More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1334 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_1334  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 312 aa  617  1e-175  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.215207  hitchhiker  0.000886879 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0729  cation diffusion facilitator family transporter  70.47 
 
 		 304 aa  410  1e-113  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4099  cation diffusion facilitator family transporter  70.61 
 
 		 304 aa  409  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.932753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3707  cation diffusion facilitator family transporter  68 
 
 		 319 aa  402  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0354783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0487  cation diffusion facilitator family transporter  68 
 
 		 319 aa  402  1e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4244  cation diffusion facilitator family transporter  69.31 
 
 		 339 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.337864 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3146  cation efflux family protein  67.72 
 
 		 296 aa  366  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440371  hitchhiker  0.000651912 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1206  cation diffusion facilitator family transporter  64.34 
 
 		 316 aa  365  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4669  cation diffusion facilitator family transporter  63.61 
 
 		 332 aa  366  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1731  cation diffusion facilitator family transporter  48.66 
 
 		 315 aa  262  6.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.560975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1850  cation diffusion facilitator family transporter  48.04 
 
 		 315 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1770  cation diffusion facilitator family transporter  48.04 
 
 		 315 aa  247  2e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1114  cation efflux protein  47.3 
 
 		 305 aa  241  1e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1483  cation diffusion facilitator family transporter  45.91 
 
 		 308 aa  238  1e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1439  cation efflux protein  44.52 
 
 		 293 aa  237  2e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0109958  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1043  cation efflux protein  45.49 
 
 		 320 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2106  cation diffusion facilitator family transporter  47.39 
 
 		 315 aa  231  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0597  cation diffusion facilitator family transporter  45.61 
 
 		 302 aa  230  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2073  cation diffusion facilitator family transporter  45.55 
 
 		 308 aa  230  2e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.981542 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1928  cation diffusion facilitator family transporter  50.35 
 
 		 305 aa  225  7e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.479128  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0980  cation diffusion facilitator family transporter  44.1 
 
 		 305 aa  224  2e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07750  cation diffusion facilitator family transporter  42.16 
 
 		 330 aa  218  1e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1801  cation efflux family protein  41.72 
 
 		 376 aa  212  7e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0942158  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0225  cation diffusion facilitator family transporter  43.6 
 
 		 312 aa  211  2e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2658  cation diffusion facilitator family transporter  45.52 
 
 		 295 aa  206  6e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2025  cation diffusion facilitator family transporter  39.59 
 
 		 313 aa  205  8e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0165078  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2198  cation diffusion facilitator family transporter  43.45 
 
 		 293 aa  204  1e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.776966  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5667  cation diffusion facilitator family transporter  44.9 
 
 		 328 aa  204  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2239  cation diffusion facilitator family transporter  45.52 
 
 		 302 aa  204  2e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0407082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1178  cation diffusion facilitator family transporter  43.4 
 
 		 300 aa  202  5e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00185198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3261  cation efflux system protein  41.97 
 
 		 305 aa  201  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826048  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1568  cation efflux family protein  42.76 
 
 		 302 aa  199  3.9999999999999996e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1514  cation efflux family protein  42.76 
 
 		 302 aa  199  3.9999999999999996e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1598  cation diffusion facilitator family transporter  42.07 
 
 		 302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2468  cation diffusion facilitator family transporter  43.01 
 
 		 295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.376521 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2873  cation diffusion facilitator family transporter  43.23 
 
 		 314 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5864  cation diffusion facilitator family transporter  40.2 
 
 		 300 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.499716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0867  cation diffusion facilitator family transporter  45.52 
 
 		 295 aa  193  4e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.851238 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5513  cation diffusion facilitator family transporter  42.65 
 
 		 295 aa  190  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.281094  normal  0.363198 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0023  cation diffusion facilitator family transporter  41.58 
 
 		 295 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.556428 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1013  metal cation efflux protein CzrB  37.46 
 
 		 302 aa  189  7e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.323499  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3075  cation diffusion facilitator family transporter  37.88 
 
 		 304 aa  188  8e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3065  cation diffusion facilitator family transporter  42.14 
 
 		 295 aa  188  9e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.686004  normal  0.910257 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1021  cation diffusion facilitator family transporter  41.48 
 
 		 346 aa  188  1e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2446  cation diffusion facilitator family transporter  40.75 
 
 		 304 aa  187  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.526861  normal  0.400869 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3290  cation diffusion facilitator family transporter  41.79 
 
 		 295 aa  186  3e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2294  cation diffusion facilitator family transporter  40.15 
 
 		 306 aa  186  4e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38282  normal  0.177312 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0050  cation diffusion facilitator family transporter  41.14 
 
 		 317 aa  186  5e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.374526 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3476  putative cation efflux family protein, CzcD-like protein  39.07 
 
 		 296 aa  185  8e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606573  normal  0.771262 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2804  cation diffusion facilitator family transporter  40 
 
