More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_4070 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03800  ferrous iron efflux protein F  100 
 
 
300 aa  606  9.999999999999999e-173  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.769582  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4070  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 
300 aa  606  9.999999999999999e-173  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4448  ferrous iron efflux protein F  100 
 
 
300 aa  606  9.999999999999999e-173  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03749  hypothetical protein  100 
 
 
300 aa  606  9.999999999999999e-173  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.859371  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4355  ferrous iron efflux protein F  99.67 
 
 
300 aa  605  9.999999999999999e-173  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.363052 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5369  ferrous iron efflux protein F  100 
 
 
300 aa  606  9.999999999999999e-173  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4145  ferrous iron efflux protein F  100 
 
 
300 aa  606  9.999999999999999e-173  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4103  ferrous iron efflux protein F  100 
 
 
300 aa  606  9.999999999999999e-173  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4394  ferrous iron efflux protein F  99.67 
 
 
300 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4278  ferrous iron efflux protein F  92.57 
 
 
300 aa  546  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.546202  normal  0.887398 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4057  ferrous iron efflux protein F  90.38 
 
 
300 aa  545  1e-154  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.3408  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4459  ferrous iron efflux protein F  92.57 
 
 
300 aa  546  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.709567  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4392  ferrous iron efflux protein F  92.57 
 
 
300 aa  546  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123338  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4307  ferrous iron efflux protein F  92.57 
 
 
300 aa  545  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4390  ferrous iron efflux protein F  92.57 
 
 
300 aa  546  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.228028 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0088  ferrous iron efflux protein F  78.16 
 
 
300 aa  468  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4808  ferrous iron efflux protein F  79.12 
 
 
300 aa  468  1.0000000000000001e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0087  ferrous iron efflux protein F  78.5 
 
 
300 aa  469  1.0000000000000001e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4127  ferrous iron efflux protein F  78.5 
 
 
300 aa  469  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0139  ferrous iron efflux protein F  71.33 
 
 
300 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.205512  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4020  ferrous iron efflux protein F  74.24 
 
 
300 aa  444  1e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3813  ferrous iron efflux protein F  72.2 
 
 
298 aa  429  1e-119  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.70191  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0137  ferrous iron efflux protein F  69.67 
 
 
300 aa  421  1e-117  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2795  ferrous iron efflux protein F  61.36 
 
 
301 aa  371  1e-102  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00102947  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00146  ferrous iron efflux protein F  58.86 
 
 
302 aa  360  1e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2262  ferrous iron efflux protein F  58.97 
 
 
302 aa  358  5e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000896639  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002221  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  57.53 
 
 
302 aa  356  1.9999999999999998e-97  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000518265  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3300  iron and zinc efflux system protein  49.32 
 
 
318 aa  306  4.0000000000000004e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.831799  normal  0.0946092 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0484  cation efflux protein  48.47 
 
 
298 aa  296  3e-79  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0263  cation diffusion facilitator family transporter  49.29 
 
 
296 aa  278  8e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000665998  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0263  cation diffusion facilitator family transporter  49.29 
 
 
296 aa  277  1e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0256  cation diffusion facilitator family transporter  49.29 
 
 
290 aa  276  3e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.015822  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0258  cation diffusion facilitator family transporter  49.29 
 
 
296 aa  276  4e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0238617  decreased coverage  0.0000137847 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4333  cation efflux protein  44.79 
 
 
297 aa  268  8.999999999999999e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1146  putative transporter  47.95 
 
 
298 aa  268  1e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0369  cation diffusion facilitator family transporter  48.76 
 
 
293 aa  267  1e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000868845  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3931  cation diffusion facilitator family transporter  49.47 
 
 
289 aa  267  2e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146752  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4790  cation efflux family protein  45.3 
 
 
297 aa  266  4e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12610  putative transporter  47.6 
 
 
298 aa  265  7e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.686969  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3741  cation diffusion facilitator family transporter  48.62 
 
 
292 aa  265  8e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0791  cation diffusion facilitator family transporter  47.35 
 
 
312 aa  265  1e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0314  cation diffusion facilitator family transporter  47.69 
 
 
289 aa  263  2e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000499164  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4774  cation diffusion facilitator family transporter  47.18 
 
 
290 aa  262  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00437993 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4650  cation diffusion facilitator family transporter  47.54 
 
 
290 aa  262  6e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.188299 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0646  cation diffusion facilitator family transporter  48.25 
 
 
289 aa  261  8.999999999999999e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.186266  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0283  cation diffusion facilitator family transporter  50.89 
 
 
289 aa  259  4e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000135254  hitchhiker  0.000000557586 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3430  cation efflux family protein  46.5 
 
 
289 aa  259  4e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.038315  normal  0.371724 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4937  cation efflux protein  45.99 
 
 
298 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0254  cation diffusion facilitator family transporter  48.77 
 
 
297 aa  258  1e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00100286  hitchhiker  0.000434478 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3767  cation diffusion facilitator family transporter  48.77 
 
