More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5513 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5513  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 295 aa  579  1e-164  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.281094  normal  0.363198 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2658  cation diffusion facilitator family transporter  91.86 
 
 		 295 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3065  cation diffusion facilitator family transporter  72.88 
 
 		 295 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.686004  normal  0.910257 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3290  cation diffusion facilitator family transporter  72.54 
 
 		 295 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0023  cation diffusion facilitator family transporter  71.19 
 
 		 295 aa  409  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.556428 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3264  cation diffusion facilitator family transporter  73.22 
 
 		 295 aa  409  1e-113  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2468  cation diffusion facilitator family transporter  59.66 
 
 		 295 aa  361  7.0000000000000005e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.376521 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0050  cation diffusion facilitator family transporter  58.95 
 
 		 317 aa  347  2e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.374526 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3476  putative cation efflux family protein, CzcD-like protein  58.87 
 
 		 296 aa  346  3e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606573  normal  0.771262 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0867  cation diffusion facilitator family transporter  62.03 
 
 		 295 aa  324  1e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.851238 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3075  cation diffusion facilitator family transporter  56.58 
 
 		 304 aa  316  3e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2384  cation diffusion facilitator family transporter  59.66 
 
 		 295 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.336168 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0463  cation efflux transporter  59.32 
 
 		 295 aa  309  4e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.632211  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3261  cation efflux system protein  58.65 
 
 		 305 aa  307  1.0000000000000001e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826048  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2198  cation diffusion facilitator family transporter  58.33 
 
 		 293 aa  303  2.0000000000000002e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.776966  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2446  cation diffusion facilitator family transporter  56.51 
 
 		 304 aa  300  2e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.526861  normal  0.400869 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2809  cation diffusion facilitator family transporter  56.23 
 
 		 304 aa  298  5e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.252612  normal  0.010552 
 
 
-
 
NC_004310  BR1568  cation efflux family protein  55.72 
 
 		 302 aa  295  6e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1514  cation efflux family protein  55.72 
 
 		 302 aa  295  6e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1598  cation diffusion facilitator family transporter  55.72 
 
 		 302 aa  295  7e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2115  cation diffusion facilitator family transporter  60 
 
 		 295 aa  294  1e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.922775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1178  cation diffusion facilitator family transporter  52.9 
 
 		 300 aa  288  7e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00185198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2294  cation diffusion facilitator family transporter  55.16 
 
 		 306 aa  288  9e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38282  normal  0.177312 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2239  cation diffusion facilitator family transporter  51.86 
 
 		 302 aa  283  3.0000000000000004e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0407082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1013  metal cation efflux protein CzrB  46.85 
 
 		 302 aa  269  5e-71  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.323499  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1536  cation diffusion facilitator family transporter  50.35 
 
 		 295 aa  266  2e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.503443  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0607  cation diffusion facilitator family transporter  51.04 
 
 		 309 aa  262  4e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.212656  normal  0.0107339 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2025  cation diffusion facilitator family transporter  41.92 
 
 		 313 aa  228  9e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0165078  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2073  cation diffusion facilitator family transporter  45.32 
 
 		 308 aa  227  1e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.981542 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1770  cation diffusion facilitator family transporter  47.25 
 
 		 315 aa  225  7e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1483  cation diffusion facilitator family transporter  45.49 
 
 		 308 aa  225  7e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3146  cation efflux family protein  44.93 
 
 		 296 aa  224  1e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440371  hitchhiker  0.000651912 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1850  cation diffusion facilitator family transporter  47.27 
 
 		 315 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0980  cation diffusion facilitator family transporter  43.37 
 
 		 305 aa  219  3e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1114  cation efflux protein  44.2 
 
 		 305 aa  219  6e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0597  cation diffusion facilitator family transporter  43.26 
 
 		 302 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1731  cation diffusion facilitator family transporter  45.29 
 
 		 315 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.560975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2106  cation diffusion facilitator family transporter  47.64 
 
 		 315 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0225  cation diffusion facilitator family transporter  44.2 
 
 		 312 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1043  cation efflux protein  43.01 
 
 		 320 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1801  cation efflux family protein  43.84 
 
 		 376 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0942158  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5864  cation diffusion facilitator family transporter  46.1 
 
 		 300 aa  209  5e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.499716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1439  cation efflux protein  41.01 
 
 		 293 aa  208  7e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0109958  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2873  cation diffusion facilitator family transporter  46.64 
 
 		 314 aa  208  1e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1021  cation diffusion facilitator family transporter  42.61 
 
 		 346 aa  207  2e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07750  cation diffusion facilitator family transporter  42.29 
 
 		 330 aa  206  4e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1928  cation diffusion facilitator family transporter  47.74 
 
 		 305 aa  199  3e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.479128  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1334  cation diffusion facilitator family transporter  42.65 
 