 		 303 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2809  cation diffusion facilitator family transporter  37.88 
 
 		 304 aa  182  7e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.252612  normal  0.010552 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3264  cation diffusion facilitator family transporter  42.14 
 
 		 295 aa  180  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0463  cation efflux transporter  39.71 
 
 		 295 aa  170  3e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.632211  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2581  cation diffusion facilitator family transporter  40.79 
 
 		 325 aa  165  8e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2384  cation diffusion facilitator family transporter  40.07 
 
 		 295 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.336168 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1661  cation diffusion facilitator family transporter  31.09 
 
 		 331 aa  163  4.0000000000000004e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0589  cation diffusion facilitator family transporter  32.47 
 
 		 285 aa  160  4e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000134664  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2115  cation diffusion facilitator family transporter  40.07 
 
 		 295 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.922775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  35.59 
 
 		 311 aa  156  4e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  35.46 
 
 		 311 aa  155  8e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0470  cation diffusion facilitator family transporter  30.59 
 
 		 337 aa  155  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0457303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2568  cation diffusion facilitator family transporter  32 
 
 		 332 aa  154  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.364379 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1521  cation diffusion facilitator family transporter  32.82 
 
 		 309 aa  144  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1256  cation diffusion facilitator family transporter  38.91 
 
 		 303 aa  142  5e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.513971  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0331  cation efflux family protein  34.93 
 
 		 311 aa  142  8e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1536  cation diffusion facilitator family transporter  34.97 
 
 		 295 aa  142  9e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.503443  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0526  cation diffusion facilitator family transporter  34.24 
 
 		 327 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0432  cation diffusion facilitator family transporter  37.5 
 
 		 331 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1954  cation diffusion facilitator family transporter  31.46 
 
 		 328 aa  139  7.999999999999999e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0806665 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0607  cation diffusion facilitator family transporter  35.79 
 
 		 309 aa  137  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.212656  normal  0.0107339 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2574  cation diffusion facilitator family transporter  34.06 
 
 		 310 aa  137  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1127  cation diffusion facilitator family transporter  33.7 
 
 		 323 aa  136  5e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3895  cation diffusion facilitator family transporter  32.64 
 
 		 307 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.640647  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0791  cation diffusion facilitator family transporter  30.39 
 
 		 312 aa  130  4.0000000000000003e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0400  cation diffusion facilitator family transporter  28.21 
 
 		 327 aa  130  4.0000000000000003e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3750  cation diffusion facilitator family transporter  30.68 
 
 		 326 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220836  hitchhiker  0.0009443 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4475  cation efflux family protein  29.79 
 
 		 296 aa  126  6e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2000  cation diffusion facilitator family transporter  33.33 
 
 		 285 aa  126  6e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.7679  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3767  cation diffusion facilitator family transporter  30.5 
 
 		 297 aa  125  7e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0281724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0369  cation diffusion facilitator family transporter  29.79 
 
 		 293 aa  124  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000868845  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0255  cation diffusion facilitator family transporter  30.58 
 
 		 299 aa  125  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000211411  hitchhiker  0.0000000259918 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0281  cation diffusion facilitator family transporter  31.29 
 
 		 289 aa  124  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000230949  unclonable  0.000000000100578 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1113  hypothetical protein  32.97 
 
 		 307 aa  124  2e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.416676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4307  ferrous iron efflux protein F  28.31 
 
 		 300 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0254  cation diffusion facilitator family transporter  29.79 
 
 		 297 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00100286  hitchhiker  0.000434478 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4459  ferrous iron efflux protein F  27.94 
 
 		 300 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.709567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4390  ferrous iron efflux protein F  27.94 
 
 		 300 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.228028 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4392  ferrous iron efflux protein F  27.94 
 
 		 300 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123338  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4790  cation efflux family protein  33.1 
 
 		 297 aa  120  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4278  ferrous iron efflux protein F  27.94 
 
 		 300 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.546202  normal  0.887398 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0724  cation diffusion facilitator family transporter  32.49 
 
 		 315 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152803  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1509  putative transport system permease protein  28.37 
 
 		 314 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073133  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1683  cation diffusion facilitator family transporter  32.43 
 
 		 308 aa  119  4.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000676071  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4333  cation efflux protein  32.74 
 
 		 297 aa  119  7e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0446  cation diffusion facilitator family transporter  32.09 
 
 		 328 aa  119  7e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.48861  normal  0.265047 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1379  cation diffusion facilitator family transporter  32.78 
 
 		 481 aa  119  7e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.892961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0258  cation diffusion facilitator family transporter  29.8 
 
 		 296 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0238617  decreased coverage  0.0000137847 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0256  cation diffusion facilitator family transporter  29.8 
 
 		 290 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.015822  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4020  ferrous iron efflux protein F  28.52 
 
 		 300 aa  118  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0263  cation diffusion facilitator family transporter  29.8 
 
 		 296 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000665998  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>