 
297 aa  255  6e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0281724  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0255  cation diffusion facilitator family transporter  48.11 
 
 
299 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000211411  hitchhiker  0.0000000259918 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3459  cation diffusion facilitator family transporter  46.62 
 
 
295 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000668227  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0281  cation diffusion facilitator family transporter  50.18 
 
 
289 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000230949  unclonable  0.000000000100578 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2871  cation efflux protein  45.49 
 
 
317 aa  253  3e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4475  cation efflux family protein  48.42 
 
 
296 aa  252  6e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4385  cation efflux family protein  42.47 
 
 
301 aa  251  1e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.592721  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3568  cation diffusion facilitator family transporter  49.11 
 
 
289 aa  248  1e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000153022  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09970  Cation efflux protein  48.94 
 
 
293 aa  246  3e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.907578  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4828  cation diffusion facilitator family transporter  46.83 
 
 
290 aa  239  5e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2628  cation efflux protein  41.4 
 
 
325 aa  236  3e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.620911  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0241  cation diffusion facilitator family transporter  46.29 
 
 
310 aa  233  3e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000961232  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1177  cation diffusion facilitator family transporter  40.56 
 
 
308 aa  211  9e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0047  cation diffusion facilitator family transporter  38.54 
 
 
325 aa  207  2e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.408108  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4753  cation diffusion facilitator family transporter  39.71 
 
 
296 aa  204  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.36054  decreased coverage  0.00983844 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4947  cation diffusion facilitator family transporter  36.18 
 
 
312 aa  189  5.999999999999999e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.723787  normal  0.395043 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1026  cation efflux family protein  31.85 
 
 
295 aa  181  1e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0972  cation efflux family protein  31.85 
 
 
295 aa  181  1e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1582  cation diffusion facilitator family transporter  35.11 
 
 
299 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1171  cation efflux family protein  31.85 
 
 
295 aa  179  2.9999999999999997e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0116  cation diffusion facilitator family transporter  37.25 
 
 
323 aa  179  4e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.358203  normal  0.378394 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0847  cation efflux protein  34.64 
 
 
297 aa  175  9e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0084  pantothenate metabolism flavoprotein  34.88 
 
 
311 aa  159  8e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00694286  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1509  putative transport system permease protein  33.1 
 
 
314 aa  149  4e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073133  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0532  ferrous-iron efflux pump FieF  36.12 
 
 
291 aa  149  7e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.800383  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2000  cation diffusion facilitator family transporter  36.33 
 
 
285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.7679  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0896  cation efflux family protein  28.96 
 
 
304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0221423  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3075  cation diffusion facilitator family transporter  31.02 
 
 
304 aa  142  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553073  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  29.89 
 
 
311 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2294  cation diffusion facilitator family transporter  30.1 
 
 
306 aa  139  6e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38282  normal  0.177312 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1521  cation diffusion facilitator family transporter  29.08 
 
 
309 aa  139  6e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2198  cation diffusion facilitator family transporter  31.85 
 
 
293 aa  139  7e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.776966  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2239  cation diffusion facilitator family transporter  31.34 
 
 
302 aa  138  8.999999999999999e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0407082  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1731  cation diffusion facilitator family transporter  29.96 
 
 
315 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.560975  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0589  cation diffusion facilitator family transporter  28.99 
 
 
285 aa  137  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000134664  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0050  cation diffusion facilitator family transporter  30.91 
 
 
317 aa  136  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.374526 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3261  cation efflux system protein  30.21 
 
 
305 aa  136  4e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826048  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2574  cation diffusion facilitator family transporter  31.42 
 
 
310 aa  135  6.0000000000000005e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3476  putative cation efflux family protein, CzcD-like protein  30.42 
 
 
296 aa  135  9e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606573  normal  0.771262 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3065  cation diffusion facilitator family transporter  30.47 
 
 
295 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.686004  normal  0.910257 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1114  cation efflux protein  28.15 
 
 
305 aa  134  9.999999999999999e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1483  cation diffusion facilitator family transporter  28.27 
 
 
308 aa  134  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1178  cation diffusion facilitator family transporter  32.04 
 
 
300 aa  135  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00185198  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2468  cation diffusion facilitator family transporter  31 
 
 
295 aa  135  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.376521 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3290  cation diffusion facilitator family transporter  30.11 
 
 
295 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2809  cation diffusion facilitator family transporter  31.02 
 
 
304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.252612  normal  0.010552 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  28.47 
 
 
311 aa  132  5e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2073  cation diffusion facilitator family transporter  28.27 
 
 
308 aa  132  6e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.981542 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1123  ferrous-iron efflux pump FieF  29.17 
 
 
289 aa  132  6.999999999999999e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00791465  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0225  cation diffusion facilitator family transporter  30.93 
 
 
312 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0023  cation diffusion facilitator family transporter  29.03 
 
 
295 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.556428 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>