 		 312 aa  200  3e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.215207  hitchhiker  0.000886879 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0729  cation diffusion facilitator family transporter  40.57 
 
 		 304 aa  200  3e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2804  cation diffusion facilitator family transporter  40.34 
 
 		 303 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  38.08 
 
 		 311 aa  195  7e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3707  cation diffusion facilitator family transporter  39.86 
 
 		 319 aa  194  1e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0354783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0487  cation diffusion facilitator family transporter  39.86 
 
 		 319 aa  194  2e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  38.08 
 
 		 311 aa  194  2e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4099  cation diffusion facilitator family transporter  40.36 
 
 		 304 aa  191  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.932753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4244  cation diffusion facilitator family transporter  41.88 
 
 		 339 aa  189  5.999999999999999e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.337864 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5667  cation diffusion facilitator family transporter  43.8 
 
 		 328 aa  187  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1661  cation diffusion facilitator family transporter  36.1 
 
 		 331 aa  185  7e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0331  cation efflux family protein  37.37 
 
 		 311 aa  180  2e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4669  cation diffusion facilitator family transporter  43.01 
 
 		 332 aa  181  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1206  cation diffusion facilitator family transporter  40.43 
 
 		 316 aa  179  4.999999999999999e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0470  cation diffusion facilitator family transporter  36.3 
 
 		 337 aa  176  5e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0457303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2568  cation diffusion facilitator family transporter  32.45 
 
 		 332 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.364379 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1127  cation diffusion facilitator family transporter  35.85 
 
 		 323 aa  172  5e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0432  cation diffusion facilitator family transporter  36.5 
 
 		 331 aa  172  7.999999999999999e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2000  cation diffusion facilitator family transporter  40.75 
 
 		 285 aa  170  2e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.7679  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3750  cation diffusion facilitator family transporter  32.76 
 
 		 326 aa  170  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220836  hitchhiker  0.0009443 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2871  cation efflux protein  34.15 
 
 		 317 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1683  cation diffusion facilitator family transporter  37.85 
 
 		 308 aa  160  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000676071  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1521  cation diffusion facilitator family transporter  32.07 
 
 		 309 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0400  cation diffusion facilitator family transporter  32.95 
 
 		 327 aa  159  4e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1954  cation diffusion facilitator family transporter  36.88 
 
 		 328 aa  158  9e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0806665 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0724  cation diffusion facilitator family transporter  37.93 
 
 		 315 aa  157  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152803  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2581  cation diffusion facilitator family transporter  40.6 
 
 		 325 aa  157  3e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0749  cation diffusion facilitator family transporter  37.26 
 
 		 338 aa  157  3e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3895  cation diffusion facilitator family transporter  36.49 
 
 		 307 aa  155  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.640647  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1256  cation diffusion facilitator family transporter  38.81 
 
 		 303 aa  155  1e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.513971  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4333  cation efflux protein  35.34 
 
 		 297 aa  152  5e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0589  cation diffusion facilitator family transporter  32.28 
 
 		 285 aa  152  8e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000134664  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2262  ferrous iron efflux protein F  32.98 
 
 		 302 aa  151  1e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000896639  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2795  ferrous iron efflux protein F  30.6 
 
 		 301 aa  148  1.0000000000000001e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00102947  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4790  cation efflux family protein  33.8 
 
 		 297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2574  cation diffusion facilitator family transporter  35 
 
 		 310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1113  hypothetical protein  33.71 
 
 		 307 aa  147  3e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.416676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0446  cation diffusion facilitator family transporter  34.03 
 
 		 328 aa  145  7.0000000000000006e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.48861  normal  0.265047 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1509  putative transport system permease protein  30.85 
 
 		 314 aa  145  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073133  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002221  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  31.01 
 
 		 302 aa  144  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000518265  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00146  ferrous iron efflux protein F  29.97 
 
 		 302 aa  141  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1143  cation efflux protein  33.85 
 
 		 331 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.344034  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2628  cation efflux protein  33.92 
 
 		 325 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.620911  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3741  cation diffusion facilitator family transporter  33.33 
 
 		 292 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4385  cation efflux family protein  30.77 
 
 		 301 aa  136  4e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.592721  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0791  cation diffusion facilitator family transporter  32.88 
 
 		 312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0526  cation diffusion facilitator family transporter  32.42 
 
 		 327 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3813  ferrous iron efflux protein F  31.97 
 
 		 298 aa  132  5e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.70191  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2400  cation diffusion facilitator family transporter  34.15 
 
 		 307 aa  132  5e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12610  putative transporter  32.26 
 
 		 298 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.686969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0369  cation diffusion facilitator family transporter  31.52 
 
 		 293 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000868845  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4459  ferrous iron efflux protein F  29.56 
 
 		 300 aa  132  9e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.709567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4127  ferrous iron efflux protein F  30.74 
 
 		 300 aa  132  9e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>