa  102  7e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.70845  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0491  cation diffusion facilitator family transporter  28.72 
 
 		 354 aa  102  7e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0566502 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1511  cation diffusion facilitator family transporter  33.12 
 
 		 314 aa  102  8e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00242761  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0634  cation efflux family protein  24.76 
 
 		 314 aa  102  1e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1439  cation efflux protein  27.43 
 
 		 293 aa  101  1e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0109958  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3290  cation diffusion facilitator family transporter  30.43 
 
 		 295 aa  101  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1366  cation diffusion facilitator family transporter  28.21 
 
 		 422 aa  102  1e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0484  cation efflux protein  25.86 
 
 		 298 aa  101  1e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1146  putative transporter  30.46 
 
 		 298 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1794  cation diffusion facilitator family transporter  26.78 
 
 		 299 aa  102  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1668  cation diffusion facilitator family transporter  27.46 
 
 		 291 aa  102  1e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0340924  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2613  cation efflux family protein  28.67 
 
 		 296 aa  101  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2008  cation efflux family protein  27.93 
 
 		 293 aa  100  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.536733  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0051  cation diffusion facilitator family transporter  27.1 
 
 		 306 aa  100  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0281  cation diffusion facilitator family transporter  29.71 
 
 		 289 aa  100  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000230949  unclonable  0.000000000100578 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3300  iron and zinc efflux system protein  25.17 
 
 		 318 aa  100  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.831799  normal  0.0946092 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0719  cation diffusion facilitator family transporter  29.93 
 
 		 278 aa  100  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.775503 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0256  cation diffusion facilitator family transporter  29.71 
 
 		 290 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.015822  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4937  cation efflux protein  31.71 
 
 		 298 aa  100  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3261  cation efflux system protein  31.27 
 
 		 305 aa  100  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826048  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4947  cation diffusion facilitator family transporter  28.23 
 
 		 312 aa  100  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.723787  normal  0.395043 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2809  cation diffusion facilitator family transporter  29.27 
 
 		 304 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.252612  normal  0.010552 